Asterias amurensis (Northern Pacific seastar): 139938014
Help
Entry
139938014 CDS
T10870
Name
(RefSeq) uncharacterized protein isoform X1
KO
K02599
Notch 1
Organism
aamu Asterias amurensis (Northern Pacific seastar)
Pathway
aamu04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aamu00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
139938014
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
HYR
Reeler
EGF_2
EGF_3
EGF_CA
EGF_Teneurin
MAP17
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
139938014
NCBI-ProteinID:
XP_071789465
LinkDB
All DBs
Position
6:12184710..12247796
Genome browser
AA seq
2181 aa
AA seq
DB search
MEYKDLIYSVLVLFLVLRSGTCRSTGAPSQACSSLTPSHSGSSQPSSTSPYQLELVSGNT
YAAGGTVTVRLSANPSTTTFKGVIMQARQVTDGSVVGSWQLSGSDYQHLACPGDTDGQGT
ITHTDGQLVKTLPVTFTWNAPVQLVGDLEFQFSVVQEYVTYWTNMKSSIAASSTPPCLSN
PCLNGATCFTGTNSYVCSCTAGFTGTNCQTATNPTPPCLSDPCQNGATCLPGTNSYTCVC
DAGFTGINCQTASSTPPCLSNPCLNGATCLTGTNSYVCSCTAGFTGTNCQTATNPTPPCL
SDPCLNGATCLTGTNSYVCQCAAGFTGTNCQTASSTPPCLSNPCLNGATCFTGTNSYVCS
CTAGFTGTNCQTATNPTPPCLSDPCQNGATCLPGTNSYTCVCDAGFTGINCQTASSTPPC
LSNPCLNGATCLTGTNSYVCSCTAGFTGTNCQTATNPTPPCLSDPCLNGATCLTGTNSYV
CQCAAGFTGTNCQTASSTPPCLSNPCLNGATCFTGTNSYVCSCTAGFTGTNCQTSSPTPC
ISNPCQNGATCSPGTNSYTCVCDAGFTGINCQTASPTPPCLSDPCQNGATCLPGTNSYTC
VCDAGFTGINCQTASSTPPCLSNPCLNGATCLTGTNSYVCSCTAGFTGTNCQTATNPTPP
CLSDPCLNGATCLTGTNSYVCQCAAGFTGTNCQTATSPTPPCLSDPCLNGATCLTGTNSY
VCQCAAGFTGTNCQTASPTPPCLSDPCLNGATCLPGTNSYVCSCTADFTGTNCQTASPTP
PCLSNPCLNGATCLTGTNSYVCSCTADFTGTNCQNSLDSTPPVVTCSADFSSDVPIGSSG
KQESWALPTATDNSGSVFFVSSTHNPNDFFPVGETTIMYTYRDASNNINTCSFTLTIVEV
TSPTPPCLSNPCLNGATCLTGTSSYVCSCTAGFTGTNCQTASPTPPCLSNPCQNGATCLT
VTNNYVCSCTAGFTGTNCQTASPTPPCLSNPCLNGATCLPGTNSYVCSCTADFTGTNCQN
SLDSTPPVVTCPADFSSEVPIGSSGKQESWALPTVTDNSGSFFYVSSTHNPNDFFPVGET
TIMYTYGDASSNINTCSFTLTIVAVTSPTPPCLSNPCLNGATCLTGTSSYVCSCTAGFTG
TNCQTASPTPPCLSNPCQNGATCLTVTNNYVCSCTAGFTGTNCQTASPTPPCLSNPCLNG
ATCLPGTNSYVCSCTADFTGTNCQNSLDSTPPVVTCPADFSSEVPIGSSGKQESWALPTV
TDNSGSFFYVSSTHNPNDFFPVGETTIMYTYGDASSNINTCSFTLTIVADSGNVCSSSPC
LNGGFCTNSAAGTYSCTCLFGYSGVRCETPNIDPCLSSPCVNGLCLKSSTSISYVCLCDT
GYTGARCDTPTAGACSSNPCLNGGTCVTSSPTTYTCLCLTGYSGTTCQVQSSDPCLSSPC
VNGRCLRSSSTYSFVCLCSDGYIGDRCDILLDPCLSSPCVNGRCMRSSSTYSFFCACDDG
YQGERCDVLRDPCLSSPCVSGVCLKSSTSFSYACLCNNDYTGTRCEIPPGSCDSSPCKNN
ANCITLPGNSIFCECFNGYTGTYCEVVPDLCSVQPCENGGTCYQLSDFHYRCVCANGFSG
LNCGIPSDVCVSAPCKNGATCVNESPLYTCICTAAYIGQDCSTPAGSRCDSDPCMNGGTC
EPNMAEDSYNCRCLQGFTGDNCQTSVDLCSPSPCKNGATCEVSGTNVSCICPMGFSGETC
EMSTPDPCASSPCDNGATCVLNQSDSFICNCPQGFSGDLCEMIVSICQSGPCMNGGTCEA
SGSGYVCTCAPGYMGTMCELYKPCTSSPCLNNGTCNEDNTDPDGYTCVCPRMYTGNNCES
PMECPMQYCSNGGTCTVVYQPDDTETYECACPNTHSGDRCDTDRCSNYCLNGGTCSVSDT
LVVTCQCQMGFFGDKCEDTAPATCATMPCENGATCMDVMGSAKCMCPNGFSGVYCQTDHC
QLVNCMNGGTCVLNNTNTAECLCPDGFTGGTCQNVINFCSPEPCKNGATCLNLQTNYTCA
CLSTFTGRTCETQVGLCGNLNGRCMHGAMCDAANNRCICEMGYLGTLCEEDVNECASNPC
QNNGVCVNRANRFDCACKAGFTGSTCEKAENPGNKATTAQMVLEPWWIALIALIGVLFVI
FLIIVICTMNRTHDDVKKPII
NT seq
6546 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagtacaaagatttgatatactctgttttagtgctttttctggtccttcggagtggt
acatgtcgatcgactggagcaccaagtcaggcctgttcatctctgacgccaagccattct
ggatcctcacagccaagcagtacaagtccgtaccaactagagctggtttctggcaatacc
tatgctgcaggaggaacagtaacagttcgtcttagcgccaaccctagcacgaccaccttc
aagggcgtcatcatgcaggcccgccaggtcactgatggttctgtcgtgggttcttggcag
ctatcaggcagcgattatcagcaccttgcatgcccaggagataccgatggtcaagggact
atcacacacacagacggccagctcgtcaagacactgccggtaacattcacttggaatgct
ccagttcagctagttggtgatctggaatttcagttttcggttgtccaggaatacgtaacg
tactggacaaatatgaagtcctccatcgctgcaagttcaacacctccatgtctttcaaac
ccatgtctgaatggggcaacatgttttactggaaccaatagctatgtctgttcatgcact
gcaggttttactggaacaaactgtcaaactgcaacaaacccaacacctccttgtctttca
gacccatgtcagaatggggcaacatgtttaccaggaaccaatagctatacctgcgtttgt
gatgcaggctttactggaataaactgtcaaactgcaagttcaacaccaccatgtctttca
aacccatgtctgaatggggcaacatgtttgactggaaccaatagctatgtctgttcatgc
actgcaggttttactggaacaaactgtcaaactgcaacaaacccaacacctccttgtctt
tcagacccatgtctgaatggggcaacatgtttgactggaaccaatagctatgtctgtcaa
tgtgctgcaggcttcactggaacaaactgtcaaactgcaagttcaacacctccatgtctt
tcaaacccatgtctgaatggggcaacatgttttactggaaccaatagctatgtctgttca
tgcactgcaggttttactggaacaaactgtcaaactgcaacaaacccaacacctccttgt
ctttcagacccatgtcagaatggggcaacatgtttaccaggaaccaatagctatacctgc
gtttgtgatgcaggctttactggaataaactgtcaaactgcaagttcaacaccaccatgt
ctttcaaacccatgtctgaatggggcaacatgtttgactggaaccaatagctatgtctgt
tcatgcactgcaggttttactggaacaaactgtcaaactgcaacaaacccaacacctcct
tgtctttcagacccatgtctgaatggggcaacatgtttgactggaaccaatagctatgtc
tgtcaatgtgctgcaggcttcactggaacaaactgtcaaactgcaagttcaacacctcca
tgtctttcaaacccatgtctgaatggggcaacatgttttactggaaccaatagctatgtc
tgttcatgcactgcaggttttactggaacaaactgtcaaacttcaagtccaacaccttgt
atttcaaacccatgccagaacggagcaacttgctcaccaggaaccaatagctatacctgc
gtttgtgatgcaggctttactggaataaactgtcaaactgctagcccaacacctccttgt
ctttcagacccatgtcagaatggggcaacatgtttaccaggaaccaatagctatacctgc
gtttgtgatgcaggctttactggaataaactgtcaaactgcaagttcaacaccaccatgt
ctttcaaacccatgtctgaatggggcaacatgtttgactggaaccaatagctatgtctgt
tcatgcactgcaggttttactggaacaaactgtcaaactgcaacaaacccaacacctcct
tgtctttcagacccatgtctgaatggggcaacatgtttgactggaaccaatagctatgtc
tgtcaatgtgctgcaggcttcactggaacaaactgtcaaactgcaacaagcccaacacct
ccttgtctttcagacccatgtctgaatggggcaacatgtttgactggaaccaatagctat
gtctgtcaatgtgctgcaggcttcactggaacaaactgtcaaactgctagtccaacacct
ccttgtctttcagacccatgtctgaacggggcaacatgtttaccaggaactaatagctat
gtctgttcatgtactgcagactttacaggaacaaactgtcaaactgctagtccaacacct
ccttgtctttcaaacccatgtctgaacggggcaacatgtttaactggaactaatagctat
gtctgttcatgtactgcagactttacaggaacaaactgtcaaaattcgttggattcaaca
ccaccagtagtaacttgttcagctgactttagttctgatgttccaattggtagttctggc
aagcaagagtcgtgggctctaccaacagcaactgacaactctggaagcgtctttttcgtg
tcaagcacgcacaatcctaacgactttttccctgttggtgaaaccacaataatgtacaca
tacagagatgcttccaacaacatcaatacctgcagttttactctaacgattgttgaagta
acaagcccaacacctccttgtctttcaaacccatgtctaaatggggcaacatgtttgact
ggaaccagtagctatgtctgttcatgtactgcaggctttacaggaacaaactgtcaaact
gctagtccaacacctccttgtctttcaaacccatgtcagaacggggcaacatgtttgact
gtcaccaataactatgtctgttcatgtactgcaggctttacaggaacaaactgtcaaact
gctagtccaacacctccttgtctttcaaacccatgtctgaacggggcaacatgtttacct
ggaactaatagctatgtctgttcatgtactgcagactttacaggaacaaactgtcaaaat
tcattggattcaacaccaccagtagtaacttgtccagctgactttagttctgaggttcca
attggtagttctggcaagcaagagtcatgggctctaccaacagtaactgataactctgga
agcttcttttacgtatcaagcacgcacaatcctaacgactttttccctgttggtgaaacc
acaataatgtacacatacggagatgcttccagcaacatcaatacctgcagttttactcta
acgattgttgcagtaacaagcccaacacctccttgtctttcaaacccatgtctaaatggg
gcaacatgtttgactggaaccagtagctatgtctgttcatgtactgcaggctttacagga
acaaactgtcaaactgctagtccaacacctccttgtctttcaaacccatgtcagaacggg
gcaacatgtttgactgtcaccaataactatgtctgttcatgtactgcaggctttacagga
acaaactgtcaaactgctagtccaacacctccttgtctttcaaacccatgtctgaacggg
gcaacatgtttacctggaactaatagctatgtctgttcatgtactgcagactttacagga
acaaactgtcaaaattcattggattcaacaccaccagtagtaacttgtccagctgacttt
agttctgaggttccaattggtagttctggcaagcaagagtcatgggctctaccaacagta
actgataactctggaagcttcttttacgtatcaagcacgcacaatcctaacgactttttc
cctgttggtgaaaccacaataatgtacacatacggagatgcttccagcaacatcaatacc
tgcagttttactctaacgattgttgcagactctggaaatgtatgcagttccagtccgtgt
ttgaatggaggtttttgtactaattctgctgctgggacgtactcttgtacctgcctattt
ggctactctggggtcagatgtgaaacaccaaacatagatccttgtctgtctagcccttgt
gtaaatggactgtgcttgaaatcctcgacatcaatctcctatgtctgtctttgtgatacg
ggttacactggtgcaagatgcgatacacctacagctggagcttgtagttccaatccctgt
ttgaacggaggtacctgtgtgacctccagtcctacaacctatacatgtctctgccttact
gggtattcagggaccacatgtcaagtacaatcttcagatccttgtctttctagcccttgt
gtaaatggaagatgcttgagatcgtcgtcaacttattcatttgtgtgtttgtgcagtgat
ggttacataggtgacagatgtgacatcctattagatccttgtctttctagtccttgtgta
aatggcagatgcatgagatcgtcgtcaacttattcatttttttgcgcttgtgatgacggg
taccaaggtgaaagatgtgacgtcctaagagatccttgtctgtctagcccttgtgtatct
ggtgtctgcttgaaatcatctacatcattctcatacgcatgtctttgtaataatgattac
actggcacaaggtgtgagataccaccaggttcctgtgactcttctccatgtaaaaacaat
gcaaattgtatcacattacccgggaactctatcttctgtgagtgcttcaatggatacaca
ggaacatattgtgaagttgtcccagatctttgttctgtgcagccatgcgagaatggaggc
acttgctaccagctttctgacttccattatcggtgtgtctgcgcaaatggattctccggg
ttgaactgtggaattccttcagacgtctgtgtgagcgcaccctgtaaaaatggagcaaca
tgtgtcaatgaatcaccattatatacctgcatctgcaccgccgcctacatcggccaagac
tgctctactccagcgggcagtaggtgtgactctgacccatgcatgaacggcggaacctgc
gaacctaatatggcagaggactcctacaactgtagatgtcttcagggatttactggagac
aactgccagacttcggtcgatctttgcagtccatccccatgtaagaatggagcaacgtgc
gaggtatccgggacaaacgtctcatgtatttgtccgatgggattcagtggagagacttgt
gaaatgtcgacccctgacccgtgtgcgtcatcaccatgcgacaacggagcaacatgtgta
ctcaatcaatcggattccttcatttgtaattgcccacaaggtttttctggagacctatgt
gaaatgattgttagtatttgccagtcaggaccttgtatgaatggtggaacttgtgaagcc
agtggttcgggatatgtatgtacctgcgctccgggttacatgggtacaatgtgcgagttg
tataaaccatgcacttccagtccttgtttgaacaacggtacatgcaatgaggataacact
gatcccgatggctatacatgcgtgtgccctcgaatgtacacaggaaacaactgtgaaagt
ccaatggaatgccccatgcagtattgttcgaatggaggcacatgtactgtggtctaccaa
ccagacgacacagagacatatgaatgcgcttgccccaacacacactcgggtgaccgatgc
gacaccgatcgctgctctaactactgcttgaacggtggaacttgttcagtcagcgacacc
ctggtggttacttgtcaatgtcaaatgggattctttggagacaagtgtgaagatacggca
ccagctacttgtgccacaatgccatgcgagaatggagctacctgtatggatgttatgggc
tctgctaaatgcatgtgtccaaatggttttagtggggtatactgtcagacagatcactgc
cagttggtaaactgtatgaatggtgggacgtgcgtactaaacaacacgaacacagcagag
tgtttatgtcctgatggtttcactgggggaacctgccaaaatgtgatcaatttctgttca
cctgaaccatgtaaaaatggagcaacctgcttgaatcttcagactaactacacatgtgcg
tgtctgagcaccttcaccggcaggacatgcgagactcaagtcggtttgtgtggcaatctg
aatggacgctgcatgcacggggctatgtgtgatgctgcaaacaacagatgcatctgcgaa
atgggatatcttggaactctctgtgaagaagatgtcaatgaatgtgcctccaatccgtgt
cagaacaatggagtctgtgtgaaccgcgccaatcggtttgattgtgcatgcaaggcagga
tttactggttccacatgcgagaaagctgagaacccaggcaacaaagctacgactgcccag
atggtcttagagccatggtggattgcactgatagcactgatcggtgttctattcgtcatc
tttctcatcatagtcatctgcaccatgaaccgtacccatgacgacgtaaagaaaccaatc
atctaa
DBGET
integrated database retrieval system
