KEGG   ORTHOLOGY: K28292
Entry
K28292            RNA       KO                                     
Symbol
SNOR136
Name
small nucleolar RNA SNOR136
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K28292  SNOR136; small nucleolar RNA SNOR136
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K28292  SNOR136; small nucleolar RNA SNOR136
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Related small nucleolar RNAs
  Box H/ACA snoRNAs
   SnoRNAs act as guides for pseudouridynation
    K28292  SNOR136; small nucleolar RNA SNOR136
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Small nucleolar RNA
  K28292  SNOR136; small nucleolar RNA SNOR136
Genes
OBR: 121053675 121054343
OGL: 127764861 127772381
BDI: 112272134
ATS: 120967725 120967726
TDC: 119290415 119319877 119319879 119327185 119327186 119327187 119327189
TAES: 123089033 123132888 123132889 123140491 123140493 123146704 123146705
TUA: 125517822
HVG: 123406770 123406772 123451653
LPER: 127311067
LRD: 124680021 124693966 124693967 124693968
ZMA: 111589475 111590396
MFLO: 136468324 136478928 136478929 136495086 136495087 136498761
SVS: 117841805 117866034
PVIR: 120643261 120657899 120658375 120684205
PHAI: 112879160 112901772
PAUA: 133920224 133923299 133925697
PDA: 113460998 113461079 120107245
EGU: 114914855
MUS: 135608618
ZOF: 121983670 121988251
DCT: 114580184 114580185 114580186 114580187 114580189
ATH: AT3G07725
CRB: 111830784
BRP: 117126351 117126352 117128796
BNA: 125576019 125576020 125578871 125584975 125584976 125584977 125607347
RSZ: 130495391 130497345
CIT: 112498700 112499436
PVY: 116129658 116130288 116130289 116130290
MINC: 123209864 123226623
GRA: 128032329
GHI: 121205497 121220685
GAB: 128279898
HSYR: 120116249 120148705 120150667
EGR: 120291003
RARG: 115746095
GMX: 112997915 112999101 112999449 113000614 113000616 113000994
GSJ: 114368769 114382858 114385571 114401088 114401089 114404508
PVU: 137827347 137827348
VAR: 128193437 128193439 128195109
VUN: 114180013 114180014 114195699 114195700 114195702
VUM: 124819986 124824473 124824474 124824475
CCAJ: 114917042
APRC: 113848696
MTR: 112416145 112422311
TPRA: 123882605 123882607 123882608 123882609 123882611 123887876
CAM: 113785555 113785556 113785557 113785558 113785560 113785991 113787870
PSAT: 127124787 127124788 127124789 127124790 127124791
VVO: 131621208 131621209 131629729 131645573
LJA: 130734971
ADU: 127742585
AHF: 112714888 112725766
PCIN: 129304267
AANS: 126789666
RCN: 112168580
PDUL: 117633315 117633316
MDM: 114819896 114824286 114824287 114825721
MSYL: 126591685 126617541 126617542 126627594
PCOX: 137709628 137743968
ZJU: 112490814
MNT: 112092769 112092829 112094757
CSAV: 115718298 115721611
HLP: 133780832 133792929
CSV: 116401826 116402990
CMO: 127145042
BHJ: 120074835 120084314
CMAX: 111495864
CMOS: 111440063
CPEP: 111783753 111804595
RCU: 112536946 112536947 112536951
MEAN: 126654267 126659002 126666424 126685271
JCU: 119371086 119371087
MESC: 122725234 122725235
POP: 112326313 112328711
PALZ: 118027728 118055622
PNZ: 133680695 133681213
JRE: 118343880 118344600 118348564
CILL: 122293084 122293085 122295275
CAVE: 132164841 132168350 132168351
AGLU: 133862157 133878737
QSU: 111996393 112030118
QLO: 115956032 115988223
CSAA: 142608513 142622988
TWL: 119983604 120003188 120003189
VVI: 132253998
VRI: 117917190
SLY: 112940815 112941395
SPEN: 114075816 114075817 114077007
SSTN: 125846141 125854067 125854068 125854069 125854070 125857292
SDUL: 129888186 129904858 129904859
SVER: 125818526 125829987 125838968 125838973
CANN: 124886918 124889182 124898366
LBB: 132608574 132616242 132629673 132629674
NTA: 142174042 142176924
NSY: 138878825
NTO: 117275067
ITR: 116002607 116007733 116007734
SSPL: 121746272 121797523 121801694
SMIL: 131007438
SHIS: 125191467 125197679 125197680
APAN: 127252285
HAN: 118483142 118483147
BHW: 143544642 143574580 143603850 143631917
ECAD: 122584093 122602468
LSV: 111913218(LOC111913218) 128128293(LOC128128293)
CCAV: 112513880
DCR: 135151009
AGRV: 141669871
CSIN: 114277702 114320643
RVL: 131308898 131308911 131308917
AEW: 130792427
DLT: 127793603
SOE: 130466693 130466694
ATRI: 130814349
MOF: 131150063
MING: 122071146 122090351
TSS: 122638435 122638436 122649291
PSOM: 113285087 113314687 113325644 113325646 113329290 113329291 113329292 113329293
MSIN: 131241916 131244964 131254658 131257271 131257272
 » show all
Reference
PMID:19357091
  Authors
Chen HM, Wu SH
  Title
Mining small RNA sequencing data: a new approach to identify small nucleolar RNAs in Arabidopsis.
  Journal
Nucleic Acids Res 37:e69 (2009)
DOI:10.1093/nar/gkp225
  Sequence
[ath:AT3G07725]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system