KEGG   COMPOUND: C21031
Entry
C21031                      Compound                               
Name
5-Hydroxymethylcytosine in DNA;
DNA 5-hydroxymethylcytosine
Formula
C10H16N3O8P(C5H8O5PR)n(C5H8O5PR)n
Structure
Comment
Generic compound in reaction hierarchy
Reaction
Enzyme
1.14.11.80      2.7.7.7
Other DBs
PubChem: 254816256
LinkDB
KCF data

ATOM        46
            1   C1y C    10.7800  -18.0600
            2   C1y C    12.1800  -18.0600
            3   C1x C    12.6000  -16.7300
            4   C1y C    11.4800  -15.8900
            5   O2x O    10.3600  -16.7300
            6   O2b O    13.1600  -19.0400
            7   C1b C     9.5900  -18.7600
            8   R   R    10.7800  -14.7000
            9   O2b O     8.1900  -18.7600
            10  P1b P     6.7900  -18.7600
            11  O1c O     6.7900  -20.1600
            12  O1c O     6.7900  -17.3600
            13  O1c O     5.3900  -18.7600
            14  C1y C    19.1800  -18.3400
            15  C1y C    20.5800  -18.3400
            16  C1x C    21.0000  -17.0100
            17  C1y C    19.8800  -16.1700
            18  O2x O    18.7600  -17.0100
            19  O2b O    21.3500  -19.1800
            20  C1b C    17.9900  -19.0400
            21  O2b O    16.5900  -19.0400
            22  P1b P    15.1900  -19.0400
            23  O1c O    15.1900  -20.4400
            24  O1c O    15.1900  -17.6400
            25  C1y C    27.8600  -18.4800
            26  C1y C    29.2600  -18.4800
            27  C1x C    29.6800  -17.1500
            28  C1y C    28.5600  -16.3100
            29  O2x O    27.4400  -17.1500
            30  O1a O    30.2400  -19.4600
            31  C1b C    26.6700  -19.1800
            32  R   R    27.8600  -15.1200
            33  O2b O    25.2700  -19.1800
            34  P1b P    23.8700  -19.1800
            35  O1c O    23.8700  -20.5800
            36  O1c O    23.8700  -17.7800
            37  N4y N    19.8800  -14.7700
            38  C8x C    21.0924  -14.0700
            39  C8y C    21.0924  -12.6700
            40  C8y C    19.8800  -11.9700
            41  N5x N    18.6676  -12.6700
            42  C8y C    18.6676  -14.0700
            43  O5x O    17.4551  -14.7700
            44  N1a N    19.8800  -10.5700
            45  C1b C    22.3048  -11.9700
            46  O1a O    23.5360  -12.6810
BOND        49
            1     1   2 1
            2     2   3 1
            3     3   4 1
            4     4   5 1
            5     1   5 1
            6     2   6 1 #Down
            7     1   7 1 #Up
            8     4   8 1 #Up
            9     7   9 1
            10    9  10 1
            11   10  11 2
            12   10  12 1
            13   10  13 1
            14   14  15 1
            15   15  16 1
            16   16  17 1
            17   17  18 1
            18   14  18 1
            19   15  19 1 #Down
            20   14  20 1 #Up
            21   20  21 1
            22   21  22 1
            23   22  23 2
            24   22  24 1
            25   22   6 1
            26   25  26 1
            27   26  27 1
            28   27  28 1
            29   28  29 1
            30   25  29 1
            31   26  30 1 #Down
            32   25  31 1 #Up
            33   28  32 1 #Up
            34   31  33 1
            35   33  34 1
            36   34  35 2
            37   34  36 1
            38   34  19 1
            39   17  37 1 #Up
            40   37  38 1
            41   38  39 2
            42   39  40 1
            43   40  41 2
            44   41  42 1
            45   37  42 1
            46   42  43 2
            47   40  44 1
            48   39  45 1
            49   45  46 1
BRACKET     1     6.4400  -21.4200    6.4400  -14.0700
            1    13.4400  -14.0700   13.4400  -21.4200
            1  n
 ORIGINAL  1    1   2   3   4   5   6   7   8   9  10  11  12
 REPEAT    1
            2    23.5200  -21.8400   23.5200  -14.4900
            2    30.5900  -14.4900   30.5900  -21.8400
            2  n
 ORIGINAL  2   25  26  27  28  29  30  31  32  33  34  35  36
 REPEAT    2

» Japanese version

DBGET integrated database retrieval system