KEGG ORTHOLOGY: K14882

ORTHOLOGY: K14882

Entry

K14882            RNA       KO

Symbol

SNORD25, U25, SNR56

Name

small nucleolar RNA SNORD25

Brite

KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K14882  SNORD25, U25, SNR56; small nucleolar RNA SNORD25
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K14882  SNORD25, U25, SNR56; small nucleolar RNA SNORD25
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
Related small nucleolar RNAs
  Box C/D snoRNAs
   SnoRNAs act as guides for 2'-O-ribose methylation
    K14882  SNORD25, U25, SNR56; small nucleolar RNA SNORD25
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
Small nucleolar RNA
  K14882  SNORD25, U25, SNR56; small nucleolar RNA SNORD25

Genes

HSA:	9303(SNORD25)

PTR:

PPS:

GGO:

CJC:

MMU:	115489078(Gm25855)

MCAL:

ANU:

ASYL:

MUN:

BTA:

BOM:

BJV:

BBUB:

BKE:

OAS:

OCAN:

BTAX:

CSUM:

ODA:

PHAS:

PPAM:

XLA:	100335123(snord25) 121403565 121403567 121403568

XTR:

116410671

DTC:

141058452

DME:	Dmel_CR32874

DYA:	Dyak_GE27106(Dyak_snoRNA:GE27106)

OBR:	121053685 121054318 121054319 121054320

OGL:	127764876 127772391 127772393 127772394 127772395

BDI:	112269628 112269629 112269630 112272160 112272161

ATS:	120975057 120975058 120975059 120975060 120975061 120975063

TDC:	119266188 119266189 119266190 119266191 119266192 119282889 119359870 119359872 119359873 119359874 119359875 119359876 119359877 119359878

TUA:	125541821 125541822 125541823 125541824 125541825 125541826 125541827 125541828

HVG:	123406490 123406491 123414380 123433675 123433677 123433678 123433679 123433680 123451518 123451519

LPER:

127310922 127310923 127310924 127328036 127337827 127337828

LRD:	124679879 124679880 124679881 124679882 124679883 124679884

ZMA:	111589368 111590331 111590332 111590998

MFLO:

136495068 136495079 136495088 136495089 136498710 136498721

SVS:	117841825 117866054 117866055 117866057

PVIR:

120643284 120643285 120643286 120657903 120658460 120684097 120684098 120684099

PHAI:

112879181 112901791 112901792 112901795

PAUA:

133889858 133889859 133889860 133920212 133923307 133925733 133925734 133925735

TANG:

140779984

CROT:

144544710 144566609 144576017

PDA:	113460996 113460997 113461078

EGU:	114914842 114914858

MUS:	135608663 135611413 135611487 135611488 135611489

ZOF:	121993292 121993296 121998812 122039123

DCT:	114578974 114579082 114580178 114580179 114580180 114580181 114580439

WAU:	144704004(LOC144704004)

ATH:	AT3G47342 AT5G00760 AT5G08860

CRB:	111829129 111830814

BRP:	117126365 117126366 117129379 117129380 117133105

BNA:	106449456 125576033 125576034 125579617 125584987 125584988 125584989 125584990 125593792 125593793 125607697 125607698

RSZ:	130495420 130497154 130500604 130500605 130502592 130510350

CIT:	112496332 112499453

PVY:	116129649 116129659 116130286 116130291 116130292 116130293 116130294 116142079

MINC:

123198432 123198444 123209835 123226616

GRA:	128032101 128039441

GHI:	121205562 121215753 121220537 121225597

GAB:	128280026 128281924

HSYR:

120113550 120116248 120142320 120148239 120148703 120150665 120206340

EGR:

120291041

RARG:

115746094

GMX:	112997828 112997843 112998450 112998895 112998896 112999408 113000298 113000508 113000509 113001074

GSJ:	114368464 114368535 114377743 114377752 114382840 114382852 114385525 114397823 114400974 114400975 114404768

PVU:	137827352 137827353 137827354

VAR:	128193431 128193438 128195116 128195118 128195119 128195120 128197618

VUN:	114180029 114180030 114180032 114189292 114195698 114195703 114195704 114195746

VUM:	124819982 124819984 124824471 124824476 124824477 124829305 124847431 124847432 124847433 124847885

CCAJ:

114916933 114917038 114917039

APRC:

113848602 113851652 113868277

MTR:	112416167 112419571 112422348 112422349

TPRA:

123882649 123882650 123882651 123882653 123882655 123882656 123887762 123911981

CAM:	113785548 113785559 113785562 113785581 113785592 113785603 113785918 113787896

PSAT:

127116978 127116979 127124808 127124809 127124810 127124811 127124812

VVO:	131621215 131621216 131625290 131629726 131654267

LJA:	130727205 130734731 130741491

ADU:	127742665 127747990

AHF:	112715575 112725014 112753624 112804817

PCIN:

129304288 129319100

AANS:

126789677 126789678 126789679

RCN:	112168606 112168607 112168608 112168609

PDUL:

117633329 117633331 117633332

MDM:	114819868 114819869 114824263 114824264

MSYL:

126591657 126591658 126617514 126617515

PCOX:

137716647 137716648 137743949 137743950

ZJU:

112490792

MNT:	112091603 112091815 112092662 112092768 112092826

CSAV:

115718299 115721614 115721615

HLP:	133780835 133792944 133792945

CSV:	116401846 116405327

CMO:	127144332 127145031

BHJ:	120078876 120084329

CMAX:

111468507 111490564 111495867

CMOS:

111440062 111455636 111457341

CPEP:

111776529 111783730 111802776

RCU:	112533767 112536945 112536948 112536949 112536950

MEAN:

126666431 126666432 126675960

JCU:	119369131 119371083 119371084 119371085

MESC:

122724479 122724715 122725216 122725217

POP:	112326317 112328706

PALZ:

118027727 118055620 118061000

PNZ:	133680687 133681217

JRE:	118344604 118348559

CILL:

122293045 122293127 122295318

CAVE:

132164846 132168282 132168283

AGLU:

133878705

QSU:	111996392 112030117

QLO:

115956097

CSAA:

142608482

TWL:	119983868 119998019 120003154 120003155 120003156

VVI:

132253980

VRI:

117917170

SLY:	112940785 112940786 112941406

SPEN:

114075777 114075778 114077029

SSTN:

125852055 125853991 125853992 125853993 125853994 125853996

SDUL:

129888130 129888131 129904830

SVER:

125838889 125838897 125838906 125838914

CANN:

124886168 124886935 124898391 124898392

LBB:	132629511 132629512 132629513

NTA:	142174062 142174063 142176941 142176942

NSY:	138878834 138878835

NTO:	117275065 117275066

ITR:	116002416 116002420 116007714 116007715 116007716 116023846

SSPL:

121746298 121797543 121801710

SMIL:

131007470 131007471

SHIS:

125191496 125197574 125197575 125197577

APAN:

HPUM:

PHUA:

PEBU:

PTAB:

CARB:

113705149 113707549 113719388 113728337 113733566

HAN:	118480021 118483181 118483183 118484630 118492596 118492597

BHW:	143574579 143593676 143593683 143602475 143603848 143607471 143619836 143631292 143631912 143632700

ECAD:

122584059 122584060 122594731 122602446

LSV:	111893208(LOC111893208) 111913161(LOC111913161) 111913169(LOC111913169) 111913176(LOC111913176)

CCAV:

112508354 112508355 112513888

DCR:	135147420 135150904

AGRV:

141669760 141688315

CSIN:

114270988 114277701 114303189 114320642

RVL:

131308904

AEW:	130771139 130792403

DLT:	127793606 127798553

CFLO:

132272001 132272002 132287259 132287260 132287261 132287262 132315158

SOE:	130462327 130462333 130464451 130464452 130466445 130466446 130466447 130468201

ATRI:

130807090 130814370 130827973

SLAF:

141624118 141624129 141624301

MOF:	131150044 131150056

MING:

122071145 122090213 122090214

TSS:	122638449 122638450 122638451 122649311

PSOM:

113284768 113300694 113307046 113307047 113307048 113314524 113319922 113325663 113325664 113329299 113329300 113329301 113329302 113329303 113341121 113341357

MSIN:

131241704 131254455 131254466 131257092 131257104

ACAK:

137943278 137966788

NCOL:

116251766 116265091

SCE:	YNCB0003W(SNR56)

AGO:	AGOS_AgSNR56

KLA:	KLLA0_E20483r(SNR56)

LTH:	KLTH0C06600r(SNR56)

ZRO:	ZYRO0B03432r(SNR56)

CAL:	CAALFM_C205600WA

PFA:	PF3D7_1424200

PREI:

PRSY57_1423500

PGAB:

PGSY75_1424200

PLAG:

39744179(PADL01_1423900)

PYO:	PY17X_1021200

PCB:	PCHAS_1020320

PBE:	PBANKA_1019540

PKN:	PKNH_1334000

PREL:

PRELSG_1326900

» show all

Reference

PMID:9387929

Authors

Frey MR, Wu W, Dunn JM, Matera AG

Title

The U22 host gene (UHG): chromosomal localization of UHG and distribution of U22 small nucleolar RNA.

Journal

Histochem Cell Biol 108:365-70 (1997)
DOI:10.1007/s004180050177

Sequence

[hsa:9303]

Reference

PMID:18256246

Authors

Esguerra J, Warringer J, Blomberg A

Title

Functional importance of individual rRNA 2'-O-ribose methylations revealed by high-resolution phenotyping.

Journal

RNA 14:649-56 (2008)
DOI:10.1261/rna.845808

Sequence

[sce:YNCB0003W]

LinkDB

DBGET integrated database retrieval system