Arenibacter algicola: AREALGSMS7_00261
Help
Entry
AREALGSMS7_00261 CDS
T04973
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor SusC
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
aalg
Arenibacter algicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aalg00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
aalg02000
]
AREALGSMS7_00261
Transporters [BR:
aalg02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
AREALGSMS7_00261
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASO03759
UniProt:
A0A221UQV4
LinkDB
All DBs
Position
complement(294732..297944)
Genome browser
AA seq
1070 aa
AA seq
DB search
MLKFKFLIITLVMVCAQNVLGQTKTITGLVSDESGLPLPGVTVVVLGTVNGTTTDFDGNY
SIGNVGPEDRLVYTYIGMVSQTLSVGQQTTINVTLLESYESLEEVVVVGYGVQKKALTTG
ANLNVKGEDIAELNTSTAMEALQGVAPGVSVTRNNGEPGAGTKVTIRGLGTIGNSSPLYI
VDGVAVGNIDYLNSSDIQSIDVLKDAASAAIYGSRAANGVVLVTTHKGRQGSKAQIQYDS
YYGIQKIYKNLSPLNAQEYMYIMDEGRVNDGLEPNDWEAILQNNNWLNNNYPNNLGTELG
SEIWGMLQNGWEGTNWIDEMSTKSAPVTSHSVNITGGGEDSTYAFGVSYLDQTGIIGGNI
IDAGYKRLTARMNTEFVLFKNDDHSILTIGENLTYTNSEYRGVATGNIYWNDLHNALVQN
PLMPAYWDKSPDANGFTPTLDGLANDQANPLAVMFYRSNYSNLGNKDNTLVGNVYIELEP
VEDLKFRSSYGLDSWFGHGRSWTPTYALGVLFSNANDGASQYQYLGANLTWTNTLTYERT
FGDHNINALIGNEVYKNQINNSVGGSMANTRFGLPEYAYLNNVDKTDVNSINTFGADYAA
GGGGLLSYIARAQYDYKEKYLLSATMRADGSSNFAKGNRWGYFPSVSAGWILTNEDFLSN
NSGVLDFAKFRGSWGQNGNQSIDNFIYSSNIAYLNPGYYFGDTKPISGATAVPARVTNPD
VTWETSEQLNFGLDARFFNSRLDFTFDWYKKTTKDWLVVAPIQGTSGAGAPYINGGDIEN
TGYELMLSWNDNIGDFKYGATISGAFNKNEITKIANSDGIIQGPSSVLSQGTASVSRAEV
GKPIGFFYGYETDGILQTQDEVDAYVKPTDGTPYFSDQRPGDVRFVDQNQDGVIDESDKK
MLGNPNPDFELGIQLNAEYKGFYANITLSGKYGMQVMQSYRSFADRFDQNYTTEIFGRWH
GAGTSNTLPRLSSVSNRNTNWISDIYMQDADYLRINNLTVGVKLGDYISDIKLFSDIKVY
AAINNLYTFTNYTGMDPEVSFGHDASWASGIDLGLYPLPRTVMFGFSVDF
NT seq
3213 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctaaagttcaaatttttgattatcactttggtaatggtttgcgcccaaaacgttctt
gggcagaccaagaccattacagggctggtgtccgatgagtccggcttgccattaccagga
gtaacggtagttgtactaggaaccgttaatggaaccactacggatttcgatggaaattat
tccattgggaatgtaggacccgaggaccgcttggtttatacctatataggtatggttagc
caaactttaagcgtaggacaacaaaccaccatcaacgtaactttactggaatcttatgag
tctttggaagaggttgttgtagtagggtatggggttcaaaaaaaggctttgactacaggg
gccaatcttaacgtaaaaggtgaagatattgccgagttgaatacatcaaccgctatggag
gcccttcaaggtgttgcacctggtgtaagtgttacaaggaacaatggggagccgggggca
ggtaccaaggttaccattcgtggtctggggacaattggtaattccagtccactctatatt
gtggatggggtagcagtaggcaatattgattatttaaactcttcagatattcagtccatc
gacgttttaaaggatgctgcatctgccgccatctacggatctagagcagccaacggagta
gtattggtaacgacccacaaaggaaggcaaggtagcaaggcgcagatacagtacgattcc
tattacggaattcagaaaatatacaagaatctatcgccattaaatgcccaggaatacatg
tacatcatggacgaaggaagggtaaatgatggtttggagccaaatgattgggaagctatt
ttacagaataataactggctaaataataattatcccaataacttggggaccgaattaggt
tcagaaatatggggcatgctccaaaatggttgggaaggaaccaattggatagatgaaatg
tctaccaaaagtgcccctgtcaccagtcactctgtaaatattaccggtggaggtgaagac
agtacctatgcgttcggtgtttcgtatttggaccaaaccgggattattggaggcaatatt
attgatgcgggctacaaaaggctaactgcccgtatgaatactgaatttgtgcttttcaaa
aatgatgatcatagtatacttaccataggggagaacctaacgtataccaattcagaatat
aggggagtggccacaggaaacatttactggaacgatcttcacaatgccttggttcaaaac
cctttaatgcctgcgtactgggacaaatctcctgatgcaaatgggtttaccccaactttg
gatggacttgccaatgaccaggcgaatccactggcggttatgttttacagaagtaactac
agtaatttggggaacaaggacaatactttggtcggtaacgtttatatagaattggagcct
gtagaagatttgaaatttagatcgtcctacggtttggattcatggtttggccacggacga
tcctggacaccaacctatgccttgggagtgcttttcagcaatgccaacgatggggcgtca
caataccaatatttaggggccaatttaacatggaccaacacattaacctatgaacgtact
tttggggaccacaatataaatgcattgataggtaatgaggtatataaaaatcagatcaat
aattccgttggtggcagtatggccaacacaagatttggattgccggaatacgcatatttg
aacaatgtggacaagaccgacgtaaattccattaatacttttggcgcagactacgcggca
ggaggtggaggattgttatcttacatagcaagggcacaatacgattataaggaaaaatat
ttgttatcggcaaccatgagggcagacggctcctccaactttgccaaaggcaacagatgg
ggttatttcccttcagtatccgcaggatggattcttaccaatgaggattttctatccaat
aacagtggtgttttggactttgctaaatttaggggaagctgggggcagaatggaaatcaa
tccatagataattttatctatagttctaatatcgcatatctaaatccaggatattatttt
ggagataccaaacctatatccggagcaactgctgtccctgccagggtaaccaatccggat
gttacctgggaaacctcagagcaattaaattttggattggatgcaaggttctttaattcc
agactggattttacctttgattggtacaagaaaacaacaaaagactggttggtggttgcc
cctattcaaggtacatcgggtgcgggagcaccgtacattaatggtggtgacatagagaat
acgggttatgaacttatgttgtcatggaacgataacattggcgattttaaatatggggcc
accataagtggagccttcaacaagaatgaaattactaaaatagcaaactcggacggtatt
atacagggaccaagctctgtattgtcacaaggtacagcttcggtttccagagcagaagtg
ggtaaacctatcgggttcttttacgggtatgaaacagatggcattctacaaactcaggat
gaggttgatgcatatgtgaagccaacggatggtactccatactttagtgatcaacgtcct
ggcgatgttaggttcgtagatcaaaatcaggatggggttatagatgagagcgataaaaaa
atgttagggaatcctaatcccgattttgaactgggtattcaactcaatgcggaatacaaa
ggtttctatgccaacattaccctgtccgggaagtatggaatgcaggttatgcaatcctat
agatcctttgccgaccgttttgaccaaaactatactaccgagatatttggacgctggcac
ggtgcgggaacgtccaatacattgcctcgcttaagctcggtatccaacaggaacaccaac
tggatttctgatatttatatgcaggatgcagattacctaagaatcaataatttgactgtt
ggggttaaattgggcgactatatttccgatattaagttattctccgatatcaaggtatac
gccgctatcaacaacttatacacttttaccaattacacgggtatggatccagaagtgtcc
tttggccacgatgccagttgggcctcaggtatagaccttggtctttatcccttacctaga
actgtaatgtttggatttagtgttgatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
