KEGG   ORTHOLOGY: K19089
Entry
K19089                      KO                                     
Symbol
cas5a_b_c
Name
CRISPR-associated protein Cas5a/b/c
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system
    K19089  cas5a_b_c; CRISPR-associated protein Cas5a/b/c
Prokaryotic defense system [BR:ko02048]
 CRISPR-Cas system
  Type I CRISPR-Cas system
   Subtype I-A factors
    K19089  cas5a_b_c; CRISPR-associated protein Cas5a/b/c
Other DBs
COG: COG1688
Genes
LDI: 104341667(HOXC9)
AVIT: 104273819
ACAR: 104518279(HOXC9)
SGRE: 126336634
LGI: LOTGIDRAFT_168234
LSV: 111886871
CRE: CHLRE_08g362150v5
CNE: CNL04590
CNG: CNAG_05166
CDEC: 89987380(IAS62_000604)
CDEP: 91090493(L203_106285)
KMG: 30163875(I203_103844)
KNE: 92179141(IAR55_001882)
KDJ: 28968182(I303_104539)
KBI: 30209780(I302_106257)
KPIN: 30172876(I206_103920)
KSH: 87955682(IL334_003551)
KER: 91100113(V865_001309)
KEP: 91094675(L201_004005)
CCAC: CcaHIS019_0308250(SWR1)
TVA: 4768621(TVAGG3_0000580)
ECOM: QTN59_09340(cas5)
ELGW: WGN25_04175(cas5)
MVH: ACN6A1_00395(cas5)
SORG: NQZ70_10517(devS)
TPOL: Mal48_15440(devS)
SING: V5E97_03740(cas5)
LIL: LA_3193
LIE: LIF_A2567
LIC: LIC_10935(devS)
LIS: LIL_12698
CHZ: CHSO_2613
TYE: THEYE_A1099(cas5_1)
BLEN: NCTC4824_01216(hisZ)
BBOR: RFB14_03820(cas5)
LRE: Lreu_0345
LRF: LAR_0334
LRT: LRI_1594(proA)
LRR: N134_01815(proA)
CBV: U729_2217(cas5)
STRM: M444_06065
SNF: JYK04_01377(glmS_1)
KIS: HUT16_17045(cas5)
SYNH: HTZ78_05015(cas5)
TSQ: D3A95_10045(cas5)
LEPT: JVX88_17775(cas5)
LEPI: EDM05_034105(cas5)
CSAU: ACL6C3_14940(cas5)
DOT: EZY12_06775(cas5)
DOC: HEQ26_13225(cas5)
MJA: MJ_0382
MESA: MLASG1_0326(cas)
AFU: AF_1872
FPL: Ferp_1865
PFU: PF0641
PFI: PFC_02340
PHO: PH0919(PH0919)
PAB: PAB1687
PYN: PNA2_1819
PYS: Py04_0804
TKO: TK0452
TGA: TGAM_1293
TLT: OCC_13315
TEU: TEU_06695
TAGG: NF865_08025(cas5a)
SMR: Smar_0322
IHO: Igni_1139
IIS: EYM_02735
DKA: DKAM_0776
TAG: Tagg_0802
IAG: Igag_0915
HBU: Hbut_0643
PARE: PYJP_06180
STO: STK_00300(cas5) STK_26380(cas5)
SOH: D1869_14400(cas5a)
SOL: Ssol_2277
SSOA: SULA_2311(cas5a)
SSOL: SULB_2312(cas5a)
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SID: M164_0911
SII: LD85_0947
SIH: SiH_0405
SIR: SiRe_0768
SIC: SiL_0389
SULE: GFS03_04740(cas5a) GFS03_04940(cas5a)
SULL: EWF20_00675(cas5a)
MSE: Msed_1142
MEMJ: MJ1HA_1274
MPRU: DFR88_00810(cas5a)
MCN: Mcup_1152
MTEN: GWK48_10290(cas5a)
AHO: Ahos_1744
ABRI: DFR85_12105(cas5a)
ASUL: DFR86_11555(cas5a)
ACIH: HS5_16500
PAI: PAE0209
PCL: Pcal_1270
PAS: Pars_1128
PYR: P186_0961
POG: Pogu_1146
CMA: Cmaq_1523
VDI: Vdis_1692
VMO: VMUT_1394
THEL: IG193_08765(cas5a)
KCR: Kcr_0430
MVJ: ACO0C9_01540(cas5a)
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Reference
  Authors
Lintner NG, Kerou M, Brumfield SK, Graham S, Liu H, Naismith JH, Sdano M, Peng N, She Q, Copie V, Young MJ, White MF, Lawrence CM
  Title
Structural and functional characterization of an archaeal clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR)-associated complex for antiviral defense (CASCADE).
  Journal
J Biol Chem 286:21643-56 (2011)
DOI:10.1074/jbc.M111.238485
  Sequence
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system