Apilactobacillus apisilvae: MOO46_01745
Help
Entry
MOO46_01745 CDS
T08479
Symbol
smc
Name
(GenBank) chromosome segregation protein SMC
Organism
aapi
Apilactobacillus apisilvae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SMC_N
SMC_hinge
AAA_23
AAA_15
AAA_21
AAA_29
FKBP15
ATG16
SbcC_Walker_B
ABC_tran
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UQS85339
UniProt:
A0ABY4PHQ6
LinkDB
All DBs
Position
335797..339348
Genome browser
AA seq
1183 aa
AA seq
DB search
MKLKSLEVIGFKSFANKTKINFNNGLTEIVGPNGSGKSNVIEAIRWVLGEQSAKTLRGTK
MPDIIFSGSVDHKALNRAEVKLTLDNTDQYINSPYSEIIIARKLFRNGDSQYFINKQECR
LKDINNLFMDTGMGLGSFSIISQGNIEKIFNSKPEDRRSIIETAAGVFKYKHQKHDANLK
LKQTKDNLDRVEDIIYELKSRNDSLKEQSNLAKKYLEKKDQLEKLDINKLVFELKDFISK
KDVNNKELVSFKNKKDILNNEISKYSKEANNQKNELEKNLNLKEKLQNQLLKSSQQLERI
SGEQNLSKQDLEFKKKSIIDKKGNLKKLIIQKKNLLNNSSSYKKEIDQLSAKFTELNNKV
QASNLNLLNKELSSKRNFQEELKSNYLDIMQKMADLNNKNIYLDKNKKQSDVQNISQKNK
IREIKNDVAEFNSKISSFSEMIGQSKESYSKIDNKYMQYKKKLSELNSIIQKNKADWYHS
LEEYQNIKIKYNSLKKITDDHSNFYRGAKNILADKKQLSGVYGSVSDYLKVSSKYSLAIE
TALGSQLQQIIVQDSNSAKNAINYLNQNKLGRATFVPVESVSKRFITNQKIDTCKNYEGF
IGTADSLVDIDKELLIIKKHLLGNVIISKDLDSATAISRAINYSNRVITLDGEIINSGGS
MTGGKNKNHYDGMLSQKNKLTDLSKKMDSFSILLKNQEKTINENNEKFINLSDEVKSLED
KMNSLSTKISNYRNNKEFNEKIISQKKRELKSIRMSINDIFDDDYEEQIQNNNQIKNKLN
QDLLKNQSASKNTNERIITLESLISSLNDDLNSNKSKLAVIKEKINNYRNKNADVIESID
QLDNDIQLTNDSIDSLDEDLKLIISNSTSKEKINNLKQQIKSNKLELNKCNQLIVNLQTK
ISNLDSMLEEKRENYIIVTSSYNKFSTNDNQIDNGIIKLKEKLSSKYNIDTKNVNNFKIN
ESYNDIKKSIGLLNEQINALGNINISSIDEYKEVSKRYQFLINQSEDLKNSSNQLTETMN
KIDSTVKYKFKDTFDKVAVQFKDVYTEIFGGGKAKLVLTNPNNLLTTGIEIMAQPPGKKY
RHMSLLSGGEKALTAISLLFAVLKVKPVPFCILDEAESALDAENVDRYAKYMSNLDTNTQ
FIVITHRKETMMYADTLYGVTMQDSGVSEVVSANLNKFNSMED
NT seq
3552 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaagttaaaatcattagaagttattggctttaaatcttttgctaataaaaccaaaatc
aattttaataatggtttaaccgaaatcgtaggtcctaatggtagtggtaaaagtaatgtt
attgaagctattcgctgggttttaggagaacaatcagccaaaacacttcgtggaactaaa
atgcctgatatcattttttctggctctgttgatcataaagctctgaatcgagcagaagta
aaattaactctagataatactgatcaatatatcaatagtccatattctgagattattatt
gctaggaaactttttcgtaatggcgatagtcaatattttattaataaacaagaatgtaga
ttaaaggatattaataacttgtttatggatactgggatggggcttggttctttttctatt
atttctcaaggtaatattgaaaagatattcaatagtaagcctgaagatagaagatcaatt
attgaaacagctgccggagtatttaaatataaacatcaaaaacacgatgctaatttaaaa
ttaaagcaaactaaggataatcttgatcgtgtcgaagatattatttacgagttgaaaagc
cgtaatgattctttaaaagaacagagtaatcttgctaaaaaatatttagaaaaaaaagat
caattagaaaaattagatataaataaattagtttttgaattaaaagatttcatatctaaa
aaagatgttaataataaagaattagttagctttaaaaataaaaaagatattctaaacaat
gaaatatcaaaatattctaaagaagccaataatcaaaaaaatgaacttgaaaaaaatcta
aatttaaaagaaaaattacaaaatcaacttttaaaatcttctcaacaattagaaagaata
tctggagaacaaaacttatctaagcaagatttggaattcaagaaaaaaagtattattgat
aaaaaaggcaacttaaaaaaattgattattcaaaaaaagaacctactcaataatagttca
tcttataaaaaggaaattgatcaactttctgcaaaatttactgaattaaataataaagtt
caagctagtaatctcaatttacttaataaggaattatcaagtaaaagaaattttcaagaa
gaattaaaatctaattacctagatattatgcaaaaaatggctgatttaaataataaaaac
atttatttagacaaaaataaaaaacaaagtgatgttcaaaacattagccaaaaaaataag
ataagagaaataaaaaatgatgtagcagaatttaattctaaaatatctagttttagtgaa
atgattggtcaatcaaaagagagctattctaaaattgataataaatatatgcagtataaa
aaaaagttatctgaattaaatagtattattcaaaaaaataaggctgattggtatcatagc
ttagaagaatatcagaatataaaaataaagtataatagtttgaaaaaaattaccgatgat
cattctaatttttatcgtggagcaaaaaatatactagctgataaaaaacaattatctgga
gtatacggatcagtatctgattatttgaaggtaagttcaaaatattcattagcaattgaa
acagctttaggttctcaattacaacaaattattgttcaagatagtaattctgccaaaaat
gcaattaattatttgaatcaaaataaattaggtagagcgacatttgtaccggttgaaagt
gtgtcaaaaagatttatcaccaatcagaaaatagatacttgcaagaactatgaagggttt
ataggcaccgcagattcattagttgatattgataaagagctgttaattattaaaaaacat
ctgttaggtaatgtcattatctcaaaagatttagattctgctactgcaattagtcgtgcc
attaattatagtaatagagttattactttagatggagaaattattaattcaggtggttca
atgactggtggtaaaaataaaaatcattatgatggaatgttatcacaaaagaacaaactt
actgatttaagtaaaaaaatggattcatttagtattcttttaaaaaatcaagagaaaact
ataaatgaaaataatgagaaatttataaatttatctgatgaagttaaatctttagaagat
aagatgaattccttatctacaaaaataagtaattatcgtaataataaagagtttaatgaa
aaaataattagtcaaaaaaagcgtgaattaaaatcaattagaatgtctatcaacgatata
tttgatgatgattatgaggaacaaatccaaaataacaatcaaattaaaaataagttaaat
caagatttattaaaaaatcaaagtgcatctaaaaataccaatgaaagaattattacatta
gagtcactgatttccagtcttaatgatgatttgaattccaataaatcgaaattagcagtt
attaaagaaaaaataaataattaccgtaataagaatgctgatgttattgaatcaattgat
cagttagataatgatattcaattaactaatgactcaattgattcgttagatgaagatctt
aagctaattatttctaattctactagtaaagaaaaaataaataatttgaagcaacaaatt
aaatctaataaattagaattgaataaatgtaatcaattaattgtaaacttgcaaaccaaa
attagtaatttagatagtatgcttgaagaaaaaagagaaaattatataattgttaccagt
agttataacaaatttagtactaatgataatcaaattgataatggtataattaaattaaaa
gaaaaactaagtagtaaatataatattgatactaaaaatgttaataattttaaaattaat
gaatcttataatgatattaaaaaatcgataggtttattgaatgaacaaatcaatgcttta
gggaatattaatatatcttcaattgacgaatataaagaggtttcaaaaagatatcaattt
ttaataaatcaatctgaagatttaaaaaattctagtaatcaattaactgaaacgatgaat
aagattgatagtaccgtgaaatataaatttaaggatacttttgataaagttgcggtgcag
tttaaagatgtatacactgaaatatttggtggcggtaaagctaaattagttttaactaat
ccgaacaatttattaacgactggtattgaaataatggcacaaccacctggcaaaaaatat
cgtcatatgtctttgctttctggtggtgaaaaagctttaactgctatttcattgttattt
gctgttttaaaagtaaagccagtcccattttgtatactagatgaagctgaatctgcactt
gatgcagaaaatgtggatagatatgctaaatatatgagtaatttagatactaatactcaa
tttattgttataactcatagaaaagaaaccatgatgtatgcagatactttgtatggtgtt
acaatgcaagattcaggtgtttcagaagttgtttcagccaacctaaataaatttaattca
atggaggattaa
DBGET
integrated database retrieval system
