KEGG   ORTHOLOGY: K28500
Entry
K28500            RNA       KO                                     
Symbol
SNOR123
Name
small nucleolar RNA SNOR123
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K28500  SNOR123; small nucleolar RNA SNOR123
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K28500  SNOR123; small nucleolar RNA SNOR123
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Related small nucleolar RNAs
  Box C/D snoRNAs
   SnoRNAs act as guides for 2'-O-ribose methylation
    K28500  SNOR123; small nucleolar RNA SNOR123
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Small nucleolar RNA
  K28500  SNOR123; small nucleolar RNA SNOR123
Genes
TAES: 123140421
ATH: AT4G08615 AT4G08625
CRB: 111829770 111829771
BRP: 117127578 117127579 117127580 117127581 117127582 117129156 117129157
BNA: 125577484 125577485 125579375 125579377 125581186 125581187 125584918 125584919
RSZ: 130499288 130499289 130500876 130500877 130508878 130508879
CIT: 112498014
PVY: 116118376 116118377 116118381
MINC: 123196159
GRA: 128033361 128033383 128036457 128036458
GHI: 121207110 121207121 121212998 121212999 121214349 121214351 121226042 121226043
GAB: 128281746 128281748 128287273
HSYR: 120123699 120141671 120162580 120198667 120200581 120202450 120209618
RARG: 115740210
GMX: 113000286
GSJ: 114397807
VUN: 114167998 114167999 114189319
CCAJ: 114916327
APRC: 113856727
MTR: 112420555
TPRA: 123919220
CAM: 113786816
PSAT: 127089965
VVO: 131633531
LJA: 130727122
PCIN: 129319131
ZJU: 112489979 112490187 112490188
MNT: 112090779
CSAV: 115703421 133033326
HLP: 133787804
CSV: 116403027 116403584
CMO: 127150114
BHJ: 120092276
CMAX: 111483520
CMOS: 111438497
CPEP: 111783846
RCU: 112535468 112536809 112536810
JCU: 119371320 119371321
MESC: 122723396 122723397 122723398 122723400 122723401
POP: 112326348 112326349 112326350 112326351 112326352
PALZ: 118027507 118027512 118027513 118027901 118027909 118027914 118040976 118040977
PNZ: 133681254 133681255 133681256 133681257 133681258
JRE: 118344321 118344639 118347837 118348558 118348560 118349522 118349523
CILL: 122290629 122290630 122300003 122312133 122314597
CAVE: 132176791 132176792
AGLU: 133853104 133867543 133872125 133876606 133876607 133876608 133880792
QSU: 111996599 111996600 111996601
QLO: 115958693 115958694 115958695
CSAA: 142641808 142641809 142641810
TWL: 119986367 119986368
VVI: 132253496
VRI: 117909696
SLY: 112940224 112940225 112940227 112940228
SPEN: 114074507 114074508 114074572 114074573
SSTN: 125866419 125866420 125866484 125866485 125866486
SDUL: 129877992 129877993 129877995 129877997 129877998
SVER: 125821346 125821347 125821348 125821349 125821350
CANN: 124888350 124888351 124888352 124888353 124888354
LBB: 132619371 132619374 132619380 132619385 132619391
NTA: 142165308 142165312 142165314 142167742 142167743 142167744
NSY: 138876686 138876687 138876688
NTO: 117278202 117278203 117278204
ITR: 116003218 116003219 116003220 116011506 116011507 116021338
SSPL: 121749945 121810096
SMIL: 130987255 130987256 130996369
SHIS: 125191435
APAN: 127248172 127248173
HPUM: 140870239 140870240
PHUA: 140985461 140989097
PEBU: 140813407 140815803
PTAB: 142519993 142528177
CARB: 113691178 140007127
HAN: 118487896
BHW: 143595381
ECAD: 122590356 122590357
CCAV: 112510630
DCR: 135151855 135151856
AGRV: 141722792 141722793
CSIN: 114321955 114321960
RVL: 131312246 131324893
AEW: 130756032 130773370 130790349
DLT: 127812354 127812355
CFLO: 132310928 132310929
SOE: 130460507
ATRI: 130819619
MOF: 131147434 131147436 131147437 131147438 131147439
MING: 122080481
PSOM: 113285002 113319849 113331640 113335090 113336587 113342174 113362502
MSIN: 131247741
ACAK: 137964389 137965422
 » show all
Reference
PMID:19357091
  Authors
Chen HM, Wu SH
  Title
Mining small RNA sequencing data: a new approach to identify small nucleolar RNAs in Arabidopsis.
  Journal
Nucleic Acids Res 37:e69 (2009)
DOI:10.1093/nar/gkp225
  Sequence
[ath:AT4G08615 AT4G08625]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system