KEGG   ORTHOLOGY: K28286
Entry
K28286            RNA       KO                                     
Symbol
SNOR86
Name
small nucleolar RNA SNOR86
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K28286  SNOR86; small nucleolar RNA SNOR86
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K28286  SNOR86; small nucleolar RNA SNOR86
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Related small nucleolar RNAs
  Box H/ACA snoRNAs
   SnoRNAs act as guides for pseudouridynation
    K28286  SNOR86; small nucleolar RNA SNOR86
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Small nucleolar RNA
  K28286  SNOR86; small nucleolar RNA SNOR86
Genes
ATH: AT1G06553 AT3G09225
CRB: 111828826 111830769
BRP: 117126325 117126997 117128735 117128736 117133798
BNA: 125575990 125578805 125578806 125582816 125584903 125586760 125589478 125590982 125592193 125592194 125608431
RSZ: 130495342 130495343 130495344 130498212 130508868 130512181 130512182
CIT: 112496399
PVY: 116120872
MINC: 123197095 123222235 123222236 123222237
GRA: 105800456 128035781
GHI: 121206941 121211600 121221555 121224854
GAB: 128281325 128285877
HSYR: 120175275 120175276 120192182 120192183 120198753 120206782 120206783
EGR: 120289104 120292359
RARG: 115739328
GMX: 113000966 113002268
GSJ: 114404387 114420824
PVU: 137808894
VAR: 128195074 128195075 128197644
VUN: 114180059 114195733 114195734
VUM: 124835655 124839461 124839462 124841267 124841269 124841270
CCAJ: 114915333
APRC: 113860443
MTR: 112419617 112419618 112419619 112421499
TPRA: 123882539 123900201
CAM: 113785197 113785198 113787326
PSAT: 127089773 127109553 127109554 127109556 127109557 127109558 127109559 127109560 127109561 127116779
VVO: 131600909 131623622 131623624 131623625 131624660 131654452
LJA: 130709661 130709662 130716395 130727117 130741644
ADU: 127748277
AHF: 112753601 112804641
PCIN: 129287375 129291933 129291934 129291935 129291936 129297315 129297316 129297318 129307500 129307501 129307503 129307504 129307505 129312228 129312230 129312232
AANS: 126793042 126805376 126805377 126805378 126805379
RCN: 112191054 112191057 112191058 112191059 112201215
PDUL: 117626829
MDM: 114819889 114824279
MSYL: 126591679 126617532
PCOX: 137716657 137743962
ZJU: 112490318
MNT: 112092508
CSAV: 115708487 115708488 115708489 115708490
CSV: 116402308
CMO: 127148734
BHJ: 120076926
CMAX: 111478901 111492545 111496647
CMOS: 111431249 111454761 111463035
CPEP: 111799347 111806214
RCU: 112535307 112535308
MEAN: 126676031 126676032
JCU: 119370647 119370910 119370911
MESC: 122723391 122724467 122724468 122724724 122724725
POP: 112323927 112323928 112325603 112325604
PALZ: 118035588 118041002 118050440 118050441
PNZ: 133668858 133670297 133670298
JRE: 118344139 118344140 118349095
CILL: 122293887 122302071 122302072
CAVE: 132168323 132176779 132176780 132191157
AGLU: 133859001
QSU: 111997269 111997270 111997272 112025694
QLO: 115966152 115966153 115993421 115993422 115993423
CSAA: 142633186 142633188 142637733 142637734 142637736
TWL: 119981594 119990272 119995751
VVI: 132253868
VRI: 117915488 117917178
SLY: 112940406 112940563 112940565 112940566 112942096
SPEN: 114074981 114075459 114075460 114075461 114078505
SSTN: 125843389 125846174 125863538 125863539 125863541
SDUL: 129871853 129871854 129890902 129901769
CANN: 124887548 124889172 124892434
LBB: 132601015 132612490 132619323 132620678 132620679
NSY: 138872264 138882486 138882487 138884468
NTO: 117275366 117276078 117277405 117280957 117281063
ITR: 116002484 116014556 116026371
SSPL: 121756646 121756647 121806037 121806038
SMIL: 131007403 131024001
SHIS: 125185766 125185768 125185769 125185770 125185771 125191421 125191423 125199748 125199749 125199750
APAN: 127242783
HPUM: 140870232 140876540
PHUA: 140989096
PEBU: 140813403
PTAB: 142528176 142544046
HAN: 118483617 118483618 118485318 118485320
ECAD: 122598724 122606370
LSV: 111912497 111912498 111912499 111914532
CCAV: 112517500 112517501 112517502
DCR: 135148596 135150993
CSIN: 114258687 114268536 114282554 114286766 114306431 114320908
RVL: 131312244 131318326
AEW: 130757350 130774889 130775739
DLT: 127789419
SOE: 130460491 130460492 130460493 130460494 130460495 130460496 130460498 130464714 130466654 130466655 130466656 130466657 130471180
ATRI: 130801176 130802001 130802002 130819614 130819615 130819616 130827992 130827993
SLAF: 141609913 141609914 141609915 141616248 141616249 141616250
MOF: 131152511
MING: 122062217 122062218 122062219 122062220 122062222 122062223 122065044
TSS: 122646963 122648379 122649230 122649231 122653307 122666421 122666422 122666424 122666425
PSOM: 113276857 113276858 113276859 113276860 113276861 113276864 113276865 113284942 113284943 113284944 113284946 113284947 113284948 113284949 113284950 113284951 113284952 113292247 113292248 113300834 113300835 113300836 113300837 113307293 113328966 113328967 113328968 113328969 113328973 113329324 113329326 113335088 113337591 113341111 113342054 113342059 113362483 113362484 113362485 113362486 113362487 113362488 113362489 113362490
OBR: 121056085
OGL: 127758274 127758275
BDI: 112269048 112269049
ATS: 120963658 120963659 120963660 120963661 120963662 120963663 120963664
TDC: 119290296 119290297 119290298 119290299 119290300 119296511 119296512 119296513 119296514 119296515
TAES: 123088913 123088914 123088915 123088916 123088917 123088918 123088919 123095312 123095313 123095314 123095315 123095316 123100885 123100886 123100887 123100889 123100890 123100891
TUA: 125527249 125527251 125527252 125527253 125527254 125555108 125555109 125555110 125555111 125555112 125555113 125555114 125555115 125555116 125555117
HVG: 123451564 123451565 123451566 123451567 123451568
LPER: 127304994 127304995 127304996 127326686 127327952 127327953 127337280 127337281 127337282 127337283 127337284 139834255 139834256
LRD: 124650713 124650714 124650715 124650716 124658513 124658514 124658517 124658518 124658519 124658520 124658521 124668776 124668779 124681705 124681709 124681710 124685506 124693860
ZMA: 111589412 111589413 111589607 111591409
MFLO: 136468265 136468266 136468267 136478818 136495057 136502389 136514631 136514632 136525002 136534150
SVS: 117841756 117851114 117851115
PVIR: 120657861 120658220 120668248 120668249 120701650 120701651
PHAI: 112879126 112888251 112888252
PAUA: 133905596 133906835
PDA: 113462353 113462354 113462355 113462476 113462477 113462478 113462480 113462481 113462482 113462808 113462809 113462810 113462813 113462814 113462815 113463331 120112288 120112289
EGU: 114913944 114913945 114913946 114913947 114914537 114914538 114914539 114914540 114914541 114914542 114914543 140851858
MUS: 135608607 135616022 135616023
ZOF: 121983639 121988222 121994985 122039360
DCT: 114579521 114579522 114579523
MSIN: 131241894
ACAK: 137935571 137957390 137960725 137964385 137964387 137965394 137965399
NCOL: 116249364 116249365 116249366 116251783 116251784
CJF: 131033888 131033891
 » show all
Reference
PMID:19357091
  Authors
Chen HM, Wu SH
  Title
Mining small RNA sequencing data: a new approach to identify small nucleolar RNAs in Arabidopsis.
  Journal
Nucleic Acids Res 37:e69 (2009)
DOI:10.1093/nar/gkp225
  Sequence
[ath:AT1G06553]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system