Acididesulfobacillus acetoxydans: DEACI_0995
Help
Entry
DEACI_0995 CDS
T07960
Name
(GenBank) Collagen triple helix repeat (20 copies)
Organism
aacx
Acididesulfobacillus acetoxydans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
FliMN_C
C1q
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAA7600342
UniProt:
A0A8S0WEQ1
LinkDB
All DBs
Position
1:1083233..1085497
Genome browser
AA seq
754 aa
AA seq
DB search
MASLTTGLIENTPVSGVRPSVTLAVKATNDDTVAASMTISGFHVSGGVKTQYVDELVAMQ
PGDVVVRSYYAQFDAFEFQFVTSSPAVEISAWGKDAAGNLVAAQRLVSEELKSLIPPGIG
PTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGAAGATGATGATGADG
ATGATGATGATGATGATGATGATGAAGATGATGATGADGATGATGATGATGATGATGATG
ATGAAGATGATGATGADGATGATGATGATGATGATGATGATGAAGATGATGATGADGATG
ATGATGATGATGATGATGATGGTGATGVTGATGATGATGADGATGATGATGATGATGATG
ATGATGATGATGAAGATGATGATGATGATGATGATGAAGATGATGATGATGAAGATGATG
ATGATGATGATGATGAAGATGATGATGATGATGVTGATGATGATGAAGATGATGATGATG
ATGATGVTGATGATGATGAAGATGATGATGATGATGATGVTGATGATGATGAAGATGATG
ATGATGATGATGAAGATGATGATGATGATGATGATGAAGATGATGATGATGATGVTGATG
ATGATGATGATGATGATGAGLSAYGYVYELATTTAAAGITGGSDVPFSNNGPLTNISHTA
GTTSVTVTTAGTYQIDYTVSITAGLGAGIAIAVNGTVDSSTPVTALVGTGQLTGQAMLTL
AAGDVVTLRNNSAVGLTLALAPNVGAQLNLMKLA
NT seq
2265 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcttcgctcacaacagggttgatagagaatacaccggtttcaggggtgagaccgtcg
gtgaccctggcggttaaggcaaccaatgatgacacggtcgcggcttcaatgacgatcagc
ggtttccatgtcagcggtggcgtcaagactcaatatgtggacgagttagtggctatgcag
ccgggagatgtcgttgttagaagttattacgcgcagtttgatgcttttgaattccagttc
gtaacgagttcgcccgcagtggaaatatcggcttggggtaaggatgccgccggaaattta
gtggcggcccaacggctggtctcagaagaactgaagtcactgattccgcccggcatcggg
ccgaccggagccacaggagccacgggagccacgggtgccacaggagccacgggagccaca
ggtgccacaggagccacgggtgcgacaggcgccacaggggctacgggtgcgaccggcgct
accggagccacgggtgccgccggtgccacgggagctacaggagccacgggtgctgacggt
gccacaggagccacgggtgcgacaggcgccacaggggctacgggtgcgaccggcgctacc
ggagccacgggtgccgccggtgccacgggagctacaggagccacgggtgctgacggtgcc
acaggagccacgggtgcgacaggcgccacaggggctacgggtgcgaccggcgctacagga
gccacgggtgccgccggtgccacgggagctacaggagccacgggtgctgacggtgccaca
ggagccacgggtgcgacaggcgccacaggggctacgggtgcgaccggcgctacaggagcc
acgggtgccgccggtgccacgggagctacaggagccacgggtgctgacggtgccacagga
gcgaccggtgccacaggtgctaccggagccacgggagcgaccggcgccacgggtgccacg
ggtggcacgggagcaacaggcgtcacgggagctacgggagccacgggtgccacgggtgct
gacggtgccacaggagccaccggggctacaggtgcgacaggcgctaccggtgccacaggt
gctacgggtgcgaccggcgccacaggagccacaggggctgcaggagctacgggtgccaca
ggcgccacgggagctacgggtgccacaggagccacgggtgcaacaggcgctgcgggtgcg
accggcgccacaggtgccacgggagccacaggggctgcaggagccacgggtgcaacaggc
gccacgggagctacgggtgccacaggagccacgggtgcaacaggcgctgcgggtgcgacc
ggcgccacaggggcaacaggtgctacgggagccacgggtgtgaccggagctacgggtgcc
acgggagccacaggggctgcaggagccacgggtgcaacaggcgccacgggagctacaggt
gctacgggagccacgggtgtgaccggagccacgggtgccacgggagccacaggggctgca
ggagccacgggtgcaacaggcgccacgggagctacgggtgccacaggagccacgggtgtg
accggagccacgggtgccacgggagccacaggggctgcaggagccacgggtgcaacaggc
gccacgggagccacgggtgccacgggagccacaggggctgcaggagccacgggtgcaaca
ggcgccacgggagctacgggtgccacaggagccacgggtgcaacaggcgctgcgggtgcg
accggcgccacaggagcaacaggtgccacgggagccacgggtgtgaccggcgctaccggg
gccacaggcgccacgggtgcgaccggagccacaggtgccacaggtgctaccggcgccggc
ttgtccgcctacgggtatgtctatgaattggcgaccactacggccgccgccggaatcaca
ggcggatcggatgtgcccttcagcaacaacggtccgttgacgaatatcagccacacagcg
ggtaccacctcggtaacggtaacgaccgccgggacctaccagattgactacactgtcagt
ataacagccggcctgggtgcgggtattgcgatcgccgtgaacggaacggttgactcatcc
accccggttacggctttggtcgggaccggtcagcttacgggtcaggctatgctgacactt
gcagccggtgatgtcgtgaccctgaggaacaattccgccgttggactcactttggccctc
gcccccaatgtcggggcgcagctgaatttgatgaaactggcgtag
DBGET
integrated database retrieval system
