KEGG   ORTHOLOGY: K14898
Entry
K14898            RNA       KO                                     
Symbol
SNR72
Name
small nucleolar RNA SNR72
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K14898  SNR72; small nucleolar RNA SNR72
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K14898  SNR72; small nucleolar RNA SNR72
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Related small nucleolar RNAs
  Box C/D snoRNAs
   SnoRNAs act as guides for 2'-O-ribose methylation
    K14898  SNR72; small nucleolar RNA SNR72
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Small nucleolar RNA
  K14898  SNR72; small nucleolar RNA SNR72
Genes
DSI: Dsimw501_GD27799(Dsim_GD27799)
ATH: AT2G43137 AT2G43138 AT2G43139 AT2G43141
CRB: 111831290 111831292 111831293 111831294
BRP: 117133213 117133215 117134505 117134506 117134507 117134509
BNA: 125584914 125586770 125586772 125586773 125607814 125607816 125609694 125609695 125609696
RSZ: 130497285 130497286 130497288 130510280 130510282 130510283
CIT: 112498435 112498438
PVY: 116106246 116108749 116108750 116113880 116113881 116113882
MINC: 123222239 123222240 123222241 123222242
GRA: 128035782 128042746
GHI: 121203918 121219729
GAB: 128295739
HSYR: 120127189 120131095 120138035 120138036
EGR: 120287957 120289126 120289128 120289133 120289138 120289140 120289144 120289148 120289150 120289151 120289152 120289155 120289159 120289161 120289165
RARG: 115739329 115739330
GMX: 112999659 113002468 113002469
GSJ: 114388797 114424814 114424815
PVU: 137836293
VAR: 128194870
VUN: 114165704
VUM: 124833049
CCAJ: 114916868
APRC: 113856726
MTR: 112416139 112419624 112421507
TPRA: 123882546 123900205
CAM: 113785204 113785205 113785206 113788200
PSAT: 127109571 127109572
VVO: 131633800 131638630
LJA: 130709668 130734918
ADU: 127741016
AHF: 112704334 112774555
PCIN: 129321146 129321148 129321149
AANS: 126805384
RCN: 112195601 112195602
PDUL: 117623645
MDM: 114823026
MSYL: 126612733
PCOX: 137709613
ZJU: 112491891 112492440 112492999 125419705
MNT: 112093741 112093742 112093743
CSAV: 115708495 115724338 115724340 115724342 115724343
CSV: 116403581 116403582 116403583
CMO: 127150417 127150418 127150419
BHJ: 120070432 120070433 120070434
CMAX: 111470904 111470905 111470909 111480148
CMOS: 111439225 111439226 111439228 111458082
CPEP: 111791931 111801231 111801233 111801234
RCU: 112533896 112536447 112536448 112536449 112536450 112536451
MEAN: 126666391 126666392 126666393 126666395 126666396 126666397 126666399 126666402
JCU: 119369337 119369338 119369339 119369340 119369341 119370873
MESC: 122723926 122725225 122725227 122725228 122725229
POP: 112324208 112324209 112324215 112327676
PALZ: 118041738 118041742 118041749 118041754 118041761 118054100 118057870
PNZ: 133684389 133684390 133684391 133684392 133684394 133684395 133684396 133695496
JRE: 118344069 118344070 118344071 118344072 118344141
CILL: 122302077 122302078 122302079 122302080 122302081 122302082 122302083
CAVE: 132166816 132176789 132180175 132180176 132180177 132180178 132180179 132180181 132180182 132180183 132180184
AGLU: 133859010 133859011 133859013 133859014 133859015 133859016 133859017 133859018 133859019 133859020 133876604
QSU: 112020872 112020875 112020876 112020877 112020878 112027491
QLO: 115966155 115966156 115966157 115966158 115966159 115966160 115966161 115966162 115966163 115966164 115966166 115966167 115966168 115966169
TWL: 120006764
VVI: 132253576 132254134 132254383
VRI: 117909695 117919482 117919483 117919484 117919485
SLY: 112940223
SPEN: 114074571
SSTN: 125866483
SDUL: 129877991
CANN: 124888348
LBB: 132619358 132619362
NSY: 138876685
NTO: 117275478
ITR: 116023854
SSPL: 121756651 121759790 121763163
SMIL: 130987254 130991069
SHIS: 125185781
APAN: 127250040
HPUM: 140876544 140893663 140893664 140893665 140893666 140893667
PHUA: 140980044 140981918
PEBU: 140831300 140835606
PTAB: 142504705 142544047
HAN: 118479424 118479426
ECAD: 122580723 122602450
LSV: 111884094 111914876
CCAV: 112526195 112526196
DCR: 135146867
CSIN: 114300365 114300366
RVL: 131331718
AEW: 130772645 130772646 130784130 130784131
DLT: 127792736 127812349
SOE: 130471196
ATRI: 130826348
MOF: 131161153 131161154
MING: 122072487 122072489 122077629 122082959 122086911 122087775
TSS: 122641231 122641234 122653312
OBR: 121053344 121053345
OGL: 127760903 127760904
BDI: 112271191 112271268 112271269
ATS: 120962228
TDC: 119273881 119283009
TAES: 123063895 123073146 123081211
TUA: 125549721
HVG: 123445847
LPER: 127327170 127327172 127327983
LRD: 124668821 124668824 124668825
ZMA: 111590740
MFLO: 136462118 136541077 136541079
SVS: 117854297 117854298 117859409 117859410 117859411
PVIR: 120677102 120677103 120710894 120710895 120710897
PHAI: 112896074 112896076
PAUA: 133891461 133891468 133910367
PDA: 113461108
ZOF: 122050005
DCT: 114578595 114578596
MSIN: 131223561
ACAK: 137952426 137954062
NCOL: 116267820
PPP: 112275412 112280728 112280729
SCE: YNCM0017W(SNR72)
AGO: AGOS_AgSNR72
KLA: KLLA0_D11217r(SNR72)
LTH: KLTH0D07788r(SNR72)
ZRO: ZYRO0E06160r(SNR72)
CAL: CAALFM_C401570CA
 » show all
Reference
PMID:9512526
  Authors
Cavaille J, Bachellerie JP
  Title
SnoRNA-guided ribose methylation of rRNA: structural features of the guide RNA duplex influencing the extent of the reaction.
  Journal
Nucleic Acids Res 26:1576-87 (1998)
DOI:10.1093/nar/26.7.1576
  Sequence
[sce:YNCM0017W]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system