Arenibacter algicola: AREALGSMS7_00120
Help
Entry
AREALGSMS7_00120 CDS
T04973
Name
(GenBank) collagen triple helix repeat (20 copies)
Organism
aalg
Arenibacter algicola
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASO03618
UniProt:
A0A221UR14
LinkDB
All DBs
Position
131539..141375
Genome browser
AA seq
3278 aa
AA seq
DB search
MSCTFATAQVKIGENPNSINAASIVELESTTKAFVLTRVSNTQMQTIKPLRGAMVYNTDA
QCVFFYNGTQWNSLCTGGSTATGGVGIQSTVNNGNGTFTFNYTDGTKFTTSNLTGPRGPA
GINGIDGTNGATGATGAQGPIGLTGATGVTGEKGDTGAKGDTGATGAKGDQGVKGDTGAT
GAKGDTGATGATGVQGEKGDAGTTGAKGDQGEKGDTGATGAQGIQGVTGATGATGEQGEK
GNTGATGSTGVQGETGATGDKGDTGATGAKGDQGVKGDTGATGTTGAKGDTGATGATGST
GETGAKGDKGDTGVTGAKGDQGVKGETGSTGAQGIQGETGATGATGATGATGTTGAKGEQ
GDKGDTGATGSTGAQGPIGLTGATGAKGDQGDKGETGAQGPIGLTGATGADGSKGDTGAT
GAQGPTGNNGNDGAKGDTGVTGATGATGDTGATGAKGDQGDKGETGATGVTGEKGDKGET
GAKGDKGDTGATGAKGDQGVKGDTGATGATGAKGDQGDKGETGAQGPIGLTGANGAKGDT
GATGVTGATGAKGDQGDKGATGATGATGEQGLKGDKGDTGAQGIQGVTGATGATGDTGAT
GTKGDQGDKGEKGDTGAKGDTGAQGIQGLTGATGTTGAKGDQGDKGDTGATGATGATGAK
GDQGVKGDTGATGAQGPIGLSVTGAQGPTGANGAKGDKGDTGATGATGATGAQGPIGISI
TGAKGDTGATGAKGDQGDKGETGATGTTGAKGDTGATGVQGPIGLTGADGAKGDTGAKGD
TGAKGDTGAKGDKGDKGETGSTGATGATGEQGIQGDKGEKGDTGAKGDQGDTGATGATGA
TGSTGATGVQGEKGDTGATGATGSTGATGAKGDTGATGAKGDQGVKGDTGATGAQGPIGL
SVTGAQGPTGANGAKGDKGDTGATGATGATGATGAQGPIGISITGAKGDTGATGAKGDQG
DKGETGATGTTGAKGDTGATGAQGPIGLTGADGAKGDTGAKGDTGAKGDTGAQGIQGIQG
VTGATGATGEQGEKGNTGATGVQGEKGDKGDTGATGATGNTGTQGIQGIQGIQGDKGDTG
AKGDQGDKGETGATGAQGIQGVKGDQGDTGATGATGLQGEKGDTGATGATGVQGEKGDKG
ETGATGAQGIQGVKGDQGDTGATGATGLQGEKGDTGATGAEGAKGDTGATGATGATGTTG
AKGDQGDKGDTGATGSTGAQGPIGLTGATGADGAKGDAGAKGDQGDKGEKGDTGAKGDQG
DKGETGATGAQGIQGVKGDQGDTGATGATGLQGEKGDTGATGADGAKGDTGATGATGATG
VQGEKGETGTTGVTGAQGPIGLTGATGADGAKGDTGATGATGAQGIQGIQGVTGATGATG
ATGSQGEKGDTGEKGDTGPKGDQGDKGDTGAQGIQGETGATGAQGIQGVTGATGATGDKG
DKGDTGATGATGAKGDQGDKGDTGATGSTGAQGIQGIQGEIGATGATGVQGEKGDKGDTG
ATGATGSTGAQGIQGETGATGAQGIQGVTGDTGEKGDTGAKGDKGDTGATGAKGDQGDKG
DTGATGSTGAQGIQGIQGEIGATGATGVQGEKGDKGEKGETGATGTTGAQGIQGETGATG
ATGSTGAQGIQGIQGIQGETGEKGDKGDTGATGTTGSTGAQGIQGATGATGATGVQGEKG
DKGDTGATGATGATGPTGAQGIQGETGATGATGSTGAQGIQGVTGATGSQGIQGIQGETG
ATGATGATGNTGATGEQGIQGETGAKGDKGDKGDTGATGATGATGAQGPIGISITGAKGD
KGDTGATGTTGAKGDTGATGAQGPIGLTGTDGAKGDTGATGVQGEKGETGAKGDQGDKGE
TGATGATGNTGEQGIQGVKGDTGATGATGSTGAQGIQGVTGATGATGAKGDQGDKGETGA
TGATGIQGEKGDTGATGATGEKGDKGETGATGDKGDKGDTGEQGIQGLKGETGAKGDQGD
KGDKGETGATGEQGIQGVTGATGATGDQGVKGDQGDKGEKGDTGAKGDQGDKGETGATGA
QGIQGVKGDQGDTGATGATGLQGEKGDTGATGADGAKGDTGAKGDQGDKGETGATGATGA
TGATGNTGAQGIQGIQGIQGKTGDKGDKGDTGATGATGATGSTGATGIQGEKGDTGATGT
TGAKGDQGEKGDTGATGATGATGNTGAQGIQGVTGATGATGATGNTGAQGIQGIQGEKGD
TGAKGDQGDTGATGATGADGDKGDTGATGLQGEKGDTGATGATGNTGAQGIQGIQGIQGE
TGDKGDQGDKGETGATGAQGPIGLTGADGAKGDTGATGATGSTGATGVQGEKGETGAKGD
QGDTGATGATGLQGEKGDTGATGSTGAQGVKGDKGDTGATGSTGAQGIQGIQGETGAKGD
QGDKGETGATGATGVQGEKGDKGDTGATGSTGEHGEKGDTGATGTTGAKGDQGDKGDTGA
QGIQGVTGATGATGSTGAQGEKGETGATGADGAKGDTGATGSTGATGVQGEKGDTGATGE
IGATGAKGDQGDKGETGATGVTGATGATGNTGAQGIQGIQGETGATGNTGAQGIQGIQGE
TGATGATGATGSTGSTGETGAKGDTGAKGDQGEKGNTGETGATGATGDKGDTGATGERGD
TGATGATGATGATGSTGAQGIQGVTGATGATGEQGIQGETGATGATGVQGEKGDKGDTGA
TGATGNTGAQGIQGIQGIQGETGDKGDKGETGAQGPIGLTGATGADGAKGDTGATGAKGD
QGDKGETGATGATGSTGAQGIQGETGATGATGSTGATGATGAKGDQGDTGATGDKGDQGV
KGETGATGATGATGSTGATGAKGIQGIQGEKGDTGAKGDQGEKGDTGAQGIQGVTGATGA
TGDTGATGSQGEKGETGEKGDTGAKGDKGDKGDTGATGAQGIQGIQGETGATGAKGDTGA
QGIQGIQGVTGATGATGSTGAKGDQGEKGDTGATGSTGAQGIQGEKGDTGAKGDTGAQGI
QGVKGDTGATGTTGSTGAQGIQGETGATGAKGDQGDKGETGATGATGATGATGEKGDKGE
IGATGSIGAQGIQGIQGETGATGATGSTGAQGMQGVTGATGATGAKGETGATGSAGPAGS
DGIDGAIGPKGDKGDTGATGPTGAAGTNGTNGATGATGPTGATGATGDTGPQGDNMIKAI
GKISAAGGIVKATSGITVTKLSGNGHYRINLPSGMVSSANYIIQLTQPDRNGAGNDNPGI
GYINQTSSSFEVIIGDNDNGASDRVRFNSEFMFMILDF
NT seq
9837 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagttgcacctttgcaactgcacaagtaaaaattggtgaaaatccaaacagtattaat
gctgcttccatagttgaattggaaagtactacaaaagcatttgtacttacaagagtttcc
aatacccaaatgcaaaccattaaaccattacgtggggcaatggtctataacacggatgca
caatgtgttttcttttacaacggaacgcaatggaatagcctttgtacaggcggatcaact
gccactggaggtgtcggcatacagtctactgttaataacggtaacgggacatttactttc
aattatacagacggaacaaaatttacaacttcaaacttaacaggaccaagaggtcctgct
ggtattaatggtattgacggaaccaatggagctactggtgctactggtgctcagggtcca
ataggattaactggagccactggtgtaaccggtgagaaaggtgatactggagcaaaaggg
gacactggtgcgaccggagccaaaggcgaccagggcgtcaaaggagacactggtgcgacc
ggagccaagggagataccggtgctactggtgcaactggagttcaaggtgaaaaaggtgat
gctggtacaaccggagccaagggcgaccagggcgaaaaaggtgacacaggtgctactgga
gctcaaggtatacagggtgtaaccggtgcaacaggtgctaccggagaacagggtgagaaa
ggtaatactggagcaactggttcaactggagttcaaggtgaaacgggagctactggtgat
aaaggagacactggtgcgaccggagccaaaggcgaccagggcgtcaaaggagatactgga
gctactggtacaaccggagccaagggagataccggtgctactggtgcaacgggttcaaca
ggagaaactggagccaagggagataagggagacactggtgtgaccggagccaaaggcgac
cagggcgtcaaaggagaaactggctcaactggagcacaaggtatacaaggagagactggt
gccacaggtgccacaggtgcaactggagctactggtacaacgggagccaagggagaacaa
ggcgacaaaggagataccggagcaactggttcaactggagctcaaggtccgatcggactt
actggagcaactggtgctaagggtgaccaaggtgataagggtgaaaccggtgctcagggt
ccgataggacttactggcgcaactggtgcagatggatcaaaaggagacacaggtgcaact
ggtgctcagggtccaacaggaaacaatggaaacgacggtgctaaaggagacactggtgta
accggtgctacaggtgcgactggagacactggggcaaccggagccaaaggcgaccaagga
gacaagggtgaaacgggagcaactggtgtaaccggtgagaaaggtgataaaggcgaaact
ggagccaagggagataagggagacactggtgcgaccggagccaaaggcgaccagggcgtc
aaaggagataccggtgcaactggtgcgaccggagccaaaggcgaccagggcgacaaaggt
gaaactggtgctcagggtccaataggattaactggtgctaacggagccaaaggagatact
ggagctactggtgtaacgggagctactggagcaaagggagatcaaggcgataagggagct
actggtgctactggtgcaacgggtgaacaaggtctaaaaggtgacaagggagacactggt
gcccaaggtattcaaggtgtaaccggagctacaggtgcgaccggagacactggtgcgacc
ggaaccaaaggcgaccagggcgacaagggtgagaaaggtgacactggtgctaaaggagac
actggagcccaaggaatacaaggtttaacaggagcaactggaactaccggagccaaggga
gaccaaggagataagggagacactggtgctacaggagctactggggcaactggagccaaa
ggagaccagggcgtcaaaggagataccggtgcgacaggagcacaaggaccaataggtcta
agtgttactggtgctcaaggacctacaggagctaacggagctaaaggtgacaaaggagat
accggggctactggtgctactggtgcgacaggagcacaaggaccaataggtataagtata
actggagcaaaaggcgacactggtgcgaccggagcaaaaggcgaccagggcgacaagggt
gaaacgggagcaactggtacaaccggagccaaaggtgacacaggagcaacgggagttcag
ggtccaataggattaactggtgctgacggagccaaaggagatactggtgccaaaggagat
acaggtgccaagggtgatactggagccaagggagataagggagacaaaggagaaactggt
tcaacaggagccacaggtgctaccggagaacagggtatccaaggagataagggtgaaaaa
ggagatactggagcgaaaggcgaccaaggtgatactggggcaactggagccacaggtgct
acaggatctaccggtgcaacaggagttcaaggcgagaaaggtgacactggtgccacaggt
gcaactggatctaccggtgcaacaggagccaagggagacactggtgcgaccggagccaaa
ggcgaccagggcgtcaaaggagataccggtgcgacaggagcacaaggaccaataggtcta
agtgttactggtgctcaaggacctacaggagctaacggagctaaaggtgacaaaggagat
acaggggctactggtgcgactggtgctactggtgcgacaggagcacaaggaccaataggt
ataagtataactggagccaaaggcgacactggtgcgaccggagcaaaaggcgaccagggc
gacaagggtgaaacgggagcaactggtacaaccggagccaaaggtgacacgggagcaaca
ggtgctcagggtccaataggattaactggtgctgacggagccaaaggagatactggtgcc
aaaggagatactggtgctaaaggtgatactggagctcaaggaattcaaggtatacaaggt
gtaaccggagccacaggtgctaccggagaacagggtgagaaaggtaatactggagcaact
ggagttcaaggtgaaaaaggtgacaagggcgacaccggagctactggtgctactggtaat
acaggaacacaaggtatacagggaatacaaggtatccaaggcgataaaggtgatactgga
gccaaaggcgaccaaggagacaagggtgaaactggagcaacaggtgctcaaggaattcaa
ggcgtaaaaggtgaccaaggtgatacaggagccacaggtgcaactggacttcaaggcgag
aaaggagataccggtgcgactggtgcaactggagttcaaggtgaaaaaggtgacaagggt
gaaactggagcaacaggtgctcaaggaattcagggcgtaaaaggtgaccaaggtgacaca
ggagccacaggtgcaactggacttcaaggcgagaaaggagataccggtgcgactggtgct
gagggagccaagggagacactggtgctacaggtgcaactggagctactggtacaactgga
gccaagggagatcaaggcgacaaaggagataccggagcaactggttcaactggagctcaa
ggtccgatcggactaactggagcaactggtgctgatggagctaaaggagatgccggtgct
aaaggcgaccaaggtgataagggtgaaaaaggtgacactggtgccaaaggtgaccaagga
gacaagggtgaaacaggagcaacaggtgctcaaggaattcaaggcgtaaaaggtgaccaa
ggtgatacaggagccacaggtgcaactggacttcaaggcgagaaaggagataccggtgcg
actggtgctgacggagccaaaggagatacaggtgcaactggagctaccggtgcaacagga
gttcaaggcgagaaaggtgaaacaggcactactggagtaacaggagcccaaggtccgatc
ggacttactggcgcaactggtgcggacggagctaaaggagatacaggggccacaggtgca
actggagctcaaggaattcaaggtatacaaggtgtaaccggtgctacaggagctactggt
gcaacaggatctcaaggcgagaaaggtgatactggagaaaaaggagataccggtcctaag
ggtgaccagggagacaaaggagacaccggagctcaaggaatacaaggagaaactggcgca
actggtgcccaaggtattcagggtgtaaccggagctactggtgctacaggagacaaagga
gataagggtgataccggagctaccggggcaactggtgctaaaggagatcagggagacaag
ggtgataccggtgcaacaggttcaaccggagcgcaaggaattcaaggtattcaaggtgaa
atcggagcaactggtgctactggtgttcaaggtgaaaaaggagacaagggcgacaccgga
gcaactggtgctactggttcaacaggagctcaaggaatacaaggagaaactggcgcaact
ggtgcccaaggtatacaaggtgtaacaggtgatactggagaaaaaggtgacactggtgct
aagggtgacaaaggtgataccggagcaactggagctaaaggagatcagggagacaagggt
gataccggtgcaacaggttcaaccggagcgcaaggaattcaaggtatacaaggtgaaatc
ggagcaactggtgctactggtgttcaaggtgaaaaaggagacaagggcgagaaaggtgaa
acgggagctactggaactaccggagcgcaaggaattcaaggagagaccggagcaactggt
gcaacaggttcaactggagcacaaggtatacagggaatacaaggtatccaaggcgaaact
ggtgaaaaaggagacaagggcgacaccggagctactggtactactggttcaactggagca
cagggaatacaaggtgcaaccggggctactggtgctactggagttcaaggtgaaaaagga
gacaagggcgacaccggagctactggtgcaactggtgctactggaccaaccggagcccaa
ggaatacaaggtgaaactggagcaactggtgcaacaggttcaactggagcacagggaata
caaggtgtaactggagcaacaggttctcaaggaattcaaggtattcaaggagagactggt
gccacaggtgcaactggagcaactggtaacacaggagcaactggtgaacaaggaatacaa
ggagaaacaggagccaagggcgacaaaggtgacaaaggagatactggggcaaccggggct
actggtgcgacaggagcacaaggaccaataggcataagtataactggagccaaaggtgac
aagggtgataccggtgctactggtacaaccggagccaaaggtgacacaggagcaacggga
gctcagggtccaataggattaactggtactgatggagccaaaggagatacaggtgcaaca
ggagttcaaggcgagaaaggtgaaactggagccaaaggcgaccaaggagacaagggtgaa
actggtgccacaggtgcaactggtaacacaggagagcaaggtatccaaggagtaaagggt
gatactggagccactggtgcaacaggttcaactggagctcaaggtattcaaggtgtaacc
ggggctactggtgcaaccggtgccaagggtgaccaaggggacaaaggtgaaaccggagca
actggtgctactggaattcaaggtgaaaaaggagacaccggagctactggtgctactgga
gaaaaaggtgataaaggagaaaccggggccacaggagacaaaggtgacaagggagatacc
ggagaacaaggtatccaaggtctaaaaggtgaaactggtgctaagggagaccaaggcgac
aagggcgacaaaggagaaactggagctactggagaacagggtatccaaggtgtaactggt
gcgaccggagccacaggcgaccagggcgtcaaaggtgatcaaggtgataagggtgaaaaa
ggtgacactggtgccaaaggtgaccaaggagacaagggtgaaactggagcaacaggtgct
caaggaattcaaggcgtaaaaggtgaccaaggtgatacaggagccacaggtgcaactgga
cttcaaggcgagaaaggagataccggtgcgactggtgctgacggagccaaaggagataca
ggtgctaaaggcgaccagggcgataaaggtgaaactggtgcaacaggagccacaggtgct
actggtgccactggtaatacgggagcacaaggtatacagggaatacaaggtatccaaggc
aaaactggtgataaaggagacaaaggagatacaggggccacaggggccacaggtgcaact
ggatctactggtgcaacaggaatacaaggtgagaaaggtgacactggtgctactggtaca
acaggagccaagggtgaccagggcgagaaaggtgatactggagccacaggagccacagga
gctactggaaatacaggggcccaaggtatacaaggtgtaaccggtgcaactggtgcaact
ggtgcaactggcaacacaggagcgcaaggaatacaaggtattcaaggagagaaaggtgat
acaggtgccaagggtgaccaaggtgatacaggagccacaggtgcgactggtgctgacgga
gacaaaggagatacaggtgcaactggacttcaaggcgagaaaggagataccggtgccact
ggtgctactggtaatacaggagcacaaggtatacagggaatacaaggtatccaaggcgaa
actggtgataaaggagaccaaggagacaaaggtgaaacgggagcaaccggagctcagggt
ccaataggattaactggtgcggacggagctaaaggagatacaggggccacaggtgctaca
ggatctactggtgctacaggagtgcaaggtgagaaaggtgaaactggtgccaaaggtgac
caaggtgatacaggagccacaggtgcaactggacttcaaggcgagaaaggtgatactgga
gcaactggttcaactggagctcaaggtgtaaaaggtgacaaaggtgatacaggagctact
ggttcaactggtgcccaaggaatacaaggtatccaaggtgaaaccggtgccaagggtgac
caaggggacaaaggtgaaaccggagcaactggtgctactggagttcaaggtgaaaaagga
gacaagggcgacaccggagctacaggttcaactggagaacatggtgagaaaggtgatact
ggtgctactggtacaacaggagccaagggagatcaaggcgataaaggtgacactggtgcc
caaggtattcagggtgtaaccggagctactggtgctactggttcaacaggagcccaaggt
gaaaaaggtgaaactggagcaactggtgcggacggtgcaaaaggagatacaggtgctact
ggttctactggagcaactggagttcaaggagagaaaggtgatactggtgcaacaggcgaa
attggtgcgaccggagccaaaggcgaccagggcgacaaaggtgaaacgggagctactggt
gtaactggtgccactggagcaactggtaacacaggagcgcaaggcatacaaggtattcaa
ggagagactggagcaactggtaatacaggagcacaaggtatacagggaatacaaggtgaa
actggagctactggtgcaaccggcgcaactggatctacaggttcaacaggagaaactgga
gccaaaggagatacaggtgccaagggtgaccaaggcgagaaaggtaatactggagaaacc
ggtgctactggcgccactggtgacaagggtgatactggtgctactggcgaaaggggtgat
accggagctacaggtgcaacaggagccactggtgcaacaggttcaactggagctcaaggt
attcaaggtgtaaccggggctactggtgcaaccggtgaacaaggaatacaaggcgaaacc
ggagcaactggtgctactggagttcaaggtgaaaaaggtgacaagggcgacaccggagct
actggtgccactggtaatacaggagcacaaggtatacagggaatacaaggtatccaaggc
gaaactggtgataaaggagacaaaggtgaaactggtgcccaaggtccgatcggacttact
ggcgcaactggtgcggacggagctaaaggagatactggtgcgaccggagccaaaggcgac
caaggagacaagggtgagactggagcgacaggtgcaactggttctactggagcacaggga
atacaaggtgaaactggtgccactggagcaactggttcaactggagcaactggagcaact
ggagctaaaggagaccaaggagatactggtgcgaccggagacaagggcgaccagggcgtc
aagggtgaaacaggagctactggtgcaaccggcgcaactggttctacaggtgcaactgga
gccaagggaatacaaggtatccaaggcgagaaaggtgatacaggtgccaagggagatcaa
ggcgagaaaggagatactggtgcccagggtattcagggtgtaaccggagcaactggtgca
accggggacactggtgcaacaggatctcaaggcgagaaaggtgaaactggagaaaaaggt
gataccggtgctaagggtgacaagggagacaaaggagatacaggggccacaggtgctcaa
ggaattcaaggtattcaaggtgagactggtgccacaggtgctaaaggtgatactggagct
caaggaattcaaggtatacaaggtgtaaccggtgctacaggagctactggctctactgga
gctaagggtgaccaaggtgagaaaggtgacactggtgctactggttcaactggagctcaa
ggaatccaaggcgagaaaggtgatactggagccaaaggagatacaggtgcccaaggtata
caaggtgtaaagggtgatactggagccactggtacaacaggttcaaccggtgcacaagga
atacaaggtgaaactggtgccaccggagccaaaggcgaccaaggcgataaaggtgaaacg
ggagctactggggcaactggagctactggggcaactggtgaaaaaggagacaaaggtgaa
atcggtgcaacaggttcaatcggagcgcaaggaatacagggaatacaaggtgagaccgga
gctactggagccacaggttcaacaggggcgcaaggtatgcaaggtgtaaccggagctact
ggtgcaaccggagcaaaaggtgaaactggagcaacaggatcagctggtcccgcaggatcg
gatggtattgatggtgcaatcggacctaaaggagataaaggcgacacaggtgctacaggc
ccaaccggtgctgcaggtactaacggaactaatggagccaccggcgctaccggcccaacg
ggtgcaacaggtgcaacaggtgatacaggacctcaaggagataatatgataaaagcaata
gggaaaatatccgcagcaggtggaattgtaaaagcgacctctggaataacggtaaccaaa
ttatccggaaacgggcattatagaataaacctgccctcaggtatggtttcaagcgccaat
tatattatacaactaacgcagcccgatagaaatggagcaggtaacgataaccctggaatc
ggatatattaatcaaacatcctcaagttttgaagtaatcattggagataatgacaatgga
gcatcagacagggtaaggtttaattctgaatttatgtttatgattttggatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
