KEGG   ORTHOLOGY: K26387
Entry
K26387            RNA       KO                                     
Symbol
RNU6ATAC
Name
U6atac small nuclear RNA
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome
    K26387  RNU6ATAC; U6atac small nuclear RNA
Spliceosome [BR:ko03041]
 Splicing related RNAs
  K26387  RNU6ATAC; U6atac small nuclear RNA
Genes
HSA: 100151684(RNU6ATAC)
PTR: 112204297 112204298 112204478 112204687 112204914 112206181 112206182 112206302 112206588 112207221 112208275 112208504 112208837 112208838 112208839 112208840 112209119 112209120 112209122 112209676
PPS: 112437671 112437672 112437809 112438031 112438605 112438998 112439186 112439470 112439471 112439472 112439473 112439733 112439734 112439736 112440269 112440771 112440772 112440909 112441088 112441301 117975506
GGO: 115930347 115931145 115931344 115931487 115931785 115931786 115932559 115933060 115933499 115933648 115933879 115934205 115934206 115934207 115934208 115934480 115934481 115934483 115934864 115934865 115935173 115935704 115935705 115936131
PON: 112129812 112129813 112130001 112130415 112131182 112132198 112132493 112132908 112132910 112132913 112133286 112134068 112134812 112134813 112135048 112135337 112135651 112135994
NLE: 115830560 115830735 115830736 115831369 115831645 115831646 115831647 115832205 115832693 115833463 115834971 115834972 115834973 115834975 115835312 115836516 115836826 115836827 115838145
HMH: 116467702 116470083 116474033 116476046 116476047
MCC: 114670231 114670232 114670693 114670694 114672035 114672545 114672920 114673321 114673896 114676604 114676605 114677894 114677895 114678587 114680029 114680509 114680510
MCF: 123567010 123567372 123567373 123568521 123568950 123569283 123569639 123570115 123572079 123572080 123573245 123573246 123573806 123575010 123575402 123575403
MTHB: 126929935 126929936 126934560 126936725 126938180 126940060 126941594 126949529 126949530 126954084 126955876 126960445 126961933 126961934 126963495 126963496
MMU: 115487680(Gm23879) 115489638(Gm25541) 115490292(Gm26044)
MNP: 132025274
MJV: 118970517
ETF: 115869441
AFZ: 127552689
GGA: 112530006
PCOC: 116234448
CJO: 116654194
TPAI: 128074125
LMUT: 125702772
APLA: 113845504
ACYG: 125181936
CATA: 118252348
AFUL: 116497097
TGU: 115497600
SCAN: 115484682
OTC: 121337162
PRUF: 121362502
OMA: 130260290
ETL: 114059141
ZAB: 113460049
MMEA: 130576732
HRT: 120761923
FCH: 114016650
ACUN: 113486669
TALA: 116958832
ACHC: 115335506
AGEN: 126052538
GCL: 127023870
SHAB: 115617260
ACAR: 114818409
RTD: 128917738
AROW: 112964369
NPD: 112956149
DNE: 112979952
PSS: 112543614
DCC: 119844433
CABI: 116817521
MRV: 120387039
PBI: 112540671
PMUR: 114923621
PGUT: 117671334
PTEX: 113448487
NSS: 113426918
VKO: 123035230
ZVI: 118094117
EMC: 129342757
XTR: 116407419
BGAR: 122929877
MUO: 115473598
CAUA: 113064508
CGIB: 127942391
PTET: 122341122
LROH: 127153104
OMC: 131529576
PPRM: 120470483
MAMB: 125253658
CIDE: 127504407
MASI: 127431392
TROS: 130570821
MANU: 129424558
IFU: 128622918
PHYP: 113535826
TFD: 113646593
CMAO: 118820741
EEE: 113591318
CHAR: 116223037
TRU: 115247085
TFS: 130525123
LCO: 113745951
CGOB: 115008950
ELY: 117257576
EFO: 125898264
PLEP: 121961648
SLUC: 116041738
ECRA: 117944158
ESP: 116688727
PFLV: 114554989
GAT: 120835875
PPUG: 119194333
AFB: 129106513
CLUM: 117731540
MSAM: 119887025
SCHU: 122870322
CUD: 121507590
ALAT: 119021993
MZE: 111501489
ONL: 112847017
OAU: 116328957
OLA: 111947485
OML: 112145811
XMA: 111605933
XCO: 114136323
XHE: 116711267
GAF: 122834778
CTUL: 119780086
GMU: 124857588
KMR: 112451365
NWH: 119412918
AOCE: 111585822
MCEP: 125007499
SSEN: 122768898
HHIP: 117762325
HSP: 118105540
LCF: 127143149
SLAL: 111660874
XGL: 120783514
SSCV: 125977940
BSPL: 114856446
ELS: 114840915
AANG: 118213498
CMK: 121848185
BFO: 118405191
CIN: 113475636
SCLV: 120333490
SPU: 115920091
AJC: 117119393
DME: Dmel_CR32989(snRNA:U6atac)
DER: 6540875
DSE: 6611679
DYA: Dyak_GE27276(Dyak_snRNA:U6atac:1)
DAN: 6508078
DPO: 6903546
DPE: 6593845
DMN: 117189208
DWI: 6648245
DGR: 6562107
DMO: Dmoj_GI25474(Dmoj_snRNA:U6atac:1)
DNV: 115563604
DHE: 111599009
DVI: 6634309
CCAT: 111591832
BOD: 118683281
LCQ: 111679644
LSQ: 119606230
HIS: 119656350
ACOZ: 120960263
AARA: 120905271
AALB: 115254394
CPII: 120417600
CNS: 116351171
BCOO: 119081172
AME: 113218817
ACER: 114577989
ALAB: 122720294
ADR: 116185847
AFLR: 116414195
BVK: 117237578
BVAN: 117165127
BAFF: 126926406
CCAL: 113464208
OBB: 114876042
NMEA: 116426698
CGIG: 122399274
SOC: 113004254
MPHA: 114253802
HST: 112589117
CFO: 112639788
OBO: 113563456
PFUC: 122517261
VPS: 122631411
TPRE: 111694570
LBD: 127281433
CGLO: 123262329
AGIF: 122850754
CINS: 118063979
VCAN: 122410339
CCIN: 112494542
DSM: 124414356
NPT: 124224014
NFB: 124184103
DPA: 125503603
CSET: 123318105
PPYR: 116179881
OTU: 111413652
BANY: 112050335
MCIX: 123664332
PBX: 123710519
ZCE: 119829212
CCRC: 123701116
LSIN: 126965825
HAW: 126054071
HZE: 124641076
TNL: 113499745
PGW: 126375812
CFEL: 113388640
CCRN: 123301917
API: 115033958
AGS: 114125616
RMD: 113550774
ACOO: 126843855
DCI: 113469156
NLU: 120351732
CSEC: 111863938
SGRE: 126274956
IEL: 124156682
DMK: 116918087
DPZ: 124315053
PJA: 122253682
HAME: 121871395
PCLA: 123772357
CQD: 128691027
PTRU: 123498998
ESN: 127003014
HAZT: 125177567
LSM: 121128791
ISC: 115312666
DSV: 119459817
RSAN: 119375673
RMP: 119168799
TUT: 112539991
DPTE: 113793858
DFR: 124491325
CSCU: 111626890
UDV: 129228854
SDM: 118204630
PCAN: 112553511
GAE: 121372788
HRF: 124140383
HRJ: 124287588
CRG: 117680812
CANU: 128190936
OED: 125664968
MCAF: 127703332
MMER: 123559270
DPOL: 127880348
OBI: 128250193
OSN: 115231011
LAK: 112042000
NVE: 116618432
EPA: 114576696
ATEN: 116287219
AMIL: 114977251
PDAM: 113672245
DGT: 114518538
XEN: 124445045
HMG: 124808338
HSY: 130637058
ATH: AT5G40395(U6acat)
CRB: 111829772
PVY: 116146884
MINC: 123212630
GHI: 121205470
GMX: 112998422
GSJ: 114377741
VUN: 114174774
CCAJ: 114916061
MTR: 112422286
PSAT: 127124746
ADU: 127748283
AHF: 112753606
RCN: 112181043
PDUL: 117629445
ZJU: 112490328
MNT: 112095365
CSV: 116403030
CMOS: 111436091
RCU: 112537112
JCU: 119370016
MESC: 122721430
POP: 112327056
PALZ: 118051781
JRE: 118349530
CILL: 122314599
QSU: 112005477
TWL: 119990277
SLY: 112941237
CANN: 124886311
ITR: 116026374
APAN: 127248175
ECAD: 122584073
LSV: 111893144
CCAV: 112502019
CSIN: 114304357
MING: 122062867
OBR: 121053352
BDI: 112272111
TUA: 125541953
LPER: 127311027
ZMA: 111590038
SVS: 117866019
PVIR: 120677108
PHAI: 112901761
PDA: 113462823
PPP: 112281965
 » show all
Reference
PMID:8791582
  Authors
Tarn WY, Steitz JA
  Title
Highly diverged U4 and U6 small nuclear RNAs required for splicing rare AT-AC introns.
  Journal
Science 273:1824-32 (1996)
DOI:10.1126/science.273.5283.1824
  Sequence
[hsa:100151684]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system