Arenibacter antarcticus: KCTC52924_02328
Help
Entry
KCTC52924_02328 CDS
T10841
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
aanr Arenibacter antarcticus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XHP74567
LinkDB
All DBs
Position
2763735..2770523
Genome browser
AA seq
2262 aa
AA seq
DB search
MTKKILLLIFLISGFAFAQTTVTLEDQCNCEVLSGTLVTAAAAATPSGADIGDIYVNTNT
GTIYFWDGDSWELTATDTNTTNTSLTQDGTDLILTDSENNSVTLALADIAAATNTNTTNA
NFAVVGADLVVTDSEGNTVSVPIVDIAAKGNGIKSTVDNGDGTFTLTYDDNTTFTTADLT
GPQGLAGADGNDGPTGPQGLAGPTGADGNDGADGVQGPQGIQGNDGPAGPQGLAGIDGND
GAQGPQGIQGNDGPTGPQGLAGADGNDGADGAQGIQGNDGPTGPQGPAGTDGNDGADGAQ
GPAGADGAQGSAGADGNDGADGAQGLQGIQGNDGPTGPQGLAGTDGNDGAQGPTGADGAQ
GPTGADGAQGPQGIQGNDGPAGPQGLAGADGNDGADGAQGPTGADGAQGPAGADGNDGAD
GVQGPQGIQGNDGPAGPQGLAGIDGNDGADGAQGPQGIQGNDGPTGPTGADGAQGPQGIQ
GNDGPAGPQGLAGADGNDGADGAQGPAGADGADGAQGPQGIQGNDGPTGPQGLAGTDGND
GADGADGAQGLQGIQGNDGPIGPQGLAGTDGNDGAQGPAGANGNDGADGADGAQGPTGAD
GAQGPQGLQGIQGNDGPAGPQGLAGADGADGAQGPQGIQGNDGPAGPQGLAGADGNDGAD
GAQGPTGADGTQGPAGADGNDGADGVQGPQGIQGNDGPAGPQGLAGIDGNDGADGAQGPQ
GIQGNDGPTGPTGADGAQGPQGIQGNDGPAGPQGLAGADGNDGADGAQGPAGADGAQGPQ
GIQGNDGPTGPQGLAGTDGNDGADGVQGPQGIQGNDGPAGPQGLAGIDGNDGAQGPQGIQ
GNDGPTGPTGADGAQGPQGIQGNDGPAGPQGLAGADGAQGPAGADGAQGLQGIQGNDGPA
GPQGLAGADGNDGADGAQGPTGADGAQGPAGADGNDGADGAQGPQGIQGNDGPTGPQGLA
GADGNDGADGAQGPTGADGADGAQGLQGIQGNDGPTGPQGLAGTDGNDGADGADGAQGPQ
GIQGNDGPTGPQGLAGTDGNDGADGADGAQGLQGIQGNDGPAGPQGLAGIDGADGADGAQ
GPQGIQGNDGPAGPQGLAGADGNDGAQGPTGADGAQGPQGLQGIQGNDGPAGPQGLAGAD
GNDGADGVQGPAGADGADGAQGPTGADGAQGPQGIQGNDGPAGPQGLAGADGNDGADGAQ
GPTGADGAQGPAGADGNDGADGAQGPQGIQGNDGPTGPSGADGNDGADGAQGPTGADGAQ
GPAGADGNDGADGVQGPQGIQGNDGPTGADGAQGPAGADGNDGADGAQGPQGLQGIQGND
GPTGPTGADGAQGPQGIQGNDGPIGPQGLAGTDGNDGTDGAQGPAGANGNDGADGADGAQ
GPTGADGAQGPQGLQGIQGNDGPAGPQGLAGIDGNDGADGADGADGAQGPQGIQGNDGPI
GPQGLAGTDGNDGTDGAQGPAGANGNDGADGADGAQGSTGADGAQGPQGLQGIQGNDGPA
GPQGLAGADGADGAQGPQGIQGNDGPAGPQGLAGADGNDGADGAQGIQGNDGPTGPSGAD
GNDGADGAQGPTGADGAQGPAGADGNDGADGAQGPQGIQGNDGPIGPRGLAGTDGNDGAD
GAQGPQGIQGNDGPAGPQGLAGADGNDGADGAQGPTGADGAQGPAGADGNDGADGAQGPQ
GIQGNDGPAGPQGLAGIDGADGADGAQGPQGIQGNDGPAGPQGLAGADGNDGVDGAQGPQ
GLQGIQGNDGPAGPQGLAGADGNDGVDGAQGPQGPQGLAGADGNDGADGVQGPAGANGND
GADGADGAQGPTGADGAQGPQGIQGNDGPAGPQGLAGADGNDGADGAQGPTGADGAQGPA
GADGNDGADGAQGIQGNDGPTGPSGADGNDGADGVQGPQGIQGNDGPAGPQGLAGIDGAD
GAQGPQGLQGIQGNDGPAGPQGLAGADGADGAQGPQGIQGNDGPAGPQGLAGADGADGAQ
GPQGIQGNDGPIGPTGADGAQGPQGPTGAVGPAGDPATDDQTLSTNGDPGDISISGGNTI
SLNVNDADFDPTNELQTLSQTGTDVTLSNGGGSISVADNDNDPTNEIQDASQVSYTNTTS
GLAATNTQAAIDELAATSTDDQYDDEVLLRVPIDVDDAGKTVVTNETTIQEVIQAIAPIT
SKAARIFYPPSIAVDASSTGTGRKIDLHDQYITQFGSPMVSSNLAPTAIPTYANTELYYY
VTHYDNSVFDNVSVDEFGEMTYDVIATPTDYNSLINVVFVVK
NT seq
6789 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaccaaaaaaattctactacttattttcctgatatccggttttgctttcgcccaaacc
acagttaccttggaagaccaatgtaattgtgaggttttaagcgggacacttgttacagcg
gctgcggcggcaactccatcaggtgcagatattggagatatttatgtaaatacaaatacc
gggacgatatacttttgggatggcgattcttgggaattgacggctacggacacgaatact
accaacacgagcttgacgcaagatggtacggatcttatattgacggacagtgagaacaat
tctgtaaccttggcccttgcggatattgctgcggcgacgaatacaaatacaacgaatgcc
aattttgcggtagtgggtgcggatttagtggtcactgacagcgaaggaaatacagtttca
gttccaattgtagatatagcagccaagggtaacggtataaagtctacagtggacaatggg
gacggtacgtttaccttgacctatgatgataatacgacatttactaccgcggatttaact
ggcccacaaggtttagcaggagctgatggtaacgatggtcctactggcccacaaggttta
gcaggtcccacgggtgctgatggtaacgatggcgctgacggtgttcaaggtccacaaggt
attcaaggaaatgacggtcccgccggtccacaaggtctagcaggtattgatggtaacgat
ggcgctcaggggccacaaggtattcaaggtaatgacggtcctactggtccgcaaggttta
gcaggtgctgatggaaacgatggtgcagatggtgctcagggtattcaaggaaatgacggt
cctactggtccacaagggccagcaggtactgatggtaacgatggtgctgacggcgctcaa
ggtccagccggtgctgatggtgcgcaaggttcagccggtgctgatggcaacgatggcgct
gatggagctcagggtctgcaaggaattcaaggaaatgacggtcctactggtccacaaggg
ctagcaggtactgatggtaacgatggcgctcaaggtcctactggagcggatggtgctcaa
ggtcccactggagccgatggtgctcagggtccacaaggaattcaaggaaatgacggtccc
gccggtccacaaggtttagcaggagctgatggaaatgatggtgctgacggagctcaaggt
cctacaggtgctgatggtgcgcaaggtccagccggtgctgatggcaatgatggtgcagat
ggtgttcagggtccgcaaggaattcaaggaaatgacggtcctgctggtccacaaggtcta
gcaggtattgatggtaacgatggtgctgatggcgctcaggggccacaaggtattcaaggt
aatgatggcccgactggccctacaggagccgatggtgctcagggtccgcaaggaattcaa
ggaaatgacggtcccgccggtccacaaggtctagcaggagctgatggtaacgatggtgct
gacggtgctcaaggtccagccggtgctgatggtgctgacggagctcagggtccgcaagga
attcaaggaaatgacggtcctactggtccacaaggtttagcaggtactgatggtaacgat
ggtgctgatggcgctgacggtgctcaaggtctgcaaggtattcaaggaaatgacggtcct
attggtccacaaggtctagcaggtactgatggtaacgatggtgcgcaaggtccagccggt
gctaatggtaacgatggtgctgatggcgctgacggagctcaaggtcccactggagccgat
ggtgctcagggtccacaaggtctacaaggtattcaaggaaatgacggtcctgctggccca
caaggtttagcaggagctgatggtgctgacggtgctcaaggtccacaaggaattcaagga
aatgacggtcccgccggtccacaaggtttagcaggtgctgatggaaacgatggcgctgac
ggagctcaaggtcctacaggtgctgatggtacgcaaggtccagccggtgctgatggcaat
gatggtgcagatggtgttcagggtccgcaaggaattcaaggaaatgacggtcctgctggt
ccacaaggtctagcaggtattgatggtaacgatggtgctgatggcgctcaggggccacaa
ggtattcaaggtaatgatggcccgactggccctacaggagccgatggtgctcagggtccg
caaggaattcaaggaaatgacggtcccgccggtccacaaggtctagcaggagctgatggt
aacgatggtgctgacggtgctcaaggtccggccggtgctgatggtgctcagggtccgcaa
ggaattcaaggtaatgacggtcctactggtccacaaggtttagcaggtactgatggtaac
gatggcgctgacggtgttcaaggtccacaaggaattcaaggaaatgacggtcccgctggt
ccacaaggtctagcaggtattgatggtaacgatggcgctcaggggccacaaggtattcaa
ggtaatgatggcccgactggccctacaggagccgatggtgctcagggtccgcaaggaatt
caaggaaatgacggtcccgccggtccacaaggtctagcaggagctgacggtgctcaaggt
ccagccggtgctgatggcgctcagggtctgcaaggaattcaaggaaatgacggtcccgcc
ggtccacaaggtttagcaggagctgatggaaatgatggtgctgacggagctcaaggtcct
acaggtgctgatggtgcgcaaggtccagccggtgctgatggcaatgatggtgcagatggt
gctcaaggtccacaaggaattcaaggaaatgatggtcctactggcccacaaggtttagca
ggagccgatggtaacgatggtgctgatggagctcagggtcccactggagccgatggtgca
gatggtgctcaaggtctacaaggaattcaaggtaatgacggtcctactggtccacaaggt
ttagcaggtactgatggtaacgatggtgctgatggcgctgatggtgctcagggtccgcaa
ggaattcaaggtaatgacggtcctactggtccacaaggtttagcaggtactgatggtaac
gatggtgctgatggcgctgacggtgctcaaggtctgcaaggtattcaaggaaatgacggt
cctgctggtccacaaggtctagcaggtattgatggtgctgatggtgctgatggcgctcag
ggtccacaaggtattcaaggaaatgacggtcctgctggcccacaaggtttagcaggtgct
gatggtaacgatggcgctcaaggtcctactggagcggatggtgctcagggtccacaaggc
ctacaaggaattcaaggaaatgacggtcctgctggcccacaaggtttagcaggagctgat
ggtaacgatggcgctgacggtgttcaaggtccagccggtgctgatggcgctgacggagct
caaggtcccactggagccgatggtgctcagggtccacaaggaattcaaggaaatgacggt
cccgccggtccacaaggtttagcaggagctgatggaaatgatggtgctgacggagctcaa
ggtcctacaggtgctgatggtgcgcaaggtccagccggtgctgatggcaatgatggtgca
gatggtgctcaaggtccacaaggaattcaaggaaatgatggtcctactggtccttcagga
gctgatggaaatgatggcgctgacggagctcaaggtcctacaggtgctgatggtgcgcaa
ggtccagccggtgctgatggcaacgatggcgctgacggtgttcagggtccgcaaggaatt
caaggaaatgacggtcctactggagcggatggtgctcagggtccagccggtgctgatggc
aacgatggcgctgatggagctcaaggtccacaaggcttacaaggaattcaaggaaatgat
ggtcctactggccccacgggcgctgatggcgctcagggtccgcaaggaattcaaggaaat
gacggtcctattggtccacaaggtctagcaggtactgatggtaacgatggtactgacggc
gctcaaggtccagccggtgctaatggtaacgatggtgctgatggcgctgacggagctcaa
ggtcccactggagccgatggtgctcagggtccacaaggtctacaaggtattcaaggaaat
gacggtcctgctggcccacaaggtttagcaggtattgatggtaacgatggtgctgatggt
gctgatggtgctgacggagctcagggtccgcaaggaattcaaggaaatgacggtcctatt
ggtccacaaggtctagcaggtactgatggtaacgatggtactgacggcgctcaaggtcca
gccggtgctaatggtaacgatggtgctgatggcgctgacggagctcaaggttccactgga
gccgatggtgctcagggtccacaaggtctacaaggaattcaaggaaatgacggtcctgct
ggcccacaaggtttagcaggagctgatggtgctgacggtgctcaaggtccacaaggaatt
caaggaaatgacggtcccgccggtccacaaggtttagcaggtgctgatggaaacgatggt
gcagatggtgctcagggtattcaaggaaatgatggtcctactggtccttcaggagctgat
ggaaatgatggcgctgacggagctcaaggtcctacaggtgctgatggtgcgcaaggtcca
gccggtgctgatggcaatgatggtgctgacggtgctcaaggtccgcaaggaattcaagga
aatgacggtcctattggtccacgaggtctagcaggtactgatggtaacgatggtgctgat
ggcgctcaggggccacaaggaattcaaggaaatgacggtcccgccggtccacaaggttta
gcaggagctgatggaaatgatggtgctgacggagctcaaggtcctacaggtgctgatggt
gcgcaaggtccagccggtgctgatggcaatgatggtgcagatggtgctcagggtccacaa
ggaattcaaggaaatgacggtcctgctggtccacaaggtctagcaggtattgatggtgct
gatggtgctgatggcgctcagggtccacaaggtattcaaggaaatgacggtcctgctggc
ccacaaggtttagcaggtgctgatggtaacgatggcgttgatggcgctcagggtccacaa
ggcctacaaggtattcaaggaaatgacggtcctgctggcccacaaggtttagcaggagcc
gatggtaatgatggcgttgatggcgctcagggtccacaaggcccacaaggtttagcagga
gctgatggtaacgatggcgctgacggtgttcaaggtccagccggtgctaatggtaacgat
ggtgctgatggcgctgacggagctcaaggtcccactggagccgatggtgctcagggtcca
caaggaattcaaggaaatgacggtcccgccggtccacaaggtttagcaggagctgatgga
aatgatggtgctgacggagctcaaggtcctacaggtgctgatggtgcgcaaggtccagcc
ggtgctgatggaaacgatggtgcagatggtgctcagggtattcaaggaaatgatggtcct
actggtccttcaggagctgatggcaatgatggtgcagatggtgttcagggtccgcaagga
attcaaggaaatgacggtcctgctggtccacaaggtctagcaggtattgatggtgctgat
ggcgctcagggtccacaaggcctacaaggtattcaaggaaatgacggtcctgctggccca
caaggtttagcaggtgctgatggcgctgacggagctcaggggccacaaggtattcaagga
aatgacggtcctgctggcccacaaggtttagcaggtgctgatggcgctgacggagctcag
gggccacaaggtattcaaggaaatgatggtccaattggtcctacaggagccgatggtgct
cagggtccgcaaggtcctacgggcgcagtaggtccagcaggagatccagcgacagatgat
caaaccttgtccacaaatggagatccaggagatataagtatctcaggcggaaacactatt
agcttaaatgttaatgatgccgattttgatcctaccaatgaactgcagaccttatcacag
acaggtaccgatgttactttgtcaaatggtggaggaagtatatcagtagcagataatgat
aacgaccctactaacgagattcaagatgcatcccaagtaagttataccaatacaacatca
ggattagcagcaacaaatactcaagcagcaattgatgaattggcagcaacaagtacagat
gaccaatatgatgacgaagttctactacgtgtgcctattgacgttgatgatgctggcaaa
acagtggtaacgaatgaaacaaccatacaggaggtaatacaagcaattgcacctattact
tcaaaagcggcaaggatattttatcctccttctattgcggtagatgcttcatcaactgga
acaggaagaaaaatagatttacatgatcagtacattactcaatttggatcgcctatggtg
tccagtaatttagcgcctactgcaattccgacctatgccaatacagaactttattactat
gttacacattatgataattcggtgtttgacaatgtaagtgttgacgaatttggggaaatg
acctatgatgtgatcgcaacaccaacagattacaattccttgatcaatgtagtttttgtt
gtaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
