Aggregatibacter aphrophilus NJ8700: NT05HA_0259
Help
Entry
NT05HA_0259 CDS
T00929
Name
(GenBank) Rhs family protein
Organism
aap
Aggregatibacter aphrophilus NJ8700
Pathway
aap03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aap00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
NT05HA_0259
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Phage_GPD
RHS_repeat
Gp5_trimer_C
DUF6531
Phage_base_V
RHS
DUF2345
DUF6484
Sarcoglycan_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACS96696
LinkDB
All DBs
Position
252465..258218
Genome browser
AA seq
1917 aa
AA seq
DB search
MTVQSDYRYSLTVNGSTQFEVVSFVVTEHLSELFRAELELASFDDSPKFSDILDHPATLT
FWQDNSAVRHLNGIVTGLKQGESGFSRTRYSMVIEPALSRADLQADLRIFQQQDSQKIIE
TLLSKNQVAKHQFHLKDSYWTREYCVQYRETDLEFIKRLAAEEGTYYYFEHTNDGHSLHF
SNSTELAELKGDLLYNAMPSGERPQAAVWRFAYEEKLKPTLQTLRDYTFTNPRYNQEHQS
THNRANVLGENRHGQYELYDYPGRYKRDAQGKPFSQYRLEYEQREAEMAMANSDDLRIIP
GYCFSLSGHTRSNFNQDWLVVGVVHRGWQSGVLEEEAGAEGNRYENEMKLIPHGRQWRPT
PQPRPVVDGPQVAHVVGPADEEIYCDEWGRVKIQFPWDRLGNNDEHSSCWVRVSQGWAGA
QFGAMMIPRIGHEVIVDFLEGDPDQPIITGRTYHSTTEPPYNLPEHKTRMTIKSKTHKGN
GFNELRFEDEKDREEIFIHAEKDQNNVVNNDETTNVGRNRTEKVGRNEKITVGKNRSQTI
KQNEMLTVGFNRMTNITMNELHNVGMMRSLNVLLDQHEMVGQSYDLKVGKDYHIDAGNNT
HLSTAQLLTLISQNMHVTGKDEIRLDSKGGHIHINEKGITLKGIVTIEGPLTIKGNAVAG
GHSVEGECIACKQAAAVGRPVNPILGIKLLSNEVDFAFPGLLPLNWQRSYFSDVAHTGWL
GQGWLVNGCQRIESRMSIPIEALADVVGEEAGSDKQHSEAQPAEQLVYVDEQGREIPLPS
ILAEQEPVYIQAEQIWTHRLSAETIRISSLDKTVHFTFMRQGEDGSAFVLTQITDNHGNC
QQFLYGQDNLPYAIKDGNGRVFALQFANISSENQTNIEDSSQRRLTHVYLLTQTFSDIDL
ALLQETLKKSTALSHTSDESFLGRKLVSYRYNTEGDLIEVTDGLGNLVRKFGYRNHLMIS
HEDSAGLISTYEYDHYTPNGKVTLNTTNLGERWEFAYFPTYTVVTDALGRREEYHFDEHN
ELVKLVSTDGQAMLLERDKLGRVLRQTSPSGQTSYFEYNPQGQMTKLTRPDNAMLYFLYD
NDGRLIGQTDALGNMTRYRYDDSGNLIERLDALSQKSVYAYNDKGLLSSSTDPLGNNTLF
AYDENFQLNQVTDCSGNQTCFKYNELGQLTSQTDALGNTTAYQYNDRQQLIAVLLPNQSQ
TRYQYDKVGRLSQVIDPQGNQTSYQYRIDGLPTSKTNAQGHHFQYHYDQAGRLVGLTNEN
HATYRFVYDEQDRLIWEKGFDDKLTQYEYDAKGQLIRRTDYGVTEAPKRNKPAIRTAEFK
YNQLGQMTEEHIRQGEQSSRTTFSFDLNGQMTQVACGGQHIDFRYDATGRLIEEAHGDKK
IAYEYDANNNRLKTVLPSGDSIRYFYYGTGHLSGIKLNSQLISEMERDDLHREISRSQGR
LNGRYYYDDMGRLVQQQAGLANQQNAVQIDRTYGYDELGHLSQTRTYFPHKPFDAPQQTQ
YQYDNLGRIAKADSQGHSQHFYFDPASNLINDPTEKVIDNRVVNYRGIRFTYDSLGNLVE
CQAANGDYQRYTYDLKNRLVQADIRDRYKAESWVYEYDPLGRRVAKSKLNKQGEQQLHTQ
FIWDGSHLVQEIRTGNHQQNAEKTDRTFTYIYSEPGSYEPLAQCYKDGDNAEHTINYFHS
DQIGIPREMTDSDGKLIWKGRYDAWGSLIRDSYRETASDSHQPFRLQNQYFDEETGLHYN
FFRYYEPVLGRFITQDPIKLAGGNNLYRFEGTVQNQTDPLGLFAPALLLAPELIALGKAA
LITLGVLAVGAAVEETVKNRARASTQAKTESTSKCKKCPPCITTSGRIVPPKTIGYRPLD
VIPDDKMEHGVYGSHHNIFESNQAPYPNCKCFWSKQKYVLKPYQLTPAMVPVEPFVN
NT seq
5754 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacagttcaatccgattatcgttatagcttaaccgtaaatggctcaacccaatttgaa
gtagtgagttttgttgtaaccgaacacttatccgaattatttcgtgcagagcttgaatta
gcaagtttcgatgattcgccaaaattctccgatatcttagaccaccccgccacgttaacc
ttttggcaagacaattctgccgtacgacatctcaacggtattgtgaccggactaaaacaa
ggtgaaagcggtttttcccgtacccgttatagcatggtgattgagccggcattatcccgt
gcagatttacaagcagatttacgtattttccaacaacaggacagccaaaagattattgaa
acgctgttaagtaaaaatcaggtcgcaaaacaccaatttcatttaaaagacagctactgg
acgcgtgaatactgtgtgcaatatcgtgaaaccgatcttgagtttatcaaacgcttagcg
gcggaagaaggcacttattattattttgaacacacaaatgacgggcactcgttacatttt
tctaatagcacggaattggcggagttaaaaggtgatttgctttacaatgcgatgccgtca
ggtgagcgtccacaagccgcggtgtggcgttttgcgtatgaagaaaagttaaagccgacc
ctgcaaaccttgcgtgattacacgtttaccaatccacgttataaccaagaacatcagtct
acccataaccgtgccaacgtactgggtgaaaaccgtcatggtcagtatgagctatatgat
tatccggggcgttataaacgtgatgcgcaaggcaaacctttcagccaataccgtttggaa
tatgaacaacgtgaagcggaaatggcgatggcaaacagtgatgatttacgtatcatcccg
ggctattgctttagcttaagcggtcatacgcgttcaaacttcaaccaagattggcttgtt
gttggtgtcgttcatcgtggttggcaaagtggcgtattggaagaagaagcgggtgctgag
ggcaaccgttacgaaaatgaaatgaagctgataccgcatggaagacaatggcgtccgaca
ccacaaccacgtcctgtggtagatggtcctcaggtagcgcatgttgttggtccggcagat
gaagaaatctattgtgatgagtgggggcgggtgaaaattcaattcccttgggatagattg
ggcaacaatgacgaacatagttcgtgttgggtgcgcgttagtcaaggttgggcgggcgcg
caatttggtgccatgatgataccgcgaatcgggcatgaagtgattgtcgatttcttagaa
ggtgacccggaccaaccgattattaccggtcgaacttatcacagcaccacagagccgcct
tataaccttccagaacacaaaacgcggatgacgattaagtctaagacgcataaaggcaat
ggttttaatgaattgcgttttgaggatgaaaaagaccgtgaagaaatctttattcatgcg
gagaaagaccaaaacaatgtagtgaataatgatgaaacgacgaatgtaggacgtaatcgt
actgaaaaagtcgggcgcaatgaaaaaatcaccgtaggtaaaaaccgctcgcaaaccatc
aaacaaaatgaaatgctcaccgtaggctttaatcgcatgaccaacattaccatgaatgag
ttgcataatgttggcatgatgcggagcttgaatgtattgttggatcaacatgaaatggtc
gggcagagctatgatttaaaggtcggcaaggattatcacattgatgcgggtaataacacg
catctgagcacggcacaattattgacgctgattagccaaaatatgcatgttaccggcaaa
gatgaaattcggttagacagtaaaggcggtcatattcatattaatgaaaagggtattacc
ttaaaaggtatcgtaacgattgaaggcccattaacgattaaaggcaatgccgtggcaggt
gggcactcggtagagggcgagtgtattgcctgtaaacaggctgcggccgtcgggcgtccg
gtgaatccgattttagggataaaattgctgagcaatgaagtggattttgctttcccgggt
cttctgccgttgaactggcagcgcagttatttttctgatgtggcgcataccggttggttg
gggcaaggttggttagtcaacggctgtcagcgtattgaatctcgtatgtctataccgata
gaagcgcttgccgatgtggtaggggaagaagccggcagtgacaaacaacactcggaggct
caacctgctgaacagctggtttatgttgacgaacaaggacgagaaattcccttgccatct
atccttgcagagcaagaacctgtgtatatccaagcagagcagatttggactcaccgttta
tctgcggaaacgattcgcatctcctccttggataaaaccgtacacttcacctttatgcgt
caaggggaggacggtagtgcttttgtgctgacacaaattacggataatcacggtaactgc
caacagtttttatacggacaagacaacttaccttatgccattaaggatggtaacgggcgg
gtctttgctttacagtttgcgaatatctcttcggaaaatcagactaatattgaggatagt
tctcaacggcggttaacccatgtttatttgttaacacagaccttttcagacattgacctg
gctctgctgcaggaaacactgaaaaaatcgaccgcactttctcacacctcagatgaatct
ttcttaggacgtaagttagtgtcttatcgctacaataccgaaggcgatttaattgaggtt
accgatggcttaggtaaccttgtgcgcaaatttggctatcgtaatcatctgatgatttcc
catgaagatagcgcaggcttaatctctacttatgaatacgaccactatacgccaaatggt
aaagtaactctcaatactaccaaccttggtgaacgttgggagtttgcctatttcccgacc
tacactgtggtaactgatgccttaggcagacgtgaggaataccattttgatgaacataat
gaattggtcaaattagtctcaacagacggacaggcgatgctacttgaacgggacaagtta
ggtcgagtgttgcgtcaaacgtcaccttccggacaaacttcctattttgaatataacccg
caagggcagatgaccaaactgacccgcccggataatgccatgttgtattttctgtatgac
aatgacggacgtttaatcgggcaaacggatgcgttgggtaatatgacccgttaccgttat
gacgacagcggtaaccttatcgaacgtctggatgcattaagtcaaaaaagcgtctatgcc
tacaacgacaaggggcttttgagctcaagcactgatccattaggaaacaatacattattt
gcttacgatgaaaacttccaattaaaccaagttaccgactgttccggtaatcaaacctgt
tttaagtataacgagttaggacagcttacctcacaaaccgacgcactgggtaacaccacg
gcgtatcagtacaacgatcgtcagcaattgattgcggtgctattaccgaatcaaagtcaa
acccgctatcaatatgacaaagtgggccgacttagtcaggtgattgatccacagggtaac
caaacaagctatcaatatcgtatcgacggtttgccgaccagcaagacgaatgcacaagga
catcacttccaatatcattatgatcaagcaggcagactggttgggttgaccaatgagaat
cacgccacttaccgttttgtgtatgacgagcaagacaggctgatttgggaaaaaggtttt
gatgataagctcacgcagtatgagtatgacgctaaaggtcagcttattagacgcacggat
tacggtgtgacggaagcgccaaaacgcaacaagccggcaattcgtactgccgaattcaaa
tataatcagcttggtcaaatgaccgaagagcatattcgtcagggcgagcaatccagtcgt
actacctttagctttgatttaaacggacaaatgacacaggttgcctgcggaggacaacac
attgattttcgctatgatgccacgggacgtttaattgaagaggcgcatggcgacaaaaaa
atcgcttatgaatatgatgccaataacaatcgtttaaaaacagtgttgccgtcgggtgat
agtattcgatatttttactacggcacggggcatttaagcggcattaagctgaacagccaa
ctgattagtgaaatggagcgggatgatttacaccgtgagattagccgcagccaagggcgg
cttaacggacgttactattatgacgatatggggcgcttggtccaacaacaggcaggactt
gcgaatcaacaaaacgccgtgcaaatcgaccgcacttacggctatgacgaattgggtcac
cttagccaaacgcgcacttattttccacataagccgtttgatgcaccacaacagacgcag
tatcaatacgacaacttgggacgcattgccaaagcggatagccaagggcatagtcagcat
ttttactttgacccggcaagtaaccttatcaacgacccgacggaaaaagttatcgacaac
cgcgtggttaactatcgcggtattcgttttacttatgacagtttgggcaatctcgtggaa
tgccaagcggcaaacggtgattatcagcgttatacttatgacctgaaaaaccgacttgtc
caggcagatattcgtgaccgttacaaagcggaaagctgggtgtatgagtatgacccactg
ggcagacgggttgctaaatcgaaactgaacaagcaaggtgaacaacaattacatacccaa
tttatttgggacggttcgcatctggtgcaggagattcgcacgggtaatcatcagcaaaat
gctgaaaaaactgaccgcactttcacttacatttacagcgaaccgggcagttacgagccg
ttggcacagtgttacaaagacggtgataatgccgaacataccatcaactacttccacagt
gaccaaatcggcatcccacgggagatgacggacagcgacggcaagctcatctggaaggga
cgttatgacgcttggggcagtcttattagagacagctaccgggaaaccgcatcggacagt
caccagccgttccgcttacagaaccaatattttgatgaagagacgggactacattataac
tttttccgctattatgagccggtgttgggacggtttattacgcaggatccgataaaattg
gctggaggaaataacctgtatcgattcgaagggactgtgcagaatcaaaccgatccgttg
gggttatttgcaccggcacttcttttagctccggagcttattgcgttaggaaaagcggcg
cttattacactgggagttcttgcagtcggggctgcagtagaggaaacagttaaaaatagg
gcgcgagcgagtacgcaagctaaaacggaaagtacatctaaatgtaaaaaatgtcctcct
tgtataacaacaagtggacgaatagttcctcctaaaacaataggatatcgtcctcttgat
gttattcctgatgataagatggagcatggagtatatggttctcaccataatatatttgaa
tcaaatcaagctccttatccaaattgtaaatgtttttggagtaaacaaaagtatgtatta
aaaccataccaattaactccagcaatggtgccggttgagccattcgtaaactaa
DBGET
integrated database retrieval system
