KEGG   ORTHOLOGY: K28288
Entry
K28288            RNA       KO                                     
Symbol
SNOR103
Name
small nucleolar RNA SNOR103
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K28288  SNOR103; small nucleolar RNA SNOR103
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K28288  SNOR103; small nucleolar RNA SNOR103
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Related small nucleolar RNAs
  Box H/ACA snoRNAs
   SnoRNAs act as guides for pseudouridynation
    K28288  SNOR103; small nucleolar RNA SNOR103
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Small nucleolar RNA
  K28288  SNOR103; small nucleolar RNA SNOR103
Genes
OBR: 121054336 121054337 121054338 121054339
OGL: 127772372 127772373 127772374
BDI: 112269541 112269542 112269543 112269544 112269545 112269642
ATS: 120975158 120975159 120975160 120975161 120975162 120975163 120975165 120975167 120975169
TDC: 119266329 119266330 119266331 119266332 119266333 119266334 119266335 119266336 119266337 119266338 119359978 119359979 119359980 119359981 119359982 119359983 119359984 119359985 119359987
TAES: 123038518 123038519 123038520 123038521 123038522 123038523 123038524 123038525 123038527 123038529 123047881 123047882 123047883 123047884 123047885 123047886 123047887 123047888 123047889 123047890 123047891 123056360 123056361 123056362 123056363 123056364 123056365 123056368 123056369 123056371
TUA: 125526181 125526182 125526183 125541958 125541959 125541960 125541961 125541962 125541963 125541964 125541965 125541966 125541969
HVG: 123433823 123433824 123433826 123433827 123433828 123433829 123433830 123433832 123433833 123433834
LPER: 127297786 127297787 127304951 127318149 127337330 127337331 127337332 127337333 127337334 127337336 127337337 127337338 127337340 127346312 127346313 127346314
LRD: 124658573 124668872 124668873 124668874 124668875 124668877 124668878 124679976 124679977 124679978 124679980 124679981 124679983 124679984 124679985 124679986 124679987 124679989 124679991 124679992 124679993 124679994 124679996 124679997 124679998 124681589 124693928 124693929 124704998 124704999 124705001
ZMA: 111589853 111589854 111590213 111590753 111591232 111591233
MFLO: 136455776 136455777 136455778 136455779 136455780 136462130 136462131 136462132 136498756 136498758
SVS: 117859362 117859363 117866021 117866023
PVIR: 120643247 120677112 120677113 120684159 120710918 120710919 120710920
PHAI: 112896086 112896088 112896089
PAUA: 133889885 133889888 133889889 133925687 133925688 133925689 133925690 133925691
TANG: 140767918
PDA: 113462367 113463104
EGU: 114913953 114914415
MUS: 135611426
ZOF: 122028431 122030738 122033225 122035629 122035630
DCT: 114581231
ATH: AT4G08325 AT5G08805
CRB: 111829100 111829776
BRP: 117127593 117129173 117129177 117132294
BNA: 125576006 125577494 125579389 125581195 125582830 125584932 125589634
RSZ: 130499298 130499299 130503409 130508887 130508888
CIT: 112498016 112499091
PVY: 116105334 116105335 116138201
MINC: 123195372 123195373 123201228 123201231 123208233
GRA: 128033394 128034392 128036465 128040298 128042751 128042752 128042753
GHI: 121203922 121203923 121203925 121205475 121205476 121205477 121207154 121208822 121211610 121216662 121218058 121218982 121219734 121219735 121219736 121230193 121231301
GAB: 128287278 128295744 128295745 128295746
HSYR: 120130308 120130311 120162573 120166356 120207779 120207780 120207781 120211992 120211993 120211994 120211995
EGR: 120287963 120289172
RARG: 115744646
GMX: 113000021 113000979 113001556 113002026
GSJ: 114394312 114404435 114410991 114417554
PVU: 137808902 137823248
VAR: 128194174 128195092 128196429 128196877
VUN: 114164936 114179990
VUM: 124819886 124837696 124849097 124849098
CCAJ: 114915534 114916714
APRC: 113848684 113853404 113853405
MTR: 112421524 112421525
TPRA: 123912044 123912045
CAM: 113787856 113787857
PSAT: 127077619 127077620
VVO: 131645534 131645535 131645536 131645537
LJA: 130716408 130727130
ADU: 127742564
AHF: 112714738 112725753
PCIN: 129289732 129310234 129321155
AANS: 126789649 126805388
RCN: 112168554 112191091 112191092
PDUL: 117616907 117636245
MDM: 114821897 114821898 114823822 114823823 114826706
MSYL: 126606114 126606115 126614145 126614146 126633651
PCOX: 137718913 137720424 137720432 137749116
ZJU: 112489393
MNT: 112090584
CSAV: 115696133
HLP: 133787806
CSV: 116403585
CMO: 127150421
BHJ: 120080637 120087434
CMAX: 111477348 111481335
CMOS: 111443726 111446822
CPEP: 111789460 111797796
RCU: 112536972
MEAN: 126654216 126662385 126666411 126670848 126670849
JCU: 119370552
MESC: 122721647 122721848 122722165 122723403 122723932
POP: 112325126 112325127 112328085
PALZ: 118034399 118050339 118051303
PNZ: 133674983 133674984 133690414
JRE: 118344765 118348852
CILL: 122298045 122300007
CAVE: 132185983
AGLU: 133867546 133878731
QSU: 112025138 112035376 136068544
QLO: 115978474 115978475
CSAA: 142622984 142622985
TWL: 119993912 119998052 120006766
VVI: 132253700 132253701 132254705
VRI: 117913716 117913717 117925777
SLY: 112940582 112940583 112941434 112941435 112941437 112941438 112941913
SPEN: 114075418 114075419 114076997 114076998 114076999 114077000 114078123
SSTN: 125850270 125850271 125854047 125857285 125878048
SDUL: 129871873 129871874 129893671 129893672 129904077
SVER: 125812001 125812002 125816941 125824742 125830545
CANN: 124886319 124887571 124887572 124899922
LBB: 132601035 132604827 132616401 132639023 132639024
NTA: 142163700 142163701 142164495 142173169 142175611 142175612
NSY: 138872285 138872287 138882497
NTO: 117276105 117279397 117279398
ITR: 116026375
SSPL: 121749955 121753425 121753426 121753427 121797497 121797498 121797499 121797500 121797501 121797502 121797504 121797506 121801663 121801664 121801666 121801667 121801668 121801669 121801670
SMIL: 130991074 130991075 130991076
SHIS: 125191450 125197641 125197642 125197644 125197645 125197646 125197647
APAN: 127264253
HPUM: 140885572 140885573
CARB: 113694388 113697650 113738289
HAN: 118484618 118484619
BHW: 143551461 143551462 143579235 143579242 143623040
ECAD: 122584075
LSV: 111914947(LOC111914947) 111914948(LOC111914948)
CCAV: 112520583 112520585
DCR: 135146881 135146882 135148607 135148608
AGRV: 141722798 141722799 141722800 141722801
CSIN: 114277925 114315895
RVL: 131305803 131305804 131309334 131315446 131315447 131321436 131321437 131321438 131321439
AEW: 130750757 130766379 130766380 130785614 130786779 130787172 130788747 130792410
DLT: 127793641 127807062
CFLO: 132287590 132287591 132287592 132287593 132305979
SOE: 130466671 130466672 130468385
ATRI: 130816766 130828001
MOF: 131152519 131152520
MING: 122077639 122085288
TSS: 122646967 122646968 122646969 122657164
PSOM: 113292273 113292274 113300882 113300884 113307337 113307338 113342299 113342307
MSIN: 131257268 131257269 131257270
ACAK: 137939633 137945075
 » show all
Reference
PMID:19357091
  Authors
Chen HM, Wu SH
  Title
Mining small RNA sequencing data: a new approach to identify small nucleolar RNAs in Arabidopsis.
  Journal
Nucleic Acids Res 37:e69 (2009)
DOI:10.1093/nar/gkp225
  Sequence
[ath:AT4G08325]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system