KEGG   ORTHOLOGY: K28496
Entry
K28496            RNA       KO                                     
Symbol
SNOR35
Name
small nucleolar RNA SNOR35
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K28496  SNOR35; small nucleolar RNA SNOR35
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K28496  SNOR35; small nucleolar RNA SNOR35
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Related small nucleolar RNAs
  Box C/D snoRNAs
   SnoRNAs act as guides for 2'-O-ribose methylation
    K28496  SNOR35; small nucleolar RNA SNOR35
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Small nucleolar RNA
  K28496  SNOR35; small nucleolar RNA SNOR35
Genes
ATH: AT1G07702
CRB: 111828771 111829102
BRP: 117126342 117129465 117132302 117133246
BNA: 125576009 125579689 125579691 125582838 125584949 125588209 125589643 125593759 125607329
RSZ: 130497877 130497878 130499304 130501846 130502325 130508897 130510305
CIT: 112499434
PVY: 116109105 116109106 116109107 116109108 116109111 116109112
MINC: 123209860 123226619
GRA: 128032322 128036473
GHI: 121205482 121213011 121220667 121220668 121226059
GAB: 128279885 128287286
HSYR: 120123120 120127185 120132797 120142268 120148240 120159325 120159634 120160070 120162575 120166164 120174989 120199338 120209464
EGR: 120289256
RARG: 115736828
GMX: 112998619 112998960 112999665 113000984
GSJ: 114377745 114377746 114380623 114388802
PVU: 137811822 137817344
VAR: 128194875 128196881
VUN: 114170961 114186377
VUM: 124830833 124843735
CCAJ: 114915935 114916417
APRC: 113856734 113860459
MTR: 112419634 112421533
TPRA: 123882574 123900217 123900218
CAM: 113785227
PSAT: 127089984 127089985 127099501 127099502 127109615 127124754
VVO: 131608500 131621460 131626564 131654489
LJA: 130709686 130741660
ADU: 127745971
AHF: 112739700 112793588
PCIN: 129314707 129316930
AANS: 126789652
RCN: 112168559
PDUL: 117633304
MDM: 114819894 114824285
MSYL: 126591683 126617540
PCOX: 137716663 137743967
ZJU: 125421206
MNT: 112092655
CSAV: 115721601
CSV: 116402270 116404854
CMO: 127144081 127144134
BHJ: 120078865 120089579 120089580 120089581
CMAX: 111484634 111500031 111500032
CMOS: 111449149 111451894 111451896
CPEP: 111777938 111796298 111796299
RCU: 112536534
MEAN: 126666415
JCU: 119371406
MESC: 122723601 122725230
POP: 112324833
PALZ: 118046132
PNZ: 133672233
JRE: 118344596 118348563
CILL: 122293081 122295274
CAVE: 132164838
AGLU: 133878733
QSU: 112025787
QLO: 115956268
CSAA: 142608505
TWL: 119992366 120003186
VVI: 132253389 132253994
VRI: 117908258 117917184 117917185
SLY: 112940410 112941736
SPEN: 114074986 114077695
SSTN: 125846183 125875306
SDUL: 129901782 129904854
CANN: 124889176 124899923
LBB: 132601040 132619437
NSY: 138872290 138882499
NTO: 117276248 117278053
ITR: 116003222 116005389
SSPL: 121742767 121746268 121797511 121801676
SMIL: 131002072 131007425
SHIS: 125191454 125197652
APAN: 127239507 127240769
HPUM: 140893685
PHUA: 140956431 140991262
PEBU: 140804130 140840364
PTAB: 142530270 142538180
HAN: 118479434 118479435 118491051
ECAD: 122594692 122602461 122609601
LSV: 111881167 111899592 111901256
CCAV: 112499735 112508330 112518785
DCR: 135151001
CSIN: 114258733 114266837 114268503 114271932 114280071 114288579
RVL: 131318296
AEW: 130763221 130768020 130771166 130792417
DLT: 127791281 127792738 127793282 127793646 127796131 127796134 127798586 127802923 127802925 127802926 127809012 127809013 127810715 127813824
SOE: 130471218
SLAF: 141645284
MOF: 131150057 131167184
MING: 122058497 122080496 122082962 122087786
TSS: 122649277 122649278 122653325 122666440
PSOM: 113276925 113307351 113314659 113325632
OBR: 121053670 121054063 121054594
OGL: 127764857 127769116 127775226
BDI: 112269547 112271213
ATS: 120965753 120967681 120973088
TDC: 119266341 119297051 119304717 119313459 119319848 119327137 119351111 119351112 119359988
TAES: 123038530 123047893 123047894 123073353 123109379 123109380 123118286 123126453 123132856 123140446 123146655 123152304 123152314 123183898
TUA: 125529027 125531312 125533382 125533383
HVG: 123400607 123406671 123424024 123424025
LPER: 127328005 127346318 127346320
LRD: 124650779 124658585 124658587 124668884 124680584 124685549 124685550
ZMA: 111591237
MFLO: 136478905 136506334 136514669 136519299 136535018
SVS: 117841799 117851087
PVIR: 120657893 120658344 120668286 120701682
PHAI: 112879152 112888208
PAUA: 133885979 133920219 133923294 133929944
TANG: 140761812 140766364
PDA: 113462422 113462855 113462894
EGU: 114914285 114914286 114914815 140858326
MUS: 135616031 135624092
ZOF: 121968969 121978999 121979000 121983659 121983661 121988240 121988241 121988242 121995126 121999005 122003315 122007646 122013210 122018341 122022166 122022167 122022168 122025993 122025994 122025995 122028432 122030739 122035632 122035633 122035634 122036224 122039383 122039385 122039386 122039388 122050020 122054533
DCT: 114578620
MSIN: 131238449 131238450 131252450 131252451
ACAK: 137937895
NCOL: 116256943
CJF: 131031416
 » show all
Reference
PMID:33784398
  Authors
Wu S, Wang Y, Wang J, Li X, Li J, Ye K
  Title
Profiling of RNA ribose methylation in Arabidopsis thaliana.
  Journal
Nucleic Acids Res 49:4104-4119 (2021)
DOI:10.1093/nar/gkab196
  Sequence
[ath:AT1G07702]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system