KEGG ORTHOLOGY: K14926

ORTHOLOGY: K14926

Entry

K14926            RNA       KO

Symbol

SNORA40, ACA40, SNR49

Name

small nucleolar RNA SNORA40

Brite

KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K14926  SNORA40, ACA40, SNR49; small nucleolar RNA SNORA40
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K14926  SNORA40, ACA40, SNR49; small nucleolar RNA SNORA40
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
Related small nucleolar RNAs
  Box H/ACA snoRNAs
   SnoRNAs act as guides for pseudouridynation
    K14926  SNORA40, ACA40, SNR49; small nucleolar RNA SNORA40
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
Small non-coding RNA
  Small nucleolar RNA
   K14926  SNORA40, ACA40, SNR49; small nucleolar RNA SNORA40

Genes

HSA:	109616967(SNORA40B) 109616968(SNORA40C) 124900209 124900228 124900245 124900246 124900268 124900298 124900333 124900400 124900444 124900462 124900534 677822(SNORA40)

PTR:	112204293 112204681 112204907 112205152 112206171 112206580 112207359 112208265 112208498 112209351 112209670 112209671 112209918 112209919

PPS:	112436810 112437662 112438020 112438486 112438987 112439180 112439971 112440263 112440264 112440586 112440587 112440767 112441082 112441295

GGO:	115930339 115931337 115931775 115932368 115933639 115933872 115934854 115935168 115935489 115935490 115935700 115936125 115936386

PON:	112129802 112130404 112131419 112132188 112132487 112133627 112134061 112134497 112134808 112135331 112135643 112135984

NLE:	115830554 115830732 115831064 115831361 115831362 115831634 115831956 115833618 115834571 115837141 115837791 115838133 115838134

HMH:	116461554 116462824 116463068 116464808 116466200 116470075 116470076 116474016 116477714 116479792 116481346 116809924 116814009

MCC:	114670225 114670226 114670678 114671620 114672541 114673311 114675124 114675239 114677251 114677888 114680505

MCF:	123567004 123567005 123567358 123567795 123568167 123568946 123569630 123571152 123571500 123572658 123573239 123575398

MTHB:

126929922 126931908 126933283 126936721 126940050 126945417 126947035 126951848 126954077 126961929 126963489 126963490

MNI:	112423173 112423332 112424392 112424875 112424997 112426215 112427183 112428523 112428612 112428659 112429223 112429298

PANU:

116268750 116269061 116269309 116269601 116269909 116270888 116271146 116272263 116272360 116272996 116274787

TGE:	112607494 112610484 112616182 112616744 112621954 112630877 112632285 112632286 112633885 112635699 112636819

RRO:	115893376 115893773 115895046 115897187 115897188 115898488 115898903 115899454 115899814 115900590 115900591

TFN:	117063814 117073883 117077061 117078663 117079703 117081879 117082910 117095516 117098174

PTEH:

111524802 111527495 111536039 111536540 111536715 111537738 111538674 111541015 111546703 111548262 111551721

CJC:	118148188 118149804 118151955 118151956

CIMI:

119466928 119468787 119469166 119469298 119470052 119470510 119471051 119471619 119473171 119473389

LCAT:

123622956 123628987 123637638 123643146

OGA:	111721927 111722449 111724669 111724670 111728009

MMU:	100302567(MBI-142) 115487304(Gm22382) 115487305(Gm57552) 115487533(Gm22186) 115487671(Gm24173) 115488076(Gm57594) 115488426(Gm26251) 115488846(Gm25909) 115489238(Gm23320) 115490068(Gm57731) 115490289(Gm22490)

MCAL:

115029165 115029335 115030208 115030294 115031040 115031228 115031229 115031666 115031843 115032067 115032254 115032884

RNO:	120093474 120094521 120099514 120100461 120100462 120100463 120100464 120102737 120103349

MCOC:

116072309 116074144 116076622 116081355 116081356 116085539 116096315 116097339 116097671 116104389

ANU:	117695651 117696882 117697575 117698464 117700031 117701892 117701899 117704810 117712210 117721119

MUN:	132647581 132647582 132647583 132649824 132650267 132652035 132652038 132652659 132652662

CGE:	113830862 113830926 113832416 113832910 113833148 113834927 113835138 113835168 113835250 113835510 113836837 113837232

MAUA:

121134202 121135612 121135856 121135898 121136019 121139614 121139615 121140104 121140599 121141671

PLEU:

114684062 114685443 114687137 114692163 114696383 114703105 114705251 114707996

MORG:

121438722 121450256 121450257 121452075 121459181

MFOT:

126486816 126487691 126491714 126491792 126492816 126495179 126500184

AAMP:

119800569 119806109 119810941 119810942 119822081 119822083

CPOC:

111755296 111756418 111756894 111756953 111757747

DSP:	122094979 122097880 122097881 122110882 122111585 122111983 122113350 122114741

PLOP:

125341265 125341647 125342262 125344415 125349799 125350950 125350954 125361125 125364351 125364352 125364356 125365087 125366601

NCAR:

124960841 124968743 124968749 124978524 124986042 124987756

OCU:	127483630 127484285 127484689 127490461 127490462 127491921

OPI:	118759181 118759365 118759625

CFA:

119865055

CLUD:

112642188

VVP:	112915915 112917638

VLG:	121476691 121480464

NPO:

129506864

AML:	117802515 117803630

UMR:

121102961

UAH:

113260247

UAR:

123787919

LLV:	125080300 125082780 125085377 125086481 125096673 125099571 125101469 125103448 125105915 125108130 125110189

MNP:	132003062 132009548 132014804 132018898

NVS:	122892851 122898317 122914897

EJU:	114212645 114221590 114221756

ZCA:	113915627 113923271 113928180

MLX:	117997568 118013595 118025865

NSU:	123325028 123325642 123326333

LWW:	115940827 115941902 115942405

FCA:	111556857 111560706 111561577 111562167

PYU:	121020655 121027926 121039133 121039570

PCOO:

112849166 112853825 112866233

PBG:	122474173 122482369 122484597 122490712

LRUF:

124502808 124506590 124516842 124529528

PUC:	125908519 125913843 125917755

AJU:	113593843 113593988 113599695

HHV:	120225698 120243359

BTA:	112441673 112444804 112444972

BBUB:

112577876 112579749 112581319 112583118 112583120 112584824 112587465

OAS:	114109490 114110220 114116767 114118121 121818386 121820094

BTAX:

128052903 128058450 128064221 128069314 128070679

ODA:	120860513 120868517 120874930 120882701

CCAD:

122425230 122426934 122436204 122450686 122452651 122453467

MBEZ:

129549143 129554983 129563638

CFR:	116658078 116662309 116666716

CDK:	116147553 116151104 116155509

VPC:	116276774 116277759 116278614 116279326 116283018 116284374

OOR:	117200247 117200281 117202168

DLE:	115801990 115802225 115803206 115803904

PCAD:

112065073 112065449 112065941 112067012 112067085

PSIU:

116745553 116750256 116754837

NASI:

112390391 112414464

ECB:

111774527

EAI:

123279220

MMYO:

118657224 118662209 118665596 118670375

MLF:	111825802 111826555 111826821

PKL:	118704187 118713849 118715811 118731089

EFUS:

114227085 114228573 114228700 114229367 114232453 114233454 129148902

DRO:	112308359 112321595

SHON:

118976289 118978670 118980411 118984299 118999708

AJM:	119050931 119054224 119056488

PDIC:

114489759 114493718 114501206 114501207 114504427

PHAS:

123805693 123812286 123814469 123816005 123817800 123818956

MMF:	118622140 118622592 118629185

RFQ:	117012029 117015514 117027877 117031380

PALE:

112476261

PGIG:

120590703

PVP:

111729280

MJV:	118971200 118972426 118974059

TOD:	119230229 119242461 119242462

LAV:

111752140

TMU:	111820666 111822231

ETF:	115869663 115870538 115872108

DNM:	111759717 111761889 111764370

GAS:

SHR:

AFZ:

OAA:

GGA:

PCOC:

MGP:

CJO:

APLA:

ACYG:

AFUL:

TGU:

LSR:

SCAN:

PMOA:

OTC:

PRUF:

PMAJ:

CCAE:

CCW:

ETL:

ZAB:

FCH:

ACUN:

TALA:

ACHC:

AGEN:

GCL:

ACAR:

AROW:

NPD:

DNE:

ASN:

PSS:	112543726 112545904 112547646

CMY:	114021202 114021705

CPIC:

TST:

CABI:

MRV:

PMUA:

PRAF:

ZVI:

STOW:

XLA:	121400264 121400825

XTR:

RTEM:

BBUF:

BGAR:

MUO:

CMK:

SCE:	YNCN0018W(SNR49)

AGO:	AGOS_AgSNR49

SLUD:

SCDLUD_003781

» show all

Reference

PMID:15199136

Authors

Kiss AM, Jady BE, Bertrand E, Kiss T

Title

Human box H/ACA pseudouridylation guide RNA machinery.

Journal

Mol Cell Biol 24:5797-807 (2004)
DOI:10.1128/MCB.24.13.5797-5807.2004

Sequence

[hsa:677822]

LinkDB

DBGET integrated database retrieval system