Advenella alkanexedens: Q3V95_04490
Help
Entry
Q3V95_04490 CDS
T09248
Name
(GenBank) YadA-like family protein
Organism
aaln
Advenella alkanexedens
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_stalk
YadA_anchor
ESPR
YadA_head
Hemagglutinin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WKU20299
LinkDB
All DBs
Position
951703..954897
Genome browser
AA seq
1064 aa
AA seq
DB search
MNHIYKSVWNEHTGAYVAVSEKTRTKGKRSGSILFKTVAAGILGFCLTGGVANAQSNPNI
NNVSNLSTTGALSPVMNILGGLTGSQGGAATNLLGGLLDPVLGLVGGLAGGNGGLLGGGN
AGAGAITDVQGTVDRLVNNTALTPVGGLVNGLVDPQTGVLAPVTGLVNGLTSATGPLAPV
GGLVNGLVGDQGALTPVVGTVNNLLGSLTGGGQSGGLLGGGQGGGLLGGLLGGGQSGGQS
GGLLGGLLGGGNAGTGVITDVQGTVDRLVNNTVLTPVGGLVNGLVDPQTGVLAPVTGLVN
GLTSATGPLAPVGGLVNGLVGDQGALTPVVGTVNNLLGSLTGGGQSGGLLGGLLGGGQSG
GLLDGLLGGGQSGGLLGGLLGGGQSGGQSGGLLGGLLGGGQGGGLLGGLLGGGQSGGQSG
GLLGGLLGGGQGGGLLGGLLGGGQGGSGSVLDLSTGIVLPQSQLGNTLDTVLTPILKPVE
GLVNSLLGALSPVLNPVLGVVNGITGGLGIELPKDLHLDLVDDLSLALQGKQPLDLSLLG
SDGNILGLITPAAPPVPGTPIPAPAVGEIAIGGGEINGLGTGAIATANGAGAMAIGDGAK
ASGALTTALGTGAAATAEATVALGGAASAAKAGATAIGSGASAAGEGSIALGLGALATVN
NSVAIGALAQATATNAVALGRGSVADEDNTVSVGSVGNERRITNVANGTKHSDAATVGQL
TPVINALGGGANIALNGTVTGPTYNGFSDTSKSFTDVGSALYYLDTRVTDLENNVVGGNN
LVQQDAVSRDITVGKDTDGSVVNFQNKDSQARKLTGVAAGAVNATSTDAINGAQLHATNQ
SIADALGGNTVVNIDGSITGTTYNINEITQGGIVNNNYTNVGDAFNSVSNSVTNLYNQVN
DGKIGLVQQASPNAAITVGKSTGGNEVNFRNESGEARRLTGVAEAVDGTDAVNLDQVTRM
VQGATPADLTEVRNDISSLRGDVRRVEKRADAGAATAMAVAGLPQAYLPGKSMVSMAGGV
YASESGYALGASTVTENGKWVLKGSVAGSSRGQMGATIGAGYQW
NT seq
3195 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaccatatttacaagtctgtttggaatgaacatacaggcgcctacgttgccgtatct
gaaaaaaccagaacgaaaggaaagcgtagcggcagtattcttttcaaaacagtggctgct
ggtattctgggattttgcctcacaggcggtgtggccaatgcacagtcaaatccaaacatt
aataatgtttccaatctgtccacgacaggcgctctttcacccgtaatgaatattctcggt
ggcctaaccggttctcaggggggggcagccaccaatctgcttggaggcttgcttgatcca
gtactgggtctggtgggtggattggcaggcggtaatggcggtttgttaggtggtggcaat
gccggtgctggcgcaattaccgatgttcagggaacggttgatcgcttggtcaataatacg
gcactcacaccggtgggtggattagtcaatggtttggttgatccgcaaaccggcgtcttg
gcaccggttaccggtctggtcaacggcttgacatctgcgactggtcctttggcgcccgtg
ggtggtttggtgaatgggctggttggtgatcagggagcattgacgcctgttgttggtacc
gttaataatctgttaggcagtctgacaggcggtggccagtctggcggtttgctaggcggt
ggtcagggtggcggtttgcttggtggcttgctgggtggaggccagagtggcggtcagtct
ggtggcttgcttggcggtttgttaggtggtggcaatgccggtactggcgtaattaccgat
gttcagggaacggttgatcgcttggtcaataatacggtactcacaccggtgggcggatta
gtcaatggtttggttgatccgcaaaccggcgtcttggcaccggttaccggtctggtcaac
ggcttgacatctgcgaccggtcctttggcgcccgtgggtggtttggtgaatggcctggtt
ggtgatcagggagcattgacgccagttgttggtaccgttaataatctgttaggcagtctg
acaggcggcggccagtctggtggtttgcttggtggtttgctgggcggaggccagtctggt
ggtttgcttgatggtttgctgggtggaggccagtctggtggtttgcttggtggtttgctg
ggcggaggccagagtggcggtcagtctggtggtttgcttggcggtttactaggtggtggt
cagggtggcggtttgcttggtggtttgctgggcggaggccagagtggcggtcagtcaggt
ggtttgcttggcggtttgctgggtggtggtcagggcggtggtttgcttggcggcttgcta
ggcggtggtcagggtggctcaggcagtgtgcttgatctgtcgacaggcattgttttgcct
cagagccagcttggcaatacactggataccgtattgacgcccattttgaaacctgttgaa
ggtttggttaattcgctgttaggtgccttgtcgccagtgctcaatcctgtgttgggtgtg
gttaatggtattacaggtggtctgggtatcgaattgccaaaagatttgcatctggacctg
gttgatgatttgtcgttggcattgcagggcaaacagcctctggatctgtcattgcttggg
tctgatggtaatattttaggactgattacgcctgccgctccacctgttcccggcacacca
atcccagctcctgctgttggtgaaatcgcaatcggtggtggagagataaacggtttgggt
accggtgctattgctaccgctaatggtgcaggcgccatggcgattggtgatggagccaag
gccagtggtgcattaacgaccgctttgggtacaggcgcagcggctacggctgaggctact
gtggccttgggtggtgccgcttctgcggcaaaggctggcgctactgctataggctctggt
gcttctgccgcgggagagggttctatcgctttaggtttaggtgctctggcgacagtcaat
aactctgtggcgatcggtgcgcttgctcaagcgacagcaacaaatgctgttgccctgggt
agaggctctgttgccgatgaggataataccgtttcagtcggttcagtgggtaatgagcgt
cgtatcactaatgtggcgaacggtaccaagcacagtgatgccgctaccgttggacaattg
acaccagttattaatgcattgggtggtggtgccaacatcgcgctaaacggtacagtgacc
ggccccacttacaatggtttctctgataccagcaagtcatttactgacgtgggaagtgcc
ttgtattacctagatactcgtgttaccgaccttgaaaataacgttgtgggtggcaataat
ctggtacagcaagatgctgtttcaagagatattactgtcggtaaagataccgatggcagt
gtggtgaactttcagaataaagacagccaggcccgtaagttgactggcgtggcagcgggt
gcagttaatgcaacaagtaccgatgctatcaacggtgctcaattgcatgcgaccaatcaa
tccattgccgatgcgctgggtggaaatacagtagttaatattgatggttccattactggc
accacctacaatatcaatgagattactcaaggtggtattgttaacaataactacactaat
gttggagatgcttttaacagcgtcagtaattccgtaaccaatctatataatcaggttaat
gatggcaagattggtctggttcagcaggcaagtcccaacgcagccattaccgtaggtaaa
tctacaggtggcaacgaggttaatttcaggaatgaaagtggtgaggcccgtcgcctgacc
ggtgttgctgaagcggttgacggaaccgatgccgtgaacctggatcaggttacccgtatg
gttcagggtgcaacacccgctgatttaaccgaagtacgtaacgacatctcatccctgcgt
ggtgatgtccgccgtgttgaaaaacgtgctgatgccggtgccgcaactgccatggcggtt
gcaggcctgccgcaggcttatttgccaggcaagagcatggtgtccatggctggtggtgtt
tatgcctctgagtctggttatgctcttggcgcatctacggttaccgaaaacggtaagtgg
gtacttaaaggcagcgtggccggctcttcacgcggccaaatgggtgcaaccattggtgcc
ggttatcagtggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
