KEGG ORTHOLOGY: K19415

ORTHOLOGY: K19415

Entry

K19415                      KO

Symbol

PHF8, JHDM1F

Name

[histone H3]-dimethyl-L-lysine9 demethylase [EC:1.14.11.65 1.14.11.-]

Disease

H00658

X-linked syndromic intellectual developmental disorder

Brite

KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03036 Chromosome and associated proteins
    K19415  PHF8, JHDM1F; [histone H3]-dimethyl-L-lysine9 demethylase
Enzymes [BR:ko01000]
1. Oxidoreductases
  1.14  Acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen
   1.14.11  With 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom of oxygen into each donor
    1.14.11.65  [histone H3]-dimethyl-L-lysine9 demethylase
     K19415  PHF8, JHDM1F; [histone H3]-dimethyl-L-lysine9 demethylase
Chromosome and associated proteins [BR:ko03036]
Eukaryotic type
  Histone modification proteins
   Histone demethylases
    K19415  PHF8, JHDM1F; [histone H3]-dimethyl-L-lysine9 demethylase

Other DBs

GO:

0032454

Genes

HSA:	23133(PHF8)

PTR:	465652(PHF8)

PPS:	100973092(PHF8)

GGO:	101133194(PHF8)

PON:	100461475(PHF8)

NLE:	100601220(PHF8)

HMH:	116811077(PHF8)

MCC:	703633(PHF8)

MCF:	102128432(PHF8)

MTHB:

126946486

MNI:	105493782(PHF8)

CSAB:

103232021(PHF8)

CATY:

105598631(PHF8)

PANU:

101015006(PHF8)

TGE:	112615507(PHF8)

MLEU:

105548124(PHF8)

RRO:	104682297(PHF8)

RBB:

108521720

TFN:	117078480(PHF8)

PTEH:

111536168(PHF8)

CANG:

105514921(PHF8)

CJC:	100405966(PHF8) 103791420

SBQ:	101038744(PHF8)

CIMI:

108297022(PHF8)

CSYR:

103255240

MMUR:

105867068(PHF8)

LCAT:

123628023(PHF8)

PCOQ:

105826066(PHF8)

OGA:	100965601(PHF8)

MMU:	320595(Phf8)

MCAL:

110286584(Phf8)

MPAH:

110313305(Phf8) 110335393

RNO:	299557(Phf8l) 317425(Phf8)

MCOC:

116089734(Phf8)

ANU:	117694335(Phf8)

MUN:	110539603(Phf8) 110559649

CGE:	100756628(Phf8) 100774109

MAUA:

101827700 101838178(Phf8)

PROB:

127216719 127217688(Phf8)

PLEU:

114702881(Phf8)

MORG:

121443097 121445328

MFOT:

126492155

AAMP:

119804634(Phf8)

NGI:	103747314(Phf8)

HGL:	101716284(Phf8)

CPOC:

100721757(Phf8)

CCAN:

109678510(Phf8)

DORD:

106000517(Phf8)

DSP:	122112019(Phf8)

PLOP:

125343282(Phf8)

NCAR:

124972075

MMMA:

107159862(Phf8)

OCU:

100344764

OPI:	101528834(PHF8)

TUP:	102482466(PHF8)

GVR:

103606305

CFA:	491897(PHF8)

CLUD:

112673067(PHF8)

VVP:	112912465(PHF8)

NPO:	129517734(PHF8)

AML:	100481292(PHF8)

UMR:	103681294(PHF8)

UAH:	113247534(PHF8)

UAR:	123793526(PHF8)

ELK:

111139928

LLV:

125091686

MPUF:

101680792(PHF8)

MNP:	132007714(PHF8)

MLK:	131820735(PHF8)

NVS:	122896281(PHF8)

ORO:	101368265(PHF8)

EJU:	114200637(PHF8)

ZCA:	113930714(PHF8)

MLX:	117999051(PHF8)

NSU:	110588792(PHF8)

LWW:	102734232(PHF8)

FCA:	101092337(PHF8)

PYU:	121024724(PHF8)

PCOO:

112870793(PHF8)

PBG:	122476885(PHF8)

PVIV:

125157204(PHF8)

LRUF:

124522277

PTG:	102951883(PHF8)

PPAD:

109261301(PHF8)

PUC:

125932157

AJU:

106985228

HHV:	120225764(PHF8)

BTA:	513959(PHF8)

BOM:	102283438(PHF8)

BIU:	109554894(PHF8)

BBUB:

102402096(PHF8)

BBIS:

104992874(PHF8)

CHX:

102186671

OAS:	101118668(PHF8)

BTAX:

128069848(PHF8)

ODA:	120882172(PHF8)

CCAD:

122434784(PHF8)

MBEZ:

129564266(PHF8)

SSC:	100520413(PHF8)

CFR:	102518453(PHF8)

CBAI:

105081541(PHF8)

CDK:	105093683(PHF8)

VPC:	102527192(PHF8)

BACU:

103000580(PHF8)

BMUS:

118888780(PHF8)

LVE:	103071419(PHF8)

OOR:	101287099(PHF8)

DLE:	111169400(PHF8)

PCAD:

102979345(PHF8)

PSIU:

116747525(PHF8)

NASI:

112414609(PHF8)

ECB:	100060410(PHF8)

EPZ:

103544040

EAI:	106827349(PHF8)

MYB:	102241201(PHF8)

MYD:	102759691(PHF8)

MMYO:

118653685(PHF8)

MLF:	102418268(PHF8)

PKL:	118714031(PHF8)

EFUS:

103301343(PHF8)

MNA:	107538839(PHF8)

DRO:	112308159(PHF8)

SHON:

118997788(PHF8)

AJM:	119055472(PHF8)

PDIC:

114505471(PHF8)

PHAS:

123814866(PHF8)

MMF:	118635658(PHF8)

PPAM:

129064592(PHF8)

HAI:	109396386(PHF8)

RFQ:	117026358(PHF8)

PALE:

102894028(PHF8)

PGIG:

120593556(PHF8)

PVP:	105307799(PHF8)

RAY:	107506610(PHF8)

MJV:	108396206(PHF8)

TOD:	119245659(PHF8)

SARA:

101555528(PHF8)

SETR:

125999168(PHF8)

LAV:	100660627(PHF8)

TMU:

101360722

ETF:	101652871(PHF8)

DNM:	101443377(PHF8)

MDO:	100019755(PHF8)

GAS:	123253723(PHF8)

SHR:	100914942(PHF8)

AFZ:

127543210

PCW:	110203535(PHF8)

OAA:	100078761(PHF8)

TGU:	115492034(PHF8)

LSR:	110480571(PHF8)

SCAN:

103825198

PMOA:

120503083(PHF8)

OTC:	121336826(PHF8)

PRUF:

121357335(PHF8)

FPG:	101923116(PHF8)

FCH:	102059772(PHF8)

ACHC:

115338232(PHF8)

AGEN:

126035175

AROW:

112972632(PHF8)

ASN:	102367801(PHF8)

AMJ:	102576916(PHF8)

CMY:	119564919(PHF8)

CCAY:

125628172(PHF8)

DCC:	119846969(PHF8)

CABI:

116818902(PHF8)

MRV:	120388512(PHF8)

ACS:	100566919(phf8)

ASAO:

132767891(PHF8)

PVT:	110078613(PHF8)

SUND:

121922074(PHF8)

PBI:	103057322(PHF8)

PMUR:

107286551(PHF8)

CTIG:

120318427(PHF8)

TSR:	106549042(PHF8)

PGUT:

117675459(PHF8)

APRI:

131193347(PHF8)

PTEX:

113443361(PHF8)

NSS:	113417747(PHF8)

VKO:	123029951(PHF8)

PMUA:

114587329(PHF8)

PRAF:

128405143(PHF8)

ZVI:	118075479(PHF8)

HCG:	128344296(PHF8)

GJA:	107120718(PHF8)

STOW:

125429704(PHF8)

EMC:	129346600(PHF8)

XLA:	108699998(phf8.S) 398683(phf8.L)

XTR:	733740(phf8)

NPR:	108790443(PHF8)

RTEM:

120913173(PHF8)

BBUF:

120977166(PHF8)

BGAR:

122946058 122946085

MUO:	115463599(PHF8)

GSH:	117349034(PHF8)

DRE:	566534(phf8)

SRX:	107716077 107745465

SANH:

107681973 107695732

SGH:	107563633 107570386

CCAR:

109075367 109081251(phf8)

CAUA:

113065491 113070542

CGIB:

127944654 128011734

PTET:

122328891(phf8)

LROH:

127154802(phf8)

OMC:	131531741(phf8)

PPRM:

120463240(phf8)

RKG:	130073425(phf8)

MAMB:

125259671(phf8)

CIDE:

127504649

MASI:

127419319 127420597

TROS:

130544899(phf8)

TDW:	130409424(phf8)

MANU:

129431410(phf8)

IPU:

108276206

IFU:	128619507(phf8)

PHYP:

113530637(phf8)

TFD:	113658180(phf8)

TVC:	132862757(phf8)

AMEX:

103038657(phf8)

CMAO:

118822123(phf8)

EEE:	113584437(phf8)

CHAR:

105897360(phf8)

TRU:	101063341(phf8)

TFS:	130530141(phf8)

LCO:	104932735(phf8)

NCC:	104956848(phf8)

TBEN:

117494000(phf8)

CGOB:

115010619(phf8)

PGEO:

117449308(phf8)

GACU:

117542020(phf8)

EMAC:

134873960(phf8)

ELY:	117258513(phf8)

EFO:	125892115(phf8)

PLEP:

121946905(phf8)

SLUC:

116039152(phf8)

ECRA:

117947756(phf8)

ESP:	116693308(phf8)

PFLV:

114558895(phf8)

GAT:	120829087(phf8)

PPUG:

119221933(phf8)

AFB:	129099945(phf8)

CLUM:

117734054(phf8)

PSWI:

130199672(phf8)

MSAM:

119905498(phf8)

SCHU:

122882923(phf8)

CUD:	121517595(phf8)

ALAT:

119023479(phf8)

MZE:	101478139(phf8)

ONL:	100707999(phf8)

OAU:	116325803(phf8)

OLA:	101166128(phf8)

OML:	112159175(phf8)

CSAI:

133457204(phf8)

XMA:	102222440(phf8)

XCO:	114145833(phf8)

XHE:	116727017(phf8)

PRET:

103467329(phf8)

PFOR:

103141155(phf8)

PLAI:

106935046(phf8)

PMEI:

106904331(phf8)

GAF:	122844097(phf8)

PPRL:

129372464(phf8)

CVG:	107086788(phf8)

CTUL:

119782202(phf8)

GMU:	124873673(phf8)

NFU:	107390865(phf8)

KMR:	108244610(phf8)

ALIM:

106534448(phf8)

NWH:	119417631(phf8)

AOCE:

111576533(phf8)

MCEP:

125019920(phf8)

CSEM:

103384580(phf8)

POV:	109630635(phf8)

SSEN:

122777424(phf8)

HHIP:

117764736(phf8)

HSP:	118111647(phf8)

SMAU:

118317592(phf8)

LCF:

108876399

SDU:	111219101(phf8)

SLAL:

111670732(phf8)

XGL:	120804106(phf8)

HCQ:	109520217(phf8)

SSCV:

125988829

PEE:	133402474(phf8)

PTAO:

133478669(phf8)

BPEC:

110164574(phf8)

MALB:

109971338(phf8)

BSPL:

114859042(phf8)

SJO:	128357365(phf8)

SASA:

106567021 106572710

STRU:

115165474 115167816

OTW:	112216368 112221678

OMY:	110532714 118939533

OGO:	124032299 124046112

ONE:	115102683 115132508

OKI:	109869377 109908318

OKE:	118360129 118360666

SALP:

111966133 111977024

SNH:	120059087 120061008

CCLU:

121537874 121545881

ELS:	105013526(phf8)

SFM:	108918571 108939360

PKI:	111857050(phf8)

AANG:

118207776(phf8)

LOC:

102684829

PSPA:

121329054(phf8)

ARUT:

117401790 117970892

PSEX:

120543264(phf8)

LCM:	102360659(PHF8)

PMRN:

LRJ:

BFO:

BBEL:

SPU:

APLC:

AME:

ACER:

ALAB:

ADR:

AFLR:

BIM:

BBIF:

BVK:

BVAN:

BTER:

BAFF:

BPYO:

BPAS:

FVI:

CCAL:

OBB:

OLG:

MGEN:

NMEA:

CGIG:

SOC:

MPHA:

AEC:

ACEP:

PBAR:

VEM:

HST:

DQU:

CFO:

FEX:

LHU:

PGC:

OBO:

PCF:

PFUC:

VPS:

VCRB:

VVE:

NVI:

CSOL:

MDL:

CGLO:

FAS:

DAM:

DSM:

NPT:

NFB:

NLO:

NVG:

AROA:

TCA:

DPA:

SOY:

ATD:

AGB:

NVL:

OTU:

BMOR:

BMAN:

MSEX:

DPL:	KGM_213911

PMAC:

PPOT:

PXU:

PRAP:

ZCE:

AAGE:

HAW:

HZE:

TNL:

SLIU:

PXY:

CLEC:

NLU:

ZNE:

CSEC:

FCD:

DPX:	DAPPUDRAFT_302352

DMK:

116921174

PVM:

113829036

HAME:

121853687

MNZ:	135210648 135216335

EAF:

DSV:

TUT:

CSCU:

PTEP:

ABRU:

UDV:

SDM:

LPOL:

CEL:	CELE_F29B9.2(jmjd-1.2)

CBR:	CBG_01727(Cbr-jmjd-1.2)

CRQ:	GCK72_006608 GCK72_014587

NAI:	NECAME_07829

HRO:	HELRODRAFT_84338

LGI:	LOTGIDRAFT_125461

PCAN:

HRF:

CANU:

MYI:

PMAX:

MCAF:

LAK:

Reference

PMID:20622853

Authors

Qi HH, Sarkissian M, Hu GQ, Wang Z, Bhattacharjee A, Gordon DB, Gonzales M, Lan F, Ongusaha PP, Huarte M, Yaghi NK, Lim H, Garcia BA, Brizuela L, Zhao K, Roberts TM, Shi Y

Title

Histone H4K20/H3K9 demethylase PHF8 regulates zebrafish brain and craniofacial development.

Journal

Nature 466:503-7 (2010)
DOI:10.1038/nature09261

Sequence

[dre:566534]

Reference

PMID:16199551

Authors

Laumonnier F, Holbert S, Ronce N, Faravelli F, Lenzner S, Schwartz CE, Lespinasse J, Van Esch H, Lacombe D, Goizet C, Phan-Dinh Tuy F, van Bokhoven H, Fryns JP, Chelly J, Ropers HH, Moraine C, Hamel BC, Briault S

Title

Mutations in PHF8 are associated with X linked mental retardation and cleft lip/cleft palate.

Journal

J Med Genet 42:780-6 (2005)
DOI:10.1136/jmg.2004.029439

Sequence

[hsa:23133]

LinkDB

DBGET integrated database retrieval system