Arenibacter algicola: AREALGSMS7_00940
Help
Entry
AREALGSMS7_00940 CDS
T04973
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor SusC
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
aalg
Arenibacter algicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aalg00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
aalg02000
]
AREALGSMS7_00940
Transporters [BR:
aalg02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
AREALGSMS7_00940
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
MetallophosN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASO04418
UniProt:
A0A221UT89
LinkDB
All DBs
Position
1087561..1090707
Genome browser
AA seq
1048 aa
AA seq
DB search
MKITLGKCLLLAGAFLCFGLAGAQTVTGNVSDGSGPLPGANVLVKGTTNGTQTDFDGNYS
LDNVSSNATLVFSYIGFKTMEIGVNGRTTVDAVMEEDASELEEVVLIGYGSQRKSDLTGA
VGQVDADQLQERPATSLNQALSGKIAGVQVNTNSGRPGGKSNIRVRGFSSINSSNNPLYV
IDGVQLPQGNQANFSSAIDYLNPNDVVSIEVLKDASSTAIYGARGANGVILVTTKRGRAG
QGRVTYDVEYSVNQFGPNRAKVLNSEQYAMIEQLSWENTQKFDPDGWAAGKYAQYEPRLK
RANPNVAYLFDSDGKAIYDTDWSKEVVQHKLSQNHQVGFSGGNERTTYAISLGIRDEQGL
LKNTYLKRYSGRFSIDDQIKTWLKIGGSLSYNNQTENLADTNDQVPRRMVEDYPFYPAPF
HTGGPLEGLYANNRDYPYAEGTRNSVNWLDNNEYILNTQTTAGSFYTNLNFTKELEMRTV
IGANILTQENNEFRNSVLDNNAVARAQASNEKQTFWSIENYLTYNKKINENNSLTALLGV
SWQQSNEFFVNADSRNFPTDFFQFNNLGAGSDNIAVQSNANREALNSYFGRLNYNLYGKY
LFTVTGRADGSSKFGDNNKFSFFPSAAVAWRISDEDFLVDNALISNLKLRTSYGVTGNSE
IPPYSSLSLLSSNYATIWNDSRVGGTGLNRLANPDLKWEKTAQYDVGLELGLFDNRISLE
ADYYYRKTTDMLLDAPVPQSSGYATIRRNVGSMENKGLELGLSTKNIATANVTWNTNFNI
SMNRNKVLSLATPSDIFGVGGPGITNETSIIRVGEPVGAFWGLTRLGTWGTDEAAEAAKF
VSYRNGLTILPGDIKYKDFNGDYIINDEDRSIIGNGYPTAWGTLTNYVSYKNIDFTLELQ
YSWGNDVMDMNLHSSEDRQALANSYTTVLDAWTPDNQDTMIAQVRDTRAGYVTNVDSHWV
KDGSFVRGRNIMLGYTFDQNLVESMHLNKLRLYASAQNFFLLVDDELLGDPEVTPIRGGE
GNNVFSQGMKWHEYPKSTTFVIGLQVGL
NT seq
3147 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagattacactaggtaaatgcctattgctggcgggagcatttttatgtttcggtctg
gcgggggcacaaacagtgacaggaaatgtttcggatggatccggacccttgcctggggcg
aacgtgttggtaaaaggtacaaccaacggaacccaaacagattttgacggtaactactca
ttggacaatgtaagtagtaacgccaccttggttttcagttatattggtttcaaaaccatg
gaaattggtgtaaacggaagaacaacagttgacgccgttatggaagaagatgccagcgaa
ctggaggaagtggtattgatcggttacggtagtcagcgaaaatcggaccttaccggtgcc
gtagggcaagtagacgccgatcagcttcaggaacgtcctgccacatccctaaatcaagcc
ttatcaggtaagattgccggggtacaggtgaacaccaactcgggtcgcccaggtggtaaa
tccaacattagggttaggggttttagttctataaactcttccaataacccgctatacgtt
atagatggggttcagttacctcaaggtaatcaagctaactttagttcggctatagattat
ctaaacccgaatgatgtagtgtctattgaagtattaaaagatgcttcctcaactgctatc
tacggtgcccgaggtgccaatggtgttattctggtgaccactaaaagaggtcgcgccgga
cagggtagggttacttacgatgtggagtacagtgtaaaccaatttggtcccaatagggcc
aaggttttaaattccgagcaatatgccatgatagaacaactttcatgggaaaacacacag
aaatttgaccctgacggatgggcagcaggaaaatacgcccagtatgagccaagactaaaa
agagcaaatcctaatgtggcttatctttttgatagtgacggcaaggcaatctatgatacg
gattggtccaaagaagtggtacaacataaattatcacaaaaccatcaggtgggcttttca
ggcggtaatgaaagaacaacatatgccatctcccttggtattagggatgaacaaggtctt
ttgaaaaacacatatctaaagcgctattcagggcgtttttctattgatgatcagattaag
acctggttaaagatcggaggttccctaagctataataaccagacagagaatttggccgat
accaatgaccaagtgccacgtagaatggtggaagattatcctttttaccccgctcctttt
catacgggagggcccttggaaggcttatatgcaaataacagggattatccctatgcagaa
ggtacccgaaattccgtgaactggcttgataacaatgagtatattttaaatacccaaaca
acggccggaagtttttataccaatcttaactttaccaaagaactggaaatgagaactgta
atcggtgccaatatccttacccaggaaaacaatgaattccgaaacagtgtactggataat
aatgcggtagccagggctcaagcgagcaacgaaaagcagacgttttggtctattgaaaac
tacttgacctataacaaaaaaatcaatgagaacaattccttgaccgctttattgggagtg
tcttggcaacaatccaatgagttctttgtaaatgctgattccagaaacttccctacagat
ttctttcaatttaacaacttgggtgcaggatcggataatatagcagtacaatccaatgca
aatagggaagcattgaattcctattttggacgattgaattataatctctatggcaagtat
ctatttacggttacgggtagggcagatggttcctcaaaatttggggacaacaataaattt
tcctttttcccctcagcagcagttgcctggaggatttcggacgaggattttcttgtagac
aatgcccttatttccaatttaaaacttagaaccagttatggggttacaggtaactctgaa
ataccaccctattcttccttgtctcttttaagctctaactacgctacaatatggaacgat
agccgtgttggtggaaccggtctaaatcgattggcgaatccagatttgaaatgggaaaag
accgcgcagtatgatgttgggttagaattaggtttatttgacaatagaattagcttagaa
gctgattattactacaggaaaaccacagatatgcttttggatgcccctgtaccacaatcc
agtgggtatgctaccattaggagaaatgtagggtccatggagaacaaaggtcttgaacta
gggctttccacaaagaacatagccacggcaaatgtaacatggaataccaactttaatatt
tccatgaacagaaataaagtactttccttggctacaccatccgatatctttggtgtaggt
ggacctggaataaccaacgaaaccagtataattagggtaggtgagccagtaggtgcgttc
tggggccttacccgtttgggaacttggggtacagatgaggccgctgaagccgctaaattt
gttagttatagaaacggacttaccattttacctggagatataaagtataaggattttaat
ggggattatattattaatgatgaggataggtccattataggaaacggttacccaacagca
tggggaacacttaccaactatgtttcctataagaacatagattttaccttggaacttcaa
tattcatggggtaacgatgtcatggatatgaacctgcactccagtgaggataggcaggcg
cttgccaatagttacactacagtattggatgcctggacacccgataatcaagacaccatg
attgcccaagttagggatacacgagctggctatgtgaccaatgtggattcgcattgggta
aaggatggttcctttgttcgtggtaggaatattatgttaggatatacttttgatcaaaat
ttggttgagagtatgcatttgaataaattgagactgtacgcttcggcacaaaatttcttt
ttattggtagatgatgaactacttggagatcccgaggtaacccctattcgtggtggtgag
ggcaacaatgtcttctctcaaggaatgaagtggcatgaatatcccaaatcgacaacattc
gttattggtctgcaagtcggtctgtaa
DBGET
integrated database retrieval system