Aggregatibacter actinomycetemcomitans D7S-1: D7S_01760
Help
Entry
D7S_01760 CDS
T02046
Name
(GenBank) permease
KO
K11935
biofilm PGA synthesis protein PgaA
Organism
aan
Aggregatibacter actinomycetemcomitans D7S-1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PgaA_barrel
TPR_19
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFI87495
LinkDB
All DBs
Position
1647843..1650239
Genome browser
AA seq
798 aa
AA seq
DB search
MVFMSGISLSTIPFAHANQSPIDLEREKIIIFSRQGDSELKQAIPQLEKLFERTKDLKVR
DDLIALYLRNNQSVHALKVCESCTPTQFSESELENLGKAARNEKQFQRSFELYSQLAKKY
PQNPNGLLGKVLVATELKNYTVAKDALINYKKRFGENTAYWDANSYLLDFTQSDMAKLGR
WQRELSRNPKNTHLAGNLYRLASKYNIHPLQKKLQAEYPDLFSEKDLLWYEHDKIVASAK
NAKNNRKHLKNSFAGLTALLRKIDPAHPLYQQTLMDRFVLGVQLHEFDVVRDDYATLKAL
PTPSAYLREAFADYELAYASPHKALATYQSLAQSALDKKAPVSDELLLKMFSAASDAGEF
ALAQHYLEQINSSPYVNDYTHTSRVPNPSYDERYFGLARLALWRGNAGLAQKMIDERALD
KTPGDGWVLLQKAELERNRYNFDEAKEWAHKAGVFFIESDQKYVRHALIEIALRQNDLPT
AKRLIQEMSPEEMDSVKPLMERYELAHKGRIVGSVNLQHRTSAPTKQHNESTQDYAIYTP
KTAEGHDLYVRYTESRVPVDGNSLNAQFIGAGTELNFYPLNVRIEAGKGIKLSKRSYVTS
DLSYELNQRWAFNLRGHINGTDVPSRAAAQNVYTKGGGASVVYTYSDLFQLGGGVYFSRF
SDSNLRHDANLWLNTKTFKHDRWALTNNFRVDYTRNKTVQSADYYNPIKAVSYEVGGDLS
YYQPFDYALILTHHLKGNFGAYKQQARQRSKTWSVSYGHEWRIGKQYGFLYEIGRKKNIY
DGNPEFNNFGNLSFSLYY
NT seq
2397 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtatttatgagtggaatttcgctctcaacaataccatttgcacatgccaatcaatct
ccaattgatcttgaacgggaaaaaattattatcttttccagacagggagatagcgaatta
aaacaagctattccccaattagaaaaactctttgaacgcactaaagatctcaaagtccgt
gatgatttaatcgccctttatttgcgtaataatcaatctgtacacgccttaaaggtatgc
gaatcttgcacaccaacacaattttccgaaagtgagttggaaaatctgggaaaagctgcc
cgtaatgaaaaacaattccaacgttcttttgaactgtattcacagttagcaaaaaaatat
ccgcaaaatcccaatgggttattaggcaaagtcttagtggcaaccgaattaaaaaattat
acggtggcaaaagacgctctcattaactacaaaaaacgttttggtgaaaatacagcttat
tgggatgccaacagttatttattggattttacccaatccgatatggcaaaattggggcgt
tggcaacgtgaattgtcaagaaatccgaaaaatacgcatcttgccggtaatctttatcgg
cttgcctcaaaatacaacattcatccgttgcagaaaaaattacaagcggaatatccggat
ttgtttagtgaaaaagatttgctttggtacgagcatgataaaatcgtcgcatcagcaaaa
aatgccaaaaataatcgaaagcatttaaaaaattcattcgcaggattgaccgcactttta
cggaaaattgatccggcacatccgctttatcaacaaacattaatggatcgatttgtatta
ggtgtgcaattacatgaatttgatgtcgttcgtgatgattatgccactttaaaagcgtta
ccgaccccgtcggcttatttgcgtgaagcttttgccgattatgaactggcatatgcgtca
ccacataaagccttggcaacatatcaatctcttgcacagtccgctttagataagaaagca
ccggtaagtgatgagcttttgttaaaaatgttttctgccgccagtgacgcaggtgaattc
gctttggcacagcactatttagaacagattaacagctcaccttatgtaaatgattacact
catacatcacgcgttccgaatccgtcatatgatgagcgttatttcggtttggcacgcttg
gcattatggcgtggcaatgcaggtttagcgcagaaaatgattgatgaacgtgcattggat
aaaacccctggggatggttgggtactattgcaaaaagccgagttggaacgtaatcgttat
aattttgatgaggctaaagaatgggcgcataaagcgggcgttttctttattgaatccgac
caaaaatatgttcgtcatgctttaattgaaatcgcattacgtcaaaatgatttaccgacg
gcgaaacgtttgattcaggaaatgagccctgaagaaatggattcagtcaaacccttgatg
gagcgttatgaattggcgcataaagggcgtattgtaggaagtgttaatctacagcaccgc
acttctgcaccgaccaaacaacataatgaatccactcaagattacgcgatttacacacca
aaaaccgcagaggggcacgatctttatgtgcgctatacggaaagccgcgtaccggtggat
ggcaattcactcaatgcacaatttattggtgcgggtaccgaactgaatttctatccgctt
aatgtgcgtatcgaagccggtaaaggcattaaactcagcaaacgcagttatgtgacatcc
gatttaagttatgagttaaatcagcgttgggcatttaatttgcgcggacatattaacggc
accgatgttccgtcaagagcagctgcgcaaaatgtttataccaaaggtggcggcgcgtct
gtggtttacacttattctgatctgttccaattaggcggtggtgtttatttttcccgcttt
agtgacagtaatttaagacatgatgctaatttatggctgaatacaaaaacctttaagcat
gatcgctgggcgctaaccaacaatttccgtgtggattatacgcgaaacaaaaccgttcaa
tccgcggattattacaacccgataaaagcagtcagttacgaagtgggcggtgatttgagt
tattaccagccgtttgattatgcgctgattctgacccatcacttgaaaggcaactttggt
gcttataaacagcaggcacgacagcgtagtaaaacctggtcagtgagttacgggcatgaa
tggcgtattggtaaacaatatggctttttatatgaaatcggacgtaaaaagaatatttat
gacggtaatcccgaatttaataactttggtaacctctctttctcactttattattag
DBGET
integrated database retrieval system