KEGG   ENZYME: 5.3.1.3
Entry
EC 5.3.1.3                  Enzyme                                 
Name
D-arabinose isomerase;
D-arabinose(L-fucose) isomerase;
L-fucose isomerase;
D-arabinose ketol-isomerase;
arabinose isomerase (misleading)
Class
Isomerases;
Intramolecular oxidoreductases;
Interconverting aldoses and ketoses, and related compounds
Sysname
D-arabinose aldose-ketose-isomerase
Reaction(IUBMB)
D-arabinose = D-ribulose [RN:R01577]
Reaction(KEGG)
R01577;
(other) R03163
Substrate
D-arabinose [CPD:C00216]
Product
D-ribulose [CPD:C00309]
Comment
Requires a divalent metal ion (the enzyme from the bacterium Escherichia coli prefers Mn2+). The enzyme binds the closed form of the sugar and catalyses ring opening to generate a form of open-chain conformation that facilitates the isomerization reaction, which proceeds via an ene-diol mechanism [3]. The enzyme catalyses the aldose-ketose isomerization of several sugars. Most enzymes also catalyse the reaction of EC 5.3.1.25, L-fucose isomerase [3]. The enzyme from the bacterium Falsibacillus pallidus also converts D-altrose to D-psicose [4]. cf. EC 5.3.1.4, L-arabinose isomerase.
History
EC 5.3.1.3 created 1961, modified 2013
Pathway
ec00040  Pentose and glucuronate interconversions
Orthology
K01818  L-fucose/D-arabinose isomerase
Genes
ECO: b2802(fucI)
ECJ: JW2773(fucI)
ECD: ECDH10B_2971(fucI)
EBW: BWG_2540(fucI)
ECOK: ECMDS42_2307(fucI)
ECOC: C3026_15405(fucI)
ECE: Z4119(fucI)
ECS: ECs_3662(fucI)
ECF: ECH74115_4066(fucI)
ETW: ECSP_3754(fucI)
ELX: CDCO157_3417(fucI)
EOI: ECO111_3527(fucI)
EOJ: ECO26_3872(fucI)
EOH: ECO103_3345(fucI)
ECOO: ECRM13514_3666(fucI)
ECOH: ECRM13516_3530(fucI)
ESL: O3K_05485(fucI)
ESO: O3O_20165(fucI)
ESM: O3M_05530(fucI)
ECK: EC55989_3081(fucI)
ECG: E2348C_3069(fucI)
EOK: G2583_3455(fucI)
ELR: ECO55CA74_16475(fucI)
ELH: ETEC_2992
ECW: EcE24377A_3107(fucI)
EUN: UMNK88_3487(fucI)
ECP: ECP_2785
ENA: ECNA114_2842(fucI)
ECOS: EC958_3072(fucI)
ECV: APECO1_3729(fucI)
ECOA: APECO78_17630(fucI)
ECX: EcHS_A2946(fucI)
ECM: EcSMS35_2943(fucI)
ECY: ECSE_3062
ECR: ECIAI1_2912(fucI)
ECQ: ECED1_3255(fucI)
EUM: ECUMN_3131(fucI)
ECT: ECIAI39_3224(fucI)
EOC: CE10_3229(fucI)
EBR: ECB_02653(fucI)
ECOB: C3029_17980(fucI)
EBL: ECD_02653(fucI)
EBE: B21_02614(fucI)
EBD: ECBD_0920
ECI: UTI89_C3174(fucI)
EIH: ECOK1_3178(fucI)
ECZ: ECS88_3071(fucI)
ECC: c3371(fucI)
ELO: EC042_3001(fucI)
ELN: NRG857_13725(fucI)
ESE: ECSF_2593
ECL: EcolC_0910
EKO: EKO11_0966
EKF: KO11_08945(fucI)
EAB: ECABU_c30720(fucI)
EDH: EcDH1_0886
EDJ: ECDH1ME8569_2712(fucI)
ELU: UM146_02555(fucI)
ELW: ECW_m3012(fucI)
ELL: WFL_14715(fucI)
ELC: i14_3095(fucI)
ELD: i02_3095(fucI)
ELP: P12B_c2901(fucI)
ELF: LF82_0770(fucI)
ECOL: LY180_14240(fucI)
ECOI: ECOPMV1_03059(fucI)
ECOJ: P423_15320(fucI)
EAL: EAKF1_ch3211c(fucI)
EMA: C1192_21640(fucI)
ESZ: FEM44_03910(fucI)
STY: STY3116(fucI)
STT: t2884(fucI)
SEX: STBHUCCB_30430
SENT: TY21A_14590(fucI)
STM: STM2976(fucI)
SEO: STM14_3590(fucI)
SEV: STMMW_29391
SEY: SL1344_2956(fucI)
SEM: STMDT12_C30280(fucI)
SEJ: STMUK_2964(fucI)
SEB: STM474_3122(fucI)
SEF: UMN798_3235(fucI)
SETU: STU288_15055(fucI)
SETC: CFSAN001921_02190(fucI)
SENR: STMDT2_28771(fucI)
SEND: DT104_29741(fucI)
SENI: CY43_15525(fucI)
SEEN: SE451236_20975(fucI)
SPT: SPA2840(fucI)
SEK: SSPA2646
SPQ: SPAB_03704
SEI: SPC_3035(fucI)
SEC: SCH_2916(fucI)
SEH: SeHA_C3186(fucI)
SHB: SU5_03466
SENH: CFSAN002069_17340(fucI)
SEEH: SEEH1578_00940(fucI)
SEE: SNSL254_A3201(fucI)
SENN: SN31241_40880
SEW: SeSA_A3138(fucI)
SEA: SeAg_B3121(fucI)
SENS: Q786_14385(fucI)
SED: SeD_A3301(fucI)
SEG: SG2886(fucI)
SEL: SPUL_2986(fucI)
SEGA: SPUCDC_2972(fucI)
SET: SEN2820(fucI)
SENA: AU38_14320(fucI)
SENO: AU37_14330(fucI)
SENV: AU39_14330(fucI)
SENQ: AU40_16135(fucI)
SENL: IY59_14925(fucI)
SENJ: CFSAN001992_18685(fucI)
SEEC: CFSAN002050_21235(fucI)
SEEB: SEEB0189_005245(fucI)
SEEP: I137_14190(fucI)
SENB: BN855_30380(fucI)
SENE: IA1_14320(fucI)
SENC: SEET0819_21745(fucI)
SES: SARI_04686
SALZ: EOS98_04550(fucI)
SFL: SF2816(fucI)
SFX: S3011(fucI)
SFV: SFV_2881(fucI)
SFE: SFxv_3089(fucI)
SFN: SFy_4007
SFS: SFyv_4086
SFT: NCTC1_03096(fucI)
SBO: SBO_2685(fucI)
SDY: SDY_3020(fucI)
SDZ: Asd1617_04054
SHQ: A0259_17615(fucI)
ECLE: ECNIH2_05850(fucI)
ECLI: ECNIH5_04950(fucI)
ECLX: LI66_04850(fucI)
ECLY: LI62_05370(fucI)
ECLZ: LI64_05055(fucI)
ECLO: ENC_23210
EHM: AB284_20035(fucI)
ECLA: ECNIH3_04960(fucI)
ECLC: ECR091_04940(fucI)
ECAN: CWI88_17335
ENS: HWQ15_13435(fucI)
ENK: LOC22_15740(fucI)
KPN: KPN_03153(fucI)
KPU: KP1_4433(fucI)
KPM: KPHS_42340
KPP: A79E_0941
KPH: KPNIH24_07640(fucI)
KPZ: KPNIH27_20490(fucI)
KPV: KPNIH29_21260(fucI)
KPW: KPNIH30_21280(fucI)
KPY: KPNIH31_20545(fucI)
KPG: KPNIH32_22140(fucI)
KPC: KPNIH10_21070(fucI)
KPQ: KPR0928_20555(fucI)
KPT: VK055_4358(fucI)
KPO: KPN2242_18800(fucI)
KPR: KPR_4167(fucI)
KPI: D364_16080(fucI)
KPA: KPNJ1_01076
KPS: KPNJ2_01107
KPX: PMK1_00636(fucI)
KPB: FH42_11795(fucI)
KPNE: KU54_005290(fucI)
KPNU: LI86_05300(fucI)
KPNK: BN49_0959(fucI)
KVA: Kvar_0900
KPE: KPK_0964(fucI)
KPK: A593_05965(fucI)
KVD: KR75_03415
KVQ: SP68_09960
KOX: KOX_01280(fucI)
KOE: A225_4717
KOY: J415_08415(fucI)
KOM: HR38_27400(fucI)
KOK: KONIH1_23695(fucI)
KOC: AB185_12685(fucI)
KQU: AVR78_25585
KQV: B8P98_05305(fucI)
KLL: BJF97_23535
KLW: DA718_05650(fucI)
KAR: LGL98_04800(fucI)
KGR: JJJ10_05675(fucI)
KPAS: LUW96_01360(fucI)
KLC: K7H21_05340(fucI)
KLM: BWI76_22925
KLP: GUC22_04910(fucI)
ROR: RORB6_23515(fucI)
RON: TE10_22730(fucI)
RAO: DSD31_05000(fucI)
RTG: NCTC13098_01323(fucI_1)
CRO: ROD_28471(fucI)
CKO: CKO_04161
CFD: CFNIH1_00970(fucI)
CBRA: A6J81_22040(fucI)
CWE: CO701_03365(fucI)
CYO: CD187_04845(fucI)
CPOT: FOB25_16175(fucI)
CFQ: C2U38_20240(fucI)
CSED: JY391_04480(fucI)
CAMA: F384_15190(fucI)
CAF: AL524_07775(fucI)
CIF: AL515_18615(fucI)
CFAR: CI104_20160(fucI)
CIR: C2U53_14760(fucI)
CIE: AN232_09390(fucI)
CPAR: CUC49_14455(fucI)
CTEL: GBC03_09600(fucI)
CITZ: E4Z61_21460(fucI)
CARS: E1B03_21325(fucI)
CIX: M4I31_04665(fucI)
CIB: HF677_004570(fucI)
CENS: P2W74_04515(fucI)
CITR: GUC46_04650(fucI)
CNT: JT31_11940(fucI)
ESC: Entcl_3381
KLE: AO703_05105(fucI)
KIE: NCTC12125_04897(fucI)
KCY: RIN60_04635(fucI)
LAZ: A8A57_04815
ASUB: NLZ15_06175
YRE: HEC60_15685(fucI)
PSHI: SAMEA2665130_0773(fucI)
SUPE: P0H77_06045(fucI)
EBU: CUC76_20475(fucI)
EBB: F652_3779
YEF: FORC2_3261
YEE: YE5303_24981(fucI)
YAL: AT01_3336(fucI)
YIN: CH53_843(fucI)
YAK: ACZ76_13230(fucI)
YMA: DA391_17720(fucI)
YCA: F0T03_04800(fucI)
YAS: N0H69_04525(fucI)
YKI: HRD70_09070(fucI)
SFO: Z042_19235(fucI)
GQU: AWC35_09890(fucI)
CARU: P0E69_21925
NIG: C1N62_04175
SGL: SG0181
SOD: Sant_3737(fucI)
SLIG: GTU79_25775(fucI)
PAY: PAU_00702(fucI)
PLUI: CE143_20935(fucI)
ETD: ETAF_0252
ETE: ETEE_2045(fucI)
ETR: ETAE_0290(fucI)
ETC: ETAC_01240(fucI)
EDW: QY76_01440(fucI)
EDL: AAZ33_01305
EHO: A9798_15180
HAV: AT03_02805(fucI)
HPAR: AL518_02725(fucI)
OPO: DSM2777_00210(fucI)
HIN: HI_0614
HIT: NTHI0871(fucI)
HIP: CGSHiEE_02050
HIQ: CGSHiGG_07020
HIF: HIBPF_15960
HIL: HICON_06840
HIU: HIB_07420
HIE: R2846_0402(fucI)
HIZ: R2866_1684(fucI)
HIK: HifGL_001603(fucI)
HIA: H733_0496
HIH: NF38_01395(fucI)
HIW: NTHI477_00998(fucI)
HIC: NTHIC486_00795(fucI)
HIX: NTHI723_00954(fucI)
HAEG: NCTC8502_00350(fucI)
HPAA: E5Q53_06035(fucI)
HAP: HAPS_1526(fucI)
HPAZ: K756_10620(fucI)
HPAS: JL26_09155(fucI)
HPAK: JT17_07195(fucI)
GLE: CJD39_09090(fucI)
HSO: HS_1448(fucI)
HSM: HSM_0583
PDAG: 4362423_01534(fucI)
PATL: KGI96_09175(fucI)
MHT: D648_940(fucI)
MHQ: D650_27190(fucI)
MHAT: B824_700(fucI)
MHX: MHH_c06290(fucI)
MHAE: F382_07670(fucI)
MHAM: J450_07360(fucI)
MHAO: J451_08300(fucI)
MHAL: N220_00400(fucI)
MHAQ: WC39_13655(fucI)
MHAY: VK67_13660(fucI)
MVR: X781_370
MVI: X808_20750
MVG: X874_19480
MVE: X875_500
MGRA: A4G16_10470
MBOS: ICJ55_02080(fucI)
MPEG: HV560_02565(fucI)
MANN: GM695_02440(fucI)
APL: APL_1684(fucI)
APJ: APJL_1716(fucI)
APA: APP7_1745(fucI)
APOR: DDU33_03445(fucI)
AIO: EXH44_05445(fucI)
ALIG: NCTC10568_02052(fucI)
AGP: NYR63_09095(fucI)
AGK: NYR60_07725(fucI)
AAZ: ADJ80_04685(fucI)
GAN: UMN179_01237
GSS: NYR30_10970(fucI)
APAG: EIA51_01265(fucI)
AVT: NCTC3438_00412(fucI)
RPNE: NCTC8284_00976(fucI_1)
RHEY: FEE42_05650(fucI)
RHAE: IHV77_08695(fucI)
FCL: A4G17_02250
BHUD: A6A11_00730
PAET: NCTC13378_02020(fucI)
PBAN: AC062_0550
VVY: VV2179
VVM: VVMO6_01069
VVL: VV93_v1c19200(fucI)
VNA: PN96_21540(fucI)
VEJ: VEJY3_21156
VSH: BSZ05_12450
VTA: A1786(fucI)
VSL: LTQ54_23205
AHY: AHML_07125(fucI)
AHR: V428_07345(fucI)
AHP: V429_07350(fucI)
AHJ: V469_16150(fucI)
GDI: GDI2657(fucI)
GDJ: Gdia_0870
CALG: SH580_01880
AMU: Amuc_1832
AGL: PYTT_0473
ABIW: Abiwalacus_19630(fucI)
AMAK: J5W79_11810
LUO: HHL09_10545
LAMB: KBB96_01985
LUI: llg_45120(fucI)
SOA: G3M56_011885
FPES: NXS98_12570
RUL: UC8_10870(fucI)
SMAM: Mal15_20250(fucI)
SNEP: Enr13x_55710(fucI)
AMOB: HG15A2_42280(fucI)
PLH: VT85_19500(fucI)
CCOP: Mal65_51610(fucI)
PBOR: BSF38_01279(fucI)
AGV: OJF2_08520(fucI)
PBU: L21SP3_01499(fucI)
PBP: STSP1_01497(fucI)
PBAS: SMSP2_02093(fucI)
ALUS: STSP2_02455(fucI)
TAER: GT409_08110 GT409_08215
VBC: C5Q97_02135
TBE: Trebr_0126
STQ: Spith_0427
OCK: EXM22_17670
SBU: SpiBuddy_2238
SGP: SpiGrapes_2577
SASS: MUG09_12335
SCC: Spico_1665
TAZ: TREAZ_3084(fucI)
SCD: Spica_2242
BHC: JFL75_13265
BRM: Bmur_2489
BPO: BP951000_0132
BPJ: B2904_orf1424
BPIP: BPP43_02430(fucI)
BPW: WESB_1306
BIP: Bint_1824
ABAC: LuPra_05002(fucI)
LUB: TBR22_A39400
BTH: BT_1273
BTHO: Btheta7330_01956(fucI)
BFR: BF0253
BFS: BF9343_0209(fucI)
BFG: BF638R_0265(fucI)
BFB: VU15_00605(fucI)
BHL: Bache_2995
BXY: BXY_00350
BOA: Bovatus_01281(fucI)
BCEL: BcellWH2_03053(fucI_1) BcellWH2_05278(fucI_2)
BCAC: CGC64_09830(fucI)
BIS: DXK01_004665 DXK01_015470(fucI)
BUN: Bun01g_08170(fucI)
BEG: INE88_01873(fucI)
BFE: K6V30_19480(fucI)
BNO: K8P02_19455(fucI)
BFC: BacF7301_20945(fucI)
BSAL: K6V25_05170(fucI)
BFIN: BFINE_31210
BVU: BVU_1373
BDO: EL88_01240(fucI)
BDH: GV66_04575(fucI)
PCOP: I6J50_11140(fucI)
PBT: ING2E5B_2254(fucI)
PMUC: ING2E5A_2964(fucI)
PET: PEIBARAKI_4033 PEIBARAKI_4378
PSAC: PSM36_0006(fucI1) PSM36_3369(fucI3)
PROJ: KDN43_04495(fucI)
DYS: G7050_15055
DYH: G7051_15490
TFO: BFO_0306(fucI)
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