Argentina anserina (silverweed cinquefoil): 126796338
Help
Entry
126796338 CDS
T10558
Name
(RefSeq) cellulose synthase-like protein D3
KO
K20924
cellulose synthase-like protein [EC:2.4.1.-]
Organism
aans Argentina anserina (silverweed cinquefoil)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aans00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01003 Glycosyltransferases [BR:
aans01003
]
126796338
Glycosyltransferases [BR:
aans01003
]
Polysaccharide
Structural polysaccharide
126796338
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cellulose_synt
zf-RING_4
Glyco_trans_2_3
zf-UDP
IBR
Glyco_tranf_2_3
zf-C3HC4_2
zf-C3HC4
Baculo_IE-1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
126796338
NCBI-ProteinID:
XP_050379105
LinkDB
All DBs
Position
5:13780378..13785533
Genome browser
AA seq
1121 aa
AA seq
DB search
MASNYPNGTSRFNHFKQTSNDLDSGIGSVEFATYTVQIPVTPDNQPAGISLQRSTSQRVE
DQYASSSLFTGGYNCVTRAQLKDKVIESETSHPQMTWAKGSYCTVPGCDAQVVTDERGLD
IVPCECGYKICMDCYRDAMRNGETICPGCQEPYKEMDMNEYGVTMRQQRLSTDGMSKTER
RMSLMKSKSIKSKALMESQAIEMDQNQWLFETKGSYGYGNAMWPKEDASGSLDGGMGGDP
KMFKDKQWKPLTREVTISAAIISPYRLLVVARLVALGLFLQWRVRNPNDDAVWLWLMSVI
CEFWFAFSWILDQLPKLCPINRIAYVDVLREKFETPNPSNPTGKSDLPGIDIFVSTADPE
KEPPLVTANTILSILATDYPVEKLACYVSDDGGALLTFEAMAEAASFANLWVPFCRKHDI
EPRNPESYFSMKRDPYKNKVRSDFVRDRRQVKREYDEFKVRINGLPDSIRRRSDAFNARE
EIKAMKLKRETRDDEPVENLKLPKATWMTDGTQWPGTWVNSSPEHTKGDHASIIQVMLKP
PSDEPLTGTEVDSNSMNLSEVDIRLPMLVYVSREKRPGYDHNKKAGAMNALVRASAIMSN
GAFILNLDCDHYIYYSQAMREGMCFMMDRGGERLCYVQFPQRFEGIDPSDRYANHNTVFF
DINMRALDGIQGPVYVGTGCLFRRIALYGFDPPLVKERDGCCSGFFAKRKKTSMVASAPE
VDSQDGSIDLDNDNEEMGVSLIPKTFGNSSLFVDSIRVAEFQGRPLADHPSMKNGRPIGA
LTLPRELLDASTVAEAISCISCWYEDKTEWGQRVGWIYGSVTEDVVTGYRMHNRGWKSIY
CVTKKDAFRGSAPINLTDRLHQVLRWATGSVEIFFSRNNALLASSRMKFLQRIAYLNVGM
YPFTSIFLIVYCFLPALSLFTGKFIVQELNVTFLVYLLAITITLILLAVLEIKWSGIELE
EWWRNEQFWLIGGTSAHLAAVLQGLLKVIAGIEISFTLTSKSGGDDTDDDFVDLYIFKWS
SLMVPPITIIMINLIGMGVAVCRTIYSDAPKWSALLGGSFFSFWVLAHLYPFAKGLMGRR
GRTPTIVFVWSGLIAITISLLWVAISPPSGSEGIGGSFQFP
NT seq
3366 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcctctaattacccaaatggaacctccaggtttaaccatttcaagcaaactagcaat
gaccttgacagtggtatagggagtgttgagtttgcaacctacactgtccagatacccgtc
acaccggacaaccagcccgccggaatctccttgcagcggtcaacttctcagagagttgag
gaccaatatgcatccagttctttgtttacaggcggctacaactgcgtcacgcgagcacag
ttgaaggacaaggtgattgaatccgaaaccagccatcctcagatgacatgggccaagggg
tcttattgtactgtgccgggatgtgatgctcaggtggtgactgatgagaggggtttggat
attgtgccttgtgaatgtggttataagatatgtatggattgttatagggatgctatgaga
aatggtgagaccatttgtccgggctgccaggaaccttataaggagatggacatgaatgag
tatggcgtgactatgcggcagcaacgtctgtcgacggatggaatgtcaaagacggagagg
aggatgtcacttatgaaatcaaagtcgatcaagtcaaaagcattgatggagagtcaggcc
attgagatggatcagaatcagtggttgtttgagactaaagggagttatggatatggaaat
gctatgtggccaaaggaagatgcgagtggtagtcttgatggtgggatggggggtgatcct
aaaatgtttaaagataagcaatggaagcctctaacgcgtgaagtgacaatctcagctgca
attattagtccataccggctcctagtagtagctcgactggtggcccttggattatttttg
caatggcgagtcagaaaccccaatgatgatgcagtatggttgtggcttatgtctgtgatt
tgtgagttctggtttgccttctcttggatacttgatcagcttccaaagctgtgccctata
aatcgcattgcttatgtcgatgttttaagggagaagtttgaaactccaaatcccagcaat
cccactggaaaatctgatcttccagggatagacatttttgtatctacagcagatccagag
aaagaacctcctcttgtaactgcaaacacaattctctcgatacttgcaactgactatcct
gttgagaagcttgcctgttatgtttcggatgatggaggtgcacttttgacttttgaggcc
atggcagaagctgctagttttgccaacttgtgggtaccattttgtcggaagcatgatatt
gagccaaggaacccagaatcttacttcagcatgaagagagatccttataagaataaagta
cgctctgattttgtaagggaccgtaggcaggtaaagcgtgagtatgatgaattcaaggtt
aggattaatggtcttcctgattccattcggagacgttccgatgcatttaatgctagagag
gagatcaaagctatgaaacttaagagagagactagagatgatgaaccagtggaaaattta
aagctcccaaaagcaacttggatgactgatggaacacagtggcctggtacttgggtgaac
tcttcccctgagcataccaagggtgatcatgccagtatcatacaggtgatgttaaaaccc
cctagcgacgagccacttacaggaacagaagtggattcaaattccatgaatctgagtgag
gttgacatccgtcttcccatgcttgtttatgtttctcgagaaaagaggcctggttatgat
cataacaagaaagctggtgctatgaatgccttggttcgtgcctcggccatcatgtccaac
ggggccttcattctcaatcttgactgtgatcactacatctactactcccaagcaatgaga
gagggcatgtgctttatgatggaccgtggtggtgaacgcctttgttatgtccaatttcct
cagaggtttgaaggaatagacccttctgatcgctatgccaaccacaacactgttttcttt
gacatcaacatgcgtgctcttgatggaattcagggtccagtatatgtgggaacagggtgt
ctctttcgtcgtattgccttgtatggctttgatccacccttggtaaaagaacgtgatggc
tgctgtagtggtttctttgcaaagcgcaagaaaacatctatggttgcttctgctcctgaa
gttgattcccaagatggatcgatcgatctagacaatgacaatgaagaaatgggagtttct
cttattccgaaaacgtttgggaactcaagcctctttgttgactccatcagagttgcagag
ttccaaggtcgaccccttgctgatcatccatctatgaaaaatggacgccccattggtgcc
cttactctaccccgggaacttcttgatgcatcaacagttgcagaggcaattagttgcatc
tcatgctggtatgaggataagactgaatggggccaacgagttgggtggatttatggttca
gtgactgaagatgtggtcacaggttacaggatgcacaaccgtggatggaaatccatctac
tgtgtcactaagaaggatgcctttcgaggaagtgccccaatcaatctcactgataggctt
caccaggttttgaggtgggctactggctctgttgagatattcttttctcgaaacaatgct
cttctagccagctccaggatgaagtttctccaaaggattgcctacttgaacgtcggaatg
taccctttcacatccattttcctcattgtttactgtttcctccctgcactctcactcttc
actggtaagttcattgttcaggaactcaacgtaaccttcctggtatatctcctggccata
acaattaccctcattcttcttgccgtgcttgagatcaagtggtctggaattgaactggag
gagtggtggaggaatgagcagttttggttgattggtggcacaagtgcccaccttgctgct
gtgctccaaggtctactaaaggttatagcaggaattgagatttcattcactttgacatca
aaatctgggggcgatgacacagatgatgattttgttgatctttatatcttcaaatggtca
tctctgatggtaccacctattactatcataatgatcaacttgattggaatgggtgttgca
gtttgtcgaacaatatacagtgatgcaccaaagtggagtgccttgcttggaggttctttc
ttcagcttctgggtgttggctcatctatacccctttgccaaaggacttatgggaagacga
gggaggacccccacgattgtgtttgtctggtctgggctgatagcaatcaccatatctctt
ctttgggtagctattagtcccccatcaggcagtgaaggaattggaggttcattccagttc
ccttga
DBGET
integrated database retrieval system