Arsenophonus apicola aApi_AU: QG404_03035
Help
Entry
QG404_03035 CDS
T09031
Name
(GenBank) sigma 54-interacting transcriptional regulator
Organism
aapc
Arsenophonus apicola aApi_AU
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Sigma54_activat
AAA_lid_14
Sigma54_activ_2
HTH_8
HTH_50
AAA_5
Mg_chelatase
AAA_16
AAA_2
AAA
HTH_28
HTH_29
MCM
AAA_19
AAA_22
HTH_17
GAF
HTH_Tnp_ISL3
AAA_7
PAS_7
HTH_23
APS_kinase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WGO83901
UniProt:
A0ABY8P4F8
LinkDB
All DBs
Position
403076..404860
Genome browser
AA seq
594 aa
AA seq
DB search
MLGVSSQSALMRIQPTILRFTKVLSRVLQLEVEIVDGALRRVAGSGPYGKYLGQKLERNS
RLLRYVIQTGKEKVVIQSRLDPLCHDCENKVNCKEKAFLGTPIFFQDVCVGVISLVAFTH
EQQERIKHNLHEFSDYVQHISTIFISKLLDEQSGVNHTSKALMTLIDNIDQGVLILSSRN
KLKFANAIALNILNLNYEKMIGKTFTIRPLIYQESFTGGHMQYVITCGDISEILTGQLHN
IQDYQIFLMAFHQLPLYANSTFESDEPQIEHLVGESPPMRKLKKLISRIAPSPSSVMITG
ESGTGKEVVARAIHKLSHRGNKAFIAINCAAIPEQLLESELFGYVKGAFTGASTNGKQGL
IQAANQGTLFLDEVGDMPLVIQAKLLRAIEAREIQPIGASKAIAVDIRIISATNQNLEKF
VREGKFREDLYYRLNVIPLALPPLRERQGDLLLLIHYFLNLHTKRLGLVYPGVSQEVLER
LKAYHWPGNLRELSNLMEYLINVTSSGDVIDVALLPPNLVSHRKNDFKVETVVVPNIEIK
EQAIDGAVVLEDMEKQLIREALSRYGSKKQAAKMLGIGIATLYRKIKRYELTSG
NT seq
1785 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgggtgtaagttctcaatctgctttaatgcggatccaaccaactatcctgcgattt
acgaaagttctttcccgtgtattacaacttgaagttgaaattgtagacggtgcattaaga
cgagtggctggatcagggccttatggaaagtatttagggcagaagctggaacgaaattcg
cgtttgttgcgttatgtcattcaaactggaaaagagaaggttgtcattcaatctcgcttg
gatcccctgtgtcacgattgtgaaaataaggtaaattgtaaggaaaaagcgtttttaggc
acaccgatatttttccaggatgtttgtgtcggggtaatcagtttggtggcttttactcat
gaacagcaggaaagaattaaacataatttacatgaattttctgattatgtgcagcatatt
tcgacgatttttatttcaaaattattagacgaacaaagtggtgtaaatcataccagcaaa
gcattaatgaccttaattgataatatcgatcaaggggttttgatattaagtagtcggaat
aaattaaaatttgccaatgctattgcacttaatatactcaatctaaattatgaaaaaatg
atcggcaagacatttaccattcggccgctaatttatcaagaaagttttaccggtggtcat
atgcaatatgtgatcacttgcggagatatatcagaaatactgaccgggcaactacataat
atacaagattatcaaatatttttgatggcttttcatcaattaccgctttatgccaattct
acatttgaatctgatgaaccccaaattgagcatctggttggtgagtcaccacccatgcgt
aagttgaaaaaattgattagccgtattgcgcctagcccttctagtgtaatgatcacgggt
gaaagtggtaccggtaaagaggttgtagcaagagcgattcataaattaagtcatcgaggt
aacaaagcttttattgccattaattgtgccgctatcccagaacagctactggaaagtgag
ttatttggctatgtgaaaggggcttttactggtgcttcaaccaatgggaagcaaggatta
attcaggcggctaaccagggaacactgtttttagatgaagtcggtgatatgccattggtt
attcaggcaaaattattgcgtgcaattgaggcgcgtgaaattcagccgattggtgccagt
aaagctattgcggtagatattcggattatttcggccaccaatcaaaatttggaaaaattt
gttcgggagggcaagtttcgcgaagatctctattatcgtttgaatgttattcctttagct
ttgccgccattacgtgagcggcagggagacttgctattacttattcactattttcttaat
ctccatactaagcgccttgggcttgtgtatccaggggtctcacaagaggtgttggagcgt
ctcaaggcttatcactggccaggtaatttacgtgaactgagtaatttgatggaatattta
attaatgtcacttcttccggcgatgttattgatgttgcattactccctcccaatttggtg
agtcatcgtaaaaatgattttaaggttgagacagtggttgttcctaatatcgaaataaag
gaacaagctattgatggtgcggttgtgcttgaagatatggaaaaacagttgatccgtgaa
gccttaagtcgttatggcagtaaaaaacaagcagcaaaaatgcttggcattggtattgct
actttataccgtaagatcaagcgctatgagttgacatctggctag
DBGET
integrated database retrieval system
