Asterias amurensis (Northern Pacific seastar): 139938832
Help
Entry
139938832 CDS
T10870
Name
(RefSeq) uncharacterized protein
KO
K02599
Notch 1
Organism
aamu Asterias amurensis (Northern Pacific seastar)
Pathway
aamu04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aamu00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
139938832
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
EGF_TEN
EGF_2
hEGF
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
139938832
NCBI-ProteinID:
XP_071790574
LinkDB
All DBs
Position
6:14505388..14545027
Genome browser
AA seq
1288 aa
AA seq
DB search
MVVSAKVFRSPVGWVLGALLCLQLHAVNCTWPWDDDSTTYAPQVEPIPPDPCVFGYCQNG
GACHNVHGTPVCFCPSYYAGQNCQYYNVCTSNPCLNDGHCSLIEYTNPPSWRCGCREGFT
GSSCETAATTQSYCARISCSNGGTCYHDDTTIEGIYCLCTERFHGTFCENAHPCNNIVCQ
NGGVCDADHGDPVCLCPTGYWGTNCEATTPDDICSYYNPCQNGGSCYTNLETVYCICLGD
YVGDSCETYQPNGQSCGSRDPCQNGATCVILAGDGGDSNVFCQCTYGWTGPSCSISSTPC
GIYTCLNGGICRQLYYGVTTCDCVPGWTGLDCSQPDADTSACATMDCNNGHCQEIFGTGF
CICDHGWQGEDCETDFQDPCSSSPCRNYGSCISFIGTYVCFCLPGFHGDNCALETATSCA
SYICQNGGNCTEISGKPYCYCAPGWYGLNCEIADPLDSCLLDHPCQNGGSCESLNGLVIC
TCQGNFFGEHCENEIPASHVCEIWYLNPCENGATCDRLDDGGYLCICSPDWYGINCTQSF
SPCGSAPCLNGGQCFWRHTDVYECQCPYGYFGDQCENTINACDSEPCQNDGICLTFTNSS
FFCICATGWSGLTCGNATGDACDSPGFTCYNGGTCKSLYGLRCVCADGWSGPQCETPIET
ASCDNWFCLNGGSCFLSFNRAYCVCYDFDYTGEHCETEILDPCDNTQCLNGGFCISYYGS
DTSCICPNSWTGLRCETEFTDPCDSFNCNDGDCYTYYDGFPYCSCNYGSTGVHCETEVSD
PCDELDCQHGGYCYSDFYYGSYGGAYCSCTSGYTGDLCETEVEDACASNPCMNGGTCYED
YGYSYCVCDSDWLGQFCEHQNECSSSPCLNGGYCYPNFDTGVAECSCQPAFAGRRCETTI
ECSGVTCLNGGTCLSDGSGGARCICPSNFIGINCETQNLCQSNPCLNGGACQSDQASFRC
TCLANYFGPTCETESGCMSNPCLNSGRCSPNSVTGEAECTCLAAFVGVRCETHIDCSGVT
CLNGGTCIAFGGGRTKCTCPKEFTGGNCETANLCLTNPCLNGGACRVESAVVKCTCLPNY
SGLTCGKHVSCADVACLNGGTCYPTGNGKTKCNCRTGYTGDNCEKGSDVNVSGTRGAQST
ALVVGLPLGIILLVVIILIAAVIMFKVIRKRRPRNQPGQQDGGVPTPDHIYNSRFSNAGL
AYNANNDTVQGMPTGGAEGGVKQERPKSENPYATPNDMAFSQLQSNGDKAGYDNPAYMVA
NPPPAYSTRPLSTSSDVFPQPDTKSLLK
NT seq
3867 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttgtgtcagcgaaagtctttcgcagcccggtgggatgggtgctcggagcgttgctt
tgcctccagttacacgcagtaaactgcacatggccatgggatgatgacagcacaacttat
gcgccgcaagtggagcccattccaccagacccgtgtgtctttggttactgtcagaacggt
ggagcttgccacaacgtacacgggactccagtgtgtttctgcccgagctactacgctggc
caaaactgccaatactacaatgtctgtaccagtaacccatgtcttaatgatggccactgc
tctctgattgagtacactaatcccccatcatggcgttgtggttgcagagagggttttact
ggttcatcatgcgaaacagcggcaaccacacagtcatattgtgcccgtatttcttgctca
aacggaggaacctgttaccatgatgacactacaattgaaggaatttactgcctttgcact
gaacgatttcatggaaccttctgtgagaatgcccacccgtgtaacaacatcgtctgtcaa
aatggtggtgtatgtgatgctgaccatggtgacccagtctgcctttgccccacagggtac
tggggaacaaactgcgaagcaactactcctgatgacatatgcagttactacaacccctgt
cagaacgggggatcgtgctacaccaacttagaaactgtgtactgcatttgcctaggagat
tatgtgggtgacagctgcgagacttatcaacccaatgggcaatcatgcggttctagggat
ccatgtcaaaatggtgctacgtgtgtaatactcgcaggtgatgggggtgattccaacgtg
ttttgtcaatgcacttacggatggactggacccagctgcagtatttcctctactccctgt
ggtatatacacctgtttaaatggtgggatatgccgtcaattatactatggagtaaccacc
tgcgattgtgttccaggatggactggtctggattgttcacaacctgacgctgacaccagt
gcttgtgccacaatggactgtaacaatggccactgtcaagaaatatttggaactggtttt
tgtatctgtgatcatggatggcagggagaggactgtgaaacagactttcaggatccatgt
tcatcatctccatgcagaaactatgggtcttgtattagtttcatcggtacatacgtctgt
ttctgtctccctggcttccatggtgataactgtgcccttgaaacggccacatcgtgtgcg
agttacatctgccaaaatggcggcaactgtacagagatatcgggtaaaccgtactgttac
tgtgctccgggatggtatgggctcaactgtgagatcgcggatccactcgattcctgctta
ctggaccatccatgtcagaatggagggtcatgtgagtcactgaacggtttagtcatttgt
acctgccagggtaacttctttggtgagcactgcgaaaatgaaattccagcaagtcatgta
tgcgaaatttggtatctgaacccttgcgaaaatggggcaacttgtgatcggcttgatgat
ggtggttacttatgcatttgcagcccagattggtatggcattaactgtacacaatccttt
tccccctgtggatcagcaccatgtttaaatggtggtcaatgcttctggagacacaccgat
gtctacgagtgtcaatgcccatatggttattttggagatcagtgtgaaaatacaatcaac
gcttgtgacagtgaaccttgtcagaatgatgggatctgcttgaccttcactaattcttca
tttttctgtatttgtgcaactggctggagtggcttgacgtgtggaaatgcaactggtgac
gcatgtgattcgccaggcttcacttgttacaacgggggtacatgtaaatccctttatggt
ttgaggtgtgtgtgtgctgatggctggtcaggacctcagtgtgaaacaccgattgagacg
gcttcatgtgataattggttctgtttaaacggcggatcgtgttttttgagctttaataga
gcttactgcgtatgttatgattttgactacactggagagcattgtgaaacagaaattttg
gacccatgtgacaacacacagtgtttgaatggaggcttttgtatatcctactatgggtca
gatacgagttgtatttgtcctaacagttggactggactgagatgtgaaacagaatttact
gatccttgtgacagtttcaattgcaatgatggagattgttacacctactacgatggtttt
ccatattgttcttgtaattatggatcgacgggagttcactgtgaaacggaagtaagcgat
ccttgtgatgaacttgattgtcagcatgggggttattgttactctgatttctactatggt
tcctatggtggagcttactgttcttgtacgagtggctacactggtgacctatgcgaaacg
gaagtggaggacgcatgtgcttcaaacccctgcatgaatggcggtacttgctatgaagac
tatgggtattcttactgtgtttgcgattcagactggcttgggcagttctgtgaacatcaa
aatgaatgtagctcatctccatgtcttaatggcgggtattgttacccaaattttgatact
ggagtggctgaatgtagttgtcaaccagcttttgctggtcgcagatgcgaaacaaccatt
gaatgctctggtgttacatgtttgaatggtggaacatgcttgtccgatggaagtggtggg
gcaagatgtatctgcccaagtaacttcattggtataaactgtgagacacagaatctctgt
cagtcaaatccatgtcttaacggaggtgcatgtcaatccgaccaggcttcattcagatgc
acttgcttggccaactattttgggccaacatgtgaaacagagagtggctgtatgtcaaac
ccatgtctcaatagtggacgttgttccccaaatagtgttactggagaggctgaatgcaca
tgcctagcagcttttgttggtgtcagatgtgaaactcacattgattgctctggtgtaaca
tgtttgaatggcggcacatgcatagcctttggaggtggcaggacaaaatgtacatgcccc
aaggaattcactggtggaaactgtgaaacagcgaacctctgtctgacaaacccatgcctt
aacggaggtgcatgtcgagttgagtctgcagttgttaaatgcacttgcctgcccaattac
tctggcttaacatgtggaaaacatgtcagttgtgctgatgtagcttgccttaacggtggt
acctgttatccaacagggaatggcaaaacaaaatgcaactgcagaacaggttacactggt
gataactgcgagaaaggaagtgatgtcaatgtgtctggtacaagaggtgctcagtccaca
gcactggttgttggattaccacttggaattattcttctcgttgtaattattctgatcgcg
gccgtcatcatgttcaaggtcatccgaaagcgaagacctcgaaaccagcctgggcagcag
gacggtggtgtgcccactcctgatcacatctacaactctcgcttctccaatgctggtcta
gcgtataacgctaataacgacaccgttcaaggaatgccaactgggggtgcagaggggggt
gtgaagcaggagcgacccaaaagtgagaacccctatgccactcccaatgatatggctttc
agccagctgcaaagcaatggagacaaagccgggtatgacaacccggcttacatggttgca
aatccaccacctgcttactccactcgcccactttctacatcatctgatgtgtttccgcag
ccggatactaaatcactcctgaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
