KEGG   ORTHOLOGY: K28306
Entry
K28306            RNA       KO                                     
Symbol
SNOR128
Name
small nucleolar RNA SNOR128
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K28306  SNOR128; small nucleolar RNA SNOR128
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K28306  SNOR128; small nucleolar RNA SNOR128
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Related small nucleolar RNAs
  Box C/D snoRNAs
   SnoRNAs act as guides for 2'-O-ribose methylation
    K28306  SNOR128; small nucleolar RNA SNOR128
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Small nucleolar RNA
  K28306  SNOR128; small nucleolar RNA SNOR128
Genes
ATH: AT2G07605 AT2G07615
CRB: 111831306 111831307
BRP: 117128784 117133823 117133824
BNA: 125578851 125586813 125586814 125592224 125608458 125608459
RSZ: 130497329 130512244 130512245
CIT: 112496456 112496458 112496460
PVY: 116123470 116123471 116123472 116123473 116123474 116123475 116123476 116123477 116123478
MINC: 123196198 123196203 123199842 123199843
GRA: 128034398 128034399 128034400 128034401
GHI: 121208826 121208827 121208828 121208829 121222945 121222947 121222948 121222949
GAB: 128282903 128282904 128282905 128282906
HSYR: 120120160 120132445 120132447 120132448 120136950 120137979 120137980 120137981 120148531 120159782 120159783 120159785 120198988 120212625 120212626
EGR: 120288604 120288659
RARG: 125312990 125312991
GMX: 112997914 113000993
GSJ: 114368764 114404501
PVU: 137813147
VAR: 128194579
VUN: 114174786
VUM: 124824170
CCAJ: 114916065
APRC: 113870568
MTR: 112422300 112422301 112422302 112422303 112422304
TPRA: 123912059 123912060 123912061 123912062 123912064 123912065 123912066 123912067 123912068 123912069
CAM: 113785549 113785550 113785551 113785552 113785553 113785554 113788191 113788192 113788193
PSAT: 127124762 127124764 127124765 127124766 127124767 127124768 127124769 127124770 127124771 127124772 127124773
VVO: 131593877 131615440 131615441 131615442 131621205 131635731 131639011 131654496 131654497 131654498 131654499 131654500 131654501 131654502 131654503 131654504 131654505 131654506
LJA: 130741671 130741673 130741674 130741675 130741676
ADU: 127748289
AHF: 112753613 112804654
PCIN: 129284706 129284707
AANS: 126805390 126805392
RCN: 112191106 112191107 112191108 112191109 112191110
PDUL: 117633310 117633311
MDM: 114821902 114821903 114821904
MSYL: 126606119 126606120 126606121 126634169 126634173 126634177
PCOX: 137720451 137720458 137720465 137721623 137721624 137721625
ZJU: 112492669 112492670 112492671
MNT: 112093756 112093757 112093758
CSAV: 115715476 115715478 115715479 115715480 115715481
CSV: 116403587
CMO: 127150422
BHJ: 120092287
CMAX: 111483522 111494254
CMOS: 111436092 111448058
CPEP: 111783088 111810970
RCU: 112536593 112536594 125370754
MEAN: 126658989 126658990 126658991 126658992
JCU: 119371501 119371502 119371503
MESC: 122721444 122721445 122721446 122721657 122721658
POP: 112327696
PALZ: 118045835
PNZ: 133695512
JRE: 118344091 118344092 118349119 118349120
CILL: 122293989 122293995 122302102 122302103
CAVE: 132188905 132188906 132188907 132188908
AGLU: 133865135 133865136
QSU: 111998617 111998618 111998619
QLO: 115951069 115951070 115951071
CSAA: 142626548 142626550 142626551
TWL: 119995763 119995764 119995765 119995766 119995767 119999202 119999203
VVI: 132254140 132254141
VRI: 117919494 117919495
SLY: 112940411 112940412 112940413 112940414 112940415
SPEN: 114074987 114074988 114074989 114074990 114074991
SSTN: 125846184 125846185 125846186 125846187 125846188
SDUL: 129904088 129904096 129904109 129904115 129904119 129904125 129904132 129904138 129904142 129904147
CANN: 124888376 124889180 124889968 124889969 124889970 124889971 124898362
LBB: 132616408 132616409 132616410 132616411 132616412 132616413 132616415
NSY: 138869886 138869887 138869888 138869889
NTO: 117274332 117274333 117274334 117274335 117274336 117274337
ITR: 116000535 116000536 116021345 116021346 116021347
SSPL: 121769594 121773136 121785595 121788157
SMIL: 131002081
SHIS: 125217260 125217261
APAN: 127242500 127244577
HPUM: 140893690
PHUA: 140963701 140971917
PEBU: 140822277 140828781
PTAB: 142513047 142547920
ECAD: 122580734 122580735
LSV: 111917327 111917328
CCAV: 112528815 112528867
DCR: 135151870
CSIN: 114297886 114297887
RVL: 131299325 131305854 131305855
AEW: 130778352 130781908
DLT: 127805432 127805434
SOE: 130471236 130471237 130471238 130471240
ATRI: 130800580 130800581 130800582 130809522 130809523 130823009 130823010
MOF: 131161170 131161171
MING: 122062225 122064962 122085291 122086955 122094605
TSS: 122660620
PSOM: 113319895 113319896
OBR: 121054844
OGL: 127778147
BDI: 112270316
ATS: 120970175 120970176
TDC: 119334960 119334961 119342511
TAES: 123155258 123155259 123163469 123171789 123171790
TUA: 125526197 125526198
HVG: 123414548 123414549
LPER: 127318156
LRD: 124685562 124685563
ZMA: 111590055 111591242
MFLO: 136462141
PVIR: 120677118 120677119 120705349 120710924 120710925 120710926
PHAI: 112891249 112891250 112896039 112896040
PAUA: 133891212 133910379
PDA: 113461952
EGU: 114914418 114914491
ZOF: 122044802 122050022
DCT: 114580355 114580356
MSIN: 131217982
ACAK: 137966774
CJF: 131035509
 » show all
Reference
PMID:19357091
  Authors
Chen HM, Wu SH
  Title
Mining small RNA sequencing data: a new approach to identify small nucleolar RNAs in Arabidopsis.
  Journal
Nucleic Acids Res 37:e69 (2009)
DOI:10.1093/nar/gkp225
  Sequence
[ath:AT2G07605]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system