Arenibacter algicola: AREALGSMS7_00653
Help
Entry
AREALGSMS7_00653 CDS
T04973
Symbol
susC
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor SusC
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
aalg
Arenibacter algicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aalg00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
aalg02000
]
AREALGSMS7_00653 (susC)
Transporters [BR:
aalg02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
AREALGSMS7_00653 (susC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASO04140
UniProt:
A0A221US92
LinkDB
All DBs
Position
complement(744753..747794)
Genome browser
AA seq
1013 aa
AA seq
DB search
MMKNCISKLTFLGAILFGSSLLAQNITGVVSDDEGPLPGVNVIIEGTSIGTSTDFDGNYT
ISNVDTNAVLLFSYIGYKTQAIPVNGQTQISVTMSVDANALDEVVLVGYSTLKKSTLTGA
ISVVDVDDLNKARTSNVAQALQGQVAGVQVASSSGAPGGGIQVRIRGVGTIGNNDPLYIV
DGVPSRDITFLNQSDIKTMSVLKDAAAASIYGSRASAGVVLITTKSGSAGKMKLEAEYWY
GVQSASNLPTMLNAEQYINTTEKAWNNTYTGANPYTADRGRADFGDTDWLDELFEGGSSQ
NLQLSASGGSENVQFLTSLGYYGENGIVVYDNDKFRRLNFRSNINADLTDRLKIGTNVQL
SSSTQDKVPSTGESLIRFALLRAPVIPVFKDVNDPTYSERDPFTDMPFFTATGYDQGLNR
TMYEMVGNPIAQAYFSDDQTRIFKTFGNIYGQYSFLKDKELTFRSNVGVDLTFFHDKTFN
ENYGDDDGGGSAIDQGLGRRNRPNNLSERRGESLALTFSNTLNYNKSFGEKHDFSAMVGT
EYVTQTESDIVASRARFPYSIDEFRYLSYGGEGLDENNAGAGTESALFSYFGSTTYSYDN
KYMITANLRADASSRFAENNRWGYFPSVSGGWTLSREDFLSEVDWLSDLKLRASWGQLGN
QNIDNYTYAELIEQTEGIVRKVRYGNPDLKWETTTQANFGIDLGLFNNKVGVTAEYFDKS
TTDILLPIGLPGFLGDLQPTIVNAGEVSNKGFEFSVNFRNSEREFKYNINANLSTVTNNV
EKLHPNVPNIVNNESRTVVGQPLDAYYGYRMEGIYQNQAEIDSHLFLEGNSKPGDIRFKD
INGDGKISPDFDREFIGSSIPDLTYGIFLTGEYKGFDMSMLFQGVEGIDRYNDGKKIIDF
DTRPFNYTTAILGAWDGEGSTNSIPRVAFEDNGSSKVSSIFVEDASYFRLKNIEIGYTID
GVQGFDSARLYISGRNLLTSTNYTGLDPEASDLVDKGTYPLSTSFMFGVNVKF
NT seq
3042 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaaaaattgtattagtaagctaacttttctcggagccattctttttggaagctcc
ctgctggcacaaaacattaccggcgtcgtctcggatgatgaaggtcccctgccaggggta
aacgtaattatagaaggaacctccataggaacttctacagattttgacggcaattacacc
atttcgaatgtggataccaatgcggtattgttgtttagctatataggctataagacccag
gcgattccggtcaatggacaaacccaaattagtgttaccatgtccgtagatgcaaatgct
ttggatgaagttgttcttgtagggtattccactttaaagaaatctactttaaccggggca
atttccgtagtggatgtggatgatttgaacaaagccagaacctccaatgttgcccaagca
ttacaggggcaagttgctggggtacaggttgcctccagtagcggggccccaggtggtggg
attcaagttcgtatccgtggagtaggtactattggaaataacgatccattatatattgtg
gatggggtaccgtctcgggatattacctttttgaaccagtccgatataaaaaccatgtcg
gttttaaaagatgctgcggctgcatccatatacggttcaagggcatctgctggtgttgtc
ctgattaccactaaaagtggttcagcaggaaaaatgaagcttgaggccgagtactggtat
ggtgttcaatccgcttcaaacttacctaccatgctcaatgccgaacaatatataaacact
actgagaaagcttggaacaatacatataccggagcaaatccatatactgcggataggggc
agggcagattttggtgataccgattggctggatgaactcttcgagggaggaagttcccaa
aacctacagttgtctgccagcggaggtagtgaaaatgttcaatttttgacatccttggga
tactatggggaaaatggtatagtggtttatgataatgacaaattccgaagattgaatttt
agatctaatatcaacgccgacctaacggatagattaaagattgggaccaatgttcaattg
tcttcatcaacccaggacaaagttccttctacaggagaaagtttaatacgatttgcgctg
ttaagggctcccgtaatacccgtttttaaagatgtaaatgatccaacctattccgaaaga
gatccttttaccgatatgcctttctttacagctaccggttatgatcaaggattgaacaga
actatgtacgaaatggtcggaaatcctattgcgcaagcttatttttcagatgaccagacg
agaatattcaaaactttcggcaacatatatggtcagtattcttttttaaaggataaagaa
ttaacctttagatccaatgtgggggtagaccttaccttttttcatgacaaaacatttaat
gagaattacggagatgatgatggtggtggaagtgcaatagatcaaggattgggaagaagg
aacaggcccaataatctaagtgaaagaagaggggagtctttggccctaacttttagtaat
accttaaattacaataagtcgttcggtgaaaaacacgacttcagtgctatggtcggtacc
gaatatgttacacaaacagagtcggacatcgttgccagcagggcgcgtttcccatattcc
atagacgagtttagatatttgtcctatggcggagaaggcttggacgaaaataacgcaggt
gcaggtactgaatctgctctgttctcctattttgggtctactacatattcctatgacaat
aaatacatgataaccgccaatttaagagcggatgcctcatcaaggtttgccgaaaataat
cgatggggatattttccatcggtttctggaggttggacactatcaagggaggatttttta
agcgaagtagattggctgtccgatttaaaattaagagctagttggggtcaactggggaat
caaaatatagacaattacacttacgctgaattaatagaacaaacggaaggcattgttaga
aaagtacgctatggtaatcccgatctaaaatgggaaactaccactcaggccaactttgga
atcgacttgggtctttttaataacaaagtcggtgttacagcggaatattttgacaaaagc
acaacggacatattgttacctataggcttacctggtttccttggcgatttgcagccaacc
atagtcaatgccggtgaggtgagcaataagggatttgaattttcagtcaattttagaaat
tcagaacgagagtttaaatataatatcaacgctaacctttcaacagtaacaaataatgtt
gaaaaattgcatccaaatgtgcccaatatagtcaataacgaatccagaacggtagttggt
cagcctttggatgcttattacggatatagaatggaagggatttaccagaatcaggcagaa
atagatagtcatttatttttggaagggaattccaaaccaggggacattaggttcaaggat
attaatggggatgggaaaataagtccggattttgatcgcgaatttataggatcctctatc
ccggatcttacctatggtatcttcctaacaggagaatacaaaggatttgacatgtccatg
ctttttcagggagtagagggtattgacaggtataatgacgggaaaaagatcatagatttt
gatacaaggccttttaattacactacggctattttaggggcttgggacggagaaggcagc
accaatagtattccaagggttgcttttgaggataatggtagtagcaaggtctcaagtatt
tttgttgaagacgcatcctatttccgtttgaaaaatattgaaattggctataccatagat
ggcgttcaagggtttgacagcgcacgactttatatatccggtagaaatctccttacctct
accaattatacaggtttggatcccgaagcatcggatttagtagataagggtacctaccca
ctttctacatccttcatgtttggtgtaaacgttaaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system