KEGG ORTHOLOGY: K27172

ORTHOLOGY: K27172

Entry

K27172            RNA       KO

Symbol

SCARNA18, U109

Name

small Cajal body-specific RNA 18

Brite

KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome
    K27172  SCARNA18, U109; small Cajal body-specific RNA 18
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K27172  SCARNA18, U109; small Cajal body-specific RNA 18
Spliceosome [BR:ko03041]
Splicing related RNAs
  K27172  SCARNA18, U109; small Cajal body-specific RNA 18
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
Other eukaryotic RNA
  Small Cajal body-specific RNA
   K27172  SCARNA18, U109; small Cajal body-specific RNA 18

Genes

HSA:	107397392(SCARNA18B) 124900433 124900482 124900483 124900484 124903808 124904380 124906189 677765(SCARNA18)

PTR:	112205794 112205973 112205974 112206295 112206317 112206809 112206810 112207326 112207603 112208298 112209379 112209957

PPS:	112437371 112437485 112437486 112437802 112437824 112438458 112438748 112439019 112440006 112440624 117977525 117977526

GGO:	115930977 115931163 115931164 115931480 115931502 115932006 115932007 115932338 115932627 115933671 115934890 115935524

PON:	112129300 112129499 112129500 112129995 112130014 112130695 112131362 112131633 112132219 112133661 112134531

PPYG:

129014936 129016436 129016437 129019200 129019222 129022022 129023761 129023787 129031009 129037752 129041882

NLE:	115832041 115833111 115833485 115834958 115835003 115835790 115836161 115836847 115838166 115838497

HMH:	116458178 116459512 116463353 116463513 116470058 116470118 116472125 116484412 116809991 116813990

SSYN:

129457953 129459102 129461589 129461753 129463373 129468703 129472762 129483816 129485616

MCC:	114670673 114672056 114673890 114673911 114674532 114674533 114675083 114675508 114677293 114679194 114680067

MCF:	123567353 123568542 123570109 123570130 123570741 123570742 123571119 123571266 123572702 123574314 123575049

MTHB:

126929917 126934581 126941588 126941610 126945160 126945285 126945765 126947069 126951891 126957821 126960484

MNI:	112423752 112425486 112425584 112426153 112426270 112426489 112426598 112427246 112427975 112428328 112428329 112429046

PANU:

116270461 116270883 116271395 116271396 116271531 116271554 116272168 116272295 116272580 116274829 116275179 116276282

TGE:	112605506 112611749 112611773 112614902 112614903 112616044 112616595 112616778 112621996 112627303 112629628 112633879

RRO:	115892555 115893047 115894476 115895378 115895566 115895586 115896731 115898076 115898521 115899497

TFN:	117063184 117064271 117064293 117066301 117071947 117073918 117077115 117088936 117094062 117096767

PTEH:

111520422 111523459 111530677 111536978 111539815 111541517 111541518 111544537 111547819 111548448 111553639

CJC:	118143471 118144027 118145444 118147064 118147095 118147643 118148387 118149374 118149820 118150857 118151999 118155194

CIMI:

119466977 119467974 119468241 119468331 119468616 119469524 119469666 119470828 119471417 119472165 119472803 119473902

ANAN:

135269556 135270491 135272396 135273053 135274556 135275055 135275056 135275666 135276145 135276167

LCAT:

123621984 123625524 123625525 123627150 123629010 123636331 123637666 123645505 123647910 123648759

OGA:	111722027 111723332 111723574 111723846 111723943 111724995 111725619 111726519 111727256 111727511 111728426

MMU:	115487685(Gm25663) 115488238(Gm24507) 115489088(Gm25443) 115489853(Gm23897)

MCAL:

115029168 115029963 115031677 115032540

RNO:	120093484 120094022 120094023 120096427(Scarna18b) 120100487 120101372(Scarna18) 120102102 134478807

MCOC:

116072347 116084030 116087872

ANU:	117695593 117700654 117701996 117712151 117716681 117720288

ASYL:

127664236 127667167 127688267 127697992

MUN:	132646631 132651469 132652585 132652675

CGE:	113832318 113833676 113834222 113834928 113835967 113837008

MAUA:

121133239 121134628 121135669 121137370 121139049 121141685

PROB:

127215503 127221125 127221685 127222880 127225467 127234385 127238192

PLEU:

114680973 114681864 114692717 114694941 114696892 114703334 114703763 114709455

MORG:

121438852 121446638 121455061 121456030

MFOT:

126487190 126487302 126505965 126506347 126507389

AAMP:

119799620 119801528 119810955 119815948 119825841 119825842 119825844

CPOC:

111754047 111754527 111754690 111755467 111755794 111755865 111756127 111756457 111756752 111757065 111757364 111757997 111758067 111758093 111758326 111758515 111758516 111758591

DSP:	122104466 122117420 122126788

DMER:

138832674 138833070 138841250

PLOP:

125340260 125344399 125347424 125360304 125364343

NCAR:

124962507 124963764 124965915 124972773 124972774 124978558 124987770

MMMA:

125611412 125615841 125617375 125617822 125618783

ITI:	120885117 120886033 120886720 120887752 120892147

OCU:	127483633 127487486 127492227 127492554 127492888

OPI:	118758134 118759185

OCZ:	121159758 121160144 121166537

CFA:	119868675 119871367 119871700 119872731

CLUD:

112648979 112649549 112652044 112654217

VVP:	112907875 112915658 112928828

VLG:	121475288 121483730 121488543 121490296

NPO:	129509202 129510023 129519004 129521103

AML:	117795592 117796209 117801695

UMR:	121100860 121103308 121105956

UAH:	113253605 113255381 113267285

UAR:	123787588 123789700 123791598

LLV:	125081559 125082775 125101478

MNP:	132017096 132024056 132029032

MLK:	131811993 131831051 131832921

NVS:	122898333 122903888 122905785 122905809

EJU:	114201709 114205139 114217678

ZCA:	113912106 113913411 113930089

MLX:	118004804 118010969 118015480 118017235 118021441

NSU:	123324250 123324761 123325446 123326447 123326686

LWW:	115936550 115942500 115942918 115944255 115945053

FCA:	111557042 111558447 111559112 111559660 111559960

PYU:	121011948 121017075 121029020 121033290 121044642

PCOO:

112857981 112861903 112864432 112867106 112868491

PBG:	122467415 122471078 122476631 122488865 122496850

PVIV:

125147563 125149742 125155883 125161415 125163153

LRUF:

124504472 124510512 124517191 124523682 124525267

LGF:	123581770 123582180 123587105 123588632 123607807

AJU:	113592554 113594926 113602403 113603117 113604030

PUC:	125914953 125926045 125931173 125935906 125937833

PLEZ:

122203038 122204306 122212507 122214709 122216742

HHV:	120229728 120236858 120237671 120241874 120243249

BTA:	112444214 112444557 112445271 112445272 112445273 112446507 112447188 112447189 112449414 112449415 112449458

BOM:	138985491 138985872 138986574 138986576 138987680 138988333 138988712 138990579 138990580 138990622 138991290

BBUB:

112578939 112578940 112578968 112578969 112580059 112581495 112581923 112582428 112582429 112582430 112586703 112587186

OAS:	114110524 114111845 114111846 114111847 114113390 114114658 114115100 114115454 114117677 114117678

BTAX:

128047100 128050110 128051836 128058943 128058944 128067610 128070694 128070695 128070696

CSUM:

138072104 138072105 138080498 138082467 138086727 138091936 138091937 138097785

ODA:	120862294 120864953 120869619 120869620 120878301 120881252 120882713 120882714 120882715

OVR:	139030310 139030460 139031711 139031767 139033884 139034047 139034573 139036655 139036868 139036870

MBEZ:

129535353 129535354 129535374 129535385 129541887 129545866 129549948 129552864 129559678 129562226

CFR:	116660321 116660691 116661048 116662869 116665120

CDK:	116149456 116149821 116150094 116152396 116154135

VPC:	116276638 116279570 116280139 116281375 116285282

BMUS:

118880416 118880460 118889347 118891573 118893738 118896204 118901379

OOR:	117195503 117197370 117198124 117198640 117200048 117201247 117202073 117202520

LALB:

132504568 132504611 132506393 132506567 132514179 132518955 132520112 132525048

GMF:	115839408 115840923 115848396 115848633 115855563 115857377 115859398 115861965

DDP:	132419098 132421482 132423788 132426354 132431463 132436683 132436724 132439054

DLE:	115801644 115801984 115802688 115802689 115803017 115803326 115803418 115803936 115804136

PCAD:

112061909 112062213 112063809 112064159 112065657 112066159 112066160 112066239 112066240 112067162

PSIU:

116739370 116739413 116741052 116748199 116750280 116752439 116754828 116759913

PPHC:

136119744 136121795 136123963 136128635 136130109 136131667 136133334 136133376 136135775 136143175

NASI:

112392001 112392604 112397389 112398631 112400702 112405588 112407503 112414974

ECB:	111767993 111769777 111771662 111773358 111774862

EPZ:	139075454 139078540 139081209 139083170 139084978

EAI:	123282789 123283661 123287498 123288410 123289100

MMYO:

118652401 118657242 118657243 118661797 118662436 118666704 118667787 118671041 118678061

MLF:	111823770 111825251 111825615 111825619 111825953 111826428 111826977 111827797

MDT:	132211632 132212893 132220202 132224654 132225262 132225447 132229076 132234012 132234013 132236368

MYUM:

138993571 139001354 139001493 139004776 139007944 139009696 139009697 139013408 139017138 139021322

PKL:	118704040 118706722 118708542 118710370 118712085 118714636 118716803 118716843 118719624 118725190 118731113

EFUS:

114226844 114227730 114229244 114230222 114232786 114232956 114233993 114234035 114235055 129151796

DRO:	112297438 112300541 112303762 112307592 112310905 112323033

SHON:

118975482 118977561 118980758 118982107 118989016 118989660 118992102 118992143 118999563 119000759

AJM:	119036762 119041252 119041997 119047527 119053052 119059721 119063687

PDIC:

114495904 114495905 114498353 114507157 114514724

PHAS:

123822338 123822339 123825039 123826469 123829193

MMF:	118619455 118627434 118636866 118636867 118643047

PPAM:

129074743 129078960

RFQ:	117012025 117012606 117025384 117029509 117030491

PALE:

112469497 112473596 112477729 112480670

PGIG:

120589364 120599222 120612697

PVP:	111732155 111741599 111741808

RAY:	118606526 118607205 118608180 118610178 118610887

MJV:	118967017 118968413 118969707 118972168 118972555

TOD:	119230238 119233200 119239645 119243854 119243856 119246849 119248507 119248527 119251984

SFUM:

130021882 130029957 130032256 130037992 130038452 130042270 130045589

SETR:

125995534 125996849 126002799 126004997 126004998 126007711 126007712 126012472 126012474 126014877 126014879 126019252 126021041 126025369 126030531 126032795 126033368

LAV:	111749680 111750026 111750467 111750469

TMU:	111819762 111822783 111822849

ETF:	115868918 115869176 115870040 115870424 115871555 115871690 115872131 115872140 115872155 115872632 115873429 115873927 115873928

DNM:	111759100 111759595 111759749 111761656 111762559 111763637 111764842 111766246 111766600 111767258

GAS:	123232790 123238551 123238553

SHR:	111718823 111720990 116420919

AFZ:	127546095 127552705 127552706

TVP:	118835084 118845220 118845221

PBRV:

138173803 138173804 138174583

MLAO:

141503811 141510784 141510785

OAA:	114810538 114813076 114813077

TACU:

119925954 119930311 119930312

GGA:

PCOC:

MGP:

CJO:

TPAI:

LMUT:

APLA:

ACYG:

CATA:

AFUL:

TGU:

LSR:

SCAN:

PMOA:

OTC:

PRUF:

ATRC:

OMA:

PMAJ:

CCAE:

CCW:

ACOE:

ETL:

ZAB:

ZLE:

MMEA:

HRT:	120765014 120766013

SATI:

CCIC:

FCH:

SHAB:

ACUN:

TALA:

ACHC:

AGEN:

HHAR:

GCL:

PPUS:

EGZ:

CBOR:

CBOY:

MAME:

CNIC:

CUCA:

ACAR:

RTD:

CRID:

LMIC:

AROW:

NPD:	112947143 112947144

DNE:

112989777

ASN:	112551310 112551892 112551893

PSS:	112543670 112544539 112545262

CIZ:	142013959 142020440

CMY:	114018299 114018581 114018582

CCAY:

125637487 125643256 125643257

DCC:	119856460 119861990

CPIC:

112058715 112058716 112059274

TST:	117879700 117883477 117883478

CABI:

116817767 116820611 116820612

MRV:	120372745 120372746 120408797

ASAO:

132763245 132763246

SUND:

121924557 121937431 121937432

PBI:	112540891 112542188 112542189

PMUR:

114922197 114922198 114922326

CTIG:

120313260 120313261 120317464

PGUT:

117654851 117679676 117679677

PCAE:

139313485 139322986 139322987

APRI:

131183940 131183941 131193774

PTEX:

113446863 113446864 113449513

NSS:	113411429 113423785 113423786

VKO:	123024184 123034993

PMUA:

114589627 114606943

PRAF:

128406141 128407065 128423806

ZVI:	118077372 118078686 118078688 118078709 118084609

HCG:	128335764 128348411

STOW:

125443199 125443200

EMC:	129341795 129341796

XLA:	121397468 121397469 121397817 121397818 121399579 121399580

XTR:	116407422 116407424 116408497

RTEM:

120914832 120914833 120925393

ACAT:

141109168 141109169 141113116 141125031

BBUF:

120978298 120978299 120978300 120978301 120992643

BGAR:

122919998 122919999 122920000 122920001 122925281

DTC:	141048236 141048237 141048238 141054459

PWL:

138260614

MUO:	115456933 115456934 115460856

GSH:	117349495 117349496 117356152

DRE:	137487660 137487661

CCAR:

122139714 122147608 122147609

CAUA:

113058167 113058168 113114545 113114546

CGIB:

127971998 127971999 128028153 128028154

PTET:

122358308

LROH:

127176694 127176695

GRF:	141289071 141289072 141289073

OMC:

PPRM:

RKG:

MAMB:

CIDE:

CERY:

MASI:

127413486 127418488 127418489

MANU:

PDAB:

IPU:

IFU:

PHYP:

SMEO:

TFD:

TVC:

CGAR:

NGRA:

TRN:	134319704 134319705

AMEX:

125804878 125804879

CMAO:

118807406 118807407 118808741

EEE:	113583067 113583068

CHAR:

SPIL:

ASAD:

TRU:

TFS:

LCO:

TBEN:

117475290 117475291 117479850

CGOB:

PGEO:

GACU:

EMAC:

ELY:

EFO:

PLEP:

SLUC:

ECRA:

ESP:

PFLV:

AFB:

CLUM:

PSWI:

CANA:

CVE:

MSAM:

SCHU:

CUD:	121516874 121516879

SPUL:

138598790 138598791

LMIX:

132982613 132982614

HTC:	141794044 141794045

ALAT:

ASTR:

MZE:

ONL:

OAU:

OLA:

OML:

CSAI:

XMA:

XCO:

XHE:

GAF:

PPRL:

CTUL:

GMU:

AOCE:

EJA:

BFRE:

MCEP:

SSEN:

SSOE:

HHIP:

HSP:

PPLT:

LCF:	127142749 127142753

SLAL:

111646522 111646523

XGL:

120785852

PEE:

133408207

ENY:	140354859 140354860

BSPL:

114865100 114865104

SJO:	128363541 128363542

SSCO:

133986476 133986477

TTY:

137190401

GMH:	115552937 115552938

STRU:

OTW:

OGO:

ONE:

OKI:	116359685 116362591

OKE:	118372573 127928677

OMM:

135506532

SNH:	120018991 120057427

SFON:

129822691 129835007 129835009

CCLU:

121537426 121567234 121568521

ELS:	114829553 114839174

OEP:

PKI:

AANG:

AROT:

CCOG:

PSPA:

121309208 121309209 121309211 121309215 121309216 121309217 121319074 121319075 121319077 121325904

ARUT:

117409694 117412701 117412702 117412704 117430982 117430983 117430984

PSEX:

120529184 120538435

CMK:	121850730 121850731 121850783

RTP:	125484988 125486684

CPLA:

122540497 122556044

HOC:	132821111 132833843

SCAU:

LERI:

HAKA:

LHT:

LBD:

AGIF:

CINS:

FOC:

PAME:

Reference

PMID:16361266

Authors

Gu AD, Zhou H, Yu CH, Qu LH

Title

A novel experimental approach for systematic identification of box H/ACA snoRNAs from eukaryotes.

Journal

Nucleic Acids Res 33:e194 (2005)
DOI:10.1093/nar/gni185

Sequence

[hsa:677765]

LinkDB

DBGET integrated database retrieval system