KEGG   ENZYME: 3.5.4.38
Entry
EC 3.5.4.38                 Enzyme                                 
Name
single-stranded DNA cytosine deaminase;
AID;
activation-induced deaminase;
AICDA (gene name);
activation-induced cytidine deaminase
Class
Hydrolases;
Acting on carbon-nitrogen bonds, other than peptide bonds;
In cyclic amidines
Sysname
single-stranded DNA cytosine aminohydrolase
Reaction(IUBMB)
cytosine in single-stranded DNA + H2O = uracil in single-stranded DNA + NH3
Substrate
cytosine in single-stranded DNA;
H2O [CPD:C00001]
Product
uracil in single-stranded DNA;
NH3 [CPD:C00014]
Comment
The enzyme exclusively catalyses deamination of cytosine in single-stranded DNA. It preferentially deaminates five-nucleotide bubbles. The optimal target consists of a single-stranded NWRCN motif (W = A or T, R = A or G) [2]. The enzyme initiates antibody diversification processes by deaminating immunoglobulin sequences.
History
EC 3.5.4.38 created 2013
Orthology
K10989  activation-induced cytidine deaminase
Genes
HSA: 57379(AICDA)
PTR: 473404(AICDA)
PPS: 100973347(AICDA)
GGO: 101135489(AICDA)
PON: 100439396(AICDA)
PPYG: 129010592(AICDA)
NLE: 100592218(AICDA)
HMH: 116472219(AICDA)
SSYN: 129483420(AICDA)
MCC: 716378(AICDA)
MCF: 102122751(AICDA)
MTHB: 126931394
MNI: 105499877(AICDA)
CSAB: 103218532(AICDA)
CATY: 105587957(AICDA)
PANU: 101022355(AICDA)
TGE: 112634673(AICDA)
MLEU: 105552616 105552619
RRO: 104672844(AICDA)
RBB: 108543657(AICDA)
TFN: 117090538(AICDA)
PTEH: 111526623(AICDA)
CANG: 105519921(AICDA)
CJC: 100387865(AICDA)
SBQ: 101034094(AICDA)
CIMI: 108291856(AICDA)
ANAN: 105721346(AICDA)
CSYR: 103251717(AICDA)
MMUR: 105878286
LCAT: 123640610(AICDA)
PCOQ: 105805010(AICDA) 105822737
OGA: 100945807(AICDA)
MMU: 11628(Aicda)
MCAL: 110295779(Aicda)
MPAH: 110317038(Aicda)
RNO: 399679(Aicda)
MCOC: 116098317(Aicda)
ANU: 117715417(Aicda)
ASYL: 127679152(Aicda)
MUN: 110556288(Aicda)
CGE: 100689250(Aicda)
MAUA: 101841949(Aicda)
PROB: 127236105(Aicda)
PLEU: 114683510(Aicda)
MORG: 121441889(Aicda)
MFOT: 126514847
NGI: 103727567(Aicda)
HGL: 101723465(Aicda)
CPOC: 100729642 100731564 100732386
CCAN: 109680708(Aicda)
DORD: 105991013(Aicda)
DSP: 122127021(Aicda)
NCAR: 124982773
MMMA: 107159908(Aicda)
ITI: 101959789(Aicda)
OCU: 100008969
OPI: 101535645(AICDA)
TUP: 102476438(AICDA)
GVR: 103582258 103597927(AICDA)
CFA: 442983(AICDA)
CLUD: 112675321(AICDA)
VVP: 112917509(AICDA)
VLG: 121479859(AICDA)
NPO: 129517094(AICDA)
AML: 100474338(AICDA)
UMR: 103669168(AICDA)
UAH: 113257425(AICDA)
UAR: 123781604(AICDA)
ELK: 111142054
LLV: 125107996
MPUF: 101679159(AICDA)
MNP: 132020581(AICDA)
MLK: 131839096(AICDA)
NVS: 122891601(AICDA)
ORO: 101375110(AICDA)
EJU: 114221688(AICDA)
ZCA: 113921816(AICDA)
MLX: 118025698(AICDA)
NSU: 110580728(AICDA)
LWW: 102740926(AICDA)
FCA: 101101143(AICDA)
PYU: 121022000(AICDA)
PCOO: 112867886(AICDA)
PBG: 122472688(AICDA)
PVIV: 125170490(AICDA)
LRUF: 124502426
LGF: 123590846(AICDA)
AJU: 106965426
PTG: 102950698(AICDA)
PPAD: 109276061(AICDA)
PUC: 125920086
PLEZ: 122225556(AICDA)
HHV: 120222699(AICDA)
BTA: 539888(AICDA)
BOM: 102271255(AICDA)
BIU: 109558588(AICDA)
BBUB: 102396934(AICDA)
BBIS: 104995476(AICDA)
CHX: 102181572(AICDA)
OAS: 101103056(AICDA)
BTAX: 128048240(AICDA) 128048260
CSUM: 138078768(AICDA)
ODA: 120857972(AICDA)
CCAD: 122423621(AICDA)
MREE: 136168132(AICDA)
OVR: 110141996(AICDA)
MBEZ: 129536138(AICDA)
SSC: 100526050(AICDA)
CFR: 102517000(AICDA)
CBAI: 105062175(AICDA)
CDK: 105098237(AICDA)
VPC: 102527290(AICDA)
BACU: 103010462(AICDA)
BMUS: 118902008(AICDA)
LVE: 103069988(AICDA)
OOR: 101285289(AICDA)
LALB: 132529218(AICDA)
DLE: 111176735(AICDA)
PCAD: 102985948(AICDA)
PSIU: 116760951(AICDA)
NASI: 112391805(AICDA)
ECB: 100061137(AICDA)
EPZ: 103556648(AICDA)
EAI: 106837434(AICDA)
MYB: 102246875(AICDA)
MYD: 102754251(AICDA)
MMYO: 118650733(AICDA)
MLF: 102430894(AICDA)
MDT: 132226021(AICDA)
MYUM: 139005688(AICDA)
PKL: 118729810(AICDA)
EFUS: 103285399(AICDA)
MNA: 107543987(AICDA)
DRO: 112321970(AICDA)
SHON: 119002541(AICDA)
AJM: 119065676(AICDA)
PDIC: 114513696(AICDA)
PHAS: 123819343(AICDA)
MMF: 118624457(AICDA)
PPAM: 129084639(AICDA)
HAI: 109372744(AICDA) 109392228
RFQ: 117028892(AICDA)
PALE: 102880164(AICDA)
PVP: 105295918(AICDA)
RAY: 107501658(AICDA)
MJV: 108396885(AICDA)
TOD: 119247037(AICDA)
SARA: 101553692(AICDA)
SFUM: 130042536(AICDA)
SETR: 126006977(AICDA)
LAV: 100656685(AICDA)
TMU: 101348216
ETF: 101651339(AICDA)
DNM: 101417910 101428702(AICDA)
MDO: 100013907(AICDA)
GAS: 123249252(AICDA)
SHR: 100931157(AICDA)
AFZ: 127564395
PCW: 110213822(AICDA)
TVP: 118851791(AICDA)
PBRV: 138175600(AICDA)
OAA: 100085951(AICDA)
TACU: 119946457(AICDA)
GGA: 418257(AICDA)
PCOC: 116240951(AICDA)
MGP: 100542460(AICDA)
CJO: 107318165(AICDA)
TPAI: 128089913(AICDA)
LMUT: 125686545(AICDA)
NMEL: 110392453(AICDA)
APLA: 101792498(AICDA)
ACYG: 106048067(AICDA)
CATA: 118247772(AICDA)
AFUL: 116490129(AICDA)
TGU: 105758674(AICDA)
LSR: 110472352(AICDA)
SCAN: 103812487(AICDA)
PMOA: 120497751(AICDA)
OTC: 121340964(AICDA)
PRUF: 121349848(AICDA)
ATRC: 139593163(AICDA)
GFR: 102039832(AICDA)
FAB: 101816423(AICDA)
OMA: 130256824
PHI: 102100565(AICDA)
PMAJ: 107212474(AICDA)
CCAE: 111925850(AICDA)
CCW: 104690263
CBRC: 103616671(AICDA)
ACOE: 138117402(AICDA)
ETL: 114069347(AICDA)
ZAB: 102067674
ZLE: 135461181(AICDA)
ACHL: 103810517(AICDA)
SVG: 106859816(AICDA)
MMEA: 130579210(AICDA)
HRT: 120748603(AICDA)
SATI: 136374915(AICDA)
CCIC: 134057856(AICDA)
FPG: 101914801(AICDA)
FCH: 102056463(AICDA)
CCRI: 104162401(AICDA)
NNT: 104402025(AICDA)
SHAB: 115605328(AICDA)
ACUN: 113491213(AICDA)
TALA: 104366491(AICDA)
ACHC: 115352641(AICDA)
HALD: 104323321
HLE: 104836676(AICDA)
AGEN: 126047956
HHAR: 128143039(AICDA)
GCL: 127016006
CSTI: 104551955(AICDA)
LDI: 104345794(AICDA)
DPUB: 104306897(AICDA)
PPUS: 135175613(AICDA)
AVIT: 104268823(AICDA)
BRHI: 104490457(AICDA)
EGZ: 104122769(AICDA)
NNI: 104014575(AICDA)
PCRI: 104031013(AICDA)
PCAO: 104048838(AICDA)
PADL: 103915113(AICDA)
AFOR: 103908541(AICDA)
FGA: 104081375(AICDA)
GSTE: 104264504(AICDA)
CLV: 102087778(AICDA)
MUI: 104538793(AICDA)
PGUU: 104466317(AICDA)
PLET: 104618143(AICDA)
EHS: 104513937(AICDA)
CMAC: 104486310(AICDA)
CUCA: 104060634(AICDA)
TEO: 104370795(AICDA)
BREG: 104631184(AICDA)
OHA: 104332448(AICDA)
ACAR: 104531752(AICDA)
CPEA: 104394553(AICDA)
CVF: 104294500(AICDA)
RTD: 128900382(AICDA)
CRID: 134510119(AICDA)
AAM: 106495707(AICDA)
AROW: 112973977(AICDA)
NPD: 112952040(AICDA)
TGT: 104580214(AICDA)
DNE: 112992434(AICDA)
SCAM: 104152044(AICDA)
ASN: 102376898(AICDA)
AMJ: 102558786(AICDA)
CPOO: 109316235(AICDA)
GGN: 109296590(AICDA)
PSS: 102452729(AICDA)
CMY: 102933542(AICDA)
CCAY: 125630289(AICDA)
DCC: 119841986(AICDA)
CPIC: 101942640(AICDA)
TST: 117884862(AICDA)
CABI: 116823840(AICDA)
MRV: 120381360(AICDA)
ACS: 100558459(aicda)
ASAO: 132766547
PVT: 110090848(AICDA)
SUND: 121922863
PBI: 103050866(AICDA)
PMUR: 107288413(AICDA)
CTIG: 120318700(AICDA)
APRI: 131190012(AICDA)
PTEX: 113444471(AICDA)
NSS: 113425291(AICDA)
VKO: 123017771(AICDA)
PMUA: 114588074(AICDA)
PRAF: 128405348(AICDA)
ZVI: 118097951(AICDA)
HCG: 128346012(AICDA)
GJA: 107116093(AICDA)
EMC: 129345720(AICDA)
XLA: 108697151(aicda.S) 734224(aicda.L)
XTR: 100497606(aicda)
NPR: 108799486(AICDA)
RTEM: 120910359(AICDA) 120913458
BBUF: 120977651 121004594
BGAR: 122942284(AICDA)
PWL: 138247196(AICDA)
MUO: 115457694
GSH: 117350312(AICDA)
DRE: 493784(aicda)
SRX: 107724977 107744312
SANH: 107672983 107692585
SGH: 107549448 107598400
CCAR: 109105833(aicda) 109113171
CAUA: 113059628 113116839
CGIB: 127975213 128031077
PTET: 122361041(aicda)
LROH: 127178851(aicda)
OMC: 131521313(aicda)
PPRM: 120484243(aicda)
RKG: 130103662(aicda)
MAMB: 125244252(aicda)
CIDE: 127496747
CERY: 137025751(aicda)
MASI: 127453529 127454160
TROS: 130558596 130558597
TDW: 130433519(aicda)
MANU: 129447865(aicda)
PDAB: 135728024 135743466
IPU: 100304619(aicda)
IFU: 128615018(aicda)
PHYP: 113542425(aicda)
SMEO: 124384570(aicda)
TFD: 113643574(aicda)
TVC: 132846078(aicda)
CGAR: 128520742(aicda)
NGRA: 132885968(aicda)
TRN: 134310056(aicda)
AMEX: 103042217(aicda)
CMAO: 118825159(aicda)
EEE: 113570641(aicda)
CHAR: 105905513(aicda)
SPIL: 134082179(aicda)
TRU: 777999(aicda)
TFS: 130533039(aicda)
TNG: GSTEN00015446G001
LCO: 104934638(aicda)
NCC: 104960416(aicda)
TBEN: 117480638(aicda)
CGOB: 115021432(aicda)
PGEO: 117461407(aicda)
GACU: 117543323(aicda)
EMAC: 134861786(aicda)
ELY: 117266528(aicda)
EFO: 125893531(aicda)
PLEP: 121946375(aicda)
SLUC: 116049673(aicda)
ECRA: 117946294(aicda)
ESP: 116691310(aicda)
PFLV: 114557330(aicda)
GAT: 120810728(aicda)
PPUG: 119197276(aicda)
AFB: 129110195(aicda)
CLUM: 117745415(aicda)
CANA: 137781466(aicda)
CVE: 137891054(aicda)
MSAM: 119897479(aicda)
SCHU: 122882091(aicda)
CUD: 121513645(aicda)
SPUL: 138584489(aicda)
LMIX: 132983085(aicda)
ALAT: 119006385(aicda)
ASTR: 137601881(aicda)
MZE: 101463826(aicda)
ONL: 100694963(aicda)
OAU: 116323857(aicda)
OLA: 101168236(aicda)
OML: 112143736(aicda)
CSAI: 133441048(aicda)
XMA: 102220777(aicda)
XCO: 114142228(aicda)
XHE: 116716637(aicda)
PRET: 103478041(aicda)
PFOR: 103136694 103136697
PLAI: 106958069(aicda)
PMEI: 106916557(aicda)
GAF: 122831115(aicda)
PPRL: 129371498(aicda)
CVG: 107082210
CTUL: 119783184(aicda)
GMU: 124865717(aicda)
NFU: 107379531
KMR: 108235484(aicda)
ALIM: 106520455(aicda)
NWH: 119409964(aicda)
AOCE: 111586370(aicda)
EJA: 138194108(aicda)
BFRE: 138619352(aicda)
MCEP: 125016550(aicda)
CSEM: 103387859(aicda)
POV: 109633057(aicda)
SSEN: 122774628(aicda)
SSOE: 131471752(aicda)
HHIP: 117776956(aicda)
HSP: 118113247(aicda)
PPLT: 128449747(aicda)
SMAU: 118315528(aicda)
LCF: 108887318
SDU: 111230178(aicda)
SLAL: 111669845(aicda)
XGL: 120784028(aicda)
HCQ: 109515270(aicda)
SBIA: 133501050(aicda)
PEE: 133401937(aicda)
PTAO: 133480209(aicda)
BPEC: 110163179(aicda)
ENY: 140374093(aicda)
MALB: 109970232(aicda)
BSPL: 114842970(aicda)
SJO: 128365872(aicda)
SSCO: 133982979(aicda)
GMH: 115554311(aicda)
SASA: 106575151 106576980
STRU: 115165100 115176836
OTW: 112237113
OMY: 118944062
OGO: 123998044
OKI: 109868790 109879275
OKE: 118378355 127914243
OMM: 135523055
OCLA: 139379567
SALP: 111964712 112081092
SNH: 120047719 120047766
CCLU: 121542386(aicda)
ELS: 105019036
OEP: 134023968(aicda)
SFM: 108924694
PKI: 111845806(aicda)
AANG: 118215063(aicda)
AROT: 135240865(aicda)
CCOG: 133131320(aicda)
LOC: 102694057
PSPA: 121302237 121325394(aicda)
ARUT: 117409992 117410177 117424122 117425258 117966747
PSEX: 120534980(aicda)
LCM: 102350911(AICDA)
CPLA: 122545864(aicda)
LERI: 129715418(aicda)
LRJ: 133339037 133357154
CSEC: 117282297
 » show all
Reference
1  [PMID:12799424]
  Authors
Sohail A, Klapacz J, Samaranayake M, Ullah A, Bhagwat AS
  Title
Human activation-induced cytidine deaminase causes transcription-dependent, strand-biased C to U deaminations.
  Journal
Nucleic Acids Res 31:2990-4 (2003)
DOI:10.1093/nar/gkg464
Reference
2  [PMID:17060445]
  Authors
Larijani M, Petrov AP, Kolenchenko O, Berru M, Krylov SN, Martin A
  Title
AID associates with single-stranded DNA with high affinity and a long complex half-life in a sequence-independent manner.
  Journal
Mol Cell Biol 27:20-30 (2007)
DOI:10.1128/MCB.00824-06
Reference
3  [PMID:17889624]
  Authors
Brar SS, Sacho EJ, Tessmer I, Croteau DL, Erie DA, Diaz M
  Title
Activation-induced deaminase, AID, is catalytically active as a monomer on single-stranded DNA.
  Journal
DNA Repair (Amst) 7:77-87 (2008)
DOI:10.1016/j.dnarep.2007.08.002
Reference
4  [PMID:17893327]
  Authors
Larijani M, Martin A
  Title
Single-stranded DNA structure and positional context of the target cytidine determine the enzymatic efficiency of AID.
  Journal
Mol Cell Biol 27:8038-48 (2007)
DOI:10.1128/MCB.01046-07
Reference
5  [PMID:19766322]
  Authors
Verma S, Goldammer T, Aitken R
  Title
Cloning and expression of activation induced cytidine deaminase from Bos taurus.
  Journal
Vet Immunol Immunopathol 134:151-9 (2010)
DOI:10.1016/j.vetimm.2009.08.016
  Sequence
[bta:539888]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 3.5.4.38
IUBMB Enzyme Nomenclature: 3.5.4.38
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 3.5.4.38
BRENDA, the Enzyme Database: 3.5.4.38
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system