KEGG   ORTHOLOGY: K14886
Entry
K14886            RNA       KO                                     
Symbol
SNORD77_80, U77_80, SNR60
Name
small nucleolar RNA SNORD77/80
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K14886  SNORD77_80, U77_80, SNR60; small nucleolar RNA SNORD77/80
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K14886  SNORD77_80, U77_80, SNR60; small nucleolar RNA SNORD77/80
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Related small nucleolar RNAs
  Box C/D snoRNAs
   SnoRNAs act as guides for 2'-O-ribose methylation
    K14886  SNORD77_80, U77_80, SNR60; small nucleolar RNA SNORD77/80
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Small non-coding RNA
  Small nucleolar RNA
   K14886  SNORD77_80, U77_80, SNR60; small nucleolar RNA SNORD77/80
Genes
HSA: 109616982(SNORD77B) 26774(SNORD80) 692197(SNORD77)
PTR: 112204296 112207329 112207370
PPS: 112438462 112438520 112440770
GGO: 115932341 115932379 115932551 115935703
PON: 112131371 112131431 112134811
NLE: 115830734 115837780 115837797
HMH: 116474013
MCC: 114672029 114675087 114675136 114678585 114680508
MCF: 123571122 123571166 123575401
MTHB: 126945298 126945457 126961932
MNI: 112427283
MMU: 115487645(Snord80)
RNO: 120096386
MCOC: 116072115
ANU: 117716719
MAUA: 121137345
PLEU: 114690039
MORG: 121455487
MFOT: 126493635
AAMP: 119799598
OOR: 117201318
NASI: 112408968
EFUS: 114233162
MJV: 118971604
AFZ: 127563632
TPAI: 128072878
LMUT: 125694276
ACYG: 125183954
LSR: 116183933
PMOA: 120510507
OTC: 121344630
PRUF: 121350403
PMAJ: 117244829
CCAE: 111932868
CCW: 120410435
ETL: 114061943
ZAB: 113459294
FCH: 114016976
ACUN: 113483203
TALA: 116964865
ACHC: 115349719
AGEN: 126042417
ACAR: 114818914
AROW: 112964760
DNE: 112983778
CABI: 116839910
SUND: 121930237
PBI: 112540298
PMUR: 114923942
CTIG: 120310529
PGUT: 117661300
PTEX: 113438193
NSS: 113413209
PMUA: 114599972
HCG: 128325473
EMC: 129331553
RTEM: 120946407
GSH: 117346974
CGIB: 127964279
CIDE: 127518220
PHYP: 113537270
EEE: 113581127
LCO: 113748056
AFB: 129095181
CLUM: 117730224
MSAM: 119901423
MZE: 111501215
OAU: 116323179
XMA: 111609797
XCO: 114151646
XHE: 116726542
GAF: 122839207
KMR: 112450239
NWH: 119408234
AOCE: 111563907
MCEP: 125010037
SSEN: 122781351
XGL: 120791406
SSCV: 125976527
OTW: 112261184
SALP: 111972424
BFO: 118422108
SPU: 115929401
AJC: 117102715
AFUN: 125766684
CPII: 120418984
OBB: 114874358
CFO: 112638997
FEX: 115233943
OBO: 113562336
VPS: 122636408
VCRB: 124432145
CINS: 118074625
DSM: 124413726
NPT: 124222584
NFB: 124185896
NLO: 124295224
NVG: 124308297
LDC: 111510447
PPYR: 116177543
MSEX: 115449668
MJU: 123864987
NIQ: 126780098
VCD: 124542968
MCIX: 123667347
ZCE: 119830601
PGW: 126382315
CLEC: 112127345
CSEC: 111865175
SGRE: 126357192
ISC: 8051658
DSV: 119443264
RSAN: 119388468
RMP: 119178838
DPTE: 113792406
DFR: 124495337
CSCU: 111638465
SDM: 118179607
PMEO: 129581504
HRF: 124152788
CRG: 117690575
OED: 125682624
PMAX: 117322561
AMIL: 114955053
HMG: 124806119
CIT: 112498010
PVY: 116143824
GRA: 128036447
GHI: 121212988
EGR: 120292361
VUN: 114180061
CCAJ: 114916262
APRC: 113856721
ADU: 127745947
AHF: 112739679
RCN: 112191060
PDUL: 117636230
ZJU: 112489024
MNT: 112092817
CSV: 116401853
CMO: 127148338
BHJ: 120072386
RCU: 112533972
JCU: 119370038
CILL: 122305930
CAVE: 132166809
QLO: 115988268
TWL: 119998049
VVI: 132254697
VRI: 117925768
SMIL: 131007404
APAN: 127252287
ATRI: 130824705
MOF: 131159074
SCE: YNCJ0009C(SNR60)
KLA: KLLA0_F02112r(SNR60)
LTH: KLTH0H11132r(SNR60)
ZRO: ZYRO0B09064r(SNR60)
 » show all
Reference
  Authors
Tycowski KT, Aab A, Steitz JA
  Title
Guide RNAs with 5' caps and novel box C/D snoRNA-like domains for modification of snRNAs in metazoa.
  Journal
Curr Biol 14:1985-95 (2004)
DOI:10.1016/j.cub.2004.11.003
  Sequence
Reference
  Authors
Creamer TJ, Darby MM, Jamonnak N, Schaughency P, Hao H, Wheelan SJ, Corden JL
  Title
Transcriptome-wide binding sites for components of the Saccharomyces cerevisiae non-poly(A) termination pathway: Nrd1, Nab3, and Sen1.
  Journal
PLoS Genet 7:e1002329 (2011)
DOI:10.1371/journal.pgen.1002329
  Sequence
[sce:YNCJ0009C]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system