KEGG   ORTHOLOGY: K11685
Entry
K11685                      KO                                     
Symbol
stpA
Name
DNA-binding protein StpA
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03036 Chromosome and associated proteins
    K11685  stpA; DNA-binding protein StpA
Chromosome and associated proteins [BR:ko03036]
 Prokaryotic type
  Nucleoid associated proteins
   HNS (histone-like nucleoid structuring protein)
    K11685  stpA; DNA-binding protein StpA
Other DBs
COG: COG2916
Genes
ECO: b2669(stpA)
ECJ: JW2644(stpA)
ECD: ECDH10B_2836(stpA)
EBW: BWG_2412(stpA)
ECOK: ECMDS42_2173(stpA)
ECOC: C3026_14710
ECE: Z3968(stpA)
ECS: ECs_3530(stpA)
ECF: ECH74115_3911(stpA)
ETW: ECSP_3614(stpA)
ELX: CDCO157_3291 CDCO157_B0018(stpA)
EOI: ECO111_3393(stpA)
EOJ: ECO26_3738(stpA)
EOH: ECO103_3210(stpA)
ECOO: ECRM13514_3507(stpA)
ECOH: ECRM13516_3373(stpA)
ESL: O3K_06205
ESO: O3O_19440
ESM: O3M_06250
ECK: EC55989_2937(stpA)
ECG: E2348C_2932(stpA)
EOK: G2583_3315(stpA)
ELR: ECO55CA74_15790
ELH: ETEC_2866
ECW: EcE24377A_2949(stpA)
EUN: UMNK88_3338
ECP: ECP_2632
ENA: ECNA114_2700(stpA)
ECOS: EC958_2933(stpA)
ECV: APECO1_3853(stpA)
ECOA: APECO78_16935
ECX: EcHS_A2804(stpA)
ECM: EcSMS35_2789(stpA)
ECY: ECSE_2922
ECR: ECIAI1_2765(stpA)
ECQ: ECED1_3122(stpA)
EUM: ECUMN_2993(stpA)
ECT: ECIAI39_2857(stpA)
EOC: CE10_3087(stpA)
EBR: ECB_02525(stpA)
ECOB: C3029_17305
EBL: ECD_02525(stpA)
EBE: B21_02489(stpA)
EBD: ECBD_1050
ECI: UTI89_C3025(stpA)
EIH: ECOK1_3035(stpA)
ECZ: ECS88_2933(stpA)
ECC: c3218(stpA)
ELO: EC042_2865(stpA)
ELN: NRG857_13065
ESE: ECSF_2466
ECL: EcolC_1037
EKF: KO11_09660(stpA)
EAB: ECABU_c29330(stpA)
EDH: EcDH1_1014
EDJ: ECDH1ME8569_2585(stpA)
ELU: UM146_03245
ELW: ECW_m2866(stpA)
ELL: WFL_14005(stpA)
ELC: i14_2948(stpA)
ELD: i02_2948(stpA)
ELP: P12B_c2777(stpA)
ELF: LF82_2194(stpA)
ECOL: LY180_13520
ECOI: ECOPMV1_02921(stpA)
ECOJ: P423_14620
EFE: EFER_0403(stpA)
EAL: EAKF1_ch3329(stpA)
EMA: C1192_22345
ESZ: FEM44_03165(stpA)
ERUY: OSH18_18335(stpA)
STY: STY2920
STT: t2695(stpA)
SEX: STBHUCCB_28390
SENT: TY21A_13660
STM: STM2799(stpA)
SEO: STM14_3377(stpA)
SEV: STMMW_27661
SEY: SL1344_2783(stpA)
SEM: STMDT12_C28530
SEJ: STMUK_2788(stpA)
SEB: STM474_2935
SEF: UMN798_3040(stpA)
SETU: STU288_14170
SETC: CFSAN001921_03080
SENR: STMDT2_27041(stpA)
SEND: DT104_28011(stpA)
SENI: CY43_14635
SEEN: SE451236_20095
SPT: SPA2657(stpA)
SEK: SSPA2478
SPQ: SPAB_03476
SEI: SPC_2843(stpA)
SEC: SCH_2732(stpA)
SEH: SeHA_C2980
SHB: SU5_03284 SU5_p004
SENH: CFSAN002069_18270 CFSAN002069_23615
SEEH: SEEH1578_22810
SEE: SNSL254_A2997
SENN: SN31241_38900
SEW: SeSA_A2945 SeSA_B0122
SEA: SeAg_A0019 SeAg_B2913
SENS: Q786_13450
SED: SeD_A3102
SET: SEN2643(stpA)
SENA: AU38_13415
SENO: AU37_13425
SENV: AU39_13425
SENQ: AU40_15105
SENL: IY59_14010
SENJ: CFSAN001992_19520
SEEC: CFSAN002050_01290 CFSAN002050_20285
SEEB: SEEB0189_006175
SENB: BN855_28360
SENE: IA1_13370
SENC: SEET0819_20810
SES: SARI_00173
SBG: SBG_2424(stpA)
SBZ: A464_2822
SBV: N643_11835
SALZ: EOS98_05540(stpA)
SFL: SF2697(stpA)
SFX: S2883(stpA)
SFV: SFV_2834(stpA)
SFE: SFxv_2959(stpA)
SFN: SFy_3831
SFS: SFyv_3911
SFT: NCTC1_02966(stpA)
SSN: SSON_2813(stpA)
SBO: SBO_2850(stpA)
SBC: SbBS512_E3212(stpA)
SDY: SDY_2859(stpA)
SDZ: Asd1617_03840
SHQ: A0259_16940
SHIG: LXH19_05615(stpA)
ENC: ECL_04007
ENL: A3UG_17580
ECLG: EC036_34310
ECLE: ECNIH2_17745 ECNIH2_25750
ECLN: ECNIH4_05395 ECNIH4_22815
ECLI: ECNIH5_16525
ECLX: LI66_17410
ECLY: LI62_18890
ECLZ: LI64_16255 LI64_23795 LI64_23835
ECLO: ENC_29180
EHM: AB284_08360
EXF: BFV63_17030
ECLA: ECNIH3_16605 ECNIH3_23225
ECLC: ECR091_16540
EAU: DI57_01930
EKB: BFV64_18065
ENO: ECENHK_17295
EEC: EcWSU1_03483(stpA)
ELG: BH714_22330
ECAN: CWI88_05060
ERN: BFV67_17060 BFV67_22295
ECLS: LI67_024780
ECHG: FY206_19005(stpA)
ESH: C1N69_17750
EPT: HWQ17_18700(stpA)
ENT: Ent638_3149
EAS: Entas_3381
ENX: NI40_017185
LNI: CWR52_17695(stpA)
EBG: FAI37_11805(stpA)
END: A4308_02010
ENZ: G0034_17735(stpA)
ENS: HWQ15_02815(stpA)
ENK: LOC22_05575(stpA)
EHU: D5067_0005395(stpA)
EMOR: L6Y89_16740(stpA)
ENB: ELK40_17825(stpA)
EQU: OM418_17050(stpA)
EPU: QVH39_18065(stpA)
EDY: F0320_16755(stpA)
EAX: AAHF05_17445(stpA) AAHF05_23000
KPN: KPN_02998(stpA)
KPU: KP1_4260(stpA)
KPM: KPHS_40700
KPP: A79E_1099
KPH: KPNIH24_08425 KPNIH24_27195
KPZ: KPNIH27_19645
KPV: KPNIH29_20435
KPW: KPNIH30_20445
KPY: KPNIH31_19660
KPG: KPNIH32_21305 KPNIH32_28110
KPC: KPNIH10_20285
KPQ: KPR0928_19765
KPT: VK055_4520(stpA)
KPO: KPN2242_17965
KPR: KPR_1291
KPJ: N559_1236 N559_5192
KPI: D364_15290
KPA: KPNJ1_01247
KPS: KPNJ2_01273
KPX: PMK1_00474
KPB: FH42_11005
KPNE: KU54_006125
KPNU: LI86_06130 LI86_28160
KPNK: BN49_1125
KVA: Kvar_1070
KPE: KPK_1130(stpA)
KPK: A593_05170
KVD: KR75_02585
KVQ: SP68_09155
KQU: AVR78_24760
KQV: B8P98_06205
KOX: KOX_00400
KOE: A225_4523
KOY: J415_09310
KOM: HR38_26475
KOK: KONIH1_22690
KOC: AB185_13570
EAE: EAE_01385
EAR: CCG33720
KLL: BJF97_22565
KAR: LGL98_05745(stpA)
KGR: JJJ10_06565(stpA) JJJ10_28445
KPAS: LUW96_00485(stpA)
KLC: K7H21_06250(stpA)
KLM: BWI76_22010
REE: electrica_01052(stpA)
KLP: GUC22_05915(stpA)
ROR: RORB6_24220
RON: TE10_21850
RPLN: B1209_05615 B1209_27825
RAO: DSD31_05735
CRO: ROD_31391(stpA)
CKO: CKO_04014
CFD: CFNIH1_00350
CBRA: A6J81_22895
CWE: CO701_04135
CYO: CD187_05630
CPOT: FOB25_16940(stpA)
CFQ: C2U38_19340
CSED: JY391_05165(stpA)
CAMA: F384_14530
CAF: AL524_00260 AL524_08555
CIF: AL515_17970
CFAR: CI104_19535 CI104_26550
CIR: C2U53_29610
CIE: AN232_10125 AN232_31250
CPAR: CUC49_13775
CTEL: GBC03_10230(stpA)
CITZ: E4Z61_22185(stpA)
CARS: E1B03_20480(stpA)
CIX: M4I31_05470(stpA)
CIB: HF677_005395(stpA)
CENS: P2W74_05260(stpA)
CITR: GUC46_05330(stpA)
CIQ: FD428_05060(stpA)
CIY: HAP28_19740(stpA)
EBT: EBL_c09210(stpA)
PGE: LG71_09990
ESC: Entcl_1052
KLE: AO703_16355
LAX: APT61_05130
LEI: C2U54_22920 C2U54_24635
LEH: C3F35_16960 C3F35_23910
LEE: DVA44_05190 DVA44_24815
LER: GNG29_17925(stpA)
LEA: GNG26_17315(stpA)
LPNU: KQ929_04455(stpA)
LEY: DVA43_23640
LAZ: A8A57_16270
LEF: LJPFL01_3190
LEW: DAI21_09880
BUF: D8682_01030
BFT: MNO13_09520 MNO13_09970
ASUB: NLZ15_22535
YRE: HEC60_13005(stpA)
SGOE: A8O29_005355(stpA)
KIN: AB182_03015
IZH: FEM41_24200(stpA)
PSGC: G163CM_46750(stpA)
PVJ: LMA04_21250
TOE: QMG90_05945(stpA)
AAPT: QNH14_14925 QNH14_23980
MPHG: MPHASIOC01_003077
EBF: D782_1031
EBC: C2U52_00190
EBU: CUC76_21315
YPS: pYptb0020
YPO: BZ17_4306
CARU: P0E69_22920
SGL: SGP1_0002
ETA: ETA_pET350210(stpA)
EPI: Q3V30_22380
PSTW: DSJ_22585 DSJ_23305
MHAN: K6958_20870
PMR: PMIP26
PSTA: BGK56_21405
HAP: HAPS_1121(hns)
PDAG: 4362423_01067(hns)
GAN: UMN179_00040
AVT: NCTC3438_01302(stpA)
PANR: A7J50_6059
RHH: E0Z06_04880
ENW: MJO57_07430 MJO57_32220
ENG: O2T12_00490
EMP: EZMO1_4244
FPP: FPB0191_01190
ACF: AciM339_0189 AciM339_0221
 » show all
Reference
PMID:10551881
  Authors
Azam TA, Ishihama A
  Title
Twelve species of the nucleoid-associated protein from Escherichia coli. Sequence recognition specificity and DNA binding affinity.
  Journal
J Biol Chem 274:33105-13 (1999)
DOI:10.1074/jbc.274.46.33105
  Sequence
[eco:b2669]
Reference
PMID:22187157
  Authors
Lim CJ, Whang YR, Kenney LJ, Yan J
  Title
Gene silencing H-NS paralogue StpA forms a rigid protein filament along DNA that blocks DNA accessibility.
  Journal
Nucleic Acids Res 40:3316-28 (2012)
DOI:10.1093/nar/gkr1247
  Sequence
[eco:b2669]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system