KEGG   ORTHOLOGY: K01813
Entry
K01813                      KO                                     
Symbol
rhaA
Name
L-rhamnose isomerase [EC:5.3.1.14]
Pathway
map00051  Fructose and mannose metabolism
map01100  Metabolic pathways
map01120  Microbial metabolism in diverse environments
Reaction
R02437  L-rhamnose ketol-isomerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00051 Fructose and mannose metabolism
    K01813  rhaA; L-rhamnose isomerase
Enzymes [BR:ko01000]
 5. Isomerases
  5.3  Intramolecular oxidoreductases
   5.3.1  Interconverting aldoses and ketoses, and related compounds
    5.3.1.14  L-rhamnose isomerase
     K01813  rhaA; L-rhamnose isomerase
Other DBs
COG: COG4806
GO: 0008740
Genes
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 » show all
Reference
PMID:10891278
  Authors
Korndorfer IP, Fessner WD, Matthews BW
  Title
The structure of rhamnose isomerase from Escherichia coli and its relation with xylose isomerase illustrates a change between inter and intra-subunit complementation during evolution.
  Journal
J Mol Biol 300:917-33 (2000)
DOI:10.1006/jmbi.2000.3896
  Sequence
[eco:b3903]
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K01820
Entry
K01820                      KO                                     
Symbol
rhaA
Name
L-rhamnose isomerase / sugar isomerase [EC:5.3.1.14 5.3.1.-]
Pathway
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map00051  Fructose and mannose metabolism
map01100  Metabolic pathways
map01120  Microbial metabolism in diverse environments
Reaction
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R06589  
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00040 Pentose and glucuronate interconversions
    K01820  rhaA; L-rhamnose isomerase / sugar isomerase
   00051 Fructose and mannose metabolism
    K01820  rhaA; L-rhamnose isomerase / sugar isomerase
Enzymes [BR:ko01000]
 5. Isomerases
  5.3  Intramolecular oxidoreductases
   5.3.1  Interconverting aldoses and ketoses, and related compounds
    5.3.1.14  L-rhamnose isomerase
     K01820  rhaA; L-rhamnose isomerase / sugar isomerase
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NCG: KGD84_18085(rhaI)
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SNAH: OUQ99_13765(rhaI)
SAIU: J4H86_09645(rhaI)
ACTW: F7P10_04095(rhaI)
ACIR: OG979_33280(rhaI)
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SPIQ: OHA34_08920(rhaI)
ACTQ: OG417_21530(rhaI) OG417_38095(rhaI)
SRO: Sros_0428
NOA: BKM31_05125
NOW: GBF35_33365(rhaI)
NCX: Nocox_27220(xylA2)
NGN: LCN96_36505(rhaI)
NFS: OIE67_12100(rhaI)
FRE: Franean1_4673
FRI: FraEuI1c_3902
NAKA: H7F38_02010(rhaI)
BMON: ABDB74_11005(rhaI)
MMAR: MODMU_5485(rhaA)
KRA: Krad_1387
SEN: SACE_4105(xylA)
AMD: AMED_4544(rhaA)
AMN: RAM_23140
AMM: AMES_4489(rhaA)
AMZ: B737_4489(rhaA)
AMQ: AMETH_2138(rhaA)
AAB: A4R43_22580
AMYY: YIM_06185(xylA1)
AORI: SD37_16560
AACD: LWP59_19355(rhaI)
APRT: MUY14_14325(rhaI)
ATHM: L1857_13245(rhaI)
ARHD: VSH64_11055(rhaI)
AMOG: QRX60_37050(rhaI)
ACYN: ORV05_35975(rhaI)
AMYZ: HUW46_08200(xylA)
ACAB: QRX50_34715(rhaI)
ANW: QP939_40915(rhaI)
AMYD: K1T34_42880(rhaI)
ABAR: AMYBAR_003403(rhaI) AMYBAR_003590(rhaI) AMYBAR_007106(rhaI)
PSEE: FRP1_02890
PSEQ: AD006_10500
PECQ: AD017_18330
PSDS: K1T35_15020(rhaI)
APRE: CNX65_15460(rhaI)
AMI: Amir_3045
SSYI: EKG83_27390(rhaI) EKG83_32160(rhaI)
KAL: KALB_5831
KUT: JJ691_43750(rhaA)
KBR: Q4V65_41400(rhaI)
KPHY: AOZ06_20890
LED: BBK82_39170
AHM: TL08_20740
ACTI: UA75_24360
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ACTA: C1701_16090(rhaI)
PMAD: BAY61_29865
CROS: N8J89_25245(rhaI)
ACTY: OG774_17690(rhaI)
UME: RM788_41690(rhaI)
MHAW: RMN56_29810(rhaI)
ASE: ACPL_2450(rhaI)
AMS: AMIS_37470
ACTS: ACWT_2323
AIH: Aiant_70360
ACTR: Asp14428_40490(rhaA)
ACTL: L3i22_026820 L3i22_079080(rhaA)
ASIC: Q0Z83_058630(rhaI)
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ACTE: ACTI_56060 ACTI_57780(rhaA)
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ASG: FB03_06695
ATIM: CYJ17_0002355(rhaI)
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ACTZ: CWT12_02050(rhaI)
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AREP: ID810_11210(rhaI)
AMAS: QU670_12935(rhaI)
AUO: R3I39_06740(rhaI)
ALIL: D5R93_11855(rhaI)
PHON: BH719_03420
AEY: CDG81_11935(rhaI)
PLAK: A1s21155_06825
PVS: A1sIA79_06460
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DAH: DAETH_40250
DTAE: LAJ19_15645(rhaI)
DSC: ABOD76_20960(rhaI)
TRA: Trad_2967
MSV: Mesil_2856
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THZ: CELL2_08710
THR: TRQ7_08955
ASAC: ATHSA_0241
AG: BAD14073(L-RhI)
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Reference
PMID:20809285
  Authors
Park CS, Yeom SJ, Lim YR, Kim YS, Oh DK
  Title
Characterization of a recombinant thermostable L: -rhamnose isomerase from Thermotoga maritima ATCC 43589 and its application in the production of L-lyxose and L-mannose.
  Journal
Biotechnol Lett 32:1947-53 (2010)
DOI:10.1007/s10529-010-0385-7
  Sequence
[tma:TM1071]
LinkDB

KEGG   ENZYME: 5.3.1.14
Entry
EC 5.3.1.14                 Enzyme                                 
Name
L-rhamnose isomerase;
rhamnose isomerase;
L-rhamnose ketol-isomerase
Class
Isomerases;
Intramolecular oxidoreductases;
Interconverting aldoses and ketoses, and related compounds
Sysname
L-rhamnose aldose-ketose-isomerase
Reaction(IUBMB)
L-rhamnopyranose = L-rhamnulose [RN:R02437]
Reaction(KEGG)
R02437
Substrate
L-rhamnopyranose [CPD:C00507]
Product
L-rhamnulose [CPD:C00861]
Comment
Contains two divalent metal ions located at different metal-binding sites within the active site. The enzyme binds the closed ring form of the substrate and catalyses ring opening to generate a form of open-chain conformation that is coordinated to one of the metal sites. Isomerization proceeds via a hydride-shift mechanism. While the enzyme from the bacterium Escherichia coli is specific for L-rhamnose, the enzyme from the bacterium Pseudomonas stutzeri has broad substrate specificity and catalyses the interconversion of L-mannose and L-fructose, L-lyxose and L-xylulose, D-ribose and D-ribulose, and D-allose and D-psicose [2].
History
EC 5.3.1.14 created 1965
Pathway
ec00051  Fructose and mannose metabolism
ec01100  Metabolic pathways
ec01120  Microbial metabolism in diverse environments
Orthology
K01813  L-rhamnose isomerase
K01820  L-rhamnose isomerase / sugar isomerase
Genes
ECO: b3903(rhaA)
ECJ: JW5561(rhaA)
ECD: ECDH10B_4093(rhaA)
EBW: BWG_3573(rhaA)
ECOK: ECMDS42_3342(rhaA)
ECOC: C3026_21100
ECE: Z5447(rhaA)
ECS: ECs_4830(rhaA)
ECF: ECH74115_5355(rhaA)
ETW: ECSP_4964(rhaA)
ELX: CDCO157_4569
EOI: ECO111_4727(rhaA)
EOJ: ECO26_4682(rhaA)
EOH: ECO103_4624(rhaA)
ECOO: ECRM13514_4971(rhaA)
ECOH: ECRM13516_4751(rhaA)
ESL: O3K_24350
ESO: O3O_00990
ESM: O3M_24270
ECK: EC55989_4381(rhaA)
ECG: E2348C_4208(rhaA)
EOK: G2583_4708(rhaA)
ELR: ECO55CA74_22560
ELH: ETEC_4173
ECW: EcE24377A_4434(rhaA)
EUN: UMNK88_4739(rhaA)
ECP: ECP_4113
ENA: ECNA114_4001(rhaA)
ECOS: EC958_4386(rhaA)
ECV: APECO1_2565(rhaA)
ECOA: APECO78_00270
ECX: EcHS_A4132(rhaA)
ECM: EcSMS35_4294(rhaA)
ECY: ECSE_4191
ECR: ECIAI1_4108(rhaA)
ECQ: ECED1_4604(rhaA)
EUM: ECUMN_4431(rhaA)
ECT: ECIAI39_3092(rhaA)
EOC: CE10_4570(rhaA)
EBR: ECB_03789(rhaA)
ECOB: C3029_01130
EBL: ECD_03789(rhaA)
EBE: B21_03738(rhaA)
EBD: ECBD_4121
ECI: UTI89_C4486(rhaA)
EIH: ECOK1_4370(rhaA)
ECZ: ECS88_4350(rhaA)
ECC: c4852(rhaA)
ELO: EC042_4276(rhaA)
ELN: NRG857_19480
ESE: ECSF_3764
ECL: EcolC_4114
EKF: KO11_03065(rhaA)
EAB: ECABU_c44080(rhaA)
EDH: EcDH1_4081
EDJ: ECDH1ME8569_3773(rhaA)
ELU: UM146_19740
ELW: ECW_m4212(rhaA)
ELL: WFL_20525(rhaA)
ELC: i14_4446(rhaA)
ELD: i02_4446(rhaA)
ELP: P12B_c4020(rhaA)
ELF: LF82_1864(rhaA)
ECOL: LY180_20250
ECOI: ECOPMV1_04263(rhaA)
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EFE: EFER_3868(rhaA)
EMA: C1192_17715(rhaA)
ESZ: FEM44_11180(rhaA)
ERUY: OSH18_13815(rhaA)
ESF: ACK8NJ_22775(rhaA)
STY: STY3827
STT: t3573(rhaA)
SEX: STBHUCCB_37590
SENT: TY21A_18060
STM: STM4046(rhaA)
SEO: STM14_4865(rhaA)
SEV: STMMW_40111
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SEM: STMDT12_C41920
SEJ: STMUK_4031(rhaA)
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SEF: UMN798_4387(rhaA)
SETU: STU288_20375
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SENR: STMDT2_39091(rhaA)
SEND: DT104_40541(rhaA)
SENI: CY43_21155
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SPT: SPA3889(rhaA)
SEK: SSPA3617
SPQ: SPAB_05012
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ACIR: OG979_33280(rhaI)
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AMN: RAM_23140
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ABAR: AMYBAR_003403(rhaI) AMYBAR_003590(rhaI) AMYBAR_007106(rhaI)
PSEE: FRP1_02890
PSEQ: AD006_10500
PECQ: AD017_18330
PSDS: K1T35_15020(rhaI)
APRE: CNX65_15460(rhaI)
AMI: Amir_3045
SSYI: EKG83_27390(rhaI) EKG83_32160(rhaI)
KAL: KALB_5831
KUT: JJ691_43750(rhaA)
KBR: Q4V65_41400(rhaI)
KPHY: AOZ06_20890
LED: BBK82_39170
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ACTI: UA75_24360
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ACTA: C1701_16090(rhaI)
PMAD: BAY61_29865
CROS: N8J89_25245(rhaI)
ACTY: OG774_17690(rhaI)
UME: RM788_41690(rhaI)
MHAW: RMN56_29810(rhaI)
ASE: ACPL_2450(rhaI)
AMS: AMIS_37470
ACTS: ACWT_2323
AIH: Aiant_70360
ACTR: Asp14428_40490(rhaA)
ACTL: L3i22_026820 L3i22_079080(rhaA)
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AOU: ACTOB_002455(rhaI)
ACTE: ACTI_56060 ACTI_57780(rhaA)
AFS: AFR_03240
PLAB: C6361_30040(rhaI)
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PFLA: Pflav_090060
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PRY: Prubr_63510(rhaA)
CATI: CS0771_58140(rhaA)
DVC: Dvina_43340(rhaI)
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Reference
1  [PMID:14095156]
  Authors
DOMAGK GF, ZECH R.
  Title
[ON THE DECOMPOSITION OF DESOXY SUGARS BY BACTERIAL ENZYMES. I. L-RHAMNOSE ISOMERASE FROM LACTOBACILLUS PLANTARUM.]
  Journal
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Reference
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  Authors
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  Title
Cloning, nucleotide sequence, and overexpression of the L-rhamnose isomerase gene from Pseudomonas stutzeri in Escherichia coli.
  Journal
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DOI:10.1128/AEM.70.6.3298-3304.2004
  Sequence
[ag:BAD14073]
Reference
3  [PMID:10891278]
  Authors
Korndorfer IP, Fessner WD, Matthews BW
  Title
The structure of rhamnose isomerase from Escherichia coli and its relation with xylose isomerase illustrates a change between inter and intra-subunit complementation during evolution.
  Journal
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  Sequence
[eco:b3903]
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  Authors
Yoshida H, Yamada M, Ohyama Y, Takada G, Izumori K, Kamitori S
  Title
The structures of L-rhamnose isomerase from Pseudomonas stutzeri in complexes with L-rhamnose and D-allose provide insights into broad substrate specificity.
  Journal
J Mol Biol 365:1505-16 (2007)
DOI:10.1016/j.jmb.2006.11.004
  Sequence
[ag:BAD14073]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 5.3.1.14
IUBMB Enzyme Nomenclature: 5.3.1.14
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 5.3.1.14
BRENDA, the Enzyme Database: 5.3.1.14
CAS: 9023-84-1
LinkDB

KEGG   REACTION: R02437
Entry
R02437                      Reaction                               
Name
L-rhamnose ketol-isomerase
Definition
L-Rhamnose <=> L-Rhamnulose
Equation
C00507 <=> C00861
Reaction class
RC00434  C00507_C00861
Enzyme
5.3.1.14
Pathway
rn00051  Fructose and mannose metabolism
rn01100  Metabolic pathways
rn01120  Microbial metabolism in diverse environments
Brite
Enzymatic reactions [BR:br08201]
 5. Isomerase reactions
  5.3  Intramolecular oxidoreductases
   5.3.1  Interconverting aldoses and ketoses, and related compounds
    5.3.1.14
     R02437  L-Rhamnose <=> L-Rhamnulose
Orthology
K01813  L-rhamnose isomerase [EC:5.3.1.14]
K01820  L-rhamnose isomerase / sugar isomerase [EC:5.3.1.14 5.3.1.-]
Other DBs
RHEA: 23163
LinkDB

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