KEGG   ORTHOLOGY: K18527
Entry
K18527            RNA       KO                                     
Symbol
spf
Name
small regulatory RNA Spot 42
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K18527  spf; small regulatory RNA Spot 42
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K18527  spf; small regulatory RNA Spot 42
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   Other RNA degradation factors
    Bacterial Small RNA Regulators
     K18527  spf; small regulatory RNA Spot 42
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Other RNA
  Unclassified
   K18527  spf; small regulatory RNA Spot 42
Genes
ECO: b3864(spf)
ECJ: JWR0097(spf)
ECD: ECDH10B_4053(spf)
EBW: BWG_4260(spf)
ECOK: ECMDS42_3302(spf)
ECE: Z5399(spf)
ECF: ECH74115_5308(spf)
EOI: ECO111_ncRNA65(spf)
EOJ: ECO26_ncRNA62(spf)
EOH: ECO103_ncRNA64(spf)
ECK: EC55989miscRNA93(spf)
ECG: E2348C_ncR_66(spf)
EOK: G2583_4663(spf)
ECX: EcHS_A4796(spf)
ECR: ECIAI1_miscRNA_82(spf)
ECQ: ECED1_misc_RNA_80(spf)
EUM: ECUMN_misc_RNA_72(spf)
ECT: ECIAI39_miscRNA70(spf)
ECZ: ECS88_misc_RNA_79(spf)
ECL: EcolC_R0115
EDJ: ECDH1ME8569_o0076(spf)
ELW: ECW_nc4165(spf)
ELF: LF82_s2164(spf)
ECOI: ECOPMV1_04224
EFE: EFER_misc_RNA_61(spf)
STY: STYs009(spf)
STT: t4648(spf)
SEO: STM14_4810(spf)
SEY: Spf(Spf)
SPT: SPA3841
SPQ: SPAB_04961
SEH: SeHA_C4328(spf)
SHB: SU5_nc5
SEE: SNSL254_A4282(spf)
SEW: SeSA_A4211(spf)
SEA: SeAg_B4232(spf)
SED: SeD_A4389(spf)
SES: SARI_03660
SFL: SF4562(spf)
SFX: S3812(spf)
SBC: SbBS512_E4466(spf)
ESA: ESA_04041
CTU: CTU_R01050
CKO: CKO_03150
EBF: D782_4491
YPK: ys003
YPA: YPA_r084
YPN: YPN_r030
YPM: YP_s1(spf)
YPP: YPDSF_R0104
YPG: YpAngola_A4213(spf)
YPS: YPTB_RNA_89(spf)
YPI: YpsIP31758_4297(spf)
YEE: YE5303miscRNA0001
SMAF: D781_4551
RAQ: Rahaq2_4509
ECA: spot_42(spot_42)
PATO: GZ59_00270(spf)
DDD: Dda3937_04680(spf)
PAM: PANA_ncRNA2(spot_42)
XBV: XBW1_misc_RNA_2
XNM: XNC2_misc_RNA_2
XDO: XDD1_misc_RNA_2
XPO: XPG1_misc_RNA_2
VHA: VIBHAR_00573
VSP: VS_m0109
VNI: VIBNI_AmiscRNA_1
VAU: spf(spf)
VTA: AMISCRNA9
VAQ: FIV01_14290(spf)
VSR: Vspart_03283
VFI: VF_2579(spf)
VSA: VSAL_I3103s(spot_42)
AWD: AWOD_I_sRNA_007
SON: SO_m006(spf)
SBN: Sbal195_R0151
SWD: Swoo_R0005
SBK: SHEWBE_MISCRNA6
ASA: ASA_4130(spot42)
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Reference
PMID:2440852
  Authors
Rice PW, Polayes DA, Dahlberg JE
  Title
Spot 42 RNA of Escherichia coli is not an mRNA.
  Journal
J Bacteriol 169:3850-2 (1987)
DOI:10.1128/JB.169.8.3850-3852.1987
  Sequence
[eco:b3864]
LinkDB

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