Arenibacter algicola: AREALGSMS7_03286
Help
Entry
AREALGSMS7_03286 CDS
T04973
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor SusC
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
aalg
Arenibacter algicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aalg00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
aalg02000
]
AREALGSMS7_03286
Transporters [BR:
aalg02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
AREALGSMS7_03286
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarbopepD_reg_2
Plug
STN
CarboxypepD_reg
CooC_C
FecR_C
DIX
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASO06711
UniProt:
A0A221V0P5
LinkDB
All DBs
Position
3875581..3878940
Genome browser
AA seq
1119 aa
AA seq
DB search
MKKPPKSGVIIPWRLKFDLKMKLSLLFLITVSFIMQANSSYSQKTKISLDLGNATMEEVI
DEIEANTEFKFIFNTKTVDLNRRVSINVRKATIKRVLEILFTNKDIVYAIEDRKILLKRK
ETTIGVLSAPSSNVNVKSIQFQLSGSISDSEGQPLPGASIVEKGTSNGTQSDFDGNYTME
VANGNAVLVVSYIGYATKEISLNGQSVLDIVLEESAAGLEEVVVVGYGTMKKADLTGSVS
QVKTETLEAVPVYNMEQALKVGAAGVRVSQNSGTPGSRIEVRIRGGNSMIGDNQPLYVVD
GFPVTGGIDFLNPSDIESVDILKDASATAIYGSRGANGVVIITSKRGAKGQDSKIEINSF
FGNQEAINRYDLLDAQEYAIIANEWLKNEGLDPFFDPNTVVNPGTDWWDAVFRVAPVTNN
TITFSGSSEKGRYSISGNYYDQEGIIENSGVVRGSVRLNLDQQLKSWLKMGVNLQLSRNE
QNLVSVDNGNRGNSLLSAAASAPPTLPIYDENGLPTQIEQAYNFGSADMRNPIIWTLRKN
QNFANSVLANTNLDIAFTPELSFKTLVGLQYQDGRNETFIPIIYGNDRGSASESNSYSNS
FLTENVLTYSKVFNEKHSVNVIGGATYQTNISRNSGISVSGFANNVTENYELAAAESVGN
PFSGYTDWTLASFLSRVNYSFDGKYLFTASIRADGSSRFGDNHKWGYFPSGAIAWRISDE
PFLKESEVVNNLKLRASYGITGNTALNPYQSLDRLGSVKYIYGNQTDVIGFVPSGISNSD
LKWETTGQLDVGFDLNILNDRLRFVFDYYKKNTKDLLASVPLPPSVGFGSILRNLGEIQN
SGIELSVDADILRGDFKWDISTQFSANKNEVMELAGDSDIFGAEQGAVWPSANIARVGEP
LGAFYGLLEDGLDENGFIKYQDLSGPDGVPDGVVNALDRVILGSYHPDFIYGLTSNFSYK
GIELNISLEGVQGNELFNATNGTHLNSFQRGNNQFRDILGNYWTEENPDPNAKYPKISSA
TQITVSDRFIEDASYLRIRSLRLAYNLPVQQIGLTGFDMAQIYLSGTNLFTFTSYTGLDP
EANTRGTDSSNVADRLRFGHDQSSYPNAKIYAIGLKFRF
NT seq
3360 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaccaccaaagtctggggtaattatcccatggcgcttaaaatttgatttaaaa
atgaagttgtcacttctttttttaataaccgtatcctttataatgcaggccaattcgtcc
tattcccagaaaaccaaaatatccttggatttgggaaacgccactatggaggaggtcatt
gatgaaatcgaggccaatactgaattcaagtttatttttaatactaagacggttgattta
aatcgtagagtttctattaatgttaggaaagctacaattaaaagagttttggagatactc
tttacaaataaagatattgtatatgccatagaggatcgcaaaattcttttaaaaaggaag
gagaccacaattggggttcttagtgctccatcttccaatgttaatgtgaaaagtatacaa
tttcagctaagtggaagtataagtgatagtgaaggacagcctttaccaggtgcaagtatt
gttgaaaaaggcacttctaatggaacccaatccgattttgacgggaattatactatggag
gtagcaaatgggaacgctgtactagtagtatcttatattggttatgctaccaaggaaata
tcccttaatgggcagtccgtactcgatatagttttggaagagagtgctgcaggtttggaa
gaagttgtggttgttggctacggtacaatgaaaaaggccgatttaacaggctctgtatcc
caagtgaaaacggaaacccttgaggctgtccccgtatataatatggagcaagctttaaaa
gttggcgctgcaggtgttcgggtatcccaaaactccggtactccgggatcaaggatcgag
gttaggataagaggtggcaattctatgattggggataaccaacccttatatgttgttgat
ggtttccctgttacgggaggtatcgattttttgaacccatctgatattgaatctgtagat
attttaaaggatgcttcggccactgctatttatggttcaagaggagccaatggggtagta
attattacttctaaacgaggagcgaaaggacaggatagtaaaatcgaaataaatagtttt
tttggtaatcaggaggcaatcaaccgttatgacttactggatgcacaagaatatgccata
attgccaacgaatggttgaaaaatgaaggtttggatcccttttttgacccgaacacggtt
gtaaatccaggtacagactggtgggatgctgtttttagggtagctccagttacaaacaat
accattacattttctggcagttctgaaaaaggaaggtattctatttcaggtaattactat
gatcaagaagggattatagaaaattctggtgtcgttaggggatcagtaagattgaacttg
gaccagcagttaaaaagctggttaaaaatgggtgtcaatcttcaattatcgaggaatgag
cagaatttagtttcggtggacaatggtaaccgtgggaattctttgctttcggctgcagcc
tcggccccgccaactttaccgatttatgatgagaacggcttgcctacacaaattgaacag
gcctataatttcggatccgcagatatgcgtaatccaatcatatggacgcttagaaagaat
cagaattttgccaatagtgttttagcgaatacaaatttagatattgcttttactcctgaa
ttatcgtttaagaccttggttggcctacaatatcaagatggaagaaatgaaacgttcata
cctattatctacggtaatgatagaggctcggcctctgaaagcaattcctattcaaattca
ttcctaacggagaacgttcttacctattccaaggtttttaatgaaaaacatagtgtaaat
gttataggtggagctacataccaaaccaatataagtagaaattctggcataagtgttagt
ggttttgccaacaatgttacggagaattatgaattggccgctgcggaatcagtaggaaat
cctttctcgggatatacggactggaccttggcctctttcctttctagagtaaattattcc
tttgatggaaaatatttgttcactgctagtataagggcagatggttcttcaagatttggc
gataaccataaatggggatattttccttctggggccatagcttggaggatatccgatgaa
ccttttcttaaagaaagtgaagttgtcaataatttaaaattacgtgccagttatggtatt
acaggaaatacggcactaaatccatatcaatccttagataggctcggttctgttaaatat
atatatggaaatcagacagatgtcattggattcgtgcccagtggaatttcaaatagtgat
ctgaagtgggaaaccacgggtcagttggatgtgggttttgatttaaatatcttgaacgat
aggctacgttttgttttcgattattacaaaaagaatactaaggatttgttggcatctgtg
ccacttccaccctcagtaggttttggatctatacttagaaatttaggcgagatacagaat
tctggtattgaattgagtgtagacgccgatatactcaggggagattttaaatgggatata
tcaactcaattctcagcaaacaaaaatgaggtaatggaacttgcaggggacagcgatatt
tttggagctgaacagggcgcagtttggccaagtgccaacatagctagggtaggtgaacct
ttgggagcattctatggtctgctagaggatggtttggacgagaatggttttataaagtat
caggatcttagtggtccggacggagtaccggatggtgtggtcaatgctttggaccgggtt
attctgggcagttaccaccctgattttatatatggtctaacttcgaactttagttataaa
ggtatagaactcaatatttctttggaaggggtacaaggaaatgaattgtttaatgccacc
aatggtactcatctaaattcgtttcagagaggaaataatcaattcagggatatattaggc
aattactggacggaggaaaatcccgatccgaatgcaaaatatcctaaaataagtagtgct
acgcagataactgtgtccgatcgtttcattgaagatgccagttatttaaggattcgctca
ttaaggttggcatataatttaccggtacagcaaattggattgactggttttgatatggcc
caaatatatctatcgggaacaaacttgttcacgtttaccagttatactggacttgatccc
gaagcaaatactcgtggtaccgactcaagcaatgtggcagatcgattaaggttcggacat
gatcaaagtagctatccaaatgcaaaaatttatgccattggtttaaaatttagattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
