KEGG   ORTHOLOGY: K14483
Entry
K14483            RNA       KO                                     
Symbol
SNORD3, U3, SNR17
Name
small nucleolar RNA SNORD3
Pathway
map03008  Ribosome biogenesis in eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
    K14483  SNORD3, U3, SNR17; small nucleolar RNA SNORD3
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K14483  SNORD3, U3, SNR17; small nucleolar RNA SNORD3
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K14483  SNORD3, U3, SNR17; small nucleolar RNA SNORD3
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Related small nucleolar RNAs
  Box C/D snoRNAs
   SnoRNAs involved in processing reactions
    K14483  SNORD3, U3, SNR17; small nucleolar RNA SNORD3
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Small non-coding RNA
  Small nucleolar RNA
   K14483  SNORD3, U3, SNR17; small nucleolar RNA SNORD3
Genes
HSA: 109616984(SNORD3G) 109616985(SNORD3J) 109617015(SNORD3E) 109617016(SNORD3H) 109617017(SNORD3K) 124900922 124901220 124901221 124901505 124901506 124901507 124901508 124901509 124901858 124901859 124901860 124902100 124902101 124902595 124902596 124902847 124903435 124903436 124903594 124903595 124904151 124904381 124904666 124904668 124904669 124904802 124904804 124904983 124905065 124905290 124905291 124905292 124905415 124906193 124906194 124906195 124906377 124906378 124906379 124906380 124906381 124906382 26851(SNORD3B-1) 780851(SNORD3A) 780852(SNORD3B-2) 780853(SNORD3C) 780854(SNORD3D)
PTR: 112204331 112204332 112204333 112204717 112204718 112204949 112205517 112205518 112205746 112205757 112206207 112206208 112206209 112206210 112206321 112206323 112206459 112206460 112206609 112206667 112206923 112206924 112206925 112206927 112207262 112207263 112207264 112207265 112208307 112208308 112208541 112208897 112208898 112208899 112208900 112208901 112208902 112209163 112209391 112209392 112209542 112209543 112209544 112209545 112209964 112209965 112209966
PPS: 112437129 112437130 112437317 112437328 112437699 112437700 112437701 112437829 112437831 112437924 112437926 112438046 112438104 112438225 112438226 112438227 112438228 112438645 112438646 112438648 112438649 112439029 112439030 112439223 112439532 112439533 112439534 112439535 112439536 112439537 112439776 112440017 112440018 112440138 112440139 112440140 112440141 112440325 112440632 112440634 112440803 112440804 112441120 112441121 112441333 117977829 117978162
GGO: 115930737 115930738 115930981 115930982 115930983 115931372 115931507 115931509 115931801 115931870 115932058 115932059 115932061 115932598 115932599 115932601 115932602 115933375 115933678 115933679 115933915 115934266 115934267 115934268 115934269 115934270 115934271 115934522 115934909 115934910 115934912 115935040 115935041 115935042 115935043 115935044 115935531 115935532 115935533 115935737 115935738 115935739 115936163 115936165 115936424
PON: 112128961 112128962 112129277 112129288 112129299 112129845 112129847 112130022 112130024 112130255 112130257 112130431 112130542 112130859 112130862 112130863 112130866 112131229 112131231 112131232 112131233 112131446 112131448 112131814 112131815 112132227 112132229 112132532 112132969 112132970 112132971 112132972 112132973 112132974 112133331 112133675 112133676 112133927 112133928 112133929 112133930 112134118 112134541 112134542 112134846 112134847 112134848 112135371 112135373 112135687
NLE: 115830591 115830759 115830760 115831401 115832059 115832224 115832226 115832227 115832723 115832724 115833177 115833505 115833507 115833508 115833593 115833725 115834205 115834206 115834207 115834618 115834619 115834620 115834621 115835023 115835024 115835026 115835224 115835225 115835797 115835798 115835799 115835800 115836207 115836553 115836854 115837182 115837183 115837455 115837676 115837856 115838178 115838180 115838507 115838508 115838509 115838511
HMH: 116456501 116463541 116464396 116470147 116472138 116474075 116476093
MCC: 114670261 114670716 114671665 114672065 114672067 114672583 114673351 114673352 114673353 114673354 114673355 114673920 114673922 114674227 114674726 114674728 114674729 114675286 114675287 114675289 114675698 114675699 114676660 114676661 114676662 114676663 114676664 114677307 114677308 114677309 114677310 114677947 114677948 114677949 114677950 114678626 114679210 114679211 114679996 114680007 114680018 114680030 114680041 114680544 114680545
MCF: 123567039 123567395 123568212 123568551 123568553 123568988 123569667 123569668 123569670 123569672 123570140 123570143 123570402 123570670 123570671 123571543 123571544 123571545 123572135 123572136 123572138 123572139 123572716 123572717 123572718 123572719 123573293 123573294 123573295 123573296 123573845 123574328 123574329 123574993 123575004 123575015 123575026 123575037 123575437 123575438
MTHB: 126929958 126933328 126934590 126934592 126936766 126940090 126940092 126940094 126940096 126941620 126941622 126943637 126944307 126944308 126947082 126947083 126947085 126947440 126947441 126949585 126949587 126949589 126949590 126951905 126951906 126951907 126951908 126954133 126954134 126954135 126954136 126955917 126957836 126957837 126960406 126960418 126960430 126960442 126960453 126961968 126961969 126963524
MMU: 115487696(Gm24826) 115487926(Gm24949) 115488090(Gm25203) 19850(Snord3a) 19858(Snord3b1) 19859(Snord3b2) 19860(Snord3b3) 19861(Snord3b4)
OCU: 127484575
PCOC: 116228247
MGP: 116217363
TPAI: 128083754
LMUT: 125703196
ACYG: 125184038
CATA: 118255207
LSR: 116184317
PMOA: 120499714
OTC: 121343536
PRUF: 121351791
PMAJ: 117245313
FCH: 114018131
TALA: 116964666
AGEN: 126040107
ACAR: 114818789
DNE: 112983993
CCAY: 125624178
TST: 117867758
SUND: 121917166
PGUT: 117660428
HCG: 128336276
EMC: 129345115
LERI: 129699178
CIN: 113474802
AJC: 117125414
DSE: 6609564
DYA: Dyak_GE27082(Dyak_snoRNA:GE27082) Dyak_GE27083(Dyak_snoRNA:GE27083)
DMO: Dmoj_GI25366(Dmoj_snoRNA:GI25366) Dmoj_GI25367(Dmoj_snoRNA:GI25367)
DNV: 115563876
TDA: 119686562
MDE: 131802264
AMER: 121598144
AFUN: 125766677
AALI: 118462186
SOC: 113003329
CINS: 118068971
DSM: 124410762
APLN: 112905608
MJU: 123865829
VCD: 124542938
MCIX: 123664808
PNAP: 125061658
ACOO: 126837560
HHAL: 112211889
PVM: 113819016
HAZT: 125178022
RMP: 119165939
DPTE: 113790906
DFR: 124491323
CEL: CELE_T19C4.11(T19C4.11)
PCAN: 112576374
HRF: 124139879
HRJ: 124292070
PMAX: 117343035
MMER: 123535509
OBI: 128247934
OSN: 115212447
EPA: 114574658
PDAM: 113685235
XEN: 124440859
HSY: 130637075
ATH: AT5G53902(U3B) AT5G54075(U3D)
BNA: 125593774
RSZ: 130500573
EGR: 120289072
TPRA: 123893374
PCIN: 129304314
MSYL: 126588125
ZJU: 112491147
CSAV: 115711839
CMO: 127144090
CAVE: 132188912
VVI: 132253317
LBB: 132608549
SMIL: 131003397
RVL: 131328190
AEW: 130775747
SOE: 130462324
ATRI: 130816776
MOF: 131147054
LRD: 124658597
PDA: 113461381
NCOL: 116246549
SCE: YNCO0025W(SNR17A) YNCP0005C(SNR17B)
KLA: KLLA0_D07408r(SNR17)
LTH: KLTH0D10758r(SNR17)
ZRO: ZYRO0D16808r(SNR17) ZYRO0F06886r(SNR17)
DHA: DEHA2E15818r(SNR17) DEHA2G09746r(SNR17)
 » show all
Reference
PMID:7556076
  Authors
Beltrame M, Tollervey D
  Title
Base pairing between U3 and the pre-ribosomal RNA is required for 18S rRNA synthesis.
  Journal
EMBO J 14:4350-6 (1995)
DOI:10.1002/j.1460-2075.1995.tb00109.x
Reference
  Authors
Venema J, Tollervey D
  Title
Ribosome synthesis in Saccharomyces cerevisiae.
  Journal
Annu Rev Genet 33:261-311 (1999)
DOI:10.1146/annurev.genet.33.1.261
Reference
  Authors
Knox AA, McKeegan KS, Debieux CM, Traynor A, Richardson H, Watkins NJ
  Title
A weak C' box renders U3 snoRNA levels dependent on hU3-55K binding.
  Journal
Mol Cell Biol 31:2404-12 (2011)
DOI:10.1128/MCB.05067-11
  Sequence
[hsa:780851]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system