KEGG   COMPOUND: C01764
Entry
C01764                      Compound                               

Name
tRNA containing uridine at position 54;
tRNA UpsiC
Formula
C9H13N2O9P(C5H8O6PR)n(C5H8O6PR)n
Structure
Comment
Generic compound in reaction hierarchy
uridine (U) at position 54, pseudouridine (psi) at position 55 and cytidine (C) at position 56
Reaction
Enzyme
2.1.1.35        2.1.1.74
Other DBs
PubChem: 4897
LinkDB
KCF data

ATOM        47
            1   C1y C    18.3400  -23.3100
            2   C1y C    19.7400  -23.3100
            3   C1y C    20.1600  -21.9800
            4   C1y C    19.0400  -21.1400
            5   O2x O    17.9200  -21.9800
            6   O2b O    20.7200  -24.2900
            7   C1b C    17.1500  -24.0100
            8   R   R    18.3400  -19.9500
            9   O2b O    15.7500  -24.0100
            10  P1b P    14.3500  -24.0100
            11  O1c O    14.3500  -25.4100
            12  O1c O    14.3500  -22.6100
            13  O1c O    12.9500  -24.0100
            14  C1y C    27.6500  -23.5900
            15  C1y C    29.0500  -23.5900
            16  C1y C    29.4700  -22.2600
            17  C1y C    28.3500  -21.4200
            18  O2x O    27.2300  -22.2600
            19  O2b O    29.8200  -24.4300
            20  C1b C    26.4600  -24.2900
            21  O2b O    25.0600  -24.2900
            22  P1b P    23.6600  -24.2900
            23  O1c O    23.6600  -25.6900
            24  O1c O    23.6600  -22.8900
            25  C1y C    36.3300  -23.7300
            26  C1y C    37.7300  -23.7300
            27  C1y C    38.1500  -22.4000
            28  C1y C    37.0300  -21.5600
            29  O2x O    35.9100  -22.4000
            30  O1a O    38.7100  -24.7100
            31  C1b C    35.1400  -24.4300
            32  R   R    36.3300  -20.3700
            33  O2b O    33.7400  -24.4300
            34  P1b P    32.3400  -24.4300
            35  O1c O    32.3400  -25.8300
            36  O1c O    32.3400  -23.0300
            37  O1a O    21.1499  -20.9901
            38  O1a O    30.4599  -21.2701
            39  O1a O    39.1399  -21.4101
            40  C8x C    26.5300  -17.7800
            41  C8x C    26.5300  -19.1800
            42  N4y N    27.7424  -19.8800
            43  C8y C    28.9549  -19.1800
            44  N4x N    28.9549  -17.7800
            45  C8y C    27.7424  -17.0800
            46  O5x O    30.1673  -19.8800
            47  O5x O    27.7424  -15.6800
BOND        50
            1     1   2 1
            2     2   3 1
            3     3   4 1
            4     4   5 1
            5     1   5 1
            6     2   6 1 #Down
            7     1   7 1 #Up
            8     4   8 1 #Up
            9     7   9 1
            10    9  10 1
            11   10  11 2
            12   10  12 1
            13   10  13 1
            14   14  15 1
            15   15  16 1
            16   16  17 1
            17   17  18 1
            18   14  18 1
            19   15  19 1 #Down
            20   14  20 1 #Up
            21   20  21 1
            22   21  22 1
            23   22  23 2
            24   22  24 1
            25   22   6 1
            26   25  26 1
            27   26  27 1
            28   27  28 1
            29   28  29 1
            30   25  29 1
            31   26  30 1 #Down
            32   25  31 1 #Up
            33   28  32 1 #Up
            34   31  33 1
            35   33  34 1
            36   34  35 2
            37   34  36 1
            38   34  19 1
            39    3  37 1 #Down
            40   16  38 1 #Down
            41   27  39 1 #Down
            42   40  41 2
            43   41  42 1
            44   42  43 1
            45   43  44 1
            46   44  45 1
            47   40  45 1
            48   43  46 2
            49   45  47 2
            50   17  42 1 #Up
BRACKET     1    14.0000  -26.6700   14.0000  -19.3200
            1    22.1200  -19.3200   22.1200  -26.6700
            1  n
 ORIGINAL  1    1   2   3   4   5   6   7   8   9  10  11  12  38
 REPEAT    1
            2    31.9900  -27.0900   31.9900  -19.7400
            2    40.1100  -19.7400   40.1100  -27.0900
            2  n
 ORIGINAL  2   25  26  27  28  29  30  31  32  33  34  35  36  40
 REPEAT    2

» Japanese version

DBGET integrated database retrieval system