KEGG ORTHOLOGY: K28310

ORTHOLOGY: K28310

Entry

K28310            RNA       KO

Symbol

RNU12

Name

U12 small nuclear RNA

Disease

H01891

Autosomal recessive spinocerebellar ataxias

Brite

KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome
    K28310  RNU12; U12 small nuclear RNA
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K28310  RNU12; U12 small nuclear RNA
Spliceosome [BR:ko03041]
Splicing related RNAs
  K28310  RNU12; U12 small nuclear RNA
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
Small nuclear RNA
  Sm-class snRNA
   K28310  RNU12; U12 small nuclear RNA

Genes

HSA:	267010(RNU12)

PTR:	112206783 112207259

PPS:	112438166 112438644

GGO:	115931982 115932596

PON:	112130700 112131228

PPYG:

129023776 129025613

NLE:	115833504 115836206

HMH:	116459539 116812413

SSYN:

129468761 129476644

MCC:	114670714 114675285

MCF:	123567393 123571542

MTHB:

126929956 126947081

MNI:	112423579 112423592 112423755

PANU:

116270923 116272309

TGE:	112616792 112633925

RRO:	115893115 115898945

TFN:	117078706 117096804

PTEH:

111532792 111549170

CJC:	118144754 118147916 118150393 118153175

CIMI:

119468369 119468475 119471601

ANAN:

135268420 135270936 135271339

LCAT:

123640797 123645271

OGA:	111722482 111722903 111723075 111723152 111727650 111727669

MMU:	104307(Rnu12) 115488440(Gm23502) 115489650(Gm25703) 115490314(Gm24525)

MCAL:

115029350 115029351 115029509 115030559 115030824 115032085

RNO:	120094037(Rnu12) 120094536 120100491(Rnu12-2l) 120102117

MCOC:

116071518 116076642 116082933 116082955 116084049 116092606 116094655

ANU:	117700625 117716684 117719453

ASYL:

127668278 127673426 127691785

MUN:	132653381 132656138

CGE:	113833645 113834456 113835311 113835703

MAUA:

121143020

PROB:

127224488 127226237 127234322

PLEU:

114686398 114687654 114697816 114710334

MORG:

121461572 121461573 121462075

MFOT:

126494179 126503604

AAMP:

119824145 119824146 119825863

CPOC:

111754149 111757059

DSP:	122111589 122113063 122116606 122123671

DMER:

138811947 138826235 138828506

PLOP:

125341911 125341919 125350975 125355847 125358909

NCAR:

124960828 124969617 124984128

MMMA:

125613832 125613975 125616828 125619688

ITI:	120888814 120890158 120892149 120892150

OCU:

127487694

OPI:	118757645 118759515 118759974

CFA:	119864040 119865065 119867661 119868005 119869440 119871374 119872427 119873137 119873800

CLUD:

112641113 112654228 112654896 112656840 112658221 112665147 112667987 112670223 112675158 112675743

VVP:	112911577 112915661 112922622 112924527 112925564 112927802 112934093 112935102 112935374

VLG:	121475159 121475468 121476697 121488580 121490309 121492312 121492313 121494119 121498412

NPO:	129493993 129498314 129499578 129503337 129505186 129511211 129512248 129520366 129520943 129523072

AML:	117795614 117796528 117796529 117797306 117797307 117801348 117801349 117801710 117802148 117804524

UMR:	121099975 121100315 121100316 121100865 121101107 121101587 121101770 121102147 121104479 121105964

UAH:	113241822 113247594 113248468 113248969 113250940 113254841 113255385 113262561 113266248 113267319

UAR:	123778128 123778585 123779700 123780981 123783940 123789709 123794391 123795431 123799326 123804105

LLV:	125081581 125081582 125092573 125094442 125094443 125096501 125099372 125099373 125101343 125105700 125105701 125108010 125108011 125110089 125110090

MNP:	132000353 132000354 132002406 132004652 132007990 132008660 132014638 132016939 132020933 132020934 132022955 132022956 132028891

MLK:	131808767 131808768 131810741 131822432 131828247 131830858 131832754 131837324 131837325 131839927 131839928

NVS:	122890596 122892714 122892715 122894792 122896953 122897722 122901395 122903703 122905606 122916569 122916570

EJU:	114198748 114206055 114208550 114208771 114210927 114211069 114218571 114218836 114221488 114222382

ZCA:	113910825 113912118 113915652 113917861 113921242 113923314 113923315 113925993 113930116 113938858

MLX:	117998937 118003798 118004334 118008361 118009041 118010983 118012793 118017252 118020514 118021452

NSU:	123324275 123324537 123324597 123325072 123325073 123325475 123325970 123326150 123326352 123326454

LWW:	115938425 115938578 115938685 115939633 115939832 115940273 115940592 115943290 115945040

FCA:	111556883 111557079 111558894 111558895 111559997 111560381 111561262 111561263 111561619 111561620 111561993 111561994

PYU:	121014526 121016496 121017147 121024015 121024817 121027946 121032543 121032544 121040600 121041162 121041163

PCOO:

112848989 112848990 112852224 112856759 112856760 112859226 112861932 112863989 112863990 112869770 112871391

PBG:	122467456 122469644 122469924 122474079 122474080 122478170 122478172 122479320 122482185 122482186 122484629 122496962

PVIV:

125147335 125147704 125158063 125158064 125163191 125165116 125169375 125169376 125171348 125171349 125174107 125174108

LRUF:

124502849 124504508 124506618 124509053 124509055 124509739 124509740 124516659 124516660 124521502 124523808

LGF:	123581812 123582377 123584757 123584758 123592236 123592237 123595590 123595591 123596665 123600074 123600075 123602863

AJU:	113594940 113595549 113597509 113598406 113599712 113600992 113601706 113601707 113602939 113602940 113603312

PUC:	125910660 125910661 125912040 125913865 125917927 125920459 125920600 125924201 125932499 125935925 125937213

PLEZ:

122201580 122203199 122210380 122216782 122218882 122223508 122223509 122225786 122225787 122228872 122228873

HHV:	120219978 120221162 120227650 120233950 120234843 120235380 120240519 120243170

BTA:	112443682 112446886

BOM:	138985045 138988069

BBUB:

112583141 112584851

OAS:	114113458 114114287

BTAX:

128044095 128049060

CSUM:

138077343 138079453

ODA:	120855216 120858994

CCAD:

122424143 122424729 122454103

MREE:

136150496 136156556 136156557 136165553 136170185 136172819 136173804

OVR:	139030726 139037609 139038121

MBEZ:

CFR:

CDK:

VPC:

BMUS:

118898615 118902907 118905541

OOR:	117195449 117196500 117199407

LALB:

132522523 132530160 132530986

GMF:	115851110 115853106 115867026

DDP:	132428824 132434697 132437439

DLE:	115802057 115802162 115802374

PCAD:

112062102 112064569 112065946 112066717

PSIU:

116757236 116761466 116763809

PPHC:

136126186 136131709 136132359

NASI:

112393648 112394739 112406902

ECB:

111771155

EPZ:

139080406

EAI:

123283678

MMYO:

118652173 118657264 118659549 118677762

MLF:	111823446 111825044 111825640 111826677

MDT:	132228834 132231978 132234040 132237876

MYUM:

138997474 139004801 139007708 139009708 139013419

PKL:	118702452 118704064 118706270 118712082

EFUS:

114227753 114229225 114230219 114231215

DRO:	112296604 112308103 112322090 112323060

SHON:

AJM:

PDIC:

PHAS:

MMF:	118621012 118621016 118622183 118624927 118624928

PPAM:

129077365 129077986 129078939

RFQ:	117012574 117029495

PALE:

112470415 112484246

PGIG:

120587899 120603035

PVP:	111739851 111745029

RAY:	118614426 118614427

MJV:

118970379

TOD:	119233229 119246870 119248537

SFUM:

130026228 130030928 130038012 130044937

LAV:	111747608 111750399

TMU:	111821194 111822782

ETF:	115868615 115871986 115873048 115873205 115873567

DNM:	111760832 111762648

GAS:	123232603 123250839

SHR:	111718570 111721240

AFZ:	127539533 127552724

TVP:

118852508

PBRV:

138156752

MLAO:

141515808 141515809

OAA:	114812392 114816855

TACU:

119920370 119929086 119937322

GGA:

112531612

PCOC:

116233529

MGP:

116216219

CJO:	116652796 116652797

TPAI:

LMUT:

APLA:

ACYG:

CATA:

AFUL:

TGU:

LSR:

SCAN:

PMOA:

OTC:

PRUF:

ATRC:

OMA:

PMAJ:

CCW:

ACOE:

ETL:

ZAB:

ZLE:

MMEA:

HRT:

SATI:

CCIC:

FCH:

SHAB:

ACUN:

TALA:

ACHC:

AGEN:

HHAR:

GCL:

PPUS:

EGZ:

CBOY:

CNIC:

CUCA:

ACAR:

RTD:

CRID:

LMIC:

AROW:

NPD:

DNE:

ASN:

PSS:	112545365 112545366 112545367 112546203 112547506

CMY:

DCC:

CPIC:

TST:

CABI:

MRV:

ASAO:

SUND:

PBI:

PMUR:

CTIG:

PGUT:

PCAE:

APRI:

PTEX:

NSS:

VKO:

PMUA:

114585752 114595073 114606068

PRAF:

ZVI:

HCG:

STOW:

EMC:

XLA:	121393470 121403487 121403488 121403489 121403491 121403492 121403493 121403494

XTR:	116410574 116410585 116410596 116410607 116410618 116410629 116410695 116410706

RTEM:

120916619 120916620 120916621 120916622 120916623 120916624 120916625 120916626

ACAT:

141106974 141111533 141111535 141111536 141111537 141111538 141111539 141130896

BBUF:

120979970 120979971 120979972 120979973 120979974 120979975 120979976 120979977 120979978 120979979

BGAR:

122944317 122944319 122944320 122944321 122944322 122944323

DTC:	141048900 141048901 141048902 141048903 141048911 141048922 141048933 141048934 141098735 141098736

PWL:	138262552 138294449 138294451 138294452 138294453

MUO:

115460794

GSH:	117356102 117360165

DRE:

137490790

CCAR:

122136923 122136924 122139131 122143710

CAUA:

113056009 113056014 113067899 113067900 113067901 113067902 113067903 113067904 113067905

CGIB:

127953956 127953957 127966303

PTET:

122342198

LROH:

127163613

GRF:	141347350 141347357

OMC:	131538174 131538175

PPRM:

120468331 120468335 120468336

RKG:	130106020 130106021

MAMB:

125250618

CIDE:

127510316 127510318

CERY:

137018230

MASI:

127452384 127452385 127452386 127452387

TROS:

130562313 130562314

TDW:	130427011 130427012 130427013 130427014

MANU:

129436995

PDAB:

135769213

IPU:	124627744 124628777 124628778

IFU:	128606189 128616378 128616379

PHYP:

113536357

SMEO:

124382300 124382312 124382313 124382314

TFD:	113661816 113661817

TVC:	132843706 132843707 132843708

CGAR:

128516233 128516234

NGRA:

132871061

TRN:	134309334 134309345 134309356 134309368

AMEX:

125799525 125799526 125799535 125799546 125799551 125799552

CMAO:

118806253 118806254

EEE:

113586151

CHAR:

116222721 116225106 116225107

SPIL:

ASAD:

TRU:

TFS:

LCO:	113744786 113747192 113747197

TBEN:

CGOB:

PGEO:

GACU:

EMAC:

ELY:

EFO:

PLEP:

SLUC:

ECRA:

ESP:

PFLV:

GAT:

PPUG:

AFB:

CLUM:

PSWI:

CANA:

CVE:

MSAM:

SCHU:

CUD:

SPUL:

LMIX:

ALAT:

ASTR:

MZE:

ONL:

OAU:

OLA:

OML:

CSAI:

XMA:

XCO:

XHE:

GAF:

PPRL:

CTUL:

GMU:	124863614 124865074

KMR:

NWH:

AOCE:

EJA:

BFRE:

MCEP:

SSEN:

SSOE:

HHIP:

117767061 117767073 117767084 117767091

HSP:	118124102 118124114 118124126

PPLT:

128459332 128459344 128459349 128459350

SMAU:

LCF:

SLAL:

XGL:

SSCV:

SBIA:

PEE:

PTAO:

ENY:	140358846 140358847

BSPL:

114861215 114861216

SJO:

128379646

SSCO:

134000321

GMH:	115539423 115539434

STRU:

115147744 115172005

OTW:	112226354 112259516 121847340

OMY:	118937981 118938563

OGO:	124000935 124016548

ONE:	115110945 115110950

OKI:	116374538 116376046

OKE:	118377006 118377007

OMM:	135554915 135556984

OCLA:

139365404 139423269

SALP:

111982174 112081366

SNH:	120034628 120045283

SFON:

CCLU:

ELS:

OEP:

SFM:

PKI:

AANG:

AROT:

CCOG:

PSPA:

121309326 121329415 121329416 121329417 121329418

ARUT:

117412707 117426003 117430985 117432483 117433113 117968051

PSEX:

CMK:

RTP:

CPLA:

HOC:

LERI:

HAKA:

PMRN:

LRJ:

BFO:

CIN:

SCLV:

120343592 120345243 120348210

SPU:	115919388 115928359 115928361

LPIC:

129259770 129259772 129259773 129266075 129268922

AJJ:

ARUN:

AAMU:

AFIL:

AJC:

PFLL:

DME:	Dmel_CR32162(snRNA:U12)

DER:

6544213

DSE:

6605992

DYA:	Dyak_GE27252(Dyak_snRNA:U12:1)

DAN:

DPO:

DPE:

DMN:

DWI:

DGR:

DMO:	Dmoj_GI25452(Dmoj_snRNA:U12:1)

DNV:

DHE:

DVI:

CCAT:

BOD:

BDR:

AOQ:

ALUD:

TDA:

MDE:

LCQ:

LSQ:

CVJ:	135949628 135956101

GFS:	119643607 119643608

ECOE:

CLON:

HIS:

AGA:

ACOZ:

AARA:

AMER:

ASTE:

AMAP:

AFUN:

AMOU:

AMRS:

AALI:

ACOS:

AALB:

115258386 115269584 115269585

ASUA:

134208429 134208430

CPII:

120427983

CNS:	116338350 116342696

BCOO:

LLL:

PPAP:

AME:

ACER:

ALAB:

ADR:

AFLR:

BIM:

BBIF:

BVK:

BVAN:

BHUN:

BTER:

BAFF:

BPYO:

BPAS:

FVI:

CCAL:

OBB:

OLG:

MGEN:

NMEA:

CGIG:

SOC:

MPHA:

COBS:

TLN:

HST:

CFO:

FEX:

PMEC:

OBO:

PFUC:

VPS:

VCRB:

VVE:

NVI:	116416426 116416427

TPRE:

111694262

LHT:	122500948 122508746

LBD:	127277407 127289131

CGLO:

CTYP:

DAM:

AGIF:

CINS:

VCAN:

CCIN:

DSM:

NPT:

NFB:

NLO:

NVG:

AROA:

TMOL:

DPA:

ESIM:

EFOR:

SOY:	115877422 115888093

AGRG:

ATD:

CSET:

HAXR:

AGB:

LDC:	111502392 111513650

DVV:	114328779 114339957

DCOR:

APLN:

PPYR:

OTU:

BMOR:

BMAN:

MSEX:

BANY:

MJU:

NIQ:

VCD:

MCIX:

BPHI:

PRAP:

PBX:	123712661 123714756

PNAP:

ZCE:

CCRC:

LSIN:

AAGE:

HAW:

HZE:

TNL:

OFU:

ONU:

ATRA:

GMW:

PXY:

PGW:

LGLY:

CSTB:

CFUM:

CFEL:

CCRN:

API:

AGS:

RMD:

ACOO:

DVT:

DCI:	113465700 113465701

CLEC:

112126658 112127841

HHAL:

112210638 112210958 112211243

NLU:

120352889

HVI:

124353274

MQU:	128988229 128993663

FOC:

TPAL:

CSEC:

PAME:

SGRE:

BROR:

IEL:

HAMR:

DMK:	116936685 123469527

DPZ:

AFRA:

PVM:

PJA:

PCHN:

HAME:

PCLA:

CQD:

PTRU:

ESN:

MNZ:

MRJ:

PORN:

HAZT:

PPOI:

ISC:

DSV:

RSAN:

RMP:	119173028 119173030

CSCU:

111616349

CVS:

136983898

PTEP:

122271971 122273155

ABRU:

129957802 129957803 129969947 129969948 129969949

UDV:	129228783 129230767

SDM:

118205948

PVUL:

126813699 126813700

PCAN:

112567385 112567386

LSAX:

138963355 138963356 138963358

GAE:

121386979

HRF:	124151730 124151731

HRJ:	124283614 124283615 124283616

HASI:

137266480 137266481 137266482 137266483 137266484 137266485 137266486 137266488 137266489

HCRA:

CRG:

CANU:

OED:

PMAX:

AIRR:

MCAF:

127699272 127726821 127736267

MMER:

123553625 123553626

RPHI:

132755493 132758126

DPOL:

127851977 127851978

MAEA:

128236322 128239495 128239496

OBI:

128248619

OSN:	115215329 115218162 115227768

LJP:	135462232 135462233 135479901

LAK:

112041551

SMM:	Smp_sma.U12.1.1

LLON:

135497438 135500034 135500035

NVE:	116604839 116604840 116612491

EPA:	114574548 114574549 114576315

ATEN:

116297863

AMIL:

114971376 122961982 122961983 122961984

MCAZ:

138031058 138031059

MFOO:

137984143 137984144

PDAM:

113686350

DGT:	114531997 114531998 114531999 114543405 114543406

XEN:	124447591 124447592

HMG:

124809296

HSY:	130618784 130622786 130622788 130622789 130649661

RES:

135686951

ATH:	AT1G61275(U12)

CRB:	111831280 111831291 111832261

BRP:	117133833 117134469

BNA:	125586499 125586501 125586502 125608475 125609764

RSZ:	108809417 130512049

CIT:

PVY:

MINC:

GRA:

GHI:	121208854 121222972 121230974

GAB:	128283052 128294390

HSYR:

120172797 120174732 120213454

EGR:

120289270

RARG:

115726556

GMX:	113000273 113001052

GSJ:	114397803 114404704

PVU:

137827325

VAR:	128195101 128195703 128196045 128196423

VUN:	114186396 114186397

VUM:	124819732 124846752

CCAJ:

114916777

APRC:

113864079

MTR:	112416897 112421445

TPRA:

123893402 123893403 123919143

CAM:	113785157 113785158 113785900 113785901

PSAT:

127109751 127132882

VVO:	131608300 131615266 131634566

LJA:

130734974

ADU:

127747132

AHF:	112746598 112799385

PCIN:

AANS:

RCN:

PDUL:

MDM:	114826200 114826826

MSYL:

PCOX:

ZJU:

MNT:

CSAV:

CSV:

CMO:

BHJ:

CMAX:

CMOS:

CPEP:

RCU:

MEAN:

126662376 126670875 126670876 126670877

JCU:

MESC:

POP:

PALZ:

PNZ:

JRE:	118344407 118349131

CILL:

122293863

CAVE:

132168266 132180129 132188920

AGLU:

133858969 133865070

QSU:

112035730

QLO:

115958760

TWL:	119981559 120006731 120006732

VVI:	132254144 132254999

VRI:	117919491 117929413

SLY:

SPEN:

SSTN:

SDUL:

CANN:

LBB:	132604672 132642946

NSY:

138869909

NTO:

117273655

ITR:

116014535

SSPL:

121753440 121797568 121801662 121801674

SMIL:

131002056 131002067

SHIS:

125208700 125208709 125208710

APAN:

HPUM:

PHUA:

PEBU:

HAN:	118482462 118491783

ECAD:

LSV:

CCAV:

DCR:

CSIN:

114275065 114275066 114275067

RVL:	131302195 131302196 131305736 131305737 131308991 131321543

AEW:	130764829 130764830 130775728

DLT:

127800925

SOE:	130462184 130466370 130468190

ATRI:

SLAF:

MOF:

MING:

TSS:

PSOM:

113314478 113329288 113340688 113343052

OBR:

121053678

OGL:

127764870

BDI:

112272142

ATS:	120965512 120967508

TDC:	119296623 119304452 119313151 119326896

TAES:

123095228 123109115 123117969 123126799 123146478

TUA:

125511942

LPER:

127311100

LRD:	124693993 124693994

ZMA:

111591490

MFLO:

136468326 136478931 136478932

SVS:

PVIR:

PHAI:

PAUA:

TANG:

PDA:

EGU:

MUS:	135606352 135611462

ZOF:	122013089 122018196 122030750

DCT:

MSIN:

ACAK:

NCOL:

CJF:	131063479 131070332

PPP:

112278189

» show all

Reference

PMID:33577674

Authors

Norppa AJ, Frilander MJ

Title

The integrity of the U12 snRNA 3' stem-loop is necessary for its overall stability.

Journal

Nucleic Acids Res 49:2835-2847 (2021)
DOI:10.1093/nar/gkab048

Sequence

[hsa:267010]

LinkDB

DBGET integrated database retrieval system