KEGG   ORTHOLOGY: K28498
Entry
K28498            RNA       KO                                     
Symbol
SNOR115
Name
small nucleolar RNA SNOR115
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K28498  SNOR115; small nucleolar RNA SNOR115
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K28498  SNOR115; small nucleolar RNA SNOR115
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Related small nucleolar RNAs
  Box C/D snoRNAs
   SnoRNAs act as guides for 2'-O-ribose methylation
    K28498  SNOR115; small nucleolar RNA SNOR115
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Small nucleolar RNA
  K28498  SNOR115; small nucleolar RNA SNOR115
Genes
ATH: AT1G05433 AT1G09467
CRB: 111828830 111832245
BRP: 117126328 117127006 117127007 117127577 117128746 117132283
BNA: 125575993 125576801 125576802 125577483 125582819 125589486 125589487 125589615 125592202
RSZ: 130497854 130498216 130499287 130508873
CIT: 112498439
PVY: 116131025 116131026 116133588 116133589 116133591 116133593
MINC: 123204976 123204978 123212628
GRA: 128034380 128034381 128035783
GHI: 121208812 121208813 121211602 121222930 121222931 121224856
GAB: 128282888 128282889 128285879
HSYR: 120122294 120162816 120199128 120209658
EGR: 120290981
RARG: 115746253
GMX: 113000013 113001747
GSJ: 114394304 114413885
PVU: 137808895
VAR: 128194570 128194571 128195081
VUN: 114180065
VUM: 124827148
CCAJ: 114916588
APRC: 113848675
MTR: 112416853 112421508
TPRA: 123887826 123887827
CAM: 113787840 113787841
PSAT: 127077607 127089960
VVO: 131593842 131640743 131645484
LJA: 130716399 130741652
AHF: 112725744
AANS: 126796568
RCN: 112181038
PDUL: 117629439
MDM: 114821262 114825706
MSYL: 126601039 126627576
PCOX: 137711788 137714043
ZJU: 112491893
MNT: 112091605
CSAV: 115711825
CSV: 116404839
CMO: 127150789
BHJ: 120074819 120078854
CMAX: 111478909
CMOS: 111433354
CPEP: 111804589
RCU: 112534056 112534057
MEAN: 126676037
JCU: 119371400
MESC: 122721840 122723927
POP: 112325112 112328063
PALZ: 118032681 118052145
PNZ: 133674967 133690401
JRE: 118349521
CILL: 122283607 122290627 122290628
CAVE: 132176790 132191167
AGLU: 133865123 133869995 133869996 133876605
QSU: 112006317
QLO: 115966173
CSAA: 142633197
TWL: 119980174 119981595
VVI: 132253030
VRI: 117905286 117934337
SLY: 112941228 112941727
SPEN: 114076625 114077687
SSTN: 125861045 125875299
SDUL: 129898085 129901773
CANN: 124897481 124899917
LBB: 132604825 132619366 132634536 132634537 132639005
NSY: 138872270 138888849
NTO: 117273867 117275450 117281869
ITR: 115997694 115997695 116003217 116011504
SSPL: 121749942 121788139 121791232
SMIL: 131024003
SHIS: 125202898 125217214
APAN: 127241602
HPUM: 140885566
PHUA: 140974676 140974677
PEBU: 140811023 140815383 140815389
PTAB: 142521642 142521646 142554906
HAN: 118489608 118490050
ECAD: 122609595 122609596
LSV: 111877772 111916815
CCAV: 112501375 112511911 112511912
DCR: 135147451 135147453
CSIN: 114258529
AEW: 130756030 130763210 130763211
DLT: 127793280
SOE: 130462291
ATRI: 130800571 130823002
SLAF: 141654097
MOF: 131147044
MING: 122077630 122077631 122086917 122086926
TSS: 122657154 122657155
PSOM: 113276870 113284982 113300851 113314634 113314635 113319837 113339143 113345095
OBR: 121054833 121055414
OGL: 127778190 127785523
BDI: 112269064 112269065
ATS: 120963684 120965716
TDC: 119296554 119304649 119304650 119304651 119313399
TAES: 123095348 123100912 123109307 123109308 123109309 123118212 123126410
TUA: 125511858 125511859
HVG: 123400580 123451603
LPER: 127304940
LRD: 124658554 124658555
ZMA: 111589844
MFLO: 136484612 136484613 136484615 136484616 136484617 136490488 136506319 136525035 136541080 136547782 136553124 136553125
SVS: 117846663
PVIR: 120663185 120696369
PHAI: 112883693
PAUA: 133898025 133902614 133925683
TANG: 140775225 140779991
PDA: 113462623 113463341
EGU: 114914714 114914759 114914760 114914849 114914850
MUS: 135613289 135628041
ZOF: 121995018 122039366
MSIN: 131217978 131217979 131222197 131222198 131223572 131223580 131223583 131230141 131234217 131235927 131241898 131244947 131244948 131250449 131250450 131250451 131250453 131257262 131257263
ACAK: 137942269
NCOL: 116249368
 » show all
Reference
PMID:19357091
  Authors
Chen HM, Wu SH
  Title
Mining small RNA sequencing data: a new approach to identify small nucleolar RNAs in Arabidopsis.
  Journal
Nucleic Acids Res 37:e69 (2009)
DOI:10.1093/nar/gkp225
  Sequence
[ath:AT1G09467 AT1G05433]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system