KEGG   ORTHOLOGY: K28499
Entry
K28499            RNA       KO                                     
Symbol
SNOR120
Name
small nucleolar RNA SNOR120
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K28499  SNOR120; small nucleolar RNA SNOR120
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K28499  SNOR120; small nucleolar RNA SNOR120
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Related small nucleolar RNAs
  Box C/D snoRNAs
   SnoRNAs act as guides for 2'-O-ribose methylation
    K28499  SNOR120; small nucleolar RNA SNOR120
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Small nucleolar RNA
  K28499  SNOR120; small nucleolar RNA SNOR120
Genes
ATH: AT1G19373 AT1G75163 AT5G01165
CRB: 111828825 111830262 111832243
BRP: 117126996 117128734 117129477 117132278 117133262 117133263
BNA: 125576793 125578804 125579706 125582815 125584973 125584974 125589476 125589477 125592192 125593780 125607344 125607345
RSZ: 130497274 130498210 130498211 130498241 130502212 130510320 130510321
CIT: 112497766
PVY: 116109918 116109919 116119463 116119464 116119465
MINC: 123230233 123230235
GRA: 128034376 128040289 128040290 128042199 128042200
GHI: 121215203 121215204 121218974 121218975 121225454 121225457 121231294 121231296
GAB: 128282884 128290899 128290900 128294590 128294591
HSYR: 120191342 120191347 120204437 120218660 120218667
EGR: 120295203
RARG: 115751663
GMX: 112999437 113001303 113002009
GSJ: 114385556 114407928 114417537
PVU: 137816746 137816812
VAR: 128193419 128195697
VUN: 114165670 114195730
VUM: 124833463 124844445
CCAJ: 114915887 114916939 114916940 114916941 114916942 114916943
APRC: 113848668 113864085
MTR: 112416848 112418790 112418791 112418792 112418793
TPRA: 123893327 123903395
CAM: 113785940 113785941 113786414 113786415 113786416 113786801
PSAT: 127099467 127099468 127134236 127134238
VVO: 131600899 131600901 131600902 131622941 131637227
LJA: 130716393 130721671 130734904 130734905
ADU: 127739973 127739974
AHF: 112700624 112700625 112762049
PCIN: 129297594 129307499 129319127
AANS: 126785569 126785570
RCN: 112174898 112174899
PDUL: 117616898 117616899
MDM: 114821883 114821884 114826701 139198493
MSYL: 126606099 126606100 126633644 126633645
PCOX: 137718908 137720336 137720343
ZJU: 112492142 112492143
MNT: 112093483
CSAV: 115703407 115703408 115724334
CSV: 116403020 116403021
CMO: 127149142 127149143
BHJ: 120092272 120092273
CMAX: 111477340 111477342 111481328 111481329
CMOS: 111443722 111443732 111446817 111446818 111446819
CPEP: 111789448 111789449 111797778 111797779
RCU: 112535401 112535404
MEAN: 126666382 126666383
JCU: 119371477 119371478
MESC: 122721418 122721420 122723595 122723596
POP: 112324205 112324206
PALZ: 118045241 118045242 118049448
PNZ: 133684385 133684386
JRE: 118348842 118348843 118348844
CILL: 122298031 122298032 122298033 122298034
CAVE: 132185977 132185978
AGLU: 133862125 133862126 133865106 133867533 133867534 133867535 133867536 133872110 133872111
QSU: 112038348
QLO: 115978438
CSAA: 142622952
TWL: 120010006 120011631
VVI: 132253303 132253304
VRI: 117908009 117908010
SLY: 112941413 112941415 112942245
SPEN: 114074119 114077041 114077042
SSTN: 125854021 125857333 125857334
SDUL: 129904842 129904843 129904844
CANN: 124898337 124898338
LBB: 132620675 132620676 132625638 132629647
NSY: 138882485 138890979
NTO: 117274104 117279284
ITR: 116002472 116023851 116023852 116023853
SSPL: 121763158 121763159 121766234 121766235 121793218 121801732
SMIL: 131013739 131013740
SHIS: 125185764 125202885 125202886 125202888
APAN: 127257562 127257563 127265371
HPUM: 140885987 140885988 140885990 140885991
PHUA: 140966167 140968834
PEBU: 140811021 140837581
PTAB: 142521631 142523571 142554904
HAN: 118482534 118482535 118487061 118488742 118490047 118490048 118490049
ECAD: 122590349 122590351
LSV: 111890317 111890318 111890319 111890325
CCAV: 112510625 112510626 112511910
DCR: 135151833 135151834
CSIN: 114304693 114304694 114305665 114307887 114307890 114307891 114307892
RVL: 131335005 131335006
AEW: 130781894 130787166 130787167 130788742
DLT: 127809067 127809068
SOE: 130466653 130471179
ATRI: 130799054 130804924
SLAF: 141593408 141593409 141598048 141609911 141609912 141654092 141654093
MOF: 131163231 131163232
MING: 122070800 122085285 122085286
TSS: 122660672 122660673 122663458
PSOM: 113292244 113319826 113330280 113342038
OBR: 121054039 121054040
OGL: 127769179 127769181
BDI: 112270258 112270260
ATS: 120963654 120963655 120967616 120967617 120970099 120975096
TDC: 119290293 119290294 119296508 119304574 119313321 119313324 119319783 119319787 119327038
TAES: 123056305 123088910 123088911 123095308 123100881 123109230 123118132 123132789 123132793 123146585 123171703
TUA: 125511790 125517749 125517752 125549664 125555105 125555106
HVG: 123406590 123451560
LPER: 127297749 127297750 127297751
LRD: 124704921 124704922 124704923 124704924 124704925 124704926 124704927 124704928 124704929
ZMA: 111590185 111590186
MFLO: 136512158 136512164 136541042 136541045
SVS: 117841245 117841247 117841248
PVIR: 120653054 120653056 120693650 120693651 120693652
PHAI: 112878430 112878431
PAUA: 133913887 133917227 133917228
TANG: 140775218 140775219
PDA: 113461037 113461038 113461087 113461088 113463229 113463230 120111249 120111251 120111252 120111253
EGU: 114913776 114913777 140853544 140853545
MUS: 135599589 135599590 135621356 135621358
ZOF: 121974076 121978980 121994978 122039359 122044781 122049999
DCT: 114579972
MSIN: 131223541 131230136 131230138 131230139 131230140
ACAK: 137952424 137952425 137954061
NCOL: 116255335 116263464
CJF: 131040415
 » show all
Reference
PMID:19357091
  Authors
Chen HM, Wu SH
  Title
Mining small RNA sequencing data: a new approach to identify small nucleolar RNAs in Arabidopsis.
  Journal
Nucleic Acids Res 37:e69 (2009)
DOI:10.1093/nar/gkp225
  Sequence
[ath:AT5G01165]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system