KEGG   ORTHOLOGY: K14880
Entry
K14880            RNA       KO                                     
Symbol
SNORD59, U59, SNR54
Name
small nucleolar RNA SNORD59
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K14880  SNORD59, U59, SNR54; small nucleolar RNA SNORD59
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K14880  SNORD59, U59, SNR54; small nucleolar RNA SNORD59
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Related small nucleolar RNAs
  Box C/D snoRNAs
   SnoRNAs involved in processing reactions
    K14880  SNORD59, U59, SNR54; small nucleolar RNA SNORD59
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Small nucleolar RNA
  K14880  SNORD59, U59, SNR54; small nucleolar RNA SNORD59
Genes
HSA: 124904806 124906142 26789(SNORD59A) 692090(SNORD59B)
PTR: 112205137 112205138 112207309 112208484
PPS: 112436794 112436795 112438451 112439165
GGO: 115930323 115930324 115932331 115933857
PON: 112131346 112132472 112135967 112135968
PPYG: 129011057 129011058 129023724 129032251
NLE: 115832655 115837416 115837417 115837773
HMH: 116470054 116481330 116481331 116809894
SSYN: 129467145 129467148 129489024 134735006
MCC: 114671185 114671186 114671606 114675072
MCF: 123567778 123567779 123571106
MTHB: 126931892 126931893 126933269 126945257
MNI: 112425297 112425298 112426569
PANU: 116269045 116269046 116269294 116272159
TGE: 112616007 112635682 112635683 112636804
RRO: 115893360 115899434 115900182 115900183
TFN: 117091223 117091224 117095501
PTEH: 111542110 111542111
CJC: 118144674 118144675 118148385
CIMI: 119469311 119472371
ANAN: 135268988 135275523 135275524
LCAT: 123640913 123640915
OGA: 111725568 111725569
MMU: 115487514(Snord59a)
MCAL: 115032198 115032199
RNO: 120093948 120093949(Snord59a)
MCOC: 116076597 116076598
ANU: 117696912 117696913
ASYL: 127671388 127671389
MUN: 132652583 132652584
CGE: 113833050 113833051
MAUA: 121143378 121143379
PROB: 127215863 127215864
PLEU: 114686931 114686932
PMAV: 121823860 121823861
MORG: 121464768 121464773
MFOT: 126492085 126492086
AAMP: 119803763 119803764
CPOC: 111753378 111755720
DSP: 122124437 122124438
DMER: 138806682 138806691
PLOP: 125341468 125341472
NCAR: 124984120 124984121
MMMA: 125618233 125618234
ITI: 120888764 120888765
OCU: 127487432 127487433 127491219 127491220
OPI: 118757621 118757622
OCZ: 121164096 121164101
CFA: 119873834
CLUD: 112665128 112678062 112678063
VVP: 112922422 112922423 112935320
VLG: 121492280 121492281 121492282
NPO: 129511227 129512231 129512232
AML: 117796509 117796510 117802121
UMR: 121101090 121104510 121104511
UAH: 113247530 113256489 113256490
UAR: 123787332 123787333 123799972
LLV: 125108119 125108120
MNP: 132021029 132021030 132022922
MLK: 131808732 131840065 131840066
NVS: 122892839 122892840 122916668
EJU: 114215115 114215116 114219716
ZCA: 113923260 113923261 113938814
MLX: 118008335 118009077 118009078
NSU: 123325008 123325009 123326108
LWW: 115938798 115943665
FCA: 111559957 111561567 111561568
PYU: 121041127 121041128 121044641
PCOO: 112863959 112863960 112864431
PBG: 122467412 122474163 122474164
PVIV: 125163150 125171435 125171436
LRUF: 124502798 124502800 124504469
LGF: 123581766 123592321 123592322
AJU: 113592553 113602911 113602912
PUC: 125920541 125920542 125937832
PLEZ: 122216739 122225731 122225732
HHV: 120219969 120219970 120244641
BTA: 112446861
BOM: 138988038 138988039
BBUB: 112584804 112584805
OAS: 114114231 114114232
BTAX: 128049143 128049144
CSUM: 138079411 138079412
ODA: 120858963 120858964
CCAD: 122427862 122427863
MREE: 136168099 136168100
OVR: 139030958 139030959
MBEZ: 129537312 129537313
CFR: 116667877 116667878
CDK: 116156634 116156635
VPC: 116282791 116282792
BMUS: 118902913 118902914
OOR: 117203034 117203035
LALB: 132530100 132530101
GMF: 115858788 115858789
DDP: 132434627 132434628
DLE: 115803532 115803533
PCAD: 112064747 112064748
PSIU: 116761397 116761398
PPHC: 136131638 136131639
NASI: 112394445 112394446
ECB: 111774079 111774080
EPZ: 139083727 139083728
EAI: 123280033 123280034
MMYO: 118652311 118652312
MLF: 111827021 111827022
MDT: 132228986 132228987
MYUM: 139007852 139007853
PKL: 118731042 118731043
EFUS: 114234184 114234185
DRO: 112319196 112319197 112319763
SHON: 118976030 118976031
AJM: 119040334 119040335
PDIC: 114514254 114514255
PHAS: 123813136 123813137
MMF: 118624852 118624854
PPAM: 129076094 129076095
RFQ: 117029479 117029480
PALE: 112477453 112477454
PGIG: 120605165 120605166
PVP: 111729745 111729746
RAY: 118614503 118614504
MJV: 118974048 118974049
TOD: 119248505 119248506
SFUM: 130029382 130029383
SETR: 126023084 126023085
LAV: 111748485 111748486
TMU: 111821196 111821197
ETF: 115870709 115870711
DNM: 111765243 111765988 111765989 111767057
GAS: 123250803 123250804
SHR: 111721249 111721250
AFZ: 127539507 127539508
TVP: 118852477 118852478
PBRV: 138156522 138156528
MLAO: 141515744 141515746
OAA: 114814917 114814918
TACU: 119933933 119933934
GGA: 112530962 112530966
PCOC: 116239843 116239844
MGP: 116216515 116216516
CJO: 116652463 116652464
TPAI: 128071975 128071977
LMUT: 125685614 125685615
APLA: 113840048 113840050
ACYG: 125181088 125181089
CATA: 118260204 118260205
AFUL: 116500037 116500038
TGU: 115491517 115491518
LSR: 116184554 116184555
SCAN: 115484704
PMOA: 120499508 120499509
OTC: 121336774 121336775
PRUF: 121356381 121356382
ATRC: 139604855 139604856
OMA: 130265928 130265929
PMAJ: 117243758 117243759
CCAE: 111945996 111945997
ACOE: 138100109 138100110
ETL: 114071131 114071132
ZAB: 113460758 113460759
ZLE: 135459258 135459259
MMEA: 130587062 130587063
HRT: 120764522 120764523
SATI: 136372862 136372863
CCIC: 134055047 134055048
FCH: 114014952 114014953
SHAB: 115618810
TALA: 116965132 116965133
ACHC: 115351426 115351427
AGEN: 126046788 126046789
HHAR: 128152265 128152266
GCL: 127028472 127028473
PPUS: 135174355 135174356
EGZ: 118452577 118452578
CBOR: 142073835 142073836
CBOY: 140644593 140644594
MAME: 142421170 142421171
CNIC: 136000640 136000641
CUCA: 128849511 128849512
ACAR: 114818749
RTD: 128903217 128903218
CRID: 134526977 134526978
LMIC: 141734063 141734064
AROW: 112961795 112961796
NPD: 112954137
DNE: 112994740 112994741
ASN: 112547927 112547928
PSS: 112547137 112547138
CIZ: 142003482 142003483
CMY: 114021058 114021059
CCAY: 125627859 125627861
DCC: 119846173 119846174
CPIC: 112060597 112060598
CABI: 116827826 116827829 116827830 116827831 116827832
MRV: 120391498 120391499
ASAO: 132769552 132769553
SUND: 121924554 121924555
PBI: 112540643 112540644
PMUR: 114922831 114922832
CTIG: 120305477 120305479
PGUT: 117663149 117663150
PCAE: 139313482 139313483
APRI: 131193771 131193772
PTEX: 113447353 113447354
NSS: 113420217 113420218
VKO: 123019354 123019355
PMUA: 114593109 114593110
PRAF: 128409688 128409689
ZVI: 118081634 118081635
HCG: 128348409 128348410
STOW: 125430345 125430346
EMC: 129329494 129329495
XLA: 121400240 121400241 121400242 121400850 121400851 121400852
XTR: 116409369 116409370 116409371
RTEM: 120929771 120929772 120929773
ACAT: 141130730 141130731 141130732
PADS: 140321891 140321892 140321893
BBUF: 120996829 120996830 120996831
BGAR: 122933528 122933530 122933531
DTC: 141091408 141091409 141091410
PWL: 138294367 138294368 138294370 138294371
MUO: 115467438 115467439
GSH: 117358338 117358339
DRE: 137489193 137489194
CCAR: 122135235 122135237 122142116 122142117
CAUA: 113041776 113041777 113094783 113094784
CGIB: 127945691 127945692 128012703 128012704
PTET: 122329335 122329336
LROH: 127155336 127155337
GRF: 141291704 141291705 141291706
OMC: 131532723 131532724
PPRM: 120463838 120463839
RKG: 130072916 130072917
MAMB: 125260855 125260856
CIDE: 127505611 127505612
CERY: 137010344 137010346
MASI: 127419575 127419576 127420612 127420614
MANU: 129431555 129431556
PDAB: 135776157 135776158
IPU: 124628994 124628995
IFU: 128619944 128619945
PHYP: 113530992 113530993
SMEO: 124399360 124399361
TFD: 113642054 113642055
TVC: 132862854 132862864
CGAR: 128510898 128510899
NGRA: 132897241 132897242
TRN: 134334025 134334027
AMEX: 125780703 125780704
CMAO: 118823127 118823128
EEE: 113575496
CHAR: 116220389 116220390 116220391 116220392 116220393 116220394 116220395 116220397 116220398 116220400 116220402 116220403 116221224 122132878
SPIL: 134088317 134088318
ASAD: 121714645 121714647
TRU: 115249417
TFS: 130530754
LCO: 113745592 113745593
TBEN: 117479617 117479618
CGOB: 115011471 115011472
PGEO: 117450194
GACU: 117543139 117543140 117543141
EMAC: 134872622 134872628
ELY: 117259001 117259002
EFO: 125892468 125892469
PLEP: 121947596 121947599
SLUC: 116062268 116062270
ECRA: 117948397 117948398
ESP: 116693310 116693311
PFLV: 114559476 114559477
GAT: 120830015 120830016 120830017
PPUG: 119223881 119223882
AFB: 129100430 129100431
CLUM: 117734222 117734223 117734224
PSWI: 130200207 130200215
CANA: 137801231 137801232
CVE: 137887036 137887037
MSAM: 119906300 119906301
SCHU: 122883830 122883831
CUD: 121518230 121518238
SPUL: 138590438 138590439
LMIX: 132990457 132990458
HTC: 141800085 141800086
ALAT: 119023632 119023633
ASTR: 137591097
MZE: 111501476 111501477
ONL: 112843384 112843385
OAU: 116310960 116310961
OLA: 111947700 111947701
OML: 112159868 112159869
CSAI: 133457599 133457601
XMA: 111610045 111610046
XCO: 114149533 114149538
XHE: 116728808 116728815
GAF: 122840505 122840511
PPRL: 129370462 129370463
CTUL: 119774168 119774169
GMU: 124877247 124877254
KMR: 112450311 112450312
NWH: 119417813 119417814
AOCE: 111583801 111583802
EJA: 138193556 138193557
BFRE: 138615517 138615518
MCEP: 124999115 124999122
SSEN: 122777909 122777910
SSOE: 131469298 131469299
HHIP: 117765436 117765437
HSP: 118111706 118111707
PPLT: 128443222 128443223
SMAU: 118317606 118317613
LCF: 127142615 127142622
SLAL: 111671556 111671557
XGL: 120804577 120804578
SSCV: 125989524 125989525
SBIA: 133497352 133497353
PEE: 133414284
PTAO: 133465620
ENY: 140363674 140363675
BSPL: 114859495
SJO: 128358153 128358154
SSCO: 133989405 133989407
TTY: 137185422 137185423
GMH: 115553784 115553788 115553794 115553799
STRU: 115166502 115166503 115166504 115169031 115169032 115169033
OTW: 112216647 112216648 112216649 112222451 112222452 112222456
OMY: 118939608 118939609 118939611 118966240 118966241 118966242
OGO: 124032480 124032481 124032482 124047041 124047042 124047043
ONE: 115103406 115103407 115103408 115132889 115132890 115132891
OKI: 116354537 116354538 116354539 116357044 116357045 116357046
OKE: 118360355 118360356 118360357 118361816 118361817 118361818
OMM: 135505338 135505339 135505340 135528577 135528578 135528579
OCLA: 139369032 139369034 139369035 139417646 139417647 139417648
SALP: 111966966 111966967 111966968 111977302 111977303 111977304
SNH: 120059640 120059641 120059642 120061747 120061749 120061750
SFON: 129830480 129830481 129830483 129861553 129861554 129861555
CCLU: 121538678 121538679 121538680 121538681 121546865 121546866 121546867 121546868
ELS: 114840603 114840604 114840605
OEP: 134019694 134019695
SFM: 114909187
PKI: 111855353
AANG: 118208738 118208739
AROT: 135235409 135235410
CCOG: 133139756 133139757
PSPA: 121309028 121309029 121309030 121309032
ARUT: 117401161 117401162 117401163 117401164 117967110 117967111 117967112 117967113
PSEX: 120526974 120526975
LERI: 129699186
HAKA: 140728650
PMRN: 116954835
BFO: 118410683
DME: Dmel_CR34537
DYA: Dyak_GE27030(Dyak_snoRNA:GE27030)
MCAF: 127713148 127713149
ATH: AT1G05907 AT1G05917
CRB: 111828819 111828820
BRP: 117126993 117126994 117127566 117127567 117128728 117128729
BNA: 125576791 125577472 125577474 125578799 125578800 125584885 125584886 125588184 125588186 125590978
RSZ: 130497837 130497838 130497841 130497842 130499276 130499277
CIT: 112497355 112497356 112497357
PVY: 116112000 116112001 116112003 116112004 116112005 116133581 116133582 116133583 116133584 116133585 116133586 116133587 116133602 116145116 116145117
MINC: 123215162 123215163 123215164 123217808 123217811 123217812 123217813
GRA: 128036443 128036444 128036445 128041481 128041482
GHI: 121212980 121226025
GAB: 128287258 128287259 128287260 128293620 128293621
HSYR: 120118247 120134789 120134791 120143911 120145771 120145780 120197249 120197251 120198664 120198665 120211575
EGR: 120296530 120296531 120296533
RARG: 115740080 115740081 115740082 115740083
GMX: 112997897 112998235 112998237 112998415 112998603 113000281 113000282 113000845 113001546 113001547 113001740 113002000 113002002
GSJ: 114368716 114372748 114372749 114377723 114380605 114397804 114403986 114410978 114410979 114410980 114413877 114417528 114417530
PVU: 137811663 137811667 137811671 137811677 137811686 137813093 137813094 137813095 137813096
VAR: 128195070 128195071 128196852 128196853 128196855 128196856 128196857 128196858 128196859 128196860 128196861 128196862 128196863
VUN: 114170927 114170928 114170930 114170931 114170932 114170933 114170934 114170935 114170936 114170937 114170938 114170939 114180055 114180056 114180057
VUM: 124821301 124821302 124825314 124828060 124828061 124828062 124828064 124828065 124828066 124828067
CCAJ: 114915397 114915941 114916257 114916258 114916260 114917075
APRC: 113856716 113856717 113856718 113856719 113856720 113866415 113866416
MTR: 112417599 112417600 112417601 112417602 112417603 112421492 112421493 112422276
TPRA: 123882532 123882533 123893323 123919199 123919200 123919201 123919202 123919203
CAM: 113785572 113785573 113785574 113785575 113785576 113786793 113787303 113787304 113787305 113787307 113787308 113787309 113787310 113787312
PSAT: 127109545 127109546 127109547 127109548 127109549
VVO: 131608435 131608436 131608437 131608438 131608439 131608440
LJA: 130709658 130716386 130716387 130716388 130716389 130716390
ADU: 127739970 127745941 127745942 127745943 127745944
AHF: 112700620 112739672 112739673 112739675 112739676 112793556 112793557 112793558 112793560
PCIN: 129284694 129289728 129312223 129312225 129312227 129316917
AANS: 126796562 126796563 126796565 126796566 126805373
RCN: 112181028 112181029 112181030 112181031 112181032 112181033 112181035
PDUL: 117616889 117616890 117616891 117616892 117629436 117629437
MDM: 114822380 114822381 114825703 114825704 114825705 139197274
MSYL: 126609451 126609453 126627570 126627571 126627572 126627574
PCOX: 137711783 137711784 137711785 137711786 137711787 137733062 137733063
ZJU: 112489744 112489745 112489746 112489748
MNT: 112090989 112090990 112090991 112090992 112090993 112090994
CSAV: 115698438 115698439 115698440 115698441 115698442 115701675 133029426
CSV: 116405329 116405331
CMO: 127144334 127144335
BHJ: 120087425 120087426
CMAX: 111477338 111477339 111481327
CMOS: 111433480 111443730 111443731
CPEP: 111789447 111797775 111797776 111797777
RCU: 112536205 112536206 112536592 112536606
MEAN: 126662377 126662378 126662445 126685243 126685244
JCU: 119370850 119370851 119370852
MESC: 122722018 122722020 122722327 122722328 122722329
POP: 112328536 112328537 112328538 112329033 112329034 112329035
PALZ: 118046627 118046628
PNZ: 133698068 133698069 133698070 133706098 133706099 133706100
JRE: 118344399 118344401 118344402 118344403 118344404
CILL: 122312125 122312126 122312127 122312129
CAVE: 132180163 132180164 132180165 132180166 132180167 132180168 132180169
AGLU: 133858990 133858991 133858992 133858993 133858994 133858995 133858997 133858998 133862119
QSU: 112010393 112010394 112010395
QLO: 115983009 115983010 115983011 115988259 115988260 115988261
CSAA: 142630133 142630134 142630135
TWL: 119995746 119995747 119995748 120001165 120001166 120004385
VVI: 132254685 132254686 132254687
VRI: 117926233 117926239 117926245
SLY: 112941410 112941411
SPEN: 114077035 114077036 114077037 114077039 114077743
SSTN: 125854019 125857329 125857330 125875357
SDUL: 129871848 129871850 129871851
CANN: 124899132 124899133
LBB: 132616384 132616385 132616386
NSY: 138878807 138890976
NTO: 117275344 117275345 117277571
ITR: 116026367 116026368
SSPL: 121742753 121746318 121769642 121769644 121773112 121797560
SMIL: 130996356 130996357 131002453
SHIS: 125217190 125217191 125217192 125217194
APAN: 127261434 127261435 127261436
HPUM: 140885977 140885979
PHUA: 140969185 140969186
PEBU: 140811017 140815343 140815348
PTAB: 142521590 142554901 142554902
HAN: 118481604 118488734 118489596
ECAD: 122598721 122598722
LSV: 111907406 111917775 111917776
CCAV: 112524027 112524028
DCR: 135149975 135149976 135149977 135149978 135149979
CSIN: 114264603 114264604 114272067 114280628 114280629 114280631 114280636 114280637 114280638 114280639 114304273 114305314 114306134 114306135
RVL: 131302221 131302222 131305783 131305784 131305785 131305786 131305787 131305789
AEW: 130772640 130772641 130772642 130792401
DLT: 127810761 127810762
SOE: 130464703 130464705 130464706 130464707 130464708 130464709
ATRI: 130814377 130814383 130814384 130814386 130814387 130827991
SLAF: 141593403 141593404 141593407 141616243
MOF: 131145306 131145307 131145308 131145309 131145310
MING: 122060285 122060286 122080472
TSS: 122638416 122638417
PSOM: 113284915 113319819 113319821 113331638 113331639 113336583 113336584 113336586 113339136 113341937 113341940 113346536 113362474
OBR: 121056083 121056084
OGL: 127758272 127758273 127769173 127775255 127780993
BDI: 112269040 112269041 112272068
ATS: 120965641 120965644 120965645 120965646 120965647 120965648 120965649 120967585 120967586 120967588 120967589 120967590 120972971 120972972 120972973 120972974
TDC: 119296115 119304542 119313280 119319755
TAES: 123109199 123118097 123126945 123126954 123126955 123132764
TUA: 125511764 125511771
HVG: 123400523
LPER: 127297737 127304984 127304985 127304986 127304987
LRD: 124658497 124668744 124668748 124668749 124668750 124668751 124668752 124668753 124668754 124685499
ZMA: 111591278 118473623 118473624
MFLO: 136506286 136506287 136506288 136506289 136509721 136509722
SVS: 117851104 117851105 117851106 117854352 117854353
PVIR: 120653043 120653044 120693644 120693645 120701647
PHAI: 112878426 112878427 112888246 112888247
PAUA: 133904175 133905595 133905621 133906834 133906856 133927866 133927868 133929961
TANG: 140775211
PDA: 113461512 113461513 113463292 113463686 113463687
EGU: 114912816 114913384 114913385 114913505 114913506
MUS: 135599585 135599587 135611420
ZOF: 121994959 122003286 122003287 122007619 122007620 122039356 122039357
DCT: 114578376 114580278
MSIN: 131247735 131247737 131247738 131247739
ACAK: 137964380 137965352 137965358
NCOL: 116249425 116249426 116261614
CJF: 131030612 131030927 131042235 131043558 131052883 131077863 131077864 131875547
PPP: 112281964 112281967 112281968 112281969 112290901 112290902
SCE: YNCM0005C(SNR54)
AGO: AGOS_AgSNR54
KLA: KLLA0_B05522r(SNR54)
CAL: CAALFM_C206400CA
PFA: PF3D7_1423900
PREI: PRSY57_1423200
PCB: PCHAS_1020340
 » show all
Reference
PMID:10024243
  Authors
Lowe TM, Eddy SR
  Title
A computational screen for methylation guide snoRNAs in yeast.
  Journal
Science 283:1168-71 (1999)
DOI:10.1126/science.283.5405.1168
Reference
PMID:15247100
  Authors
Accardo MC, Giordano E, Riccardo S, Digilio FA, Iazzetti G, Calogero RA, Furia M
  Title
A computational search for box C/D snoRNA genes in the Drosophila melanogaster genome.
  Journal
Bioinformatics 20:3293-301 (2004)
DOI:10.1093/bioinformatics/bth394
  Sequence
[dme:Dmel_CR34537]
Reference
PMID:8674114
  Authors
Kiss-Laszlo Z, Henry Y, Bachellerie JP, Caizergues-Ferrer M, Kiss T
  Title
Site-specific ribose methylation of preribosomal RNA: a novel function for small nucleolar RNAs.
  Journal
Cell 85:1077-88 (1996)
DOI:10.1016/S0092-8674(00)81308-2
  Sequence
[hsa:26789]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system