KEGG ORTHOLOGY: K26306

ORTHOLOGY: K26306

Entry

K26306            RNA       KO

Symbol

SNORD53_92

Name

small nucleolar RNA SNORD53/92

Brite

KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K26306  SNORD53_92; small nucleolar RNA SNORD53/92
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K26306  SNORD53_92; small nucleolar RNA SNORD53/92
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
Related small nucleolar RNAs
  Box C/D snoRNAs
   SnoRNAs act as guides for 2'-O-ribose methylation
    K26306  SNORD53_92; small nucleolar RNA SNORD53/92
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
Small nucleolar RNA
  K26306  SNORD53_92; small nucleolar RNA SNORD53/92

Genes

HSA:	109617012(SNORD53B) 26796(SNORD53) 692209(SNORD92)

PTR:	112208256 112208257 112208258

PPS:	112438978 112438979 112438980

GGO:	115933630 115933631 115933632

PON:	112132179 112132180 112132181

PPYG:

129030967 129030968 129030969

NLE:	115831625 115831626 115831627

HMH:	116481333 116481334 116481335

SSYN:

129468705 129468706 129468707

MCC:	114672016 114672017 114672018

MCF:	123568502 123568503 123568504

MTHB:

126934541 126934542 126934543

MNI:	112426366 112426367 112426368 112426369

PANU:

116270420 116270421 116270422

TGE:	112605465 112605467 112605468

RRO:	115894436 115894437 115894438

TFN:	117063139 117063140 117063141

PTEH:

111546051 111546052 111546053

CJC:	118147600 118147601 118147602

CIMI:

119473726 119473727 119473728

ANAN:

135269815 135269816 135269817

LCAT:

123637623 123637624 123637625

OGA:	111724396 111724398 111724399

MMU:	100217456(Snord53) 100217462(Snord92) 115488835(Gm22858)

MCAL:

115029772 115029773 115029774

RNO:	120093416(Snord53l1) 120093417 120093418(Snord53l2)

MCOC:

116081297 116081298 116081299

ANU:	117717381 117717382 117717477

ASYL:

127688196 127688197 127688199

MUN:	132651470 132651471 132651474

CGE:	113830803 113830809 113830811

MAUA:

121133885 121133886 121133887

PROB:

127220179 127220180 127220181

PLEU:

114697513 114697515 114697521

MORG:

121433114 121433115 121433116

MFOT:

126514241 126514244 126514245

AAMP:

119808566 119808567 119808568

CPOC:

111757773 111757774 111757775

DSP:	122122561 122122569 122122570

DMER:

138829349 138829350 138829351

PLOP:

125356944 125356945 125356946

NCAR:

124963808 124963809 124963810

MMMA:

125617359 125617360 125617361

ITI:	120885155 120885156 120885157

OCU:	127490449 127490450 127490451

OPI:	118760768 118760771 118760773

OCZ:	121165484 121165485 121165486

CFA:	119864024 119864025

CLUD:

112665130 112665131 112665132

VVP:	112933027 112933028 112933029

VLG:	121492285 121492286 121492287

NPO:	129511229 129511230 129511231

AML:	117802122 117802123 117802124

UMR:	121101091 121101092 121101093

UAH:	113247533 113247538 113247543

UAR:	123799973 123799974 123799975

LLV:	125110180 125110181 125110182

MNP:	132022925 132022926 132022927

MLK:	131808735 131808736 131808737

NVS:	122916672 122916673 122916674

EJU:	114206048 114206049 114206051

ZCA:	113938818 113938819 113938820

MLX:	118008336 118008337 118008338

NSU:	123326112 123326113 123326114

LWW:	115943752 115943753 115943754

FCA:	111559961 111559962 111559963

PYU:	121044643 121044644 121044646

PCOO:

112864433 112864434 112864435

PBG:	122467416 122467417 122467418

PVIV:

125163154 125163155 125163156

LRUF:

124504473 124504474 124504475

LGF:	123581771 123581772 123581773

AJU:	113592555 113592556 113592557

PUC:	125937834 125937835 125937836

PLEZ:

122216744 122216745 122216746

HHV:	120235942 120235946 120235947

BTA:	112448919 112448920 112448921

BOM:	138990048 138990049 138990050

BBUB:

112578262 112578263 112578264

OAS:	114114236 114114237 114114238

BTAX:

128057089 128057090 128057091

CSUM:

138093880 138093885 138093893

ODA:	120852352 120852353 120852354

CCAD:

122442780 122442781 122442782

MREE:

136165812 136165814 136165815

OVR:	139031716 139031720 139031722

MBEZ:

129540131 129540132 129540133

CFR:	116669100 116669101 116669102

CDK:	116157592 116157594 116157595

VPC:	116283544 116283545 116283546

BMUS:

118906569 118906570 118906571

OOR:	117200796 117200797 117200798

LALB:

132532051 132532052 132532053

GMF:	115854350 115854352 115854353

DDP:	132435650 132435706 132435707

DLE:	115803456 115803457 115803458

PCAD:

112063686 112063687 112063688

PSIU:

116764808 116764809 116764810

PPHC:

136134308 136134309 136134310

NASI:

112390569 112390570 112390571

ECB:	111768254 111768255 111768256

EPZ:	139075873 139075874 139075875

EAI:	123286779 123286780 123286781

MMYO:

118669546 118669547 118669549

MLF:	111827120 111827121 111827122

MDT:	132214087 132214089 132214090

MYUM:

139020226 139020227 139020228

PKL:	118717849 118717850 118717851

EFUS:

114230385 114230386 114230387

DRO:	112298229 112298230 112298231

SHON:

119001504 119001506 119001507

AJM:	119050458 119050459 119050460

PDIC:

114501150 114501151 114501153

PHAS:

123822626 123822627 123822628

MMF:	118631292 118631293 118631294

PPAM:

129068158 129068166 129068174

RFQ:	117033510 117033512 117033513

PALE:

112478644 112478645 112478646

PGIG:

120622197 120622198 120622199

PVP:	111746075 111746076 111746077

RAY:	118605869 118605870 118605871

MJV:	118970749 118970750 118970751

TOD:	119260025 119260026 119260028

SFUM:

130038296 130038304 130038309 130038314

SETR:

126025372 126025373 126025374 126025375

LAV:	111751198 111751199 111751201

TMU:	111820820 111820821 111820822

ETF:

115868458

DNM:	111762717 111762721 111762722

GAS:	123238481 123238482 123238483 123238484

SHR:	111718605 111718607 111718608 111718609

AFZ:	127552659 127552660 127552661 127552662

TVP:	118845183 118845184 118845185 118845186

PBRV:

138149312 138149313 138149314 138149316

MLAO:

141510691 141510692 141510693

OAA:	114814366 114814377 114814388 114814399 114814492

TACU:

119932692 119932705 119932716 119932728 119932739

GGA:	112532235 112532236 112532237 112532238

PCOC:

116233195 116233206 116233210 116233217

MGP:	116216398 116216399 116216400 116216401

CJO:	116653285 116653286 116653287

TPAI:

128090236 128090240 128090244 128090248

LMUT:

125690251 125690252 125690253 125690254

APLA:

113843394 113843395 113843397

ACYG:

125184600 125184601 125184602

CATA:

118257511 118257516 118257523

AFUL:

116488378 116488379 116488380 116488382

TGU:	115494752 115494753 115494754

LSR:	116183518 116183519 116183520

SCAN:

115485023 115485024 115485025

PMOA:

120501508 120501509 120501510

OTC:	121346405 121346406 121346407

PRUF:

121365340 121365341 121365342

ATRC:

139600346 139600367 139600374

OMA:	130251947 130251949 130251950

PMAJ:

117244200 117244201 117244209

CCAE:

111926691 111926692 111926693

CCW:	120411821 120411822 120411823

ACOE:

138108864 138108866 138108867

ETL:	114060425 114060426 114060427

ZAB:	113459833 113459834 113459835

ZLE:	135446393 135446395 135446396

MMEA:

130584168 130584169 130584170

HRT:	120751338 120751339 120751340

SATI:

136359837 136359838 136359839

CCIC:

134042842 134042843 134042844

FCH:	114016148 114016149 114016150 114016151

SHAB:

115614038 115614039 115614040 115614041

ACUN:

113478963 113478964 113478965 113478966

TALA:

116960841 116960842 116960843 116960844

ACHC:

115350531 115350535 115350536 115350537

AGEN:

126052822 126052823 126052824 126052825

HHAR:

128150575 128150579 128150580 128150581

GCL:	127015356 127015357 127015358 127015360

PPUS:

135186719 135186720 135186721 135186722

EGZ:	118453307 118453308 118453309 118453310

CBOR:

142081510 142081511 142081512 142081513

CBOY:

140650413 140650414 140650415 140650416

MAME:

142408532 142408533 142408534 142408535

CNIC:

135987836 135987837 135987839 135987840

CUCA:

128851926 128851927 128851928 128851929

ACAR:

114818299 114818300 114818301 114818302

RTD:	128908014 128908015 128908016 128908018

CRID:

134514025 134514026 134514027 134514028

LMIC:

141741531 141741532 141741533 141741534

AROW:

112974948 112974949 112974950 112974951

NPD:	112954863 112954864 112954865 112954866

DNE:	112980117 112980118 112980119 112980120

ASN:	112552058 112552063 112552064 112552065

PSS:	112544582 112544583 112544584 112544585

CIZ:	142011733 142011735 142011736 142011737

CMY:	114022370 114022371 114022372 114022373

CCAY:

125635037 125635038 125635039 125635041

DCC:	119854124 119854125 119854126 119854127

CPIC:

112061662 112061665 112061669 112061679 112061682

TST:	117875687 117875688 117875689 117875691 117875692

CABI:

116821531 116821533 116821534 116821535

MRV:	120402477 120402478 120402480 120402481 120402482

ASAO:

132762257 132762258 132762259

SUND:

121920135 121920136 121920137

PBI:	112541073 112541074 112541075

PMUR:

114923443 114923444 114923445

CTIG:

120305415 120305416 120305417

PGUT:

117672127 117672128 117672129

PCAE:

139309137 139309138 139309139

APRI:

131189381 131189382 131189383

PTEX:

113433454 113433455 113433456

NSS:	113423513 113423534 113423538

VKO:	123034443 123034449 123034455

PMUA:

114595092 114595093

PRAF:

128411679 128411680

ZVI:	118083289 118083290

HCG:	128341368 128341369

STOW:

125425658 125425660 125425661

EMC:	129345997 129346005 129346013

XLA:	121393994 121393995 121393996 121393997 121393998 121393999 121394375 121394376 121394377 121394378

XTR:	116411272 116411273 116411274 116411275 116411276 116411277

RTEM:

120938423 120938424 120938425

ACAT:

141142066 141142068

BBUF:

121000196 121000197 121000198 121000199 121000200

BGAR:

122937041 122937042 122937043 122937044 122937045 122937046 122937047

DTC:	141060172 141060173 141060175 141060176

PWL:

138297981

MUO:	115467442 115467443

GSH:	117358340 117358341

DRE:	137488200 137488201 137488202 137488203 137488204

CCAR:

122140299 122140300 122140301 122140303 122148464 122148465 122148466 122148467

CAUA:

113060965 113060966 113060967 113060968 113060969 113060971 113060972 113060973 113117973 113117974 113117975 113117976

CGIB:

127933635 127933636 127933637 127933638 127976858 127976859 127976860 127976861

PTET:

122362419 122362420 122362421 122362422

LROH:

127180278 127180279 127180280 127180281 127180282 127180283 127180284 127180285 127180286

GRF:	141296415 141296416 141296418 141296419 141296420 141296421

OMC:	131523816 131523817 131523818 131523819 131523820

PPRM:

120486979 120486988 120486993 120487001 120487007 120487011

RKG:	130089062 130089063 130089064 130089065 130089066 130089067

MAMB:

125269417 125269418 125269419 125269420 125269421 125269422

CIDE:

127499241 127499242 127499243 127499244 127499246 127499247

CERY:

137007190 137007191 137007192 137007193 137007194 137007195

MASI:

127411601 127411602 127411609 127411610 127411611 127455639 127455640 127455641 127455642

TROS:

130560865 130560866 130560867 130560868 130560871

TDW:	130437449 130437450 130437451 130437452 130437453 130437454 130437455

MANU:

129418374 129418375 129418376 129418377 129418379

PDAB:

135737779 135737788 135737795 135737804 135737810 135737818

IPU:	124628541 124628542 124628543

IFU:	128613246 128613247

PHYP:

113539018 113539020 113539021

SMEO:

124390668 124390669 124390670 124390671

TFD:	113659842 113659847

TVC:	132853036 132853037

CGAR:

128540268 128540269 128540270 128540271

NGRA:

132894705 132894706 132894707

TRN:	134325882 134325883 134325884 134325886 134325887

AMEX:

125781146 125781147 125781148

CMAO:

118824235 118824236 118824237 118824238

EEE:	113578618 113578619 113578620

CHAR:

116223644 116223645 116223646

SPIL:

134068266 134068267

ASAD:

121693809 121693811 121693812 121693813

TRU:	115248963 115248964

TFS:	130513371 130513372

LCO:

113744651

PGEO:

117441708 117441709 117441710 117441711 117441712 117441713 117441714 117441715 117441716

EMAC:

134882085 134882087 134882088 134882091 134882092

ELY:	117267665 117267666 117267667

EFO:	125901493 125901494 125901495

PLEP:

121938688 121938745

SLUC:

116063170

PFLV:

114547543

GAT:	120833458 120833459 120833460 120833461

AFB:	129104052 129104053

PSWI:

130202065

CANA:

137803158

CVE:	137892262 137892263

MSAM:

119889564 119889565 119889566 119911080 119911081 119911082 119911083

SCHU:

122862531 122862532 122862533 122862535

CUD:

121526848

SPUL:

138591843 138591844

LMIX:

132993861 132993862

HTC:	141807113 141807114 141807115 141807117 141807118 141807119

ALAT:

119005239

ASTR:

137611593 137611594 137611595

MZE:

111500580

ONL:

112843212

OAU:

116318110

OLA:	111946897 111946898 111946899

OML:	112150522 112150537 112150541

CSAI:

133463004 133463005 133463006

XMA:	111612319 111612320 111612323 111612324

XCO:	114156685 114156686 114156687

XHE:	116709672 116709673 116709674 116709675

GAF:	122846727 122846728 122846729 122846730

PPRL:

129377456 129377457 129377458 129377459

CTUL:

119793688 119793689 119793691 119793692 119793693

GMU:	124856069 124856073

KMR:	112450255 112450259 112450260

NWH:	119427936 119427937 119427939 119427940

AOCE:

111575106 111585191 111585192 111585193 111585194 111585195

EJA:	138200288 138200289 138200294

BFRE:

138631903 138631904 138631905

MCEP:

125024302 125024303 125024304 125024305 125024307 125024308

SSOE:

131445373

HHIP:

117756892 117756894 117756895 117756896 117756897 117756898 117756900 117756901

HSP:	118117089 118117096 118117144 118117145 118117147

PPLT:

128452550 128452551 128452552 128452554 128452555 128452556 128452558

SMAU:

118286868 118286869 118286870 118286871 118286873 118286874 118286875

LCF:	127142271 127142272 127142273

SLAL:

111645779 111649113 111649114 111649116 111649479 111649706 111649707 111649708

XGL:	120795989 120795990 120795991 120795992 120795993

SSCV:

125981586

SBIA:

133513853

PEE:	133413279 133413280

PTAO:

133488396 133488397

ENY:	140354531 140354532

BSPL:

114849133 114849134

SJO:	128376084 128376085 128376086 128376089 128376090 128376091 128376092

SSCO:

134001480 134001481 134001482 134001483 134001485 134001486

TTY:

137200570

GMH:	115544653 115544654 115544655 115544656 115544657 115544659 115544660 115544661 115544662 115544663 115544665 115544666 115544667 115544668 115544669 115544670 115544671

STRU:

115147510 115147517 115174172 115174173 115174174

OTW:	112226350 112266251 112266252 121839129

OMY:	118938605 118938606 118941237 118941238 118941239

OGO:	124013449 124013450 124013451 124016568

ONE:	115104437 115104438 115129097 115129098 115129099

OKI:	116354541 116354542 116354543 116376042 116376043

OKE:	118365812 118365814 118399670 118399671 118399672

OMM:	135538738 135553509 135553510 135553511 135554899

OCLA:

139365347 139373973 139373974 139373976

SALP:

111982211 111982212 112068843 112068844

SNH:	120022877 120022878 120022879 120022880 120034619 120034620 120045240

SFON:

129820410 129820411 129820413 129820414 129833832 129834060 129834061

CCLU:

121570814 121570815 121570816 121570817 121586981 121586982 123492951

ELS:	114840082 114840439

OEP:	134027236 134027237 134027238 134027239 134027240 134027241 134027243 134027244 134027245

SFM:

114912349

PKI:	111858490 111858492

AANG:

118215600 118215607

AROT:

135242176 135242180

CCOG:

133110669

CMK:	121848615 121848616 121848617 121848618

RTP:

CPLA:

HOC:

SCAU:

LERI:

129697707 129697708 129697709

HAKA:

140733843 140733844

BFO:	118429808 118429809

SCLV:

120336977

DME:	Dmel_CR43582

DER:

DSE:

DAN:

DPO:

DPE:

DMN:

DHE:

DVI:

BOD:

BDR:

AOQ:

ALUD:

HIS:

PXY:

HHAL:

NLU:	120352575 120352576

CEL:	CELE_F01D5.12(F01D5.12) CELE_F01D5.14(F01D5.14)

PMAX:

117326636 117344411 117344412 117344413 117344414 117344418 117344419

AIRR:

138317107 138326606 138326608

YBA:	132552217 132560524

MCAF:

127699273 127699274 127699275 127699276 127699277 127699278 127699279 127699280 127699281 127699282 127699289

LAK:	112041364 112041365 112041366 112041367 112042445 112042446 112042447 112042448 112042449

ATH:	AT3G21805 AT4G06240 AT4G15258(SNOR37-2)

CRB:	111829818 111829819 111831772

BRP:	117129147 117129148 117133208 117133209 117133210 117134504

BNA:	106376368 125579361 125581177 125581178 125584911 125588198 125590987 125590988 125594273 125607810 125607811 125607812 125609693

RSZ:	108843652 130495352 130495353 130495354 130497284 130501784 130501786 130505454 130512194 130512195

CIT:

112497364

PVY:

116112587

MINC:

123197097 123224606

GRA:	128036450 128036452

GHI:	121212991 121212992 121226033 121226035

GAB:	128287266 128287267

HSYR:

120118250 120134780 120145772 120179539

EGR:	120290075 120290076

RARG:

115750941

GMX:	112998607 112998608 113002011 113002012

GSJ:	114380610 114380611 114417539 114417540

PVU:	137811734 137811743 137811750

VAR:	128196870 128196871

VUN:	114170946 114170947 114170948 114170949

VUM:	124835343 124835346

CCAJ:

114916804 114916810 114916811 114916907 114916946

APRC:

113860446

MTR:	112416852 112421505 112421506 112422281

TPRA:

123882543 123887822 123893333 123893334

CAM:	113784190 113784191 113784192 113784193 113784194 113784200 113784211 113784219 113784220 113785599

PSAT:

127109566 127109567 127109568 127109569 127109570 127124740 127124742 127134242

VVO:	131608450 131608451 131608452 131608453 131624043 131626418 131640963 131645480 131645481 131654458 131654459

LJA:	130709666 130709667

ADU:

127745951

AHF:

112793566

PCIN:

129287377 129297725 129307509 129316924

AANS:

126793043 126801362

RCN:	112191069 112201220

PDUL:

117612549 117612924 117613277 117620444 117623641 117623642 117623643 117623644 117629438 117633291 117633292 117633293 117636236 117636237 117636238

MDM:	114822838 114827212

MSYL:

126584055 126612732

PCOX:

137709612 137741232

ZJU:

112491491

MNT:	112091277 112094105

CSAV:

115701708 115701710 115701711 115701712 115701713 115711822

CSV:	116402311 116402312 116402313

CMO:	127144117 127144118 127144119

BHJ:	120089571 120089572

CMAX:

111469933 111484624

CMOS:

111449141 111451886

CPEP:

111777929 111796285

RCU:	112534268 112534269

MEAN:

JCU:

MESC:

POP:

PALZ:

118032149 118052963 118055018

PNZ:

JRE:

CILL:

CAVE:

AGLU:

QSU:	111996089 111996093 112004437 112024051 136063589

QLO:	115958689 115988183

TWL:	119992354 120001170 120008333

VVI:

132254825

VRI:

117927410

SLY:	112941605 112941954 112941955

SPEN:

114077404 114078107 114078195

SSTN:

125869501 125878112 125878113

SDUL:

129893655 129893656

CANN:

124886303 124886304 124899136

LBB:	132620682 132620685 132643111 132643112 132643113

NSY:	138869869 138869870 138874253

NTO:	117277525 117280783 117280786

ITR:	116033743 116033744

SSPL:

121742756 121742757 121746251 121746252 121756649 121756650 121759787 121759789 121763161 121763162 121769570

SMIL:

131013751 131013752

SHIS:

125191430 125197619 125197620 125202897

APAN:

HPUM:

PHUA:

PEBU:

PTAB:

HAN:	118479422 118479423 118481607 118483621 118483622 118487892 118489604 118489605 118489606 118489607 118491034 118491035

ECAD:

122586229

LSV:	111887771 111887772 111903808 111903809 111903810

CCAV:

112523972 112526191 112526192

DCR:	135146866 135148119 135148120

CSIN:

114266654 114266655

RVL:

131331716

AEW:	130752277 130790342 130790343

DLT:

127812348

SOE:	130471182 130471184 130471185 130471186 130471187 130471188

ATRI:

130807107 130807108

SLAF:

141604043 141609924 141625738 141625739 141625740 141658343

MOF:	131143609 131165149

MING:

122060287 122080480

TSS:	122641230 122663462 122666427 122666428 122670215

PSOM:

113276867 113276868 113276869 113284972 113284973 113284974 113314633 113325612 113325613 113325614 113330281 113330283 113330284 113342100 113342104

OBR:	121054831 121054832

OGL:	127769094 127769096 127778188 127778189

BDI:	112270277 112270278

ATS:	120965714 120965715 120967646 120967648 120967649 120967650 120967651 120970144 120970145

TDC:	119319822 119319824 119327101 119327102 119327103 119334916 119334918 119342459 119342460 119344703 119344704

TAES:

123109305 123126407 123126409 123132831 123132833 123140407 123140408 123140409 123146613 123146617 123146618 123146619 123151660 123151667 123155207 123155209 123163410 123163411 123171754

TUA:	125517788 125526165 125526166 125528311 125531445

HVG:	123406628 123406630 123406631 123406632 123414500 123414502

LPER:

127318138 127318139 127318141 127327978 127346289

LRD:	124650752 124668814 124668817 124681115 124681116 124681118 124685527 124685528

ZMA:	111589430 111590734 111590735 111591053

SVS:	117854288 117854289 117854290 117854291 117854292 117854293

PVIR:

120671711 120687108 120705321 120705322 120705324

PHAI:

112891221 112891223 112891224 112891226

PAUA:

133883796 133883797 133927888 133927889

TANG:

140761808

PDA:	113462503 113463426

EGU:	114913053 114914602

MUS:

135599595

ZOF:	121993452 121998988 122003292 122003293 122007625 122007626

DCT:

MSIN:

ACAK:

NCOL:

CJF:	131032597 131065771

PPP:	112272890 112277065 112277066 112277067 112277068

» show all

Reference

PMID:8674114

Authors

Kiss-Laszlo Z, Henry Y, Bachellerie JP, Caizergues-Ferrer M, Kiss T

Title

Site-specific ribose methylation of preribosomal RNA: a novel function for small nucleolar RNAs.

Journal

Cell 85:1077-88 (1996)
DOI:10.1016/S0092-8674(00)81308-2

Sequence

[hsa:26796]

Reference

PMID:12736310

Authors

Chen CL, Liang D, Zhou H, Zhuo M, Chen YQ, Qu LH

Title

The high diversity of snoRNAs in plants: identification and comparative study of 120 snoRNA genes from Oryza sativa.

Journal

Nucleic Acids Res 31:2601-13 (2003)
DOI:10.1093/nar/gkg373

Sequence

[ath:AT4G15258]

LinkDB

DBGET integrated database retrieval system