KEGG   Apilactobacillus apisilvae: MOO46_00305
Entry
MOO46_00305       CDS       T08479                                 
Symbol
uvrA
Name
(GenBank) excinuclease ABC subunit UvrA
  KO
K03701  excinuclease ABC subunit A
Organism
aapi  Apilactobacillus apisilvae
Pathway
aapi03420  Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:aapi00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03420 Nucleotide excision repair
    MOO46_00305 (uvrA)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:aapi03400]
    MOO46_00305 (uvrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:aapi03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    GGR (global genome repair) factors
     MOO46_00305 (uvrA)
  DSBR (double strand breaks repair)
   NHEJ (non-homologous end-joining)
    SHDIR (short-homology-dependent illegitimate recombination)
     Supressor
      MOO46_00305 (uvrA)
SSDB
Motif
Pfam: UvrA_DNA-bind UvrA_inter ABC_tran SMC_N RsgA_GTPase AAA_29 AAA_15 AAA_16 AAA_33 AAA_23 DnaJ_CXXCXGXG nSTAND1 AAA_22 BCA_ABC_TP_C nSTAND3 Viral_helicase1 cobW AAA_18 AAA_14 NACHT MMR_HSR1 ATPase_2 RNA_helicase NTPase_1 Mtrc-MtrF_II-IV_dom Septin Aq_aa27
Other DBs
NCBI-ProteinID: UQS85082
UniProt: A0ABY4PHL0
LinkDB
Position
56525..59377
AA seq 950 aa
MQNDKIIIKGARAHNLKNINVEIPKNKLTVMTGLSGSGKSSLAFDTLYAEGQRRYVESLS
SYARQFLGQMDKPDVDSIEGLSPAIAIDQKTTSHNPRSTVGTVTEINDYFRLLWARVGTP
ICPNDGTKITRQSIDQMIDEIMALPERTKLQILSPVVRESRGQHKKTFDKIQREGFVRYR
LDGEIHEIGDGIVPEKSKKHNIDIVVDRIIVKDGIKSRLSDSLETALRLSGGYATADLMG
KGDNLIFSEHYACPLCGFTISELEPRLFSFNSPIGACPDCDGLGMKLDVDESLVIPDKNK
TLKDGAIDPWNPISSKFYPSLLEQACDAFNIDMDIPFKKLPKKKRDLILNGSNGKEFHFH
FDSSFGGVRDTDAPFEGVLRNISRRYNSTNSDFTREQMRKYMTELTCQTCNGYRLNREAL
SVKIDGQNISEITNLDINKELAFFKQLTFGEKDTTIAKPILKEIIDRLSFLRNVGLDYLT
LSRTAGTLSGGESQRIRLATQIGSNLSGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLIKSLKSMRDLGN
TLVVVEHGEDTMLASDYIVDIGPGAGSNGGKVMAVGTPEEVANNDQSLTGQYLSGKKYIS
VPLKRRKGNNKHIKVKGASENNLKNVDVDIPLGEFNVITGVSGSGKSTLINRVLKRALAQ
KLNNNSEKPGKYKSISGYKNIDKLINIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRELFAETNEA
KLRGYQKGRFSFNVKGGRCETCHGDGILKIEMNFLPDVYVPCEVCHGKRYNNETLEVQYK
GKNIADVLDMTVKDALSFFEAMPKITRKLKTINEVGLGYVKLGQSATTLSGGEAQRMKLA
AELYKKSAGNNLYILDEPTIGLHTDDIKRLLVVLHELVDQGNTILIIEHNLDVIKTADHI
IDLGPEGGEGGGNIIATGTPEEIIKVKNSYTGQYLSPILKRDLKRTKDDK
NT seq 2853 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttgcaaaacgacaaaattattattaagggtgctcgagcacataatctaaaaaatattaat
gttgaaattccgaaaaataagttaaccgtcatgacgggactatctggttcaggcaaaagt
tctttagcttttgacaccttatatgccgaaggacaacgtcgttatgttgagagcttatct
tcatatgccaggcagtttttaggccaaatggataaaccagatgttgattcaattgaggga
ttaagtccagcaattgcaattgatcaaaaaacgacctcacataatccgcgttcaactgtt
ggaactgttactgaaataaacgattattttagattattgtgggcaagagttggaacacct
atttgtcccaatgatggaactaagatcacccgtcaatcaattgatcaaatgattgatgaa
attatggcattgcctgaaagaactaagttgcaaattttatcaccagttgtccgcgaatca
cgtggccaacataaaaagacttttgataaaattcaacgagaaggctttgttcgttaccga
ttagatggagaaattcatgaaattggtgatggcattgttcctgaaaaaagcaaaaaacat
aacattgatattgttgttgatagaatcattgttaaagatggaattaagtcacgtttatct
gattcactggaaactgctttaagattaagtggtggttatgcaactgctgatttaatggga
aaaggcgataatttaattttttctgaacattatgcttgtccattatgtggattcacaatt
agtgaactagaaccacgtttattttcatttaattcaccaatcggtgcttgtcctgattgt
gatggattggggatgaagctagatgttgatgaaagtctagtaattccagataaaaataaa
actttaaaagacggcgcaattgatccttggaatccaattagttctaaattttatcctagt
ctattagaacaagcttgtgatgcttttaatattgatatggatattccatttaaaaagtta
cctaaaaagaaacgtgatttaattttaaatggatctaatggcaaagaatttcatttccat
tttgatagcagttttggcggagttcgtgatactgatgcaccatttgaaggggtacttaga
aacatttcgcgtcgttacaatagtactaatagtgactttactagagaacaaatgcgtaaa
tatatgactgaattaacttgtcaaacttgtaatggttatcgattaaatcgagaagcttta
agtgtaaaaattgatggtcaaaatataagcgaaattactaatttggatattaataaggaa
ctagcattttttaaacaacttacttttggtgaaaaagatacaacaattgctaaaccaatt
ttgaaagaaattattgatcgactttcatttttaagaaatgttggcttagattatttaact
ttatctagaactgccgggactttatctggtggcgaatcccaaagaattcgtttggctact
caaattggttccaatttatctggtgtattatatgtattagatgaaccatcaattggttta
catcagcgtgataatgatcgactaattaaatcgttaaaatcaatgcgtgatttaggaaat
acattagtcgttgttgaacatggcgaagatacgatgctagcatctgattatattgttgat
attggtccaggggctggatctaatggtggtaaagtaatggctgttggtacacctgaagaa
gtagcaaataatgatcaatcactaactggtcaatatttatcaggcaaaaaatatatttca
gtgccattaaaacgacgtaagggtaataataagcatattaaagtaaaaggtgctagtgaa
aacaatttaaagaacgttgatgttgatattccattaggtgagtttaatgttataactgga
gtatctggttctggaaagtctactttaattaatcgtgttttaaaacgtgcattagcacaa
aaattaaataataattctgaaaaaccagggaaatataaatcaatttctgggtataagaat
attgataaattaatcaatattgaccaaagccctattgggaggacgcctcgtagtaatcct
gccacttatactggtgtttttgatgatattcgtgaacttttcgccgaaacaaatgaagca
aagttaagaggttatcaaaagggtcgctttagctttaatgttaagggtggacgttgtgag
acatgtcatggggatggaattctaaaaattgaaatgaatttcttacctgatgtatatgta
ccttgtgaagtgtgtcatggaaaacgctacaacaatgaaactttggaagttcaatataaa
ggtaaaaatattgcggatgttttagatatgacggtaaaagatgctttatcattttttgaa
gccatgcctaagattactagaaaattgaaaacaattaatgaagtaggtttaggatatgtt
aaattaggccaatctgcaacgacattgtctggtggtgaagcccaaagaatgaagttagca
gctgagttatataaaaaatcagctggtaataatttatatattcttgatgaacctacaatt
ggattacacactgatgacattaaacgcttgttagtagtgttacatgaattagtagatcaa
ggaaatacgatattaattattgaacacaatttggatgtaattaaaactgctgatcatatt
attgatttaggaccagaaggtggtgaaggcggtggtaatattattgccactggaacacct
gaagaaattatcaaagttaagaatagttacactggtcaatatctttctccaattttaaaa
cgtgatctaaagcgaaccaaagatgataaataa

DBGET integrated database retrieval system