KEGG ORTHOLOGY: K14917

ORTHOLOGY: K14917

Entry

K14917            RNA       KO

Symbol

SNORD88

Name

small nucleolar RNA SNORD88

Brite

KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K14917  SNORD88; small nucleolar RNA SNORD88
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K14917  SNORD88; small nucleolar RNA SNORD88
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
Related small nucleolar RNAs
  Box C/D snoRNAs
   SnoRNAs involved in processing reactions
    K14917  SNORD88; small nucleolar RNA SNORD88
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
Small nucleolar RNA
  K14917  SNORD88; small nucleolar RNA SNORD88

Genes

HSA:	124903100 692202(SNORD88A) 692203(SNORD88B) 692204(SNORD88C)

PTR:	112205158 112206449 112206450 112206499

PPS:	112436816 112437962 112437963 112437964 134729665

GGO:	115930343 115931686 115931687 115931688

PON:	112130245 112130246 112130247 112135989

PPYG:

129011080 129021241 129021243 129021244

NLE:	115832972 115837146 115837147 115837148

HMH:	116474030 116479799 116479800 116479801

SSYN:

129461353 129461354 129461355 129483781

MCC:	114671204 114674256 114674257 114674258

MCF:	123567799 123570432 123570433 123570434

MTHB:

126931912 126943669 126943670 126943671

MNI:	112426839 112429422 112429423 112429424

PANU:

116269065 116271783 116271784 116271785

TGE:	112613664 112613666 112613667 112635703

RRO:	115892573 115892574 115892576 115900202

TFN:	117091245 117094083 117094084 117094086

PTEH:

111520189 111520190 111520191 111552149

CJC:	118144698 118150378 118150379 118150380 118152612

CIMI:

119468687 119468688 119468689 119471563

ANAN:

135275541 135276875 135276876 135276877

LCAT:

123624906 123624907 123624908 123645482

OGA:	111722079 111722080

MMU:	100217433(Snord88a) 100217434(Snord88c) 115486841(Gm26247) 115486842(Gm23991)

MCAL:

115031669 115031670 115031672

RNO:	120100470 120100471 120100472(Snord88c) 120100473(Snord88b) 120100474 120102741

MCOC:

116104395 116104396 116104397 116104398 116104399

ANU:	117700326 117701932 117701945 117701960

ASYL:

127676598 127676600 127676602

MUN:	132649614 132652044 132652045 132652046 132652047 132653402 132655689

CGE:	113835410 113836319 113836320 113836321 113836322

MAUA:

121136223 121136224 121136225 121136226

PROB:

127214042 127214043 127214044 127214045

PLEU:

114684370 114684371 114684372 114684373 114695014 114707492

PMAV:

121821822 121823336 121827017 121827019 121827020 121827021 121827771

MORG:

121455027 121455030 121455035 121455038 121466676

MFOT:

126488225 126488226 126488227 126488228 126497857

AAMP:

119803140 119803141 119803143 119803144 119822089

CPOC:

111755568 111755569 111755570

DSP:	122125908 122125909 122125910

DMER:

138812941 138812942 138812943

PLOP:

125339157 125339158 125339159 125339161

NCAR:

124967642 124967643 124967644 124992036

MMMA:

125612687 125612688

ITI:	120888201 120888202

OCU:	127489397 127493869

OPI:	118760809 118760811

OCZ:	121155188 121155189

CFA:	119866654 119869919 119869920 119869921

CLUD:

112645741 112645742 112645743 112672677

VVP:	112918194 112931582 112931583 112931584

VLG:	121486020 121486022 121486023 121486024

NPO:	129493985 129501108 129501109 129501110

AML:	117795331 117795332 117795333 117802868

UMR:	121101332 121103603 121103604 121103605

UAH:	113247348 113247349 113247350 113252592

UAR:	123778055 123778056 123778057 123784006

LLV:	125085382 125090073 125090075 125090076

MNP:	132006245 132006246 132006247 132017084

MLK:	131819028 131819029 131819030

NVS:	122914902 122914903 122914904

EJU:	114199659 114199660 114199661 114205525

ZCA:	113923995 113936787 113936788 113936789

MLX:	117998405 117998406 117998407 117998740 118012770

NSU:	123323316 123323317 123323731 123323733 123325238

LWW:	115937311 115937312 115937313 115941708

FCA:	111557194 111558151 111558152 111558153

PYU:	121019061 121019062 121019063 121037596

PCOO:

112851449 112851450

PBG:	122493626 122495299 122495300 122495301

PVIV:

125153832 125153833 125153834

LRUF:

124507368 124511958 124511959 124511960

LGF:	123579490 123579491 123579492

AJU:	113593486 113593487 113593488 113600403

PUC:	125916243 125916244 125916246

PLEZ:

122209235 122209236 122209237

HHV:	120230638 120243844 120244777 120244783 120244789

BTA:	112442437 112442438 112442439 112442440

BOM:	138991877 138991878 138991879 138991880

BBUB:

112580489 112580490 112580491 112580492

OAS:	114118124 114118125 114118126 114118127

BTAX:

128064224 128064225 128064226 128064227

CSUM:

138097249 138097250 138097251 138097252

ODA:	120873356 120873357 120873358 120873359

CCAD:

122421845 122421846 122421847 122421848

MREE:

136162331 136162332 136162333 136162334 136173902

OVR:	139030104 139030105 139030106 139030107 139033083 139037904

MBEZ:

129547383 129547384 129547385 129547386

CFR:	116664598 116666143 116666144 116666145 116666146

CDK:	116153752 116155018 116155019 116155020 116155021

VPC:	116278068 116282309 116282310 116282311 116282312

BMUS:

118885969 118885970 118885971 118885972 118891559

OOR:	117198993 117198994 117198995 117198996 117202940

LALB:

132506334 132510526 132510528 132510529 132510530

GMF:	115845199 115849095 115849097 115849098 115849099

DDP:	132417356 132417357 132417358 132417359 132421465

DLE:	115802620 115802621 115802622 115802623 115803493

PCAD:

112063492 112067341 112067343 112067344 112067345

PSIU:

116744836 116744837 116744838 116744839 116750263

PPHC:

136119728 136141566 136141567 136141568 136141569

NASI:

112391294 112415699 112415700 112415701 112415703

ECB:	111775532 111775533 111775534 111775535

EPZ:	139073768 139073769 139073770 139073771

EAI:	123281352 123281353 123281354 123281355

MMYO:

118649313 118649314 118649315 118649316 118649318 118649319 118649320 118649321

MLF:	111824466 111824467 111824468 111824469 111824470 111824471 111824559 111824773 111824774

MDT:	132217706 132217707 132217708 132217709 132217710 132219478

MYUM:

139000438 139000440 139000441 139000442 139000443 139000444 139000446 139000447

PKL:	118710768 118714630 118718778 118718779

EFUS:

114227386 114227387 114227388 114227389 114230837

DRO:	112299969 112310252 112310254 112310256

AJM:	119052045 119052046 119052047

PDIC:

114511743 114511744 114511745

PHAS:

123830362 123830363 123830364

MMF:	118639679 118639681 118639682 118639683

PPAM:

129082991 129082992 129082993

RFQ:	117035684 117035685 117035686

PALE:

112482119 112482125 112482133

PGIG:

120584047 120584048 120614240

PVP:	111732819 111732820 111732821 111735617

RAY:	118611560 118611561 118611562

MJV:	118973837 118973838 118973839

TOD:	119250561 119250562 119250563 119251930

SFUM:

130044594 130044595 130044597

SETR:

125998502 126010247 126016730 126028841 126028843 126028844 126028845

LAV:	111749209 111749682 111749683 111749684 111749685

TMU:	111821523 111821524 111821526 111822160

ETF:	115869010 115869898 115869899 115870421

DNM:	111760234 111760594 111761418 111761419 111761420 111761524 111761986 111763498 111763873

GAS:	123238519 123238520 123243499 123243500 123243501

SHR:	116423122 116423123

AFZ:	127558531 127558533

TVP:	118840583 118840586

PBRV:

138170853

MLAO:

141510735 141510736

OAA:	114814909 114814910 114814911 114814912 114814913 114814914 114814915

TACU:

119933912 119933913 119933914 119933915 119933916 119933917 119933919 119933921

ACYG:

136788876 136789427

LSR:	116184693 116184795

SCAN:

OTC:

PRUF:

ATRC:

CCAE:

ACOE:

ETL:

MMEA:

CCIC:

FCH:

CBOY:

CNIC:

CUCA:

LMIC:

NPD:

ASN:	112549374 112549375 112549379

PSS:	112546424 112546425

CIZ:	142025369 142025370

CMY:	114018266 114018267 119564964

CCAY:

125628498 125628499 125628500

DCC:	119847533 119847534 119847535

CPIC:

112061369 112061370 112061371

CABI:

116818010 116818011 116818012

MRV:	120388974 120388975 120388976

ASAO:

SUND:

PBI:

PMUR:

CTIG:

PGUT:

APRI:

VKO:	123032339 123032344

PMUA:

114583770 114583771

PRAF:

128401091 128401092

ZVI:	118095941 118095942 118095943 118095944

HCG:	128332200 128332201

STOW:

125445377

EMC:	129340763 129340764

XLA:	121395816 121395817 121395818 121396658 121396659 121396662 121396663 121396664 121396665 121396666 121396667

XTR:	116412523 116412524 116412525 116412526 116412527

RTEM:

120916678 120916679 120916680 120916681

ACAT:

141111570 141111571 141111572

PADS:

140341553

BBUF:

120987510 120987511 120987512

BGAR:

122929873 122929874 122929875

DTC:	141085690 141085691 141085692 141085693 141085694 141085696

PWL:	138247549 138247550

MUO:	115467454 115467455

GSH:	117368748 117368749

DRE:

137490050

CCAR:

122136942 122136943 122139150

CAUA:

CGIB:

PTET:

LROH:

GRF:

OMC:

PPRM:

RKG:	130097261 130097262

MAMB:

CIDE:

CERY:

MASI:

TROS:

TDW:	130427030 130427031

MANU:

129436992

PDAB:

135771218

IPU:	124626559 124626560

IFU:	128604604 128604609

PHYP:

113528659 113528660

SMEO:

124397405 124397406

TFD:	113642144 113642146

TVC:	132861758 132861759

CGAR:

128545137 128545138

NGRA:

132869490

TRN:	134300445 134300446 134300447

AMEX:

125784544 125784545

CMAO:

118821873 118821874

EEE:	113590908 113590909

CHAR:

116222737 116222738

SPIL:

134077688 134077689

ASAD:

121706358 121706359

TRU:	115250089 115250090 115250091

TFS:	130515612 130515613 130515614

LCO:	113747189 113747190 113747191

TBEN:

117493710 117493711 117493712

CGOB:

115012895 115012896 115012897

PGEO:

117451802 117451804 117451805

GACU:

117548895 117548896 117548897

EMAC:

134878797 134878798 134878799

ELY:	117269109 117269110 117269111

EFO:	125880222 125880223 125880224

PLEP:

121957343 121957344

SLUC:

116064037 116064038 116064039

ECRA:

117958786 117958787 117958788

ESP:	116703816 116703818 116703819

PFLV:

114570444 114570447 114570448

GAT:	120828533 120828534

PPUG:

119221161 119221163

AFB:	129099182 129099184 129099185 129099186

CLUM:

117735735 117735736 117735739

PSWI:

130189415 130189416 130189417

CANA:

137787277 137787278 137787279

CVE:	137885754 137885755 137885756

MSAM:

119896654 119896655

SCHU:

122869608 122869609 122869610

CUD:	121504030 121504032 121504033

SPUL:

138604503 138604504

LMIX:

132954770 132954771 132954772

HTC:	141810252 141810253 141810254

ALAT:

119014852 119014854 119014855 119014856 119014857 119014858

ASTR:

137610394 137610396

MZE:	111500537 111500538 111500539

ONL:	112846809 112846810 112846811

OAU:	116329264 120440100 120440101

OLA:	111947848 111947849

OML:	112147029 112147031

CSAI:

133422849 133422850 133422851

XMA:	111611750 111611751

XCO:	114160573 114160575

XHE:	116736315 116736316

GAF:	122822659 122822660

PPRL:

129374051 129374052

CTUL:

119791313 119791314 119791315

GMU:	124863621 124863622 124865080 124865081

KMR:	112450611 112450612 112450613

NWH:	119418785 119418788 119422245 119422246

EJA:	138207977 138207981 138207982

BFRE:

138627081 138627082 138627083

MCEP:

124998534 124998535 124998537

SSEN:

122785941 122785942 122785943

SSOE:

131442896 131442897 131442898

HHIP:

117767092 117767093 117767094

HSP:	118124140 118124141 118124142

PPLT:

128459346 128459347 128459348

SMAU:

118289628 118289630 118289631

LCF:	127143060 127143061 127143062

SLAL:

111660639 111660640 111660641

XGL:	120788515 120788516 120788517

SSCV:

125984275 125984276

SBIA:

133515164 133515165

PEE:	133415533 133415534

PTAO:

133466680 133466681

BSPL:

114861176 114861177

SJO:	128379688 128379689

SSCO:

134000325 134000326

TTY:	137168716 137168717 137168719

GMH:	115539491 115539493 115539494

STRU:

115147603 115147611 115147616 115189522 115189524 115189525

OTW:	112242434 112242435 112259511

OMY:	118937941 118937942 118937943 118938635 118938636 118938637

OGO:	124000917 124000918 124000919 124027189 124027190 124027191 124028860 124028861 124028863

ONE:	115126192 115126193 115126194 115126810 115126811 115126812

OKI:	116374535 116374536 116374537 116376063 116376064

OKE:	118380790 118380791 118380792

OMM:	135554913 135554914 135554916 135557015 135557016 135557017

OCLA:

139365377 139365378 139365379 139423304 139423305 139423306

SALP:

112076125

SNH:	120042702 120042703 120042704 120045256 120045257 120045258

SFON:

129834073 129834075 129834076 129850306 129850307

CCLU:

121570849 121570850 121570851 121570852 121570854 121570855

ELS:	114840454 114840455 114840456

OEP:	134015936 134015946 134015961

SFM:	114909240 114909241 114909242

PKI:	111836531 111858266 111858267

AANG:

AROT:

CCOG:

STOZ:

HAKA:

SPU:

Reference

PMID:26867678

Authors

Chen S, Blank MF, Iyer A, Huang B, Wang L, Grummt I, Voit R

Title

SIRT7-dependent deacetylation of the U3-55k protein controls pre-rRNA processing.

Journal

Nat Commun 7:10734 (2016)
DOI:10.1038/ncomms10734

Sequence

[hsa:692203]

LinkDB

DBGET integrated database retrieval system