Alteromonas australica H 17: EP13_06515
Help
Entry
EP13_06515 CDS
T03220
Name
(GenBank) histidine kinase
Organism
aal
Alteromonas australica H 17
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS_3
Y_Y_Y
PAS_9
Reg_prop
PAS
PAS_4
PAS_8
GGDEF_GdpP
RRM_MUD2_C
Lectin_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIF98372
UniProt:
A0A075P4X9
LinkDB
All DBs
Position
complement(1430171..1434718)
Genome browser
AA seq
1515 aa
AA seq
DB search
MRSTLACSVLILWLQIIGTFFSDATAIEVADLQFTELNKQDGLSNTVVLDVAEDNKGYIW
LATMNGLNRYSGYDIQQYHPSDIDPNALPSGLIHKLLVDDNGDLWVGTHSGLAKYRPLTD
DFERFTKDNTVMKFDSVMALAQGESGEILFTDPKYLYSLDPKTGVVKIVTQLYSTPVGTR
VIFDEPNRIWVGSNQNFALIYDKSSGTLYQSDQINPWGIFLTDTTVNDIKILDNHYWLAT
DNGVIVLAANGNVVNHIKFSEFGSDSHVLITTILTVGNRLWLSSKNDGVLIADFIDNPST
QLDGSSFTRINADNGQLTGLTEDFIFSLHEDRSGSIWLATSQGAFKYNKTYSQVKFFPST
STQQSSAESAIIWGLAESRDNSVFFASQQNGIGKLEKVSGNISYLPSRPEKAENVTYWDL
VIDRNDGFWAAASNGLRKYQYTQNTLVLEDTFFEGNFVDYIHYDGQSLWVWLVNKGLHSV
DTTATASDTGRHAITAYDIGIEDTFHLPIYTDSAGNIWLRHEEGLVLFNPKSGKILRRLD
STNGLNSLVYSVYETAESFWLTTRSDGVVELDKTTYNVVRKQARDDKDGYIFSSIGINNA
IWYADSAGVHQVELPSLREITTVSNIQLEFNSLGESAVLATDTGDIYFGGNKGFNKVRAR
TQRNTKAMPPTRLPELFEFSVFGHSSSPFELGTNQTKEKGLSRRQNITYTSSTLLEHHES
RFSISFGLLNPLYPEEVQYRYKLAGYDKLWTNIGGQHTAQFNNVSFGNYTFEVQAKEPGK
NWSPSRKLTIQIARPPWLHTVALVFYALLLTVVLAFVIRQYQLRKSNQLAIKESEERLKL
TLWSSGDELWDWDVYRGQVYRANTWGTLDFPQDDIRTTGAFDANIHPNDIQRVKDALRAH
LEGKSDFYELAYRAKTFKNQWVWILDRGKVVERDHNQQPVRMTGTLKNINHLKEAEEQLN
LFKRSIENISEGVFITNTQFKFISVNNAYCQYTGETREQALASYMNFHLYPDAFTEEIKK
TLRTKSNWSGEVESVRMNGERFEMELNIDAVHDEDGRISHFVGVFSDITSRKSTEKELLK
LANTDPLTELPNRSFYQASHQNLVRKAAPHTLLCLDMDNFKKINDSLGHQTGDILIKQIA
KRLQRITGKNATCYRLGGDEFSVLMEDSADIHTVTHYAQNLLDTLSRPFIINKQEFVLGA
SIGIAFFPNDGTTPQEMLKNADTAMYFAKNNGGNSYQFFSGEMNQNAVRQLQIENLIRQG
IKDDLFTVYYQPKVDIASGKLVSMEALVRFEHPEKGIVSPGQFIPLAEQTGQIIEIGEQV
LRKACADTKRWVNQGIFTGRVAVNISAKQFELPDLDDRINKVLNEVGLSPLHLECEITEG
TLMENPENGLRMMRRLREKGIHLALDDFGTGYSSLAYLKRFPLNTLKIDKAFIDDIAKSN
VDRHMAAAIISIAHNLGLKVVAEGVEDEQQLSILRRYDCEMLQGFLYSRPINADRFEKLL
SENQQLHNLLGHSNI
NT seq
4548 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgcgctcaaccctagcttgctcagtattgatattgtggctgcaaatcatcggaactttt
ttctccgatgcgacagctatagaggtcgctgaccttcaatttactgaattaaataaacaa
gatggtttatccaatactgtagtgcttgatgtagctgaagataacaaaggctatatttgg
ctggctactatgaacggattaaaccgctattcaggctacgatatccaacaatatcatccg
tcagatattgaccccaatgcgctgcctagtggtttgattcacaaattactggtagacgac
aacggtgacctttgggtaggcacgcattcaggactagcaaaataccgcccgttaaccgac
gattttgaacgtttcaccaaagacaacactgtaatgaagttcgactcggtgatggcctta
gcgcaaggtgagtctggcgagattttatttacagatcccaagtacctgtattctcttgac
cccaaaacgggtgtcgtaaaaatagtgacccaactttattccacgccagtgggaacgcgc
gtaatttttgacgaaccaaacagaatctgggtgggttctaatcaaaattttgcactcata
tacgataagtcgtctggaactctctatcaaagtgaccaaatcaatccttggggtattttc
ttaacggatacaacagtcaatgatattaagatactggataaccactactggctagctacc
gataatggtgtcatcgtactcgctgccaatggcaatgtggttaatcatattaaattctca
gaatttggctcagacagtcatgttcttattactaccatcctcactgttggaaataggcta
tggctaagctcaaaaaatgatggcgttttaatagccgactttattgacaacccctccacg
caacttgatggcagttcctttacacgaatcaatgcggacaacggtcaactaacaggctta
acagaagactttattttttctttacacgaagataggtcgggtagcatttggctagccacc
tctcaaggggcctttaagtacaataaaacctattcacaagttaagttcttcccgagcacc
agcacccaacaaagctccgcggaaagcgctatcatctggggccttgctgaatcccgtgat
aacagcgttttctttgcttcacagcaaaatggtattggtaaattagaaaaggtcagtggc
aatattagctacctcccttctcgcccagaaaaagcagaaaatgttacctattgggacctt
gtgatcgacagaaacgatggcttttgggcagccgcctctaacggccttagaaagtatcaa
tacacgcaaaacaccttggtcttagaagacaccttttttgagggtaactttgtcgactat
atccattacgatggtcagtcgttatgggtttggttagtaaataaaggcctgcattctgtg
gatacgacagcaactgccagcgacactggcagacatgcaataacggcgtatgatattggt
attgaagatacgttccatcttcctatttacactgacagtgctggcaatatatggttgcgc
cacgaagaagggttagttttgtttaaccccaaatccggcaaaattttacgtcgcctcgat
tctaccaatgggttaaattcactggtatatagcgtgtatgaaacagcagaatccttctgg
ttaaccacccgttctgacggggtggtcgaactagataaaacaacctacaacgtggtgcga
aaacaagcccgggacgataaagatggctatattttctcttccattggcataaacaatgct
atttggtacgcagacagcgctggcgtacaccaagttgaattaccgtctttacgtgaaata
acgacggtgtcgaatattcagttagagtttaactctttaggtgaaagtgcggtgttagcc
actgacacgggagacatttattttggtggaaataaagggtttaacaaagtaagagcaaga
acccaaagaaataccaaagccatgccccctacccgcttacctgaactttttgagtttagt
gtattcgggcactcctcttctccctttgaacttggcacaaaccaaacaaaagagaaagga
ttatctcgtcgacagaatattacctatacgtccagcaccctgctagagcaccatgaatct
cgctttagtatttcatttggtttactgaaccctttgtacccagaagaagtgcaatacagg
tacaaactggcgggctatgacaaactgtggacaaatattgggggacagcacactgcccag
tttaataatgtgtcttttggtaattacacctttgaagtacaagcaaaagagccaggtaaa
aactggtcgcccagccgtaaactaaccattcaaattgcgcgcccaccctggttacacact
gttgcattggtattttatgcgctgcttcttaccgtggtacttgcctttgttattcgccag
tatcaactgagaaaatctaatcaattggccatcaaagagtctgaagagcggttgaagcta
accctgtggagctctggcgatgagctgtgggattgggacgtttatcgcggccaagtttat
cgggctaatacctggggtacactggactttcctcaggatgacattagaaccacaggcgcc
tttgacgccaatatacaccctaatgacattcagcgggtcaaagatgcgttaagagcgcac
ttagaaggaaaaagtgacttttacgagttagcttaccgagccaaaactttcaaaaatcag
tgggtttggatattagatagagggaaagtggttgaaagggaccacaatcagcaacccgta
aggatgacaggaacgctaaaaaatattaaccacctgaaagaggccgaagaacaacttaat
ttgtttaagcgctctattgaaaacatttcagaaggcgtatttattaccaacacgcaattt
aagtttatttcagtgaacaacgcctattgccaatacacgggagaaacccgtgagcaggcc
ttagccagctacatgaacttccacctttacccagatgcgttcacagaagaaattaaaaaa
accttaaggactaaaagcaattggtctggcgaggtagaatctgtgcgcatgaatggcgaa
cgctttgagatggagctaaatattgatgccgtgcacgacgaagacgggcgcatcagtcat
tttgtaggtgtatttagcgacattacctctcgtaaaagtaccgaaaaagagctattaaag
ttagctaacacagacccgcttactgaactgcctaatcggtctttctatcaggcaagccac
caaaacttagtcaggaaagccgcaccacacaccttgctatgcttagacatggataacttt
aaaaagattaacgattcattggggcatcaaaccggtgatattttaattaagcaaattgcg
aaacgtcttcagcgtattactggtaaaaatgcaacctgttaccgcctagggggagatgag
ttcagtgtattaatggaagacagtgccgatatacacaccgttacccattacgcccaaaat
ttactcgatactttgtctcgcccgtttattataaataaacaagaatttgtattaggtgcg
agtattggcattgcatttttccccaacgacggcactacaccacaagaaatgctgaaaaat
gccgatacggccatgtattttgctaagaacaatggcggcaatagctatcagttcttcagt
ggcgagatgaaccaaaacgcggtccgacagttacaaattgaaaacttgatccgccaaggt
ataaaagatgatttatttacagtttattatcaacccaaggtagatattgcgtctgggaag
ttggtaagcatggaagcgctagtgcgctttgaacacccagaaaaaggcatagtaagccct
gggcaattcattccattggccgagcagaccggccaaattatcgaaattggagaacaagtc
ttacgaaaagcgtgtgcggatacgaagcgctgggttaaccaaggtatattcaccggcaga
gtggccgtgaacatctccgccaagcaattcgaactgcccgacctagatgatagaatcaac
aaagtgttgaatgaagtaggcctgtcgcctttacatctagagtgtgaaattactgaaggc
actctgatggaaaacccagagaacgggctaagaatgatgcgccggcttcgtgaaaaagga
attcatttagcgttagacgactttggtacaggctattcgtccctcgcctacctaaaacgc
ttcccgctaaacacactaaaaatagataaagcgtttatcgacgatattgccaaaagtaac
gtagaccggcatatggctgccgccattatcagcattgcccataacctcggtctaaaagta
gtagctgagggtgtcgaagacgaacagcagctcagtatcttacgccgctatgactgtgaa
atgctgcaaggtttcttgtatagccgccccattaatgccgatcgcttcgaaaaactgctg
tcggaaaaccaacagttacacaacctgctagggcattcaaatatttga
DBGET
integrated database retrieval system