KEGG   ORTHOLOGY: K28291
Entry
K28291            RNA       KO                                     
Symbol
SNOR135
Name
small nucleolar RNA snoR135
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K28291  SNOR135; small nucleolar RNA snoR135
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K28291  SNOR135; small nucleolar RNA snoR135
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Related small nucleolar RNAs
  Box H/ACA snoRNAs
   SnoRNAs act as guides for pseudouridynation
    K28291  SNOR135; small nucleolar RNA snoR135
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Small nucleolar RNA
  K28291  SNOR135; small nucleolar RNA snoR135
Genes
ATH: AT2G09700 AT2G09705
CRB: 111831256 111831257
BRP: 117133256 117133825 117134531 117134532
BNA: 125584967 125584968 125586815 125607339 125608460 125609723
RSZ: 130497332 130497333 130510316 130510317
CIT: 112496012 112496463
PVY: 116117834 116119504 116122690 116122691 116122695 116122696 116122697 116122700 116122701 116127652 116140556 116146997
MINC: 123193782 123193783 123193784 123198450 123206082 123215181 123217829 123217830 123226622
GRA: 128033516 128041502
GHI: 121207274 121214361 121218066 121230201
GAB: 128281786 128293647
HSYR: 120114190 120127961 120128182 120131905 120133359 120148629 120155470 120160772 120181791 120194544
EGR: 120290996 120295215
RARG: 115737613
GMX: 112997958 112997959 112997961 112998965 112999671 113000294 113000296
GSJ: 114369044 114369045 114369047 114377750 114388811 114397817 114397818
PVU: 137816762 137827341 137827342 137827343 137827344 137827345 137836245
VAR: 128194881 128195655 128195656 128195657 128195658 128195659
VUN: 114186386 114186387 114186388 114186389 114186390 114186391 114186392
VUM: 124830973
CCAJ: 114916154 114916155 114916604
APRC: 113856741 113864103
MTR: 112419642 112420577
TPRA: 123893365 123893367 123893368 123893369 123900228 123903458 123903459 123919252 123919253
CAM: 113785147 113785235 113785236 113785237 113785238 113785239 113785977
PSAT: 127090002 127090003 127099512 127099513 127134276
VVO: 131593881 131593882 131600942 131600943 131608514 131608515 131608516 131608517 131621206 131621207 131624157 131632480 131637158 131638330 131638399 131641876 131645569 131654511 131654512
LJA: 130709700 130734951
ADU: 127741024 127742577
AHF: 112704344 112714806 112725762 112768435
PCIN: 129289735 129304311
AANS: 126785534 126785535 126789659
RCN: 112168568 112168569 112168570 112174945 112174946 112195620
PDUL: 117616917
MDM: 114821905 114826710 114826711
MSYL: 126606122 126606124 126633655 126633656
PCOX: 137718918 137720471
ZJU: 112489360
MNT: 112091946
CSAV: 115703441 115708518 115708519 115724361
CSV: 116402983
CMO: 127149157
BHJ: 120070441
CMAX: 111480151 111493460
CMOS: 111452911 111458084
CPEP: 111789461 111791939
RCU: 112534361 112536282
MEAN: 126662392 126685268
JCU: 119370356 119370762
MESC: 122724961 122725232
POP: 112327060 112327061
PALZ: 118029323 118062973
PNZ: 133702455
JRE: 118344599 118344773 118349121 118349122
CILL: 122280265 122293083 122294014 122305964
CAVE: 132176815 132180192 132183522 132188910
AGLU: 133855111 133862155 133865138
QSU: 111988349 111995983 112029722 136063820
QLO: 115958714 115993448 115993449
TWL: 120008345 120011648
VVI: 132254231 132254232 132254390 132254391
VRI: 117915494 117921366 117921367 117922798 117922799
SLY: 112940543 112940544 112941935
SPEN: 114075427 114075429 114075810 114078144
SSTN: 125846189 125854061 125863495 125863497 125875309 125878068
SDUL: 129893694 129904152
CANN: 124886335 124888379 124894647 124896456 124897499
LBB: 132619481 132620733 132643125
NSY: 138874276 138876707
NTO: 117273631 117274455
ITR: 116005391 116026380 116026381 116031102
SSPL: 121769596 121769597 121769598 121773137 121773138 121789629 121797521 121801691
SMIL: 130987276 130996451 130996452
SHIS: 125208706 125208707 125217266 125217267
APAN: 127263219 127263220
HPUM: 140885582
PHUA: 140960602 140968363
PEBU: 140824938 140842219
HAN: 118490063 118492018
ECAD: 122590368
LSV: 111900106 111907954
CCAV: 112511918 112511919
CSIN: 114268641 114300988 114300989
RVL: 131299327 131302184 131312205
AEW: 130750760 130763169
DLT: 127796088 127813825
SOE: 130460545 130460546 130468405
ATRI: 130801297 130807136 130814395 130816775
SLAF: 141622764 141625771
MOF: 131161173 131165168 131165169
MING: 122072496
TSS: 122670168 122670169
PSOM: 113276948 113276949 113285066 113285067 113285069 113300909 113300910 113307372 113307373 113314664 113314665 113314667 113319908 113319909 113319910 113319911 113335494 113354900
OBR: 121054017 121055080 121055081
OGL: 127769128 127780964 127780965 127780966
BDI: 112269074 112270320 112270321 112270322 112270323 112270324
ATS: 120962251 120962252 120962253 120973111 120975177 120975178 120975179 120975180 141040188
TDC: 119266350 119266351 119266352 119351142 119360003 119360004 119360005 119360006
TAES: 123038543 123038544 123038545 123038546 123047905 123047906 123047907 123047908 123056379 123056380 123056381 123056383 123073618 123073626 123152497 123183924
TUA: 125533403 125533404 125541984 125541985 125541986
LPER: 127337348 127337349 127337351 127337352 127337353 139837249
LRD: 124680004 124680005 124680008 124680009 124680010 124705055 124705057 124705058
ZMA: 111589863 111589864 111589865 111591078 111591079
SVS: 117846671 117846673 117846675
PVIR: 120663197 120663198 120663200 120696374 120696375 120696376
PHAI: 112879156 112879157 112883641 112883642 112883643
PAUA: 133891848 133891849 133891850 133891851 133891852 133891853 133894232
TANG: 140775234
PDA: 113461315 113461316 113461683 113462585 113462641 113462642 113463180 120111254 120111255 120111820
EGU: 114913696 114913697 114913698 114914066 114914766 114914767
MUS: 135599606 135599607 135599608
ZOF: 121968980 122054544 122054545
DCT: 114579327 114579328
MSIN: 131224588
ACAK: 137950953
NCOL: 116249395 116249396 116249397 116259758
CJF: 131055437 131078297
 » show all
Reference
PMID:19357091
  Authors
Chen HM, Wu SH
  Title
Mining small RNA sequencing data: a new approach to identify small nucleolar RNAs in Arabidopsis.
  Journal
Nucleic Acids Res 37:e69 (2009)
DOI:10.1093/nar/gkp225
  Sequence
[ath:AT2G09700]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system