KEGG   ORTHOLOGY: K28502
Entry
K28502            RNA       KO                                     
Symbol
SNOR74
Name
small nucleolar RNA SNOR74
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K28502  SNOR74; small nucleolar RNA SNOR74
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K28502  SNOR74; small nucleolar RNA SNOR74
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Related small nucleolar RNAs
  Box H/ACA snoRNAs
   SnoRNAs act as guides for pseudouridynation
    K28502  SNOR74; small nucleolar RNA SNOR74
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Small nucleolar RNA
  K28502  SNOR74; small nucleolar RNA SNOR74
Genes
ATH: AT1G06087 AT1G08937
CRB: 111828768 111832252 111832253
BRP: 117127016 117127017 117127018 117127596 117127597 117128770 117132300
BNA: 125576809 125576811 125576812 125577497 125577498 125578836 125582837 125584944 125584945 125588207 125589498 125589640 125591011
RSZ: 130495376 130497874 130498232 130498233 130498234 130499302 130499303 130502366 130508895
CIT: 112499094 112499095 112499096
PVY: 116108309 116108310 116126489 116126491 116126492 116126494 116126495
MINC: 123198443 123206501 123215169 123215170 123215171 123215173 123215174 123215175 123215176 123215177 123217825 123217826
GRA: 128033405 128040853 128042755
GHI: 121203927 121207165 121214352 121216665 121216666 121219739 121228820
GAB: 128289566 128292084 128295748
HSYR: 120118093 120122289 120134785 120149199 120149200 120149201 120149202 120149203 120149204 120149206 120149207 120149208 120149209 120149211 120174211 120174219 120174227 120174235 120174242 120204733 120204734 120204735 120210847 120210848 120215404 120215405 120215406 120215407 120215409
EGR: 120290989 120290990 120290991 120290992 120290993
RARG: 115749449 115749454
GMX: 112998425 113000288 113001755 113001758 113002473 113002474 113002475 113002476
GSJ: 114382846 114397809 114413894 114413895 114424819 114424820 114424821 114424822
PVU: 137813133 137813134 137813136 137813137 137813138 137813139 137813140 137813141 137816760
VAR: 128195095 128195096 128195097 128195098 128195099 128195100 128195702
VUN: 114165388 114165396 114179993 114179994 114179995 114179997
VUM: 124841089 124843514 124843515 124843516 124843517
CCAJ: 114916225 114916647 114916648 114916649 114916650 114916651 114916652
APRC: 113851735 113856731 113856732 113856733
MTR: 112417615 112417616 112417617 112417618 120577802
TPRA: 123919237 123919238 123919239 123919240 123919241
CAM: 113787360 113787361 113787362 113787363 113787364 113787365 113787367 113787368 113787369 113787370 113787371 113787372 113787373 113788135 113788136 113788137 113788138 113788139 113788140
PSAT: 127109606 127109607 127109609 127109610 127109611 127109612 127109613 127109614
VVO: 131593860 131600925 131600926 131608484 131608485 131608486 131608487
LJA: 130716412 130716413 130716416 130716417 130727132
ADU: 127743768 127745966 127745967
AHF: 112704336 112739694 112739696 112793582 112793583 112793584
PCIN: 129294037 129294039 129294040 129294041 129310185
AANS: 126792987 126801305 126801306
RCN: 112191095 112191096 112201230
PDUL: 117613689 117613690 117613691 117616912 117616914
MDM: 114820812 114820813 139193255 139193256 139193257
MSYL: 126598275 126598276 126609472 126609473 126609474
PCOX: 137733080 137733081 137733082 137738540 137738541
ZJU: 112493261 112493262
MNT: 112093433 112094853 112094854
CSAV: 115715467 115715468 115715469 115715470 115715471 115715472
CSV: 116404214 116404215 116404216 116404217 116404852
CMO: 127148749 127151518 127151519 127151520 127151521 127151522
BHJ: 120076931 120082272 120082273 120082274 120082275 120082276
CMAX: 111466648 111466649 111466652 111466653 111492539 111494213 111494219 111494231 111494237 111494243 111496655
CMOS: 111450069 111450070 111450071 111450072 111454770 111458966 111458968 111458969 111458970 111458971 111458972 111463030
CPEP: 111783025 111783031 111783038 111783045 111783051 111783057 111799368 111802791 111802792 111802793 111802794 111806234
RCU: 112534098 112534099 112534103 112534104
MEAN: 126658981 126658982
JCU: 119371535 119371536 119371537 119371538
MESC: 122721435 122721436 122721437 122721438 122721439 122721651 122721652 122721653 122721849
POP: 112324574 112326359 112326360 112328544 112328545 112329046 112329047
PALZ: 118027567 118027574 118044509 118044516 118048965 118048966 118058265 118058271
PNZ: 133698082 133698083 133706107 133706108
JRE: 118344355 118344595 118344914 118344915 118349114 118349776
CILL: 122277920 122293964 122295273 122298049 122305955 122312138 122312139 122314600 122314601
CAVE: 132180187 132180188 132180189 132180190
AGLU: 133858208 133859026 133859027 133859028 133859029 133859030 133859031 133859032 133859033 133859034
QSU: 111996983 112011674 112011676 112011678 112011679 112011680
QLO: 115983040 115983041 115983043 115983044
CSAA: 142630084 142630085 142630086 142630087 142630088
TWL: 120001177 120001178 120001179 120001182 120008340 120008341 120008342
VVI: 132253033 132253873 132254225 132254388 132254690 132254691 132254706 132254710 132254711 132254712 132254713 132254714 132254715 132255138
VRI: 117905294 117926257 117926263 117926267 117926275 117926288 117926294 117926300 117926307 117926314 117926320
SLY: 112941036 112941037 112941038
SPEN: 114076186 114076187 114076188
SSTN: 125849573 125849574 125849575
SDUL: 129875395 129875397 129875398 129883794
CANN: 124888364 124892489 124897494 124898358 124898359
LBB: 132620711 132629665 132639027 132643118 132643119
NSY: 138876697 138884471
NTO: 117273630 117277873 117278702
ITR: 116026377 116026378
SSPL: 121746267 121756662 121756663 121756664 121759801 121759802 121769587 121773131
SMIL: 130987269 130987270 130996379 130996380 130996381 130996382 130996383 130996384 130996387 130996388 130996389 130996390 130996391 130996392 130996393 130996394 130996395 130996396 130996398 130996399 130996400 130996401 130996403 130996404 130996405 130996406 130996407 130996408 130996410 130996411 130996412 130996414 130996415 130996417 130996418 130996420 130996421 130996422 130996424 130996425 130996426 130996427 130996428 130996430 130996440
SHIS: 125185792 125185793 125191453 125208696
APAN: 127245216 127253937 127253938 127255057 127255058
HPUM: 140870246 140872390 140872391 140872392 140872393 140872394
PHUA: 140983676 140983677 140983678 140990776 140990777 140990778
PEBU: 140808559 140808560 140808561 140817644 140817645 140817646
PTAB: 142525731 142525732 142525733 142525734 142534017 142534018 142534019
HAN: 118483120 118483121 118483123 118488751
ECAD: 122584079 122594691
LSV: 111878795 111878796
CCAV: 112513875 112516072
DCR: 135150997 135150998 135151000
CSIN: 114272725 114283790 114291813 114294245 114294252 114310361 114310364 114310365 114310366
RVL: 131312198 131312199 131312200 131312201 131312203
AEW: 130750758 130769531 130772647 130773077 130773078 130773079 130780199 130780200 130781900 130781901 130781902 130790356 130792412 130792413 130792415
DLT: 127791278 127798585 127810763 127810764 127810765
SOE: 130460528 130462306 130466677 130471216
ATRI: 130809520 130809521 130809574 130823005 130823006
SLAF: 141616254 141616255 141625760 141625762 141625763 141625764 141625766 141625767 141625768 141636853 141636854 141636855 141636856 141637816 141637817 141645276 141645277 141645278 141645280 141645281 141645282 141654117
MOF: 131161165 131161166 131161167 131161168
MING: 122077641 122077642 122077643 122077644 122080492 122080493 122080494
TSS: 122638432 122648380 122657165
PSOM: 113285034 113300891 113300892 113307348 113362517 113362518
OBR: 121055416 121055417 121055418 121055419
OGL: 127785528 127785529 127785530
BDI: 112269070 112269071 112269072
ATS: 120965749 120965750 120965751
TDC: 119304709 119304710 119304711 119313454 119313456 119313457
TAES: 123109372 123109373 123109374 123118277 123118278 123118279 123126448 123126450 123126451
TUA: 125511878 125511879 125511880
HVG: 123400604 123400605
LPER: 127304953 127304954 127311031 127311033
LRD: 124658577 124658578 124658579 124658581 124658582 124658584
ZMA: 111589642 111590052 111590214 111590757
MFLO: 136478902 136514663 136514664 136514665 136519288 136519289 136519290 136519292 136519293 136519294 136519296
SVS: 117834920 117841184 117866024
PVIR: 120646585 120653098 120668284 120677116 120677117 120687114 120693684 120701678 120701680
PHAI: 112872496 112878379 112888206
PAUA: 133896532 133898028 133898029 133913920 133917188 133917189
TANG: 140769426 140772761 140775227 140775228 140775229 140775230 140775231
PDA: 113461126 113461127 113461143 113462954 113462958
EGU: 114914416 114914417 114914489 114914490
MUS: 135611428 135611429 135613303
ZOF: 121993467 122003313
DCT: 114578640 114578668 114579492 114579494 114579563 114579564 114579764
MSIN: 131236307 131236308 131236309 131241902 131241904 131241906 131241907 131241908 131241909 131241910 131247749 131247750 131247751 131247752
ACAK: 137947146 137947147 137947148 137947150 137947151 137950950 137950951 137950952
NCOL: 116249374 116251791 116251792
CJF: 131029815 131074010
 » show all
Reference
PMID:19357091
  Authors
Chen HM, Wu SH
  Title
Mining small RNA sequencing data: a new approach to identify small nucleolar RNAs in Arabidopsis.
  Journal
Nucleic Acids Res 37:e69 (2009)
DOI:10.1093/nar/gkp225
  Sequence
[ath:AT1G06087]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system