KEGG   ORTHOLOGY: K27171
Entry
K27171            RNA       KO                                     
Symbol
SCARNA17, U91
Name
small Cajal body-specific RNA 17
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome
    K27171  SCARNA17, U91; small Cajal body-specific RNA 17
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K27171  SCARNA17, U91; small Cajal body-specific RNA 17
Spliceosome [BR:ko03041]
 Splicing related RNAs
  K27171  SCARNA17, U91; small Cajal body-specific RNA 17
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Other eukaryotic RNA
  Small Cajal body-specific RNA
   K27171  SCARNA17, U91; small Cajal body-specific RNA 17
Genes
HSA: 124905172 124905173 124905174 677769(SCARNA17)
PTR: 112206299 112206812 112206813
PPS: 112437806 117977527 117977528
GGO: 115931484 115932009 115932010
PON: 112129998 112130697
PPYG: 129019203 129023763
NLE: 115834964 115836167
HMH: 116459517 116470073
SSYN: 129461612 129468715
MCC: 114670677 114673894
MCF: 123567357 123570113
MTHB: 126929921 126941592
MNI: 112426491 112427979 112429053
PANU: 116270887 116271535
TGE: 112611754 112633884
RRO: 115893058 115895570
TFN: 117064276 117096772
PTEH: 111530678 111539819
CJC: 118147068 118148423
CIMI: 119469525 119471419 119472170
ANAN: 135269562 135273054 135276153
LCAT: 123621988
OGA: 111723523 111724661 111727535
MCAL: 115029969
RNO: 120098358(Scarna17)
MCOC: 116087884
ANU: 117695599 117712163 117720296
ASYL: 127664243
MUN: 132652593
CGE: 113833677
MAUA: 121139054
PROB: 127234386
PLEU: 114694942 114709557
PMAV: 107400811 121825940 121829232
MORG: 121438855
MFOT: 126507390
AAMP: 119815960
CNL: 130887118
CPOC: 111758109
DSP: 122104470
DMER: 138832691
PLOP: 125347445 125364350
NCAR: 124965923
MMMA: 125617826
ITI: 120886729
OCU: 127487487 127492561
OPI: 118757963 118758137
OCZ: 121150971 121159759 121166538
CFA: 119872740
CLUD: 112648988
VVP: 112925333 112925334
VLG: 121475366
NPO: 129509206 129510027
AML: 117796213
UMR: 121103311
UAH: 113253608
UAR: 123787590
LLV: 125081548 125082779
MNP: 132024060
MLK: 131811997
NVS: 122903895 122905795
EJU: 114205140
ZCA: 113913415
MLX: 118004807 118015484
MANO: 123853339 123860725
NSU: 123324773 123326690
LWW: 115942501 115944256
FCA: 111559113 111559975
PYU: 121011952 121033293 121044649
PCOO: 112864438 112868494
PBG: 122467430 122471082 122476642
PVIV: 125149747 125155893 125163166
LRUF: 124504487 124517193
LGF: 123581786 123588636
AJU: 113592560 113602406
PUC: 125914957 125937840
PLEZ: 122204310 122216759
HHV: 120229729
CCRU: 144242771
BTA: 112444215 112444561 112449397
BOM: 138985492 138985876 138990562
BJV: 133237875 133239703 133259937
BBUB: 112578949 112578950 112580061 112581496 112581930 112585871
BKE: 129626279 129626280 129630439 129636378 129638278
OAS: 114110526 114113405
OCAN: 138428581 138434906 138434907
BTAX: 128067613
CSUM: 138097786
ODA: 120881253
CCAD: 122421835 122421836 122422995 122425592 122425914 122441134 122444459 122449059 122449060 122449062
MREE: 136144554 136152025 136152584 136162288 136162289 136162290 136168115 136170141 136170142 136170143
OVR: 139030461
MBEZ: 129541897 129549950
CFR: 116660693
CDK: 116149822
VPC: 116279571
BMUS: 118880405
OOR: 117200050
LALB: 132504620
GMF: 115859400
DDP: 132436731
DLE: 115803020
PCAD: 112067164
PSIU: 116739420
PPHC: 136133384
NASI: 112407505
ECB: 111774865
EPZ: 139084981
EAI: 123287502
MMYO: 118654884 118663903
MLF: 111825202
MDT: 132240384
MYUM: 139014778
PKL: 118708561
EFUS: 114234038
DRO: 112323042
SHON: 118975483 118980533 118989026 118992093
AJM: 119041256 119063688
PDIC: 114507176
PHAS: 123826477
MMF: 118619476
PPAM: 129078965
RFQ: 117012028
PALE: 112469498
PGIG: 120589379
PVP: 111741809
RAY: 118610183
MJV: 118972557
TOD: 119243868 119243869
SFUM: 130045599
SETR: 126008032
LAV: 104845534
ETF: 115871701
DNM: 111762556 111764843
 » show all
Reference
PMID:12032087
  Authors
Darzacq X, Jady BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T
  Title
Cajal body-specific small nuclear RNAs: a novel class of 2'-O-methylation and pseudouridylation guide RNAs.
  Journal
EMBO J 21:2746-56 (2002)
DOI:10.1093/emboj/21.11.2746
  Sequence
[hsa:677769]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system