KEGG   Apilactobacillus apisilvae: MOO46_07155
Entry
MOO46_07155       CDS       T08479                                 
Symbol
mfd
Name
(GenBank) transcription-repair coupling factor
  KO
K03723  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) [EC:5.6.2.4]
Organism
aapi  Apilactobacillus apisilvae
Pathway
aapi03420  Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:aapi00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03420 Nucleotide excision repair
    MOO46_07155 (mfd)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:aapi03400]
    MOO46_07155 (mfd)
Enzymes [BR:aapi01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     MOO46_07155 (mfd)
DNA repair and recombination proteins [BR:aapi03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     TRCF (transcription-repair coupling factor)
      MOO46_07155 (mfd)
SSDB
Motif
Pfam: TRCF UvrB_inter DEAD CarD_TRCF_RID Helicase_C ResIII Cas3-like_C_2 RecG_dom3_C MFD_D3 UB2H AAA_22 SNF2-rel_dom ERCC3_RAD25_C IstB_IS21
Other DBs
NCBI-ProteinID: UQS85008
LinkDB
Position
1438622..1442149
AA seq 1175 aa
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NT seq 3528 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
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DBGET integrated database retrieval system