KEGG ORTHOLOGY: K27154

ORTHOLOGY: K27154

Entry

K27154            RNA       KO

Symbol

SCARNA6, SCARNA5

Name

small Cajal body-specific RNA 6

Brite

KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome
    K27154  SCARNA6, SCARNA5; small Cajal body-specific RNA 6
Spliceosome [BR:ko03041]
Splicing related RNAs
  K27154  SCARNA6, SCARNA5; small Cajal body-specific RNA 6

Genes

HSA:	124900577 677772(SCARNA6) 677775(SCARNA5)

PTR:	112208494 112208495

PPS:	112439176 112439177

GGO:	115931138 115933868 115933869

PON:	112129476 112132483 112132484

NLE:	115832674 115832675

HMH:	116809920 116809921

MCC:	114671616 114671617

MCF:	123568163 123568164

MTHB:

126933279 126933280

MNI:	112425251 112425253

PANU:

116269305 116269306

TGE:	112636815 112636816

RRO:	115893371 115893372

PTEH:

111523769 111523770 111531962

CJC:	118155138 118155139

CIMI:

119472584 119472585

LCAT:

123644256 123644257

OGA:	111723609 111723610

MMU:	100217415(Scarna6) 115485773(Gm25395)

MCAL:

115032441 115032443

RNO:	120094896(Scarna6) 120094897(Scarna6l)

MCOC:

116089601 116089602

ANU:	117722831 117722833

CGE:	113831046 113831047

MAUA:

PLEU:

MORG:

MFOT:

AAMP:

CPOC:

DSP:

PLOP:

NCAR:

OCU:	127487718 127487719

OPI:	118757961 118757962

CFA:	119865992 119866042

CLUD:

112670210 112670211

VVP:	112925560 112925562

VLG:	121498375 121498376

NPO:	129494033 129494034

AML:	117801312 117801313

UMR:	121099946 121099947

UAH:	113250923 113250924

UAR:	123790130 123790131

LLV:	125096669 125096671

MNP:	132014798 132014799

NVS:

122903894

EJU:

114210928

ZCA:

113921198

MLX:	118012763 118012764

NSU:	123324495 123324496

LWW:

115937370

FCA:	111562163 111562164

PYU:	121014534 121014535

PCOO:

112849162 112849163

PBG:	122482365 122482366

LRUF:

124516838 124516839

PUC:	125912012 125912013

AJU:	113598376 113598377

HHV:

120233394

BTA:	112446116 112446117

BBUB:

112585869 112585870

OAS:	114111327 114111333

BTAX:

ODA:

CCAD:

MBEZ:

CFR:	116663900 116663901

CDK:	116153169 116153170

VPC:	116280696 116280697

OOR:	117201906 117201907

DLE:	115802147 115802148

PCAD:

112065156 112065158

PSIU:

116757218 116757219

NASI:

112396769 112396770

ECB:	111774085 111774087

EAI:	123278572 123278573

MMYO:

118662340 118662342

MLF:	111828155 111828159

PKL:	118710040 118710041

EFUS:

114230532 114230533

DRO:	112308085 112308086

SHON:

118999181 118999183

AJM:	119048448 119048457

PDIC:

114495871 114495872

PHAS:

123823281 123823282

MMF:	118625930 118625931

RFQ:	117026417 117026418

PALE:

112475457 112475458

PGIG:

120597517 120597518

PVP:	111731943 111731944

MJV:	118968233 118968234

TOD:

119256452

LAV:	111752763 111752764

TMU:	111819032 111819033

ETF:	115872106 115872946

DNM:	111767355 111767356

GAS:	123248243 123248244

SHR:

111720827

AFZ:

127563654

OAA:	114816699 114816702

GGA:	112533090 112533092

PCOC:

116236407 116236408

MGP:	116217065 116217066

CJO:	116653876 116653877

TPAI:

LMUT:

APLA:

ACYG:

CATA:

AFUL:

TGU:	115496478 115496479

LSR:	116183981 116183982

SCAN:

115483998 115484000

PMOA:

120500950 120500951

OTC:	121341197 121341198

PRUF:

121353610 121353611

OMA:	130257111 130257113

PMAJ:

117244897 117244906

CCAE:

111933801 111933802

CCW:	120410506 120410507

ETL:	114054856 114054857

ZAB:	113460275 113460276

MMEA:

130583190 130583191

HRT:	120757528 120757529

FCH:	114016527 114016528

ACUN:

TALA:

ACHC:

AGEN:

GCL:	127020390 127020397

SHAB:

115612414 115612415

ACAR:

114818758 114818759

RTD:	128912199 128912200

AROW:

112972935 112972936

NPD:

112949228

DNE:	112988943 112988944

ASN:

112551056

PSS:	112547095 112547096

CMY:	114019717 114019746

CCAY:

125643249 125643250

DCC:	119861983 119861984

CPIC:

112060532 112060533

TST:	117883470 117883471

CABI:

116837339 116837340

MRV:	120372738 120372739

SUND:

PBI:

PMUR:

CTIG:

PGUT:

PTEX:

NSS:

VKO:	123034475 123034482

PMUA:

114598226

PRAF:

128414986

ZVI:

118094114

HCG:	128352699 128352700

STOW:

125438670

EMC:

129332975

XLA:	121394003 121394381 121394383

XTR:	116411281 116411282

RTEM:

BBUF:

BGAR:

MUO:

GSH:

CAUA:

113059048 113059049 113059050 113080033 113080034 113115597

CGIB:

127973196 127973197 128029910 128029911 128029912

PTET:

122359596 122359600 122359602

LROH:

127177791 127177792 127177793

OMC:	131521036 131521037 131521038

PPRM:

120470851 120470853 120470854

MAMB:

125249802 125249803 125249804

CIDE:

127496353 127496354 127496355

MASI:

127422676 127430361 127430362 127430363

TROS:

130565356 130565357 130565360

IPU:

124629125

IFU:

128621902

PHYP:

113544681

TFD:	113637963 113637964

CMAO:

118804805

EEE:	113588559 113588560 113588561

CHAR:

116221966 116221967

TFS:

130535627

LCO:	113746203 113746204 113746205

CGOB:

115005144 115005145

ELY:	117260389 117260390

EFO:	125889583 125889584 125889585 125889586

PLEP:

121937810 121964727 121966663

SLUC:

116058428 116058429 116058430

ECRA:

117940336 117940337 117940338

ESP:

116679093

PFLV:

114551564 114551565 114551566 114551567

GAT:	120830222 120830230

PPUG:

119223597 119223604

AFB:	129097953 129097958 129097960

CLUM:

117742216 117742217 117742218

MSAM:

119883639 119883641 119883642

SCHU:

122879728 122879729 122879731

CUD:	121527495 121527501

ALAT:

119013842 119013850 119013855

MZE:	111501040 111501041

ONL:	112842297 112842298

OAU:	116335362 116335363

OML:

112150048

XMA:	111612109 111612110

XCO:

114133716

XHE:	116708385 116708386

GAF:	122833353 122833354

CTUL:

119791606 119791607

GMU:	124884809 124884810

KMR:

112449938

NWH:	119411594 119411595

AOCE:

111564455 111564457

MCEP:

125014232 125014234

SSEN:

122774055 122774056 122774057

HHIP:

117773515 117773517

HSP:	118108388 118108389

LCF:	127139091 127139092 127139093

SLAL:

111646706 111646707

XGL:	120792611 120792612

BSPL:

114868765

STRU:

115164005 115164006 115206905

OTW:	112217291 112266261 112266262

OMY:	118938969 118944795 118944796

OGO:	123994286 123994287 123996001

ONE:	115107228 115137828 115137829

OKI:	116353746 116353747 116355124

OKE:	118366437 118397608 118397609

SALP:

111949991 111949992 111960806

SNH:	120018986 120018987 120018988 120029244

ELS:	114840014 114840015 114840016

SFM:

114911720

PKI:

111835841

AANG:

118210470 118210471 118210472

PSPA:

121323724 121323725 121327449

ARUT:

117417511 117417512 117417513 117423796 117423798

PSEX:

120520147

CMK:	121849917 121849918

CPLA:

122556405

LERI:

129703831

» show all

Reference

PMID:12032087

Authors

Darzacq X, Jady BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T

Title

Cajal body-specific small nuclear RNAs: a novel class of 2'-O-methylation and pseudouridylation guide RNAs.

Journal

EMBO J 21:2746-56 (2002)
DOI:10.1093/emboj/21.11.2746

Sequence

[hsa:677775 677772]

LinkDB

DBGET integrated database retrieval system